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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.689 ? 98735 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.023 ? 10509 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 10441 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 12510 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8QEM _struct.title 'Neck channel of phage 812 after tail contraction (C1)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QEM _struct_keywords.text 'phage, neck, A-form DNA, connector, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LYS 121 A . ? LYS 121 A PRO 122 A ? PRO 122 A 1 -5.94 2 LYS 121 B . ? LYS 121 B PRO 122 B ? PRO 122 B 1 -5.94 3 LYS 121 C . ? LYS 121 C PRO 122 C ? PRO 122 C 1 -5.97 4 LYS 121 D . ? LYS 121 D PRO 122 D ? 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AE8 ? 2 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 3 ? AG1 ? 3 ? AG2 ? 2 ? AG3 ? 3 ? AG4 ? 3 ? AG5 ? 2 ? AG6 ? 3 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 2 ? AG9 ? 3 ? AH1 ? 3 ? AH2 ? 2 ? AH3 ? 3 ? AH4 ? 3 ? AH5 ? 2 ? AH6 ? 2 ? AH7 ? 3 ? AH8 ? 2 ? AH9 ? 3 ? AI1 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA3 8 9 ? anti-parallel AA3 9 10 ? anti-parallel AA3 10 11 ? anti-parallel AA3 11 12 ? anti-parallel AA3 12 13 ? anti-parallel AA3 13 14 ? anti-parallel AA3 14 15 ? anti-parallel AA3 15 16 ? anti-parallel AA3 16 17 ? anti-parallel AA3 17 18 ? anti-parallel AA3 18 19 ? anti-parallel AA3 19 20 ? anti-parallel AA3 20 21 ? anti-parallel AA3 21 22 ? anti-parallel AA3 22 23 ? anti-parallel AA3 23 24 ? anti-parallel AA3 24 25 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH6 1 2 ? anti-parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH7 2 3 ? anti-parallel AH8 1 2 ? anti-parallel AH9 1 2 ? anti-parallel AH9 2 3 ? anti-parallel AI1 1 2 ? anti-parallel AI1 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASP A 97 ? HIS A 106 ? ASP A 97 HIS A 106 AA1 2 PHE A 192 ? SER A 203 ? PHE A 192 SER A 203 AA1 3 ILE A 123 ? PHE A 133 ? ILE A 123 PHE A 133 AA1 4 ARG A 136 ? LYS A 140 ? ARG A 136 LYS A 140 AA2 1 VAL A 116 ? HIS A 117 ? VAL A 116 HIS A 117 AA2 2 HIS A 154 ? LEU A 157 ? HIS A 154 LEU A 157 AA2 3 TRP A 146 ? GLU A 149 ? TRP A 146 GLU A 149 AA3 1 ILE A 248 ? VAL A 255 ? ILE A 248 VAL A 255 AA3 2 ILE A 258 ? THR A 264 ? ILE A 258 THR A 264 AA3 3 ILE B 248 ? VAL B 255 ? ILE B 248 VAL B 255 AA3 4 ILE B 258 ? THR B 264 ? ILE B 258 THR B 264 AA3 5 ILE C 248 ? VAL C 255 ? ILE C 248 VAL C 255 AA3 6 ILE C 258 ? THR C 264 ? ILE C 258 THR C 264 AA3 7 ILE D 248 ? VAL D 255 ? ILE D 248 VAL D 255 AA3 8 ILE D 258 ? THR D 264 ? ILE D 258 THR D 264 AA3 9 ILE E 248 ? VAL E 255 ? ILE E 248 VAL E 255 AA3 10 ILE E 258 ? THR E 264 ? ILE E 258 THR E 264 AA3 11 ILE F 248 ? VAL F 255 ? ILE F 248 VAL F 255 AA3 12 ILE F 258 ? THR F 264 ? ILE F 258 THR F 264 AA3 13 ILE G 248 ? VAL G 255 ? 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LYS B 140 ? ARG B 136 LYS B 140 AA6 1 VAL B 116 ? HIS B 117 ? VAL B 116 HIS B 117 AA6 2 HIS B 154 ? LEU B 157 ? HIS B 154 LEU B 157 AA6 3 TRP B 146 ? GLU B 149 ? TRP B 146 GLU B 149 AA7 1 MET B 299 ? LEU B 302 ? MET B 299 LEU B 302 AA7 2 ILE O 325 ? VAL O 328 ? ILE O 325 VAL O 328 AA7 3 GLY N 290 ? ARG N 295 ? GLY N 290 ARG N 295 AA7 4 ASP N 332 ? ASN N 337 ? ASP N 332 ASN N 337 AA8 1 ASP C 97 ? HIS C 106 ? ASP C 97 HIS C 106 AA8 2 PHE C 192 ? SER C 203 ? PHE C 192 SER C 203 AA8 3 ILE C 123 ? PHE C 133 ? ILE C 123 PHE C 133 AA8 4 ARG C 136 ? LYS C 140 ? ARG C 136 LYS C 140 AA9 1 VAL C 116 ? HIS C 117 ? VAL C 116 HIS C 117 AA9 2 HIS C 154 ? LEU C 157 ? HIS C 154 LEU C 157 AA9 3 TRP C 146 ? GLU C 149 ? TRP C 146 GLU C 149 AB1 1 MET C 299 ? LEU C 302 ? MET C 299 LEU C 302 AB1 2 ILE P 325 ? VAL P 328 ? ILE P 325 VAL P 328 AB1 3 GLY O 290 ? ARG O 295 ? GLY O 290 ARG O 295 AB1 4 ASP O 332 ? ASN O 337 ? ASP O 332 ASN O 337 AB2 1 ASP D 97 ? HIS D 106 ? ASP D 97 HIS D 106 AB2 2 PHE D 192 ? SER D 203 ? PHE D 192 SER D 203 AB2 3 ILE D 123 ? PHE D 133 ? ILE D 123 PHE D 133 AB2 4 ARG D 136 ? LYS D 140 ? ARG D 136 LYS D 140 AB3 1 VAL D 116 ? HIS D 117 ? VAL D 116 HIS D 117 AB3 2 HIS D 154 ? LEU D 157 ? HIS D 154 LEU D 157 AB3 3 TRP D 146 ? GLU D 149 ? TRP D 146 GLU D 149 AB4 1 MET D 299 ? LEU D 302 ? MET D 299 LEU D 302 AB4 2 ILE Q 325 ? VAL Q 328 ? ILE Q 325 VAL Q 328 AB4 3 GLY P 290 ? ARG P 295 ? GLY P 290 ARG P 295 AB4 4 ASP P 332 ? ASN P 337 ? ASP P 332 ASN P 337 AB5 1 ASP E 97 ? HIS E 106 ? ASP E 97 HIS E 106 AB5 2 PHE E 192 ? SER E 203 ? PHE E 192 SER E 203 AB5 3 ILE E 123 ? PHE E 133 ? ILE E 123 PHE E 133 AB5 4 ARG E 136 ? LYS E 140 ? ARG E 136 LYS E 140 AB6 1 VAL E 116 ? HIS E 117 ? VAL E 116 HIS E 117 AB6 2 HIS E 154 ? LEU E 157 ? HIS E 154 LEU E 157 AB6 3 TRP E 146 ? GLU E 149 ? TRP E 146 GLU E 149 AB7 1 MET E 299 ? LEU E 302 ? MET E 299 LEU E 302 AB7 2 ILE R 325 ? VAL R 328 ? ILE R 325 VAL R 328 AB7 3 GLY Q 290 ? ARG Q 295 ? GLY Q 290 ARG Q 295 AB7 4 ASP Q 332 ? ASN Q 337 ? ASP Q 332 ASN Q 337 AB8 1 ASP F 97 ? HIS F 106 ? ASP F 97 HIS F 106 AB8 2 PHE F 192 ? SER F 203 ? PHE F 192 SER F 203 AB8 3 ILE F 123 ? PHE F 133 ? ILE F 123 PHE F 133 AB8 4 ARG F 136 ? LYS F 140 ? ARG F 136 LYS F 140 AB9 1 VAL F 116 ? HIS F 117 ? VAL F 116 HIS F 117 AB9 2 HIS F 154 ? LEU F 157 ? HIS F 154 LEU F 157 AB9 3 TRP F 146 ? GLU F 149 ? TRP F 146 GLU F 149 AC1 1 MET F 299 ? LEU F 302 ? MET F 299 LEU F 302 AC1 2 ILE S 325 ? VAL S 328 ? ILE S 325 VAL S 328 AC1 3 GLY R 290 ? ARG R 295 ? GLY R 290 ARG R 295 AC1 4 ASP R 332 ? ASN R 337 ? ASP R 332 ASN R 337 AC2 1 ASP G 97 ? HIS G 106 ? ASP G 97 HIS G 106 AC2 2 PHE G 192 ? SER G 203 ? PHE G 192 SER G 203 AC2 3 ILE G 123 ? PHE G 133 ? ILE G 123 PHE G 133 AC2 4 ARG G 136 ? LYS G 140 ? ARG G 136 LYS G 140 AC3 1 VAL G 116 ? HIS G 117 ? VAL G 116 HIS G 117 AC3 2 HIS G 154 ? LEU G 157 ? HIS G 154 LEU G 157 AC3 3 TRP G 146 ? GLU G 149 ? TRP G 146 GLU G 149 AC4 1 MET G 299 ? LEU G 302 ? MET G 299 LEU G 302 AC4 2 ILE T 325 ? 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