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D PRO 1073 D PRO 1073 ? ? # _struct_ncs_ens.id ens_1 _struct_ncs_ens.details ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 # _struct.entry_id 8QJA _struct.title 'T6SS-linked Rhs repeat protein - Advenella mimigardefordensis VgrG-Rhs core' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8QJA _struct_keywords.text 'Rhs, T6SS, VgrG-Rhs, toxin cannister, Rhs-repeat, CELL INVASION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL INVASION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code W0PIA9_ADVMD _struct_ref.pdbx_db_accession W0PIA9 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MNRTVNATTPLGDKLKFKSLKGHEQLSDLFEWTVEFVSDSPGLVLEDLLGKTISLEVETSAAPRYMHGVITAFKLVHRET QTRRYYIYEATVRPWLWYSTQVTDNRIFQDQTAVQIITQVLQAYDYPIENRLVGQYRKWGYSVQFQESDFNFISRLMEHE GIYYWFRHEKDQHVLVLMDDAHSHAPLPVMPDIPFYPDDTRSVPLEEYIRDWQIAGELTPTTYSTMDYDFQKPQAEMSAR RWVKNQNTQGLDLDWYDPMGGYVDSADSDHYARVHLESMQCLQEQAWAVSNVRNLAPGYTFSLKYYPNSEENKSYLILRA EYDFRDPSYASAGGVQENATFVIRSQHIPASVQFRAPRSTPAPRMSGPQTATVVGPDGQEIWTDKYGRIKVQFHWDRQGA MDENSSCWLRVSSPWAGGGFGGVQIPRVREEVVVDFINGDVDRPIAVGRVYNASNMPPVSLPENATQSGFLTRTKNGTPE NANKMLFEDSQGNELLSMVAEKDMNTHVKNNQQHDVVGNAVSSIGGLRSHTAHSTSSITMASGAVKSYQSNHNRTVQASL DDSVGGNLEQTLSDGVDETITGAHSHTVSGAASHQLLGLHVNTTTQDVETVNGTVTETVSADETTNVTSSSELEAADITL ETPSLYKESTKQDININAGGSLDIQSTGPGIIQTPTDIEKESPANLEAAVMLDNNTVNREDKYILKLNLDAMSDVMVSGA KTDRNIADLAFYGMGGTMQLANVGIYGASIQMGSSDQKMGLASLSITGLELDKGFKIKTMGAGGRSGYKGKHRAAGGGRG PRGGKGGRHRAGNKGDPKKPHADCKECRGRVGGSIGLDVGDERFSHLDFVLPGVFPLEWNRTYRSNMTAKDGQGELGPRW ITAFTLVVLPLETGGYEYISEVGRAVSVIELEPGQEWYDRTEELIWRRPDVDTLEVSQKYQRTETFERSGDVFRLKTIAD RAGNQAQLIYDAENGFLVRVETAIQTVHLDHDAHGRITTIWHEVTGDDGTPLRRTLARYQYDEAHDLVAAVDQYERTHTY AYQNHLITRYSDKTGRGINLEWDGDHPQAKCVREYRDDGSNLLRFRWDESESKTYVTDALSATTVYTFDAHNYIIHIDFA DGTRQSRIRDEFHNIVEVRYPDDSFEKYEYDEFDNILKLTRADHTTVGWEYDQYSQITKIVDPGGNIWTRDYDQFGNMIR ETDPKGHTSEFQYTAEGLLIQSVNPAGGVSTLSYNPAGLLIRYSDCSNKTRRWEYDLLGRTVKQTDPCGNAESYEYNRYG FINEVRRPDGSVLTLDFDEEGRLLSFIDPIDNLTVYAYDGAGRLARKTDPLKQDFHYNYDKKGRLASLQDENGAQFTFQF DPVDRLIRTVGFDGKVKKYNYDKPTGLLFSMEDADRETHFEYDVMGQLLKRRAGHLVDSFEYDISNRIIRAHNEYCDQHF EYDVLNNPIRETHIYNAFGQNREYVWENEFDELSNRLTTRRPSGEKVSWLRYGAGHVHGILLDDQEVLSFERDNSHRAVR KRQSNSLLAVTNYDVMGRVKEQKLNLAQGNRTNLRSRQYAYGLDGSLVAIEDSRHGTTTYRYDALDRLVSATAFNETELF AFDPASNLVDRDKTERSKPANTFPKNVSKVLGNILKRCAGMHFEYDAQGNLIRKRKPDSLQEFEWDEFGRLRKTVNTDLN SKHVSEAEYIYDTFDRRIGKVNQQETSGAAVTFYGWDGHHLAFEESTVGDAVDKTHYLYEENSFVPLIQYQYSADNTIAE GRNHLSVSHYQCDHIGTPQLLTDDNGHIVWEGRYSALGKQLDSIGGDAGVAGGQNNLCYQGQYYDRESGLHYNRFRYYDP DIGRFIQQDPIGLFGDSNFYTYAPNTANWIDPFGL ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QJA A 5 ? 1879 ? W0PIA9 1 ? 1875 ? -798 1076 2 1 8QJA B 5 ? 1879 ? W0PIA9 1 ? 1875 ? -798 1076 3 1 8QJA C 5 ? 1879 ? W0PIA9 1 ? 1875 ? -798 1076 4 1 8QJA D 5 ? 1879 ? W0PIA9 1 ? 1875 ? -798 1076 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8QJA GLY A 1 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -802 1 1 8QJA SER A 2 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -801 2 1 8QJA GLY A 3 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -800 3 1 8QJA SER A 4 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -799 4 2 8QJA GLY B 1 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -802 5 2 8QJA SER B 2 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -801 6 2 8QJA GLY B 3 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -800 7 2 8QJA SER B 4 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -799 8 3 8QJA GLY C 1 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -802 9 3 8QJA SER C 2 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -801 10 3 8QJA GLY C 3 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -800 11 3 8QJA SER C 4 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -799 12 4 8QJA GLY D 1 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -802 13 4 8QJA SER D 2 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -801 14 4 8QJA GLY D 3 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -800 15 4 8QJA SER D 4 ? UNP W0PIA9 ? ? 'expression tag' -799 16 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? monomeric 1 2 author_defined_assembly ? monomeric 1 3 author_defined_assembly ? monomeric 1 4 author_defined_assembly ? monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A 2 1 B 3 1 C 4 1 D # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 1166 ? 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AC3 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA3 8 9 ? anti-parallel AA3 9 10 ? anti-parallel AA3 10 11 ? anti-parallel AA3 11 12 ? anti-parallel AA3 12 13 ? anti-parallel AA3 13 14 ? anti-parallel AA3 14 15 ? anti-parallel AA3 15 16 ? anti-parallel AA3 16 17 ? anti-parallel AA3 17 18 ? anti-parallel AA3 18 19 ? anti-parallel AA3 19 20 ? anti-parallel AA3 20 21 ? anti-parallel AA3 21 22 ? anti-parallel AA3 22 23 ? anti-parallel AA3 23 24 ? anti-parallel AA3 24 25 ? anti-parallel AA3 25 26 ? anti-parallel AA3 26 27 ? anti-parallel AA3 27 28 ? anti-parallel AA3 28 29 ? anti-parallel AA3 29 30 ? anti-parallel AA3 30 31 ? anti-parallel AA3 31 32 ? anti-parallel AA3 32 33 ? anti-parallel AA3 33 34 ? anti-parallel AA3 34 35 ? anti-parallel AA3 35 36 ? anti-parallel AA3 36 37 ? anti-parallel AA3 37 38 ? anti-parallel AA3 38 39 ? anti-parallel AA3 39 40 ? anti-parallel AA3 40 41 ? anti-parallel AA3 41 42 ? anti-parallel AA3 42 43 ? anti-parallel AA3 43 44 ? anti-parallel AA3 44 45 ? anti-parallel AA3 45 46 ? anti-parallel AA3 46 47 ? anti-parallel AA3 47 48 ? anti-parallel AA3 48 49 ? anti-parallel AA3 49 50 ? anti-parallel AA3 50 51 ? anti-parallel AA3 51 52 ? anti-parallel AA3 52 53 ? anti-parallel AA3 53 54 ? anti-parallel AA3 54 55 ? anti-parallel AA3 55 56 ? anti-parallel AA3 56 57 ? anti-parallel AA3 57 58 ? anti-parallel AA3 58 59 ? anti-parallel AA3 59 60 ? anti-parallel AA3 60 61 ? anti-parallel AA3 61 62 ? anti-parallel AA3 62 63 ? anti-parallel AA3 63 64 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA4 8 9 ? anti-parallel AA4 9 10 ? anti-parallel AA4 10 11 ? anti-parallel AA4 11 12 ? anti-parallel AA4 12 13 ? anti-parallel AA4 13 14 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA8 7 8 ? anti-parallel AA8 8 9 ? anti-parallel AA8 9 10 ? anti-parallel AA8 10 11 ? anti-parallel AA8 11 12 ? anti-parallel AA8 12 13 ? anti-parallel AA8 13 14 ? anti-parallel AA8 14 15 ? anti-parallel AA8 15 16 ? anti-parallel AA8 16 17 ? anti-parallel AA8 17 18 ? anti-parallel AA8 18 19 ? anti-parallel AA8 19 20 ? anti-parallel AA8 20 21 ? anti-parallel AA8 21 22 ? anti-parallel AA8 22 23 ? anti-parallel AA8 23 24 ? anti-parallel AA8 24 25 ? anti-parallel AA8 25 26 ? anti-parallel AA8 26 27 ? anti-parallel AA8 27 28 ? anti-parallel AA8 28 29 ? anti-parallel AA8 29 30 ? anti-parallel AA8 30 31 ? anti-parallel AA8 31 32 ? anti-parallel AA8 32 33 ? anti-parallel AA8 33 34 ? anti-parallel AA8 34 35 ? anti-parallel AA8 35 36 ? anti-parallel AA8 36 37 ? anti-parallel AA8 37 38 ? anti-parallel AA8 38 39 ? anti-parallel AA8 39 40 ? anti-parallel AA8 40 41 ? anti-parallel AA8 41 42 ? anti-parallel AA8 42 43 ? anti-parallel AA8 43 44 ? anti-parallel AA8 44 45 ? anti-parallel AA8 45 46 ? anti-parallel AA8 46 47 ? anti-parallel AA8 47 48 ? anti-parallel AA8 48 49 ? anti-parallel AA8 49 50 ? anti-parallel AA8 50 51 ? anti-parallel AA8 51 52 ? anti-parallel AA8 52 53 ? anti-parallel AA8 53 54 ? anti-parallel AA8 54 55 ? anti-parallel AA8 55 56 ? anti-parallel AA8 56 57 ? anti-parallel AA8 57 58 ? 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