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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.545 ? 6511 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.122 ? 663 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 764 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 794 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8P2Z _struct.title 'Structure of human SIT1 bound to L-pipecolate (focussed map / refinement)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8P2Z _struct_keywords.text 'amino acid transporter, proline, SLC6A20, ACE2, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ACE2_HUMAN Q9BYF1 ? 1 ;MSSSSWLLLSLVAVTAAQSTIEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLA QMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNE RLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHL HAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGL PNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGF HEAVGEIMSLSAATPKHLKSIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEM KREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRL GKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYADQSIKVRISLKSALGDKAYEWNDNEM YLFRSSVAYAMRQYFLKVKNQMILFGEEDVRVANLKPRISFNFFVTAPKNVSDIIPRTEVEKAIRMSRSRINDAFRLNDN SLEFLGIQPTLGPPNQPPVSIWLIVFGVVMGVIVVGIVILIFTGIRDRKKKNKARSGENPYASIDISKGENNPGFQNTDD VQTSF ; 1 2 UNP S6A20_HUMAN Q9NP91 ? 2 ;MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTI SPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSL QENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNT FDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLL MLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKDYPAYALAVIG LLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8P2Z A 1 ? 812 ? Q9BYF1 1 ? 805 ? -6 805 2 2 8P2Z C 1 ? 592 ? Q9NP91 1 ? 592 ? 1 592 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8P2Z ASP A 18 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 11 1 1 8P2Z TYR A 19 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 12 2 1 8P2Z LYS A 20 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 13 3 1 8P2Z ASP A 21 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 14 4 1 8P2Z ASP A 22 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 15 5 1 8P2Z ASP A 23 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 16 6 1 8P2Z ASP A 24 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 17 7 1 8P2Z LYS A 25 ? UNP Q9BYF1 GLN 18 conflict 18 8 2 8P2Z ALA C 593 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 593 9 2 8P2Z GLU C 594 ? 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UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 611 27 2 8P2Z SER C 612 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 612 28 2 8P2Z ALA C 613 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 613 29 2 8P2Z TRP C 614 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 614 30 2 8P2Z SER C 615 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 615 31 2 8P2Z HIS C 616 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 616 32 2 8P2Z PRO C 617 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 617 33 2 8P2Z GLN C 618 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 618 34 2 8P2Z PHE C 619 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 619 35 2 8P2Z GLU C 620 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 620 36 2 8P2Z LYS C 621 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 621 37 2 8P2Z GLY C 622 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 622 38 2 8P2Z GLY C 623 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 623 39 2 8P2Z GLY C 624 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 624 40 2 8P2Z SER C 625 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 625 41 2 8P2Z GLY C 626 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 626 42 2 8P2Z GLY C 627 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 627 43 2 8P2Z GLY C 628 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 628 44 2 8P2Z SER C 629 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 629 45 2 8P2Z GLY C 630 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 630 46 2 8P2Z GLY C 631 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 631 47 2 8P2Z SER C 632 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 632 48 2 8P2Z ALA C 633 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 633 49 2 8P2Z TRP C 634 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 634 50 2 8P2Z SER C 635 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 635 51 2 8P2Z HIS C 636 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 636 52 2 8P2Z PRO C 637 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 637 53 2 8P2Z GLN C 638 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 638 54 2 8P2Z PHE C 639 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 639 55 2 8P2Z GLU C 640 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 640 56 2 8P2Z LYS C 641 ? UNP Q9NP91 ? ? 'expression tag' 641 57 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 747 ? ARG A 775 ? SER A 740 ARG A 768 1 ? 29 HELX_P HELX_P2 AA2 SER B 11 ? VAL B 23 ? SER C 11 VAL C 23 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY B 24 ? TRP B 29 ? GLY C 24 TRP C 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 TRP B 29 ? TYR B 38 ? TRP C 29 TYR C 38 1 ? 10 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY B 40 ? GLU B 54 ? GLY C 40 GLU C 54 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU B 54 ? ARG B 70 ? GLU C 54 ARG C 70 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 GLY B 72 ? SER B 81 ? GLY C 72 SER C 81 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO B 82 ? LEU B 84 ? PRO C 82 LEU C 84 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 SER B 85 ? HIS B 115 ? SER C 85 HIS C 115 1 ? 31 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP B 136 ? ALA B 142 ? ASP C 136 ALA C 142 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 SER B 143 ? ARG B 151 ? SER C 143 ARG C 151 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 GLN B 167 ? GLY B 188 ? GLN C 167 GLY C 188 1 ? 22 HELX_P HELX_P13 AB4 THR B 192 ? THR B 199 ? THR C 192 THR C 199 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 SER B 201 ? LEU B 215 ? SER C 201 LEU C 215 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY B 219 ? THR B 229 ? GLY C 219 THR C 229 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN B 237 ? GLY B 253 ? ASN C 237 GLY C 253 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY B 257 ? TYR B 265 ? GLY C 257 TYR C 265 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN B 271 ? ASP B 322 ? ASN C 271 ASP C 322 1 ? 52 HELX_P HELX_P19 AC1 THR B 329 ? SER B 331 ? THR C 329 SER C 331 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 ASN B 332 ? TYR B 344 ? ASN C 332 TYR C 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 TYR B 344 ? PHE B 352 ? TYR C 344 PHE C 352 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 SER B 359 ? ALA B 367 ? SER C 359 ALA C 367 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY B 372 ? ASN B 384 ? GLY C 372 ASN C 384 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 VAL B 387 ? SER B 421 ? VAL C 387 SER C 421 1 ? 35 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 421 ? SER B 426 ? SER C 421 SER C 426 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO B 429 ? GLY B 445 ? PRO C 429 GLY C 445 1 ? 17 HELX_P HELX_P27 AC9 MET B 446 ? MET B 450 ? MET C 446 MET C 450 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA B 452 ? ALA B 464 ? ALA C 452 ALA C 464 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU B 467 ? TYR B 482 ? LEU C 467 TYR C 482 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY B 485 ? GLY B 498 ? GLY C 485 GLY C 498 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 AD4 SER B 502 ? GLY B 511 ? SER C 502 GLY C 511 1 ? 10 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY B 511 ? GLY B 532 ? GLY C 511 GLY C 532 1 ? 22 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO B 552 ? ARG B 582 ? PRO C 552 ARG C 582 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? B CYS 126 SG ? ? ? 1_555 B CYS 139 SG ? ? C CYS 126 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 309 SG ? ? ? 1_555 B CYS 358 SG ? ? C CYS 309 C CYS 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale one ? B ASN 131 ND2 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? C ASN 131 C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 357 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? C ASN 357 C NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # _struct_sheet.id AA1 _struct_sheet.type ? _struct_sheet.number_strands 2 _struct_sheet.details ? # _struct_sheet_order.sheet_id AA1 _struct_sheet_order.range_id_1 1 _struct_sheet_order.range_id_2 2 _struct_sheet_order.offset ? _struct_sheet_order.sense anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS B 535 ? 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