data_8QN4 # _entry.id 8QN4 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.406 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8QN4 pdb_00008qn4 10.2210/pdb8qn4/pdb WWPDB D_1292133548 ? ? EMDB EMD-18507 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2024-10-02 ? 2 'EM metadata' 1 0 2024-10-02 ? 3 'Additional map' 1 0 2024-10-02 ? 4 'Half map' 1 0 2024-10-02 1 5 'Half map' 1 0 2024-10-02 2 6 Image 1 0 2024-10-02 ? 7 'Primary map' 1 0 2024-10-02 ? 8 'Structure model' 1 1 2024-10-23 ? 9 'Additional map' 1 0 2024-10-02 ? 10 'Half map' 1 0 2024-10-02 1 11 'Half map' 1 0 2024-10-02 2 12 Image 1 0 2024-10-02 ? 13 'Primary map' 1 0 2024-10-02 ? 14 'Structure model' 2 0 2025-10-01 ? 15 'EM metadata' 1 1 2025-10-01 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 'Additional map' repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? 8 9 'Additional map' repository 'Initial release' ? ? 9 10 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 10 11 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 11 12 Image repository 'Initial release' ? ? 12 13 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? 13 14 'Structure model' author 'Coordinate replacement' 'Model completeness' ;In the updated model, BamA POTRA domains 1 and 2 were excluded due to the absence of interpretable density in the cryo-EM map, improving model completeness and accuracy. The updated model exhibits improved map-model fit, as evidenced by increased atom inclusion scores for both all atoms (from 0.708 to 0.749) and backbone atoms (from 0.832 to 0.879). Minor geometry variations reflect local adjustments for density-guided refinement. The revised model better represents the interpretable experimental data and has been validated accordingly. The entry title has also been revised to align with the nomenclature used in the accompanying manuscript. ; # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 8 'Structure model' 'Data collection' 2 8 'Structure model' 'Structure summary' 3 14 'Structure model' Advisory 4 14 'Structure model' 'Atomic model' 5 14 'Structure model' 'Data collection' 6 14 'Structure model' 'Derived calculations' 7 14 'Structure model' 'Structure summary' 8 15 'EM metadata' 'Data collection' 9 15 'EM metadata' 'Data processing' 10 15 'EM metadata' 'Experimental summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 8 'Structure model' em_admin 2 8 'Structure model' pdbx_entry_details 3 8 'Structure model' pdbx_modification_feature 4 14 'Structure model' atom_site 5 14 'Structure model' em_admin 6 14 'Structure model' em_imaging 7 14 'Structure model' em_software 8 14 'Structure model' pdbx_contact_author 9 14 'Structure model' pdbx_poly_seq_scheme 10 14 'Structure model' pdbx_struct_sheet_hbond 11 14 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_residues 12 14 'Structure model' pdbx_validate_peptide_omega 13 14 'Structure model' pdbx_validate_planes 14 14 'Structure model' pdbx_validate_rmsd_angle 15 14 'Structure model' pdbx_validate_torsion 16 14 'Structure model' struct 17 14 'Structure model' struct_conf 18 14 'Structure model' struct_sheet 19 14 'Structure model' struct_sheet_order 20 14 'Structure model' struct_sheet_range 21 15 'EM metadata' em_admin 22 15 'EM metadata' em_imaging 23 15 'EM metadata' em_software # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 8 'Structure model' '_em_admin.last_update' 2 14 'Structure model' '_em_admin.last_update' 3 14 'Structure model' '_em_admin.title' 4 14 'Structure model' '_em_imaging.microscope_model' 5 14 'Structure model' '_pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id' 6 14 'Structure model' '_pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num' 7 14 'Structure model' '_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id' 8 14 'Structure model' '_struct.title' 9 15 'EM metadata' '_em_admin.last_update' 10 15 'EM metadata' '_em_admin.title' 11 15 'EM metadata' '_em_imaging.microscope_model' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8QN4 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-09-25 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of BAM-EspP complex in the non-closing EspP state' _pdbx_database_related.db_id EMD-18507 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email rhzhou@zju.edu.cn _pdbx_contact_author.name_first Ruhong _pdbx_contact_author.name_last Zhou _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-8624-5591 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Xie, T.' 1 0009-0003-2716-6094 'Pang, J.' 2 ? 'Shen, C.' 3 ? 'Chang, S.' 4 ? 'Tang, X.' 5 ? 'Zhang, X.' 6 ? 'Dong, H.' 7 ? 'Zhou, R.' 8 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Dynamic topology-mediated maturation of beta-barrel proteins in BAM-catalyzed folding' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Xie, T.' 1 0009-0003-2716-6094 primary 'Chan, K.C.' 2 ? primary 'Pang, J.' 3 ? primary 'Shen, C.' 4 ? primary 'Chang, S.' 5 ? primary 'Buratto, D.' 6 ? primary 'Tang, X.' 7 ? primary 'Zhang, X.' 8 ? primary 'Dong, H.' 9 ? primary 'Zhou, R.' 10 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Outer membrane protein assembly factor BamA' 90689.477 1 ? 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N1293C ? ? # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name Omp85 # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAMKKLLIASLLFSSATVYGAEGFVVKDIHFEGLQRVAVGAALLSMPVRTGDTVNDEDISNTIRALFATGNFEDVRVLRD GDTLLVQVKERPTIASITFSGNKSVKDDMLKQNLEASGVRVGESLDRTTIADIEKGLEDFYYSVGKYSASVKAVVTPLPR NRVDLKLVFQEGVSAEIQQINIVGNHAFTTDELISHFQLRDEVPWWNVVGDRKYQKQKLAGDLETLRSYYLDRGYARFNI DSTQVSLTPDKKGIYVTVNITEGDQYKLSGVEVSGNLAGHSAEIEQLTKIEPGELYNGTKVTKMEDDIKKLLGRYGYAYP RVQSMPEINDADKTVKLRVNVDAGNRFYVRKIRFEGNDTSKDAVLRREMRQMEGAWLGSDLVDQGKERLNRLGFFETVDT DTQRVPGSPDQVDVVYKVKERNTGSFNFGICYGTESGVSFQAGVQQDNWLGTGYAVGINGTKNDYQTYAELSVTNPYFTV DGVSLGGRLFYNDFQADDADLSDYTNKSYGTDVTLGFPINEYNSLRAGLGYVHNSLSNMQPQVAMWRYLYSMGEHPSTSD QDNSFKTDDFTFNYGWTYNKLDRGYFPTDGSRVNLTGKVTIPGSDNEYYKVTLDTATYVPIDDDHKWVVLGRTRWGYGDG 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? 2 'polypeptide(L)' no no ;MQLRKLLLPGLLSVTLLSGCSLFNSEEDVVKMSPLPTVENQFTPTTAWSTSVGSGIGNFYSNLHPALADNVVYAADRAGL VKALNADDGKEIWSVSLAEKDGWFSKEPALLSGGVTVSGGHVYIGSEKAQVYALNTSDGTVAWQTKVAGEALSRPVVSDG LVLIHTSNGQLQALNEADGAVKWTVNLDMPSLSLRGESAPTTAFGAAVVGGDNGRVSAVLMEQGQMIWQQRISQATGSTE IDRLSDVDTTPVVVNGVVFALAYNGNLTALDLRSGQIMWKRELGSVNDFIVDGNRIYLVDQNDRVMALTIDGGVTLWTQS DLLHRLLTSPVLYNGNLVVGDSEGYLHWINVEDGRFVAQQKVDSSGFQTEPVAADGKLLIQAKDGTVYSITR ; ;MQLRKLLLPGLLSVTLLSGCSLFNSEEDVVKMSPLPTVENQFTPTTAWSTSVGSGIGNFYSNLHPALADNVVYAADRAGL VKALNADDGKEIWSVSLAEKDGWFSKEPALLSGGVTVSGGHVYIGSEKAQVYALNTSDGTVAWQTKVAGEALSRPVVSDG LVLIHTSNGQLQALNEADGAVKWTVNLDMPSLSLRGESAPTTAFGAAVVGGDNGRVSAVLMEQGQMIWQQRISQATGSTE IDRLSDVDTTPVVVNGVVFALAYNGNLTALDLRSGQIMWKRELGSVNDFIVDGNRIYLVDQNDRVMALTIDGGVTLWTQS DLLHRLLTSPVLYNGNLVVGDSEGYLHWINVEDGRFVAQQKVDSSGFQTEPVAADGKLLIQAKDGTVYSITR ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MAYSVQKSRLAKVAGVSLVLLLAACSSDSRYKRQVSGDEAYLEAAPLAELHAPAGMILPVTSGDYAIPVTNGSGAVGKAL DIRPPAQPLALVSGARTQFTGDTASLLVENGRGNTLWPQVVSVLQAKNYTITQRDDAGQTLTTDWVQWNRLDEDEQYRGR YQISVKPQGYQQAVTVKLLNLEQAGKPVADAASMQRYSTEMMNVISAGLDKSATDAANAAQNRASTTMDVQSAADDTGLP MLVVRGPFNVVWQRLPAALEKVGMKVTDSTRSQGNMAVTYKPLSDSDWQELGASDPGLASGDYKLQVGDLDNRSSLQFID PKGHTLTQSQNDALVAVFQAAFSK ; ;MAYSVQKSRLAKVAGVSLVLLLAACSSDSRYKRQVSGDEAYLEAAPLAELHAPAGMILPVTSGDYAIPVTNGSGAVGKAL DIRPPAQPLALVSGARTQFTGDTASLLVENGRGNTLWPQVVSVLQAKNYTITQRDDAGQTLTTDWVQWNRLDEDEQYRGR YQISVKPQGYQQAVTVKLLNLEQAGKPVADAASMQRYSTEMMNVISAGLDKSATDAANAAQNRASTTMDVQSAADDTGLP MLVVRGPFNVVWQRLPAALEKVGMKVTDSTRSQGNMAVTYKPLSDSDWQELGASDPGLASGDYKLQVGDLDNRSSLQFID PKGHTLTQSQNDALVAVFQAAFSK ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTRMKYLVAAATLSLFLAGCSGSKEEVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYY KNADLPLAQAAIDRFIRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT TDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKIIAA NSSNT ; ;MTRMKYLVAAATLSLFLAGCSGSKEEVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYY KNADLPLAQAAIDRFIRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT TDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKIIAA NSSNT ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MRCKTLTAAAAVLLMLTAGCSTLERVVYRPDINQGNYLTANDVSKIRVGMTQQQVAYALGTPLMSDPFGTNTWFYVFRQQ PGHEGVTQQTLTLTFNSSGVLTNIDNKPALSGNGGHHHHHHHH ; ;MRCKTLTAAAAVLLMLTAGCSTLERVVYRPDINQGNYLTANDVSKIRVGMTQQQVAYALGTPLMSDPFGTNTWFYVFRQQ PGHEGVTQQTLTLTFNSSGVLTNIDNKPALSGNGGHHHHHHHH ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;NIELVSAPKDTNENVFKASKQTIGFSDVTPVITTRETDDKITWSLTGYNTVANKEATRNAAALFSVDYKAFLNEVNNLNK RMGDLRDINGEAGAWARIMSGTGSASGGFSDNYTHVQVGVDKKHELDGLDLFTGFTVTHTDSSASADVFSGKTKSVGAGL YASAMFDSGAYIDLIGKYVHHDNEYTATFAGLGTRDYSTHSWYAGAEAGYRYHVTEDAWIEPQAELVYGSVSGKQFAWKD QGMHLSMKDKDYNPLIGRTGVDVGKSFSGKDWKVTARAGLGYQFDLLANGETVLRDASGEKRIKGEKDSRMLMSVGLNAE IRDNVRFGLEFEKSAFGKYNVDNAVCANFRYSF ; ;NIELVSAPKDTNENVFKASKQTIGFSDVTPVITTRETDDKITWSLTGYNTVANKEATRNAAALFSVDYKAFLNEVNNLNK RMGDLRDINGEAGAWARIMSGTGSASGGFSDNYTHVQVGVDKKHELDGLDLFTGFTVTHTDSSASADVFSGKTKSVGAGL YASAMFDSGAYIDLIGKYVHHDNEYTATFAGLGTRDYSTHSWYAGAEAGYRYHVTEDAWIEPQAELVYGSVSGKQFAWKD QGMHLSMKDKDYNPLIGRTGVDVGKSFSGKDWKVTARAGLGYQFDLLANGETVLRDASGEKRIKGEKDSRMLMSVGLNAE IRDNVRFGLEFEKSAFGKYNVDNAVCANFRYSF ; F ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 MET n 1 4 LYS n 1 5 LYS n 1 6 LEU n 1 7 LEU n 1 8 ILE n 1 9 ALA n 1 10 SER n 1 11 LEU n 1 12 LEU n 1 13 PHE n 1 14 SER n 1 15 SER n 1 16 ALA n 1 17 THR n 1 18 VAL n 1 19 TYR n 1 20 GLY n 1 21 ALA n 1 22 GLU n 1 23 GLY n 1 24 PHE n 1 25 VAL n 1 26 VAL n 1 27 LYS n 1 28 ASP n 1 29 ILE n 1 30 HIS n 1 31 PHE n 1 32 GLU n 1 33 GLY n 1 34 LEU n 1 35 GLN n 1 36 ARG n 1 37 VAL n 1 38 ALA n 1 39 VAL n 1 40 GLY n 1 41 ALA n 1 42 ALA n 1 43 LEU n 1 44 LEU n 1 45 SER n 1 46 MET n 1 47 PRO n 1 48 VAL n 1 49 ARG n 1 50 THR n 1 51 GLY n 1 52 ASP n 1 53 THR n 1 54 VAL n 1 55 ASN n 1 56 ASP n 1 57 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F N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP BAMA_ECOLI P0A940 ? 1 ;MAMKKLLIASLLFSSATVYGAEGFVVKDIHFEGLQRVAVGAALLSMPVRTGDTVNDEDISNTIRALFATGNFEDVRVLRD GDTLLVQVKERPTIASITFSGNKSVKDDMLKQNLEASGVRVGESLDRTTIADIEKGLEDFYYSVGKYSASVKAVVTPLPR NRVDLKLVFQEGVSAEIQQINIVGNHAFTTDELISHFQLRDEVPWWNVVGDRKYQKQKLAGDLETLRSYYLDRGYARFNI DSTQVSLTPDKKGIYVTVNITEGDQYKLSGVEVSGNLAGHSAEIEQLTKIEPGELYNGTKVTKMEDDIKKLLGRYGYAYP RVQSMPEINDADKTVKLRVNVDAGNRFYVRKIRFEGNDTSKDAVLRREMRQMEGAWLGSDLVDQGKERLNRLGFFETVDT DTQRVPGSPDQVDVVYKVKERNTGSFNFGIGYGTESGVSFQAGVQQDNWLGTGYAVGINGTKNDYQTYAELSVTNPYFTV DGVSLGGRLFYNDFQADDADLSDYTNKSYGTDVTLGFPINEYNSLRAGLGYVHNSLSNMQPQVAMWRYLYSMGEHPSTSD QDNSFKTDDFTFNYGWTYNKLDRGYFPTDGSRVNLTGKVTIPGSDNEYYKVTLDTATYVPIDDDHKWVVLGRTRWGYGDG LGGKEMPFYENFYAGGSSTVRGFQSNTIGPKAVYFPHQASNYDPDYDYECATQDGAKDLCKSDDAVGGNAMAVASLEFIT PTPFISDKYANSVRTSFFWDMGTVWDTNWDSSQYSGYPDYSDPSNIRMSAGIALQWMSPLGPLVFSYAQPFKKYDGDKAE QFQFNIGKTW ; 1 2 UNP BAMB_ECOLI P77774 ? 2 ;MQLRKLLLPGLLSVTLLSGCSLFNSEEDVVKMSPLPTVENQFTPTTAWSTSVGSGIGNFYSNLHPALADNVVYAADRAGL VKALNADDGKEIWSVSLAEKDGWFSKEPALLSGGVTVSGGHVYIGSEKAQVYALNTSDGTVAWQTKVAGEALSRPVVSDG LVLIHTSNGQLQALNEADGAVKWTVNLDMPSLSLRGESAPTTAFGAAVVGGDNGRVSAVLMEQGQMIWQQRISQATGSTE IDRLSDVDTTPVVVNGVVFALAYNGNLTALDLRSGQIMWKRELGSVNDFIVDGNRIYLVDQNDRVMALTIDGGVTLWTQS DLLHRLLTSPVLYNGNLVVGDSEGYLHWINVEDGRFVAQQKVDSSGFQTEPVAADGKLLIQAKDGTVYSITR ; 1 3 UNP BAMC_ECOLI P0A903 ? 3 ;MAYSVQKSRLAKVAGVSLVLLLAACSSDSRYKRQVSGDEAYLEAAPLAELHAPAGMILPVTSGDYAIPVTNGSGAVGKAL DIRPPAQPLALVSGARTQFTGDTASLLVENGRGNTLWPQVVSVLQAKNYTITQRDDAGQTLTTDWVQWNRLDEDEQYRGR YQISVKPQGYQQAVTVKLLNLEQAGKPVADAASMQRYSTEMMNVISAGLDKSATDAANAAQNRASTTMDVQSAADDTGLP MLVVRGPFNVVWQRLPAALEKVGMKVTDSTRSQGNMAVTYKPLSDSDWQELGASDPGLASGDYKLQVGDLDNRSSLQFID PKGHTLTQSQNDALVAVFQAAFSK ; 1 4 UNP BAMD_ECOLI P0AC02 ? 4 ;MTRMKYLVAAATLSLFLAGCSGSKEEVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYY KNADLPLAQAAIDRFIRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT TDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKIIAA NSSNT ; 1 5 UNP BAME_ECOLI P0A937 ? 5 ;MRCKTLTAAAAVLLMLTAGCSTLERVVYRPDINQGNYLTANDVSKIRVGMTQQQVAYALGTPLMSDPFGTNTWFYVFRQQ PGHEGVTQQTLTLTFNSSGVLTNIDNKPALSGN ; 1 6 UNP C1J8F9_ECOLX C1J8F9 ? 6 ;NIELVSAPKDTNENVFKASKQTIGFSDVTPVITTRETDDKITWSLTGYNTVANKEATRNAAALFSVDYKAFLNEVNNLNK RMGDLRDINGEAGAWARIMSGTGSASGGFSDNYTHVQVGVDKKHELDGLDLFTGFTVTHTDSSASADVFSGKTKSVGAGL YASAMFDSGAYIDLIGKYVHHDNEYTATFAGLGTRDYSTHSWYAGAEAGYRYHVTEDAWIEPQAELVYGSVSGKQFAWKD QGMHLSMKDKDYNPLIGRTGVDVGKSFSGKDWKVTARAGLGYQFDLLANGETVLRDASGEKRIKGEKDSRMLMSVGLNAE IRDNVRFGLEFEKSAFGKYNVDNAVNANFRYSF ; 948 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QN4 A 1 ? 810 ? P0A940 1 ? 810 ? 1 810 2 2 8QN4 B 1 ? 392 ? P77774 1 ? 392 ? 1 392 3 3 8QN4 C 1 ? 344 ? P0A903 1 ? 344 ? 1 344 4 4 8QN4 D 1 ? 245 ? P0AC02 1 ? 245 ? 1 245 5 5 8QN4 E 1 ? 113 ? P0A937 1 ? 113 ? 1 113 6 6 8QN4 F 1 ? 353 ? C1J8F9 948 ? 1300 ? 948 1300 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8QN4 CYS A 431 ? UNP P0A940 GLY 431 'engineered mutation' 431 1 5 8QN4 GLY E 114 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 114 2 5 8QN4 GLY E 115 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 115 3 5 8QN4 HIS E 116 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 116 4 5 8QN4 HIS E 117 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 117 5 5 8QN4 HIS E 118 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 118 6 5 8QN4 HIS E 119 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 119 7 5 8QN4 HIS E 120 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 120 8 5 8QN4 HIS E 121 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 121 9 5 8QN4 HIS E 122 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 122 10 5 8QN4 HIS E 123 ? UNP P0A937 ? ? 'expression tag' 123 11 6 8QN4 CYS F 346 ? UNP C1J8F9 ASN 1293 'engineered mutation' 1293 12 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 190 ? SER A 195 ? THR A 190 SER A 195 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 GLN A 215 ? GLY A 234 ? GLN A 215 GLY A 234 1 ? 20 HELX_P HELX_P3 AA3 HIS A 280 ? GLU A 285 ? HIS A 280 GLU A 285 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 297 ? TYR A 315 ? ASN A 297 TYR A 315 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS A 361 ? GLU A 368 ? LYS A 361 GLU A 368 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 378 ? ASN A 390 ? GLY A 378 ASN A 390 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU A 450 ? THR A 452 ? LEU A 450 THR A 452 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN A 542 ? GLY A 553 ? GLN A 542 GLY A 553 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 VAL C 76 ? LEU C 80 ? VAL C 76 LEU C 80 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO D 32 ? ASP D 45 ? PRO D 32 ASP D 45 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA D 51 ? TYR D 62 ? ALA D 51 TYR D 62 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 GLN D 69 ? ALA D 83 ? GLN D 69 ALA D 83 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP D 84 ? ASN D 99 ? ASP D 84 ASN D 99 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN D 104 ? ASP D 121 ? ASN D 104 ASP D 121 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 AB6 GLN D 138 ? TYR D 154 ? GLN D 138 TYR D 154 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 GLN D 158 ? THR D 186 ? GLN D 158 THR D 186 1 ? 29 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA D 190 ? TYR D 205 ? ALA D 190 TYR D 205 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 AB9 THR D 208 ? MET D 225 ? THR D 208 MET D 225 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN D 228 ? ALA D 240 ? ASN D 228 ALA D 240 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 THR E 51 ? LEU E 59 ? THR E 51 LEU E 59 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 SER F 65 ? ASP F 87 ? SER F 1012 ASP F 1034 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 431 SG ? ? ? 1_555 F CYS 346 SG ? ? A CYS 431 F CYS 1293 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 690 SG ? ? ? 1_555 A CYS 700 SG ? ? A CYS 690 A CYS 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 431 ? CYS F 346 ? CYS A 431 ? 1_555 CYS F 1293 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS A 690 ? CYS A 700 ? CYS A 690 ? 1_555 CYS A 700 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 28 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA4 8 9 ? anti-parallel AA4 9 10 ? anti-parallel AA4 10 11 ? anti-parallel AA4 11 12 ? anti-parallel AA4 12 13 ? anti-parallel AA4 13 14 ? anti-parallel AA4 14 15 ? anti-parallel AA4 15 16 ? anti-parallel AA4 16 17 ? anti-parallel AA4 17 18 ? anti-parallel AA4 18 19 ? anti-parallel AA4 19 20 ? anti-parallel AA4 20 21 ? anti-parallel AA4 21 22 ? anti-parallel AA4 22 23 ? anti-parallel AA4 23 24 ? anti-parallel AA4 24 25 ? anti-parallel AA4 25 26 ? anti-parallel AA4 26 27 ? anti-parallel AA4 27 28 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 177 ? 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ASN A 523 SER A 537 AA4 11 THR A 505 ? PRO A 518 ? THR A 505 PRO A 518 AA4 12 SER A 484 ? PHE A 494 ? SER A 484 PHE A 494 AA4 13 GLN A 466 ? THR A 474 ? GLN A 466 THR A 474 AA4 14 TYR A 454 ? LYS A 462 ? TYR A 454 LYS A 462 AA4 15 VAL A 438 ? TRP A 449 ? VAL A 438 TRP A 449 AA4 16 SER A 425 ? TYR A 432 ? SER A 425 TYR A 432 AA4 17 ALA F 344 ? PHE F 349 ? ALA F 1291 PHE F 1296 AA4 18 PHE F 327 ? ALA F 335 ? PHE F 1274 ALA F 1282 AA4 19 MET F 311 ? GLU F 320 ? MET F 1258 GLU F 1267 AA4 20 LYS F 273 ? LEU F 287 ? LYS F 1220 LEU F 1234 AA4 21 LEU F 255 ? SER F 268 ? LEU F 1202 SER F 1215 AA4 22 ALA F 218 ? SER F 230 ? ALA F 1165 SER F 1177 AA4 23 TYR F 197 ? TYR F 210 ? TYR F 1144 TYR F 1157 AA4 24 ALA F 170 ? GLU F 184 ? ALA F 1117 GLU F 1131 AA4 25 LYS F 152 ? PHE F 166 ? LYS F 1099 PHE F 1113 AA4 26 LEU F 129 ? SER F 142 ? LEU F 1076 SER F 1089 AA4 27 TYR F 113 ? HIS F 124 ? TYR F 1060 HIS F 1071 AA4 28 TRP F 95 ? MET F 99 ? TRP F 1042 MET F 1046 AA5 1 LYS A 671 ? VAL A 673 ? 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