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'expression tag' 641 57 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 747 ? 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LYS C 231 ALA C 236 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN B 237 ? GLY B 253 ? ASN C 237 GLY C 253 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY B 257 ? TYR B 265 ? GLY C 257 TYR C 265 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 CYS B 272 ? ASP B 322 ? CYS C 272 ASP C 322 1 ? 51 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN B 332 ? TYR B 344 ? ASN C 332 TYR C 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 TYR B 344 ? PHE B 352 ? TYR C 344 PHE C 352 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 SER B 359 ? ALA B 367 ? SER C 359 ALA C 367 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY B 372 ? ASN B 384 ? GLY C 372 ASN C 384 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 VAL B 387 ? SER B 421 ? VAL C 387 SER C 421 1 ? 35 HELX_P HELX_P24 AC6 SER B 421 ? SER B 426 ? SER C 421 SER C 426 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 PRO B 429 ? MET B 446 ? PRO C 429 MET C 446 1 ? 18 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL B 447 ? MET B 450 ? VAL C 447 MET C 450 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA B 452 ? TYR B 463 ? ALA C 452 TYR C 463 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 466 ? TYR B 482 ? THR C 466 TYR C 482 1 ? 17 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY B 485 ? GLY B 498 ? GLY C 485 GLY C 498 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 AD3 SER B 502 ? VAL B 512 ? SER C 502 VAL C 512 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 VAL B 512 ? GLY B 532 ? VAL C 512 GLY C 532 1 ? 21 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO B 552 ? ARG B 582 ? PRO C 552 ARG C 582 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? B CYS 126 SG ? ? ? 1_555 B CYS 139 SG ? ? C CYS 126 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 309 SG ? ? ? 1_555 B CYS 358 SG ? ? C CYS 309 C CYS 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale one ? B ASN 131 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? C ASN 131 C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 357 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? C ASN 357 C NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG C . ? ASN B 131 ? NAG C 701 ? 1_555 ASN C 131 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG D . ? ASN B 357 ? NAG C 702 ? 1_555 ASN C 357 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 CYS B 126 ? CYS B 139 ? CYS C 126 ? 1_555 CYS C 139 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS B 309 ? CYS B 358 ? CYS C 309 ? 1_555 CYS C 358 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # _struct_sheet.id AA1 _struct_sheet.type ? _struct_sheet.number_strands 2 _struct_sheet.details ? # _struct_sheet_order.sheet_id AA1 _struct_sheet_order.range_id_1 1 _struct_sheet_order.range_id_2 2 _struct_sheet_order.offset ? _struct_sheet_order.sense anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS B 535 ? ASP B 540 ? LYS C 535 ASP C 540 AA1 2 GLN B 545 ? ASP B 550 ? GLN C 545 ASP C 550 # _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id AA1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id N _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id ALA _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id B _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id 538 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id N _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id ALA _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id C _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id 538 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id O _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id VAL _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id B _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id 547 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id O _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id VAL _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id C _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id 547 # _pdbx_entry_details.entry_id 8P2W _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OH C TYR 204 ? ? 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OG1 C THR 466 ? ? 2.16 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 HIS C 115 ? ? -91.15 51.37 2 1 THR C 189 ? ? -137.52 -33.34 3 1 GLU C 386 ? ? -91.97 -60.33 4 1 PHE C 448 ? ? -68.39 0.30 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8P2W _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details 'Initial model fitting was peformed in Chimera and model building in COOT' _em_3d_fitting.overall_b_value 150 _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 6M18 _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id C _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.chain_id C _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 6M18 _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8P2W _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ;cryoSPARC local refinement using mask focussed on SIT1 domain using particles after symmetry expansion and 3D classification in RELION ; _em_3d_reconstruction.resolution 3.76 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 322202 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'SIT1:ACE2 complex' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2' # _em_image_scans.entry_id 8P2W _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 50 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.used_frames_per_image 1-50 # _em_imaging.entry_id 8P2W _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2200 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 50.0 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? 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