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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.527 ? 39609 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.928 ? 3918 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 4839 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5019 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8R9W _struct.title 'PDCoV spike glycoprotein ectodomain in complex with the 22C10 antibody Fab fragment' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8R9W _struct_keywords.text 'Spike, coronavirus, antibody, complex, PDCoV, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 4 ? M N N 6 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 4 ? R N N 6 ? S N N 4 ? 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A ASN 311 A NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 453 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 472 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 475 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 494 A NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 507 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? A ASN 526 A NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 633 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 652 A NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 642 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 661 A NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 769 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 788 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 895 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 914 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? 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N-Glycosylation covale23 covale one ? H ASN 292 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? B ASN 311 B NAG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? H ASN 453 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 472 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? H ASN 475 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? B ASN 494 B NAG 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? H ASN 507 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? B ASN 526 B NAG 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? H ASN 633 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? B ASN 652 B NAG 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? H ASN 642 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? B ASN 661 B NAG 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? H ASN 769 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? B ASN 788 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? H ASN 895 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 6 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 6 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 5 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 6 ? AF9 ? 6 ? AG1 ? 5 ? AG2 ? 3 ? AG3 ? 3 ? AG4 ? 5 ? AG5 ? 5 ? AG6 ? 3 ? AG7 ? 5 ? AG8 ? 3 ? AG9 ? 4 ? AH1 ? 3 ? AH2 ? 2 ? 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parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? parallel AE6 3 4 ? parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AE9 4 5 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF8 5 6 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AF9 5 6 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG1 4 5 ? anti-parallel AG2 1 2 ? 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