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L N N 10 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q8SDA7_BPDPK Q8SDA7 ? 1 ;MGLYAKVVDHNEVHDQFTGKRIYANDYNTSNSDEKEEFDRHFYSHFQDSEAIESSVSCDCRAIEDAHKLGVICDICNTPV VNTSSRPIEPSMWVRTPKHVRSLINPRLIIMLTGYLVTKEFDFLAYLTDTSYRYDVESIGSKETRRKVDRLLHRGFERGL NHFIDNFNEIFQFLLDANIISNNKSEFAQFVAQNKDKLFPKYLPVPSKLCFVAESTTSGTYLDKPIEAAIDATLTFASID ASSVPLSPIKAQNRTMRGLRLYGQFYEIYAKSRIAQKPGLARRHMFGARLNATARAVITSISDPHDYDELHIPWGVGCQL LKYHLTNKLKAKFNMTTREAFSFVYENVLQYNQIIADLFKELIAEAAPYKGMGCTFHRNPTLQRGSTQQFFITKVKDDIN DNSISMSVLCLKAPN ; 1 2 PDB 8QUE 8QUE ? 1 ? 436 3 PDB 8QUE 8QUE ? 2 ? 1 4 UNP Q8SD88_BPDPK Q8SD88 ? 3 ;MNLNRYKARDLLNLSYDDLWSLPSEWHLIEFDDGKTVVSVDRITKLSVLCWYPLKHYKDCPIPSDHHIDFNRILTDNPKD YLNVEGGRVTSKAMVKHLNKAIWNIYDWSGETVDPEVLSKLAIEGKNWLYNQTTVKLSEYLATLSMFDIAEVYNHPKVRE ANHNIEPTTYGIEKISYGKVKEVFNDPTQFIGNSIIEGLRSGTQKTEQLLQAFAWRGFPTDINSDIFKYPVTTGYIDGIW NLYENMIESRSGTKALLYNKELLRVTEYFNRKSQLIAQYVQRLHPGDCKTTILAEYPVTKLTLKAFKGKYYQKEDGKLDW IRGNETHLIGTKQKFRSVFGCNHPDSQGICMTCYGRLGINIPKGTNIGQVAAVSMGDKITSAVLSTKHTDASSAVEQYKL GKIESNYLRTGEIPETLYLKKELTQKDYRLVIARSEAENLADILMIDDLTAYPATSATELTSLALVYDDEVNGECGDVLT VSLYNRRASLSIEMLKHIKMVRWELDQRDNIVISLRGFDFNLPFLTLPNKHVNMYEVMKRFQSFLHSGSDSAEAGKLSTE KVGYTSKTYLKNYKSPIEALPVFATMANEKISLNISHCEILIYAMMIRSAQYRDYRLPKPGINGQFEKYNRLMQCRSLGG AMAFEKQHEPLNNPGSFLNKMRNDHPYDLLVKGGKLR ; 1 5 UNP Q8SD39_BPDPK Q8SD39 ? 4 ;MPDPFLIEKIRENTPCMNPTLANGITVEHTMTRDPNTGVNMTRRYIDSLFDISSVLFPDGFKYEGNRACTPLKHFEEITR EYNAKRIANIAPTDMYMIDLMFSYKGEMLYPRPMLLPAFKRGNMVTINGAKYIGSPVLTDVGFSVLNDSIFIPFRRTKLT FKQTDHHYMCNGQRKIMYVIWSQIHNEMAKRTKRDLDNRPHIESCLAHYFFCQFGVTQTFKQWANVDVKCGLLSDFPEEE YPREKWNIYSSATLKGKHPTGEMVLVIPRHQESIFATRLIAGFWYVVDAFPMRFTRPEYVDSTNLWRVILGHMVFGDFEH QGKVEENIDSHLHSFCNSLDEMTIEELKTVGVNVSTIWELLYEIMTSLAHHLYATDIDETSMYGKRLTVLHYLMSEFNYA VSMFGYMFQSRRDREWTVQELNEGLKRSFKLQTAIKRLTVDHGELDTMSNPNSSMLIKGTSILVTQDRAKTAKAHNKSLI NDSSRIIHASIAEVGQYKNQPKNNPDGRGRLNMYTKVGPTGLVERREEVREIIDNAQLMFRAK ; 1 6 PDB 8QUE 8QUE ? 5 ? 1 7 GB NC_004629.1 29134936 ? 6 GTACCTATATTGTAACTTTAGGCTTTTGGGAACTGTCTACATAGCAATATAGCAAATACATTCACTAAAATTACT 117654 8 PDB 8QUE 8QUE ? 7 ? 1 9 UNP Q8SD94_BPDPK Q8SD94 ? 8 ;MQIIVTGVQGTGFTEVATEHNGKRLTWTTTAYSKIRVQDQQRVFQEINDYWSGLSAEAQQHIWNCYVEIRKIMDMAMDPM RIAMSLSYYIKEMYKAMPMNSFRRWLLTIGKLYIPVDIEEVITDDSRYNRPDQTYLKHDYINLASVSLALRPLVPIWGEF IDQGTSQEMHKECEVISLISDCEVNHWPVDEISIDGTPVETAYDKLSAYVKFCVEDEAPTLANLYRGMSSAEVPDILQAK VMVRRLTILPLNDATSHSIVSNMFRYVKSNLNPAERSTADRVNDKRPDKGGIDDDDKTSFIESHKTKQRVTPGDIVAYNL DALDVVKLVHKIDDTVPVELIQECLDCVAVTATKDIYPHQILLAQWVMHKAFPARAFSHINKNAVNHLLAAAQSLMWHWG FQQVAVFMQVELYYSGEHAMSIQPRNSTRIQIKYKDVMDELYPHQRQQRAINGVPVAPVNIAGIAVQSAHASIRSSNWIY HGPDRLFKEAEQVTQNKVLVVPATIKSVITELVIHLGKLNQ ; 1 10 PDB 8QUE 8QUE ? 9 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8QUE A 21 ? 435 ? 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UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -18 2 1 8QUE SER A 3 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -17 3 1 8QUE SER A 4 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -16 4 1 8QUE HIS A 5 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -15 5 1 8QUE HIS A 6 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -14 6 1 8QUE HIS A 7 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -13 7 1 8QUE HIS A 8 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -12 8 1 8QUE HIS A 9 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -11 9 1 8QUE HIS A 10 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -10 10 1 8QUE SER A 11 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -9 11 1 8QUE SER A 12 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -8 12 1 8QUE GLY A 13 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -7 13 1 8QUE LEU A 14 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -6 14 1 8QUE VAL A 15 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -5 15 1 8QUE PRO A 16 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -4 16 1 8QUE ARG A 17 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -3 17 1 8QUE GLY A 18 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -2 18 1 8QUE SER A 19 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' -1 19 1 8QUE HIS A 20 ? UNP Q8SDA7 ? ? 'expression tag' 0 20 5 8QUE GLY E 197 ? UNP Q8SD39 ASP 197 variant 197 21 9 8QUE GLU B 2 ? UNP Q8SD94 GLN 2 variant 2 22 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details heptameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 7 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 44010 ? 1 MORE -272 ? 1 'SSA (A^2)' 98730 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 29 ? 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PRO A 313 LEU A 321 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 LEU A 341 ? PHE A 353 ? LEU A 321 PHE A 333 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 356 ? ASN A 367 ? THR A 336 ASN A 347 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN A 372 ? ALA A 386 ? ASN A 352 ALA A 366 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN A 403 ? GLY A 405 ? GLN A 383 GLY A 385 5 ? 3 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL A 428 ? LYS A 432 ? VAL A 408 LYS A 412 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 450 ? GLU A 458 ? ASP A 430 GLU A 438 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG A 459 ? TRP A 465 ? ARG A 439 TRP A 445 5 ? 7 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 476 ? GLU A 480 ? SER A 456 GLU A 460 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 GLN A 482 ? HIS A 494 ? GLN A 462 HIS A 474 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 PRO A 500 ? LYS A 506 ? PRO A 480 LYS A 486 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY B 15 ? ASP B 20 ? GLY C 15 ASP C 20 5 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 TRP B 22 ? THR B 26 ? TRP C 22 THR C 26 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 SER B 27 ? GLN B 40 ? SER C 27 GLN C 40 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY B 55 ? TYR B 63 ? 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G DG 35 H C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? F DT 36 N3 ? ? ? 1_555 G A 5 N1 ? ? G DT 36 H A 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? F DT 36 O4 ? ? ? 1_555 G A 5 N6 ? ? G DT 36 H A 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? F DC 37 N3 ? ? ? 1_555 G G 4 N1 ? ? G DC 37 H G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? F DC 37 N4 ? ? ? 1_555 G G 4 O6 ? ? G DC 37 H G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? F DC 37 O2 ? ? ? 1_555 G G 4 N2 ? ? G DC 37 H G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? F DT 38 N3 ? ? ? 1_555 G A 3 N1 ? ? G DT 38 H A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? F DT 38 O4 ? ? ? 1_555 G A 3 N6 ? ? G DT 38 H A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 ALA N CA sing N N 40 ALA N H sing N N 41 ALA N H2 sing N N 42 ALA CA C sing N N 43 ALA CA CB sing N N 44 ALA CA HA sing N N 45 ALA C O doub N N 46 ALA C OXT sing N N 47 ALA CB HB1 sing N N 48 ALA CB HB2 sing N N 49 ALA CB HB3 sing N N 50 ALA OXT HXT sing N N 51 ARG N CA sing N N 52 ARG N H sing N N 53 ARG N H2 sing N N 54 ARG CA C sing N N 55 ARG CA CB sing N N 56 ARG CA HA sing N N 57 ARG C O doub N N 58 ARG C OXT sing N N 59 ARG CB CG sing N N 60 ARG CB HB2 sing N N 61 ARG CB HB3 sing N N 62 ARG CG CD sing N N 63 ARG CG HG2 sing N N 64 ARG CG HG3 sing N N 65 ARG CD NE sing N N 66 ARG CD HD2 sing N N 67 ARG CD HD3 sing N N 68 ARG NE CZ sing N N 69 ARG NE HE sing N N 70 ARG CZ NH1 sing N N 71 ARG CZ NH2 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N 157 DA OP3 P sing N N 158 DA OP3 HOP3 sing N N 159 DA P OP1 doub N N 160 DA P OP2 sing N N 161 DA P "O5'" sing N N 162 DA OP2 HOP2 sing N N 163 DA "O5'" "C5'" sing N N 164 DA "C5'" "C4'" sing N N 165 DA "C5'" "H5'" sing N N 166 DA "C5'" "H5''" sing N N 167 DA "C4'" "O4'" sing N N 168 DA "C4'" "C3'" sing N N 169 DA "C4'" "H4'" sing N N 170 DA "O4'" "C1'" sing N N 171 DA "C3'" "O3'" sing N N 172 DA "C3'" "C2'" sing N N 173 DA "C3'" "H3'" sing N N 174 DA "O3'" "HO3'" sing N N 175 DA "C2'" "C1'" sing N N 176 DA "C2'" "H2'" sing N N 177 DA "C2'" "H2''" sing N N 178 DA "C1'" N9 sing N N 179 DA "C1'" "H1'" sing N N 180 DA N9 C8 sing Y N 181 DA N9 C4 sing Y N 182 DA C8 N7 doub Y N 183 DA C8 H8 sing N N 184 DA N7 C5 sing Y N 185 DA C5 C6 sing Y N 186 DA C5 C4 doub Y N 187 DA C6 N6 sing N N 188 DA C6 N1 doub Y N 189 DA N6 H61 sing N N 190 DA N6 H62 sing N N 191 DA N1 C2 sing Y N 192 DA C2 N3 doub Y N 193 DA C2 H2 sing N N 194 DA N3 C4 sing Y N 195 DC OP3 P sing N N 196 DC OP3 HOP3 sing N N 197 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sing N N 570 SER CB HB2 sing N N 571 SER CB HB3 sing N N 572 SER OG HG sing N N 573 SER OXT HXT sing N N 574 THR N CA sing N N 575 THR N H sing N N 576 THR N H2 sing N N 577 THR CA C sing N N 578 THR CA CB sing N N 579 THR CA HA sing N N 580 THR C O doub N N 581 THR C OXT sing N N 582 THR CB OG1 sing N N 583 THR CB CG2 sing N N 584 THR CB HB sing N N 585 THR OG1 HG1 sing N N 586 THR CG2 HG21 sing N N 587 THR CG2 HG22 sing N N 588 THR CG2 HG23 sing N N 589 THR OXT HXT sing N N 590 TRP N CA sing N N 591 TRP N H sing N N 592 TRP N H2 sing N N 593 TRP CA C sing N N 594 TRP CA CB sing N N 595 TRP CA HA sing N N 596 TRP C O doub N N 597 TRP C OXT sing N N 598 TRP CB CG sing N N 599 TRP CB HB2 sing N N 600 TRP CB HB3 sing N N 601 TRP CG CD1 doub Y N 602 TRP CG CD2 sing Y N 603 TRP CD1 NE1 sing Y N 604 TRP CD1 HD1 sing N N 605 TRP CD2 CE2 doub Y N 606 TRP CD2 CE3 sing Y N 607 TRP NE1 CE2 sing Y N 608 TRP NE1 HE1 sing N N 609 TRP CE2 CZ2 sing Y N 610 TRP CE3 CZ3 doub Y N 611 TRP CE3 HE3 sing N 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695 # _em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2023-10-16 _em_admin.deposition_site PDBE _em_admin.entry_id 8QUE _em_admin.last_update 2024-07-31 _em_admin.map_release_date 2024-07-31 _em_admin.title 'Structure of the Bacteriophage PhiKZ non-virion RNA Polymerase bound to DNA and RNA' # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.id _em_buffer_component.name 1 40 mM Tris-Cl 1 ? 1 10 mM MgCl2 2 ? 1 5 mM DTT 3 ? # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.4 # _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 2905945 _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Pseudomonas phage phiKZ' _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? _em_entity_assembly_naturalsource.details ? # _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 562 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid 'pET vectors' _em_entity_assembly_recombinant.strain 'BL21(DE3)' # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time ? 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Reactions were incubated for 30 min at 37 C before use. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 8QUE 'double helix' 8QUE 'a-form double helix' 8QUE 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 E DT 45 1_555 F DA 31 1_555 -0.167 -0.323 0.975 -1.446 -4.519 -0.494 1 F_DT45:DA31_G F 45 ? 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