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INNREDVYIETSNLLKHKILIYPLNSELIKFKPSKYMLPTPNEQVDKDSTDVAHSYIDFVLGGLLATRKTILQVNIKQS ; AB,AC,AJ,AK,AL,AS,AT,AU,BB,BC,BD,BK,BL,BM,BT,BU,BV,CC,CD,CE,CL,CM,CN,CU,CV,CW ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSDITKIKQEFDKKVAEIQALMKNPQQDSGLLSNSIDFRDQNLIFSNSGGVCTSSKDKIENYPAKGYPYKRGVKLSFGDG TTELEVEAGGGDDLYGVCSDIDEFSGMATVIPITNNFTGYLTLKKDGQNGVNPGDKLNFNQHGELEKVTGAQKSVNAIAL SKAHKLTEDLFIVLASVFGNRAIKG ; ;MSDITKIKQEFDKKVAEIQALMKNPQQDSGLLSNSIDFRDQNLIFSNSGGVCTSSKDKIENYPAKGYPYKRGVKLSFGDG TTELEVEAGGGDDLYGVCSDIDEFSGMATVIPITNNFTGYLTLKKDGQNGVNPGDKLNFNQHGELEKVTGAQKSVNAIAL SKAHKLTEDLFIVLASVFGNRAIKG ; AD,AO,AW,AX,BF,BG,BN,BO,BW,BX,CF,CG,CH,CP,CQ ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGDTTQLVKEYQEKRSKLEKFMKNPQHDASLLSNSNEFRDKNVEFFASGGTRTSKFDKLENHPFLGYPYKRGVKRVIQEA QDNQSHYEPHVEAGGGEDLYGICIDIDEFSKTATIVPITNNFEGYLVAKDSTVKVKDKLIFNKDGALEKVTGAPNKATIN ATALTDAKQISNEVYLVKVAVFGNKAMSRN ; ;MGDTTQLVKEYQEKRSKLEKFMKNPQHDASLLSNSNEFRDKNVEFFASGGTRTSKFDKLENHPFLGYPYKRGVKRVIQEA QDNQSHYEPHVEAGGGEDLYGICIDIDEFSKTATIVPITNNFEGYLVAKDSTVKVKDKLIFNKDGALEKVTGAPNKATIN 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AI ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8PHS 8PHS ? 1 ? 1 2 PDB 8PHS 8PHS ? 2 ? 1 3 PDB 8PHS 8PHS ? 3 ? 1 4 UNP Q9R2Q2_BORBU Q9R2Q2 ? 4 ;MTEKEEKEDLQAQDKEEQQIKADTKVISVQEFEEYMRFKEQANSKSKETSRDLSINERITKELAEVEERERIEKQLLLEA ERINEIDTLAKAHLSNHFNKEVLLAKGYTLKDIMQAQRRELVRKFVPIEQIKAIAKVSDISHIDGEILEQLVSLAKVNIK LRKNASSSSSSVDSIKGNIAIKSEERASLLDSNFVPINFTEFVQAISNTYKQRRIQFYENLKRHKRTSIA ; 1 5 PDB 8PHS 8PHS ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8PHS AB 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 2 1 8PHS AC 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 3 2 8PHS AD 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 4 3 8PHS AF 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 5 4 8PHS AH 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 6 4 8PHS AI 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 7 1 8PHS AJ 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 8 1 8PHS AK 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 9 1 8PHS AL 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 10 5 8PHS AM 1 ? 254 ? 8PHS 1 ? 254 ? 1 254 11 3 8PHS AN 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 12 2 8PHS AO 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 13 4 8PHS AP 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 14 4 8PHS AQ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 15 4 8PHS AR 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 16 1 8PHS AS 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 17 1 8PHS AT 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 18 1 8PHS AU 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 19 3 8PHS AV 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 20 2 8PHS AW 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 21 2 8PHS AX 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 22 4 8PHS AY 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 23 4 8PHS AZ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 24 4 8PHS BA 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 25 1 8PHS BB 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 26 1 8PHS BC 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 27 1 8PHS BD 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 28 3 8PHS BE 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 29 2 8PHS BF 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 30 2 8PHS BG 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 31 4 8PHS BH 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 32 4 8PHS BI 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 33 4 8PHS BJ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 34 1 8PHS BK 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 35 1 8PHS BL 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 36 1 8PHS BM 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 37 2 8PHS BN 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 38 2 8PHS BO 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 39 3 8PHS BP 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 40 4 8PHS BQ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 41 4 8PHS BR 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 42 4 8PHS BS 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 43 1 8PHS BT 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 44 1 8PHS BU 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 45 1 8PHS BV 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 46 2 8PHS BW 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 47 2 8PHS BX 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 48 3 8PHS BY 1 ? 190 ? 8PHS 1 ? 192 ? 1 192 49 4 8PHS BZ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 50 4 8PHS CA 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 51 4 8PHS CB 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 52 1 8PHS CC 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 53 1 8PHS CD 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 54 1 8PHS CE 1 ? 319 ? 8PHS 1 ? 319 ? 1 319 55 2 8PHS CF 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 56 2 8PHS CG 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 57 2 8PHS CH 1 ? 185 ? 8PHS 1 ? 185 ? 1 185 58 4 8PHS CI 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 59 4 8PHS CJ 1 ? 230 ? Q9R2Q2 1 ? 230 ? 1 230 60 4 8PHS CK 1 ? 230 ? 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'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8PHS _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8PHS _struct.title 'Bottom cap of the Borrelia bacteriophage BB1 procapsid, fivefold-symmetrized outer shell' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8PHS _struct_keywords.text 'Bacteriophage, capsid, procapsid, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 5 ? K N N 3 ? L N N 2 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 1 ? Q N N 1 ? R N N 1 ? S N N 3 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 4 ? W N N 4 ? X N N 4 ? Y N N 1 ? Z N N 1 ? AA N N 1 ? BA N N 3 ? CA N N 2 ? DA N N 2 ? EA N N 4 ? FA N N 4 ? GA N N 4 ? HA N N 1 ? IA N N 1 ? JA N N 1 ? KA N N 2 ? LA N N 2 ? MA N N 3 ? NA N N 4 ? OA N N 4 ? PA N N 4 ? QA N N 1 ? RA N N 1 ? SA N N 1 ? TA N N 2 ? UA N N 2 ? VA N N 3 ? WA N N 4 ? XA N N 4 ? YA N N 4 ? ZA N N 1 ? AB N N 1 ? BB N N 1 ? CB N N 2 ? DB N N 2 ? EB N N 2 ? FB N N 4 ? GB N N 4 ? HB N N 4 ? IB N N 1 ? JB N N 1 ? KB N N 1 ? LB N N 3 ? MB N N 2 ? NB N N 2 ? OB N N 4 ? PB N N 4 ? QB N N 4 ? RB N N 1 ? SB N N 1 ? TB N N 1 ? UB N N 4 ? VB N N 4 ? WB N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 7 ? ILE A 17 ? ASN AB 7 ILE AB 17 1 ? 11 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 18 ? VAL A 20 ? GLY AB 18 VAL AB 20 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 23 ? PHE A 29 ? PRO AB 23 PHE AB 29 5 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 30 ? ILE A 34 ? SER AB 30 ILE AB 34 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 GLN A 93 ? TYR A 99 ? GLN AB 93 TYR AB 99 5 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 PRO A 114 ? GLY A 137 ? PRO AB 114 GLY AB 137 1 ? 24 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 170 ? LYS A 174 ? ALA AB 170 LYS AB 174 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 LYS A 176 ? LEU A 191 ? LYS AB 176 LEU AB 191 1 ? 16 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 206 ? VAL A 214 ? ASP AB 206 VAL AB 214 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 LYS A 229 ? ASN A 243 ? LYS AB 229 ASN AB 243 1 ? 15 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN B 7 ? ILE B 17 ? ASN AC 7 ILE AC 17 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 GLY B 18 ? VAL B 20 ? GLY AC 18 VAL AC 20 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO B 23 ? PHE B 29 ? PRO AC 23 PHE AC 29 5 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 SER B 30 ? ILE B 34 ? SER AC 30 ILE AC 34 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO B 114 ? GLY B 137 ? PRO AC 114 GLY AC 137 1 ? 24 HELX_P HELX_P16 AB7 ALA B 170 ? LYS B 174 ? ALA AC 170 LYS AC 174 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS B 176 ? LEU B 191 ? LYS AC 176 LEU AC 191 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU B 193 ? PHE B 197 ? LEU AC 193 PHE AC 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP B 206 ? VAL B 214 ? ASP AC 206 VAL AC 214 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 LYS B 229 ? ASN B 243 ? 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