HEADER PROTEIN FIBRIL 12-FEB-24 8RZL TITLE SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS THREADS (0406) FILAMENT. COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS THREADS (0406) FILAMENT.; COMPND 3 CHAIN: C, E, A, B, D SOURCE MOL_ID: 1; SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS; SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 2285 KEYWDS CELL SURFACE APPENDAGE, N-GLYCOSYLATION, O-GLYCOSYLATION, PROTEIN KEYWDS 2 FIBRIL EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY AUTHOR M.N.ISUPOV,M.GAINES,M.MCLAREN,B.DAUM REVDAT 2 09-OCT-24 8RZL 1 REMARK REVDAT 1 01-MAY-24 8RZL 0 JRNL AUTH M.N.ISUPOV,M.GAINES,M.MCLAREN,B.DAUM JRNL TITL SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS THREADS (0406) FILAMENT. JRNL REF TO BE PUBLISHED JRNL REFN REMARK 2 REMARK 2 RESOLUTION. 2.65 ANGSTROMS. REMARK 3 REMARK 3 REFINEMENT. REMARK 3 SOFTWARE PACKAGES : REFMAC, COOT, ISOLDE, UCSF CHIMERAX REMARK 3 RECONSTRUCTION SCHEMA : NULL REMARK 3 REMARK 3 EM MAP-MODEL FITTING AND REFINEMENT REMARK 3 PDB ENTRY : NULL REMARK 3 REFINEMENT SPACE : RECIPROCAL REMARK 3 REFINEMENT PROTOCOL : FLEXIBLE FIT REMARK 3 REFINEMENT TARGET : NULL REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE : NULL REMARK 3 REMARK 3 FITTING PROCEDURE : NULL REMARK 3 REMARK 3 EM IMAGE RECONSTRUCTION STATISTICS REMARK 3 NOMINAL PIXEL SIZE (ANGSTROMS) : NULL REMARK 3 ACTUAL PIXEL SIZE (ANGSTROMS) : NULL REMARK 3 EFFECTIVE RESOLUTION (ANGSTROMS) : 2.650 REMARK 3 NUMBER OF PARTICLES : 626078 REMARK 3 CTF CORRECTION METHOD : PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE REMARK 3 CORRECTION REMARK 3 REMARK 3 EM RECONSTRUCTION MAGNIFICATION CALIBRATION: NULL REMARK 3 REMARK 3 OTHER DETAILS: NULL REMARK 4 REMARK 4 8RZL COMPLIES WITH FORMAT V. 3.30, 13-JUL-11 REMARK 100 REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY PDBE ON 13-FEB-24. REMARK 100 THE DEPOSITION ID IS D_1292136526. REMARK 245 REMARK 245 EXPERIMENTAL DETAILS REMARK 245 RECONSTRUCTION METHOD : HELICAL REMARK 245 SPECIMEN TYPE : NULL REMARK 245 REMARK 245 ELECTRON MICROSCOPE SAMPLE REMARK 245 SAMPLE TYPE : FILAMENT REMARK 245 PARTICLE TYPE : HELICAL REMARK 245 NAME OF SAMPLE : FILAMENT 0406 REMARK 245 SAMPLE CONCENTRATION (MG ML-1) : NULL REMARK 245 SAMPLE SUPPORT DETAILS : NULL REMARK 245 SAMPLE VITRIFICATION DETAILS : NULL REMARK 245 SAMPLE BUFFER : NULL REMARK 245 PH : 3.00 REMARK 245 SAMPLE DETAILS : NULL REMARK 245 REMARK 245 DATA ACQUISITION REMARK 245 DATE OF EXPERIMENT : NULL REMARK 245 NUMBER OF MICROGRAPHS-IMAGES : 20579 REMARK 245 TEMPERATURE (KELVIN) : NULL REMARK 245 MICROSCOPE MODEL : TFS KRIOS REMARK 245 DETECTOR TYPE : GATAN K3 BIOQUANTUM (6K X REMARK 245 4K) REMARK 245 MINIMUM DEFOCUS (NM) : 1000.00 REMARK 245 MAXIMUM DEFOCUS (NM) : 2500.00 REMARK 245 MINIMUM TILT ANGLE (DEGREES) : NULL REMARK 245 MAXIMUM TILT ANGLE (DEGREES) : NULL REMARK 245 NOMINAL CS : NULL REMARK 245 IMAGING MODE : BRIGHT FIELD REMARK 245 ELECTRON DOSE (ELECTRONS NM**-2) : 4330.00 REMARK 245 ILLUMINATION MODE : FLOOD BEAM REMARK 245 NOMINAL MAGNIFICATION : NULL REMARK 245 CALIBRATED MAGNIFICATION : NULL REMARK 245 SOURCE : FIELD EMISSION GUN REMARK 245 ACCELERATION VOLTAGE (KV) : 300 REMARK 245 IMAGING DETAILS : NULL REMARK 247 REMARK 247 ELECTRON MICROSCOPY REMARK 247 THE COORDINATES IN THIS ENTRY WERE GENERATED FROM ELECTRON REMARK 247 MICROSCOPY DATA. PROTEIN DATA BANK CONVENTIONS REQUIRE REMARK 247 THAT CRYST1 AND SCALE RECORDS BE INCLUDED, BUT THE VALUES REMARK 247 ON THESE RECORDS ARE MEANINGLESS EXCEPT FOR THE CALCULATION REMARK 247 OF THE STRUCTURE FACTORS. REMARK 300 REMARK 300 BIOMOLECULE: 1 REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. REMARK 350 REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. REMARK 350 REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: PENTAMERIC REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: PENTAMERIC REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 50170 ANGSTROM**2 REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 48920 ANGSTROM**2 REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: 298.0 KCAL/MOL REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: C, E, A, B, D, F, G, H, I, J, REMARK 350 AND CHAINS: K, L, M, N, O, P, Q, R, S, REMARK 350 AND CHAINS: T, U, V, W, X, Y, Z, a, b, c, REMARK 350 AND CHAINS: d REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 REMARK 470 REMARK 470 MISSING ATOM REMARK 470 THE FOLLOWING RESIDUES HAVE MISSING ATOMS (M=MODEL NUMBER; REMARK 470 RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER; REMARK 470 I=INSERTION CODE): REMARK 470 M RES CSSEQI ATOMS REMARK 470 ASN C 57 ND2 REMARK 470 ASN E 57 ND2 REMARK 470 ASN A 57 ND2 REMARK 470 ASN B 57 ND2 REMARK 470 ASN D 57 ND2 REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: CLOSE CONTACTS IN SAME ASYMMETRIC UNIT REMARK 500 REMARK 500 THE FOLLOWING ATOMS ARE IN CLOSE CONTACT. REMARK 500 REMARK 500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES C SSEQI DISTANCE REMARK 500 N ASP C 24 CG ASN A 57 1.33 REMARK 500 CG ASN B 57 N ASP D 24 1.33 REMARK 500 CG ASN C 57 N ASP E 24 1.34 REMARK 500 C3 NAG Y 2 C1 YZT Y 3 2.19 REMARK 500 C3 NAG J 2 C1 YZT J 3 2.19 REMARK 500 C3 NAG T 2 C1 YZT T 3 2.19 REMARK 500 C3 NAG d 2 C1 YZT d 3 2.19 REMARK 500 C3 NAG O 2 C1 YZT O 3 2.19 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 500 REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES REMARK 500 REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). REMARK 500 REMARK 500 STANDARD TABLE: REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) REMARK 500 REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 REMARK 500 REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI REMARK 500 ASN C 49 17.85 57.36 REMARK 500 ALA C 52 0.63 -69.43 REMARK 500 ASN C 56 51.14 -104.99 REMARK 500 ASN C 57 40.11 -162.98 REMARK 500 PRO C 61 5.55 -62.83 REMARK 500 THR C 82 -158.37 -136.86 REMARK 500 ASP C 181 41.83 -143.16 REMARK 500 ASN E 49 17.90 57.30 REMARK 500 ALA E 52 0.43 -69.38 REMARK 500 ASN E 56 51.44 -105.07 REMARK 500 ASN E 57 40.18 -163.14 REMARK 500 PRO E 61 5.73 -62.95 REMARK 500 THR E 82 -157.96 -136.72 REMARK 500 ASP E 181 42.19 -143.35 REMARK 500 ASN A 49 17.86 57.33 REMARK 500 ALA A 52 0.57 -69.49 REMARK 500 ASN A 56 51.25 -104.99 REMARK 500 ASN A 57 40.25 -163.16 REMARK 500 PRO A 61 5.56 -63.03 REMARK 500 THR A 82 -158.30 -136.82 REMARK 500 ASP A 181 41.80 -143.29 REMARK 500 ASN B 49 17.92 57.33 REMARK 500 ALA B 52 0.63 -69.51 REMARK 500 ASN B 56 51.18 -105.05 REMARK 500 ASN B 57 40.20 -163.05 REMARK 500 PRO B 61 5.54 -62.81 REMARK 500 THR B 82 -158.35 -136.82 REMARK 500 ASP B 181 41.95 -143.24 REMARK 500 ASN D 49 17.81 57.36 REMARK 500 ALA D 52 0.38 -69.30 REMARK 500 ASN D 56 51.24 -105.00 REMARK 500 ASN D 57 40.23 -163.06 REMARK 500 PRO D 61 5.57 -62.88 REMARK 500 THR D 82 -158.21 -136.75 REMARK 500 ASP D 181 41.80 -143.26 REMARK 500 REMARK 500 REMARK: NULL REMARK 900 REMARK 900 RELATED ENTRIES REMARK 900 RELATED ID: EMD-19608 RELATED DB: EMDB REMARK 900 SULFOLOBUS ACIDOCALDARIUS THREADS (0406) FILAMENT. DBREF 8RZL C 24 206 UNP Q4JBK8 Q4JBK8_SULAC 24 206 DBREF 8RZL E 24 206 UNP Q4JBK8 Q4JBK8_SULAC 24 206 DBREF 8RZL A 24 206 UNP Q4JBK8 Q4JBK8_SULAC 24 206 DBREF 8RZL B 24 206 UNP Q4JBK8 Q4JBK8_SULAC 24 206 DBREF 8RZL D 24 206 UNP Q4JBK8 Q4JBK8_SULAC 24 206 SEQRES 1 C 183 ASP VAL ILE TYR TYR TYR GLN GLY GLN ILE THR VAL GLY SEQRES 2 C 183 ASN VAL ALA PRO PRO MET TYR PHE ALA ILE GLN PRO ASN SEQRES 3 C 183 GLY ASN ALA LYS ILE GLY ASN ASN SER ASN VAL PRO SER SEQRES 4 C 183 TYR ILE ASN ALA GLN PRO SER SER GLY GLY SER GLY PHE SEQRES 5 C 183 THR ALA GLN VAL ASN ILE THR ASN ALA THR TYR ASN TYR SEQRES 6 C 183 TYR PHE ASN PHE MET GLY LEU ALA VAL SER LYS THR GLY SEQRES 7 C 183 TYR ILE TYR LEU ALA LYS VAL ALA TYR SER TYR THR ALA SEQRES 8 C 183 THR ASN ASN PRO ILE GLN ASN ALA THR LEU TYR ILE MET SEQRES 9 C 183 ASN GLN GLN GLY GLN ILE VAL TYR LYS TYR LYS LEU ILE SEQRES 10 C 183 VAL ASN GLY VAL VAL ASN SER THR LEU PRO SER THR PRO SEQRES 11 C 183 LEU GLN ILE ASN SER GLY SER TYR ILE VAL SER LEU LEU SEQRES 12 C 183 ILE VAL PRO TYR GLN GLY THR LEU PRO LYS THR PRO SER SEQRES 13 C 183 ASN ASP LEU ALA THR ILE THR VAL ASN PHE GLY PHE SER SEQRES 14 C 183 PRO MET THR ALA SER PRO PRO PRO ILE PRO LEU PRO SER SEQRES 15 C 183 PRO SEQRES 1 E 183 ASP VAL ILE TYR TYR TYR GLN GLY GLN ILE THR VAL GLY SEQRES 2 E 183 ASN VAL ALA PRO PRO MET TYR PHE ALA ILE GLN PRO ASN SEQRES 3 E 183 GLY ASN ALA LYS ILE GLY ASN ASN SER ASN VAL PRO SER SEQRES 4 E 183 TYR ILE ASN ALA GLN PRO SER SER GLY GLY SER GLY PHE SEQRES 5 E 183 THR ALA GLN VAL ASN ILE THR ASN ALA THR TYR ASN TYR SEQRES 6 E 183 TYR PHE ASN PHE MET GLY LEU ALA VAL SER LYS THR GLY SEQRES 7 E 183 TYR ILE TYR LEU ALA LYS VAL ALA TYR SER TYR THR ALA SEQRES 8 E 183 THR ASN ASN PRO ILE GLN ASN ALA THR LEU TYR ILE MET SEQRES 9 E 183 ASN GLN GLN GLY GLN ILE VAL TYR LYS TYR LYS LEU ILE SEQRES 10 E 183 VAL ASN GLY VAL VAL ASN SER THR LEU PRO SER THR PRO SEQRES 11 E 183 LEU GLN ILE ASN SER GLY SER TYR ILE VAL SER LEU LEU SEQRES 12 E 183 ILE VAL PRO TYR GLN GLY THR LEU PRO LYS THR PRO SER SEQRES 13 E 183 ASN ASP LEU ALA THR ILE THR VAL ASN PHE GLY PHE SER SEQRES 14 E 183 PRO MET THR ALA SER PRO PRO PRO ILE PRO LEU PRO SER SEQRES 15 E 183 PRO SEQRES 1 A 183 ASP VAL ILE TYR TYR TYR GLN GLY GLN ILE THR VAL GLY SEQRES 2 A 183 ASN VAL ALA PRO PRO MET TYR PHE ALA ILE GLN PRO ASN SEQRES 3 A 183 GLY ASN ALA LYS ILE GLY ASN ASN SER ASN VAL PRO SER SEQRES 4 A 183 TYR ILE ASN ALA GLN PRO SER SER GLY GLY SER GLY PHE SEQRES 5 A 183 THR ALA GLN VAL ASN ILE THR ASN ALA THR TYR ASN TYR SEQRES 6 A 183 TYR PHE ASN PHE MET GLY LEU ALA VAL SER LYS THR GLY SEQRES 7 A 183 TYR ILE TYR LEU ALA LYS VAL ALA TYR SER TYR THR ALA SEQRES 8 A 183 THR ASN ASN PRO ILE GLN ASN ALA THR LEU TYR ILE MET SEQRES 9 A 183 ASN GLN GLN GLY GLN ILE VAL TYR LYS TYR LYS LEU ILE SEQRES 10 A 183 VAL ASN GLY VAL VAL ASN SER THR LEU PRO SER THR PRO SEQRES 11 A 183 LEU GLN ILE ASN SER GLY SER TYR ILE VAL SER LEU LEU SEQRES 12 A 183 ILE VAL PRO TYR GLN GLY THR LEU PRO LYS THR PRO SER SEQRES 13 A 183 ASN ASP LEU ALA THR ILE THR VAL ASN PHE GLY PHE SER SEQRES 14 A 183 PRO MET THR ALA SER PRO PRO PRO ILE PRO LEU PRO SER SEQRES 15 A 183 PRO SEQRES 1 B 183 ASP VAL ILE TYR TYR TYR GLN GLY GLN ILE THR VAL GLY SEQRES 2 B 183 ASN VAL ALA PRO PRO MET TYR PHE ALA ILE GLN PRO ASN SEQRES 3 B 183 GLY ASN ALA LYS ILE GLY ASN ASN SER ASN VAL PRO SER SEQRES 4 B 183 TYR ILE ASN ALA GLN PRO SER SER GLY GLY SER GLY PHE SEQRES 5 B 183 THR ALA GLN VAL ASN ILE THR ASN ALA THR TYR ASN TYR SEQRES 6 B 183 TYR PHE ASN PHE MET GLY LEU ALA VAL SER LYS THR GLY SEQRES 7 B 183 TYR ILE TYR LEU ALA LYS VAL ALA TYR SER TYR THR ALA SEQRES 8 B 183 THR ASN ASN PRO ILE GLN ASN ALA THR LEU TYR ILE MET SEQRES 9 B 183 ASN GLN GLN GLY GLN ILE VAL TYR LYS TYR LYS LEU ILE SEQRES 10 B 183 VAL ASN GLY VAL VAL ASN SER THR LEU PRO SER THR PRO SEQRES 11 B 183 LEU GLN ILE ASN SER GLY SER TYR ILE VAL SER LEU LEU SEQRES 12 B 183 ILE VAL PRO TYR GLN GLY THR LEU PRO LYS THR PRO SER SEQRES 13 B 183 ASN ASP LEU ALA THR ILE THR VAL ASN PHE GLY PHE SER SEQRES 14 B 183 PRO MET THR ALA SER PRO PRO PRO ILE PRO LEU PRO SER SEQRES 15 B 183 PRO SEQRES 1 D 183 ASP VAL ILE TYR TYR TYR GLN GLY GLN ILE THR VAL GLY SEQRES 2 D 183 ASN VAL ALA PRO PRO MET TYR PHE ALA ILE GLN PRO ASN SEQRES 3 D 183 GLY ASN ALA LYS ILE GLY ASN ASN SER ASN VAL PRO SER SEQRES 4 D 183 TYR ILE ASN ALA GLN PRO SER SER GLY GLY SER GLY PHE SEQRES 5 D 183 THR ALA GLN VAL ASN ILE THR ASN ALA THR TYR ASN TYR SEQRES 6 D 183 TYR PHE ASN PHE MET GLY LEU ALA VAL SER LYS THR GLY SEQRES 7 D 183 TYR ILE TYR LEU ALA LYS VAL ALA TYR SER TYR THR ALA SEQRES 8 D 183 THR ASN ASN PRO ILE GLN ASN ALA THR LEU TYR ILE MET SEQRES 9 D 183 ASN GLN GLN GLY GLN ILE VAL TYR LYS TYR LYS LEU ILE SEQRES 10 D 183 VAL ASN GLY VAL VAL ASN SER THR LEU PRO SER THR PRO SEQRES 11 D 183 LEU GLN ILE ASN SER GLY SER TYR ILE VAL SER LEU LEU SEQRES 12 D 183 ILE VAL PRO TYR GLN GLY THR LEU PRO LYS THR PRO SER SEQRES 13 D 183 ASN ASP LEU ALA THR ILE THR VAL ASN PHE GLY PHE SER SEQRES 14 D 183 PRO MET THR ALA SER PRO PRO PRO ILE PRO LEU PRO SER SEQRES 15 D 183 PRO HET NAG F 1 14 HET NAG F 2 14 HET YZT F 3 14 HET BGC F 4 11 HET MAN F 5 11 HET MAN F 6 11 HET NAG G 1 14 HET NAG G 2 14 HET YZT G 3 14 HET BGC G 4 11 HET MAN G 5 11 HET MAN G 6 11 HET NAG H 1 14 HET NAG H 2 14 HET YZT H 3 14 HET BGC H 4 11 HET MAN H 5 11 HET MAN H 6 11 HET NAG I 1 14 HET NAG I 2 14 HET YZT I 3 14 HET BGC I 4 11 HET MAN I 5 11 HET MAN I 6 11 HET NAG J 1 14 HET NAG J 2 14 HET YZT J 3 14 HET BGC J 4 11 HET MAN J 5 11 HET MAN J 6 11 HET NAG K 1 14 HET NAG K 2 14 HET YZT K 3 14 HET BGC K 4 11 HET MAN K 5 11 HET MAN K 6 11 HET NAG L 1 14 HET NAG L 2 14 HET YZT L 3 14 HET BGC L 4 11 HET MAN L 5 11 HET MAN L 6 11 HET NAG M 1 14 HET NAG M 2 14 HET YZT M 3 14 HET BGC M 4 11 HET MAN M 5 11 HET MAN M 6 11 HET NAG N 1 14 HET NAG N 2 14 HET YZT N 3 14 HET BGC N 4 11 HET MAN N 5 11 HET MAN N 6 11 HET NAG O 1 14 HET NAG O 2 14 HET YZT O 3 14 HET BGC O 4 11 HET MAN O 5 11 HET MAN O 6 11 HET NAG P 1 14 HET NAG P 2 14 HET YZT P 3 14 HET BGC P 4 11 HET MAN P 5 11 HET MAN P 6 11 HET NAG Q 1 14 HET NAG Q 2 14 HET YZT Q 3 14 HET BGC Q 4 11 HET MAN Q 5 11 HET MAN Q 6 11 HET NAG R 1 14 HET NAG R 2 14 HET YZT R 3 14 HET BGC R 4 11 HET MAN R 5 11 HET MAN R 6 11 HET NAG S 1 14 HET NAG S 2 14 HET YZT S 3 14 HET BGC S 4 11 HET MAN S 5 11 HET MAN S 6 11 HET NAG T 1 14 HET NAG T 2 14 HET YZT T 3 14 HET BGC T 4 11 HET MAN T 5 11 HET MAN T 6 11 HET NAG U 1 14 HET NAG U 2 14 HET YZT U 3 14 HET BGC U 4 11 HET MAN U 5 11 HET MAN U 6 11 HET NAG V 1 14 HET NAG V 2 14 HET YZT V 3 14 HET BGC V 4 11 HET MAN V 5 11 HET MAN V 6 11 HET NAG W 1 14 HET NAG W 2 14 HET YZT W 3 14 HET BGC W 4 11 HET MAN W 5 11 HET MAN W 6 11 HET NAG X 1 14 HET NAG X 2 14 HET YZT X 3 14 HET BGC X 4 11 HET MAN X 5 11 HET MAN X 6 11 HET NAG Y 1 14 HET NAG Y 2 14 HET YZT Y 3 14 HET BGC Y 4 11 HET MAN Y 5 11 HET MAN Y 6 11 HET NAG Z 1 14 HET NAG Z 2 14 HET YZT Z 3 14 HET BGC Z 4 11 HET MAN Z 5 11 HET MAN Z 6 11 HET NAG a 1 14 HET NAG a 2 14 HET YZT a 3 14 HET BGC a 4 11 HET MAN a 5 11 HET MAN a 6 11 HET NAG b 1 14 HET NAG b 2 14 HET YZT b 3 14 HET BGC b 4 11 HET MAN b 5 11 HET MAN b 6 11 HET NAG c 1 14 HET NAG c 2 14 HET YZT c 3 14 HET BGC c 4 11 HET MAN c 5 11 HET MAN c 6 11 HET NAG d 1 14 HET NAG d 2 14 HET YZT d 3 14 HET BGC d 4 11 HET MAN d 5 11 HET MAN d 6 11 HET MAN C 311 11 HET MAN E 311 11 HET MAN A 311 11 HET MAN B 311 11 HET MAN D 311 11 HETNAM NAG 2-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE HETNAM YZT 6-DEOXY-6-SULFO-BETA-D-GLUCOPYRANOSE HETNAM BGC BETA-D-GLUCOPYRANOSE HETNAM MAN ALPHA-D-MANNOPYRANOSE HETSYN NAG N-ACETYL-BETA-D-GLUCOSAMINE; 2-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA- HETSYN 2 NAG D-GLUCOSE; 2-ACETAMIDO-2-DEOXY-D-GLUCOSE; 2-ACETAMIDO- HETSYN 3 NAG 2-DEOXY-GLUCOSE; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE HETSYN BGC BETA-D-GLUCOSE; D-GLUCOSE; GLUCOSE HETSYN MAN ALPHA-D-MANNOSE; D-MANNOSE; MANNOSE FORMUL 6 NAG 50(C8 H15 N O6) FORMUL 6 YZT 25(C6 H12 O8 S) FORMUL 6 BGC 25(C6 H12 O6) FORMUL 6 MAN 55(C6 H12 O6) HELIX 1 AA1 GLN C 47 ASN C 51 5 5 HELIX 2 AA2 SER C 70 GLY C 72 5 3 HELIX 3 AA3 GLN E 47 ASN E 51 5 5 HELIX 4 AA4 SER E 70 SER E 73 5 4 HELIX 5 AA5 GLN A 47 ASN A 51 5 5 HELIX 6 AA6 SER A 70 GLY A 72 5 3 HELIX 7 AA7 GLN B 47 ASN B 51 5 5 HELIX 8 AA8 SER B 70 GLY B 72 5 3 HELIX 9 AA9 GLN D 47 ASN D 51 5 5 HELIX 10 AB1 SER D 70 GLY D 72 5 3 SHEET 1 AA1 6 MET A 42 ALA A 45 0 SHEET 2 AA1 6 TYR A 86 VAL A 97 -1 O ALA A 96 N TYR A 43 SHEET 3 AA1 6 VAL C 25 ASN C 37 -1 N TYR C 28 O TYR A 86 SHEET 4 AA1 6 GLY B 74 ILE B 81 1 O ALA B 77 N THR C 34 SHEET 5 AA1 6 ILE B 64 PRO B 68 -1 N GLN B 67 O THR B 76 SHEET 6 AA1 6 ASN B 59 VAL B 60 -1 N VAL B 60 O ILE B 64 SHEET 1 AA2 9 VAL A 144 VAL A 145 0 SHEET 2 AA2 9 ILE A 133 VAL A 141 -1 N VAL A 141 O VAL A 144 SHEET 3 AA2 9 ILE A 119 MET A 127 -1 N LEU A 124 O TYR A 137 SHEET 4 AA2 9 GLY A 159 PRO A 169 -1 O ILE A 162 N MET A 127 SHEET 5 AA2 9 TYR A 86 VAL A 97 -1 N TYR A 89 O LEU A 165 SHEET 6 AA2 9 VAL C 25 ASN C 37 -1 N TYR C 28 O TYR A 86 SHEET 7 AA2 9 SER B 179 SER B 192 -1 O PHE B 191 N TYR C 27 SHEET 8 AA2 9 GLY B 101 TYR B 112 -1 N ALA B 109 O THR B 186 SHEET 9 AA2 9 LEU B 154 ILE B 156 -1 O ILE B 156 N GLY B 101 SHEET 1 AA3 6 MET C 42 ALA C 45 0 SHEET 2 AA3 6 TYR C 86 VAL C 97 -1 O ALA C 96 N TYR C 43 SHEET 3 AA3 6 VAL E 25 ASN E 37 -1 O TYR E 28 N TYR C 86 SHEET 4 AA3 6 GLY D 74 ILE D 81 1 O ALA D 77 N THR E 34 SHEET 5 AA3 6 ILE D 64 PRO D 68 -1 N GLN D 67 O THR D 76 SHEET 6 AA3 6 ASN D 59 VAL D 60 -1 N VAL D 60 O ILE D 64 SHEET 1 AA4 9 VAL C 144 VAL C 145 0 SHEET 2 AA4 9 ILE C 133 VAL C 141 -1 N VAL C 141 O VAL C 144 SHEET 3 AA4 9 ILE C 119 MET C 127 -1 N LEU C 124 O TYR C 137 SHEET 4 AA4 9 GLY C 159 PRO C 169 -1 O ILE C 162 N MET C 127 SHEET 5 AA4 9 TYR C 86 VAL C 97 -1 N TYR C 89 O LEU C 165 SHEET 6 AA4 9 VAL E 25 ASN E 37 -1 O TYR E 28 N TYR C 86 SHEET 7 AA4 9 SER D 179 SER D 192 -1 O ILE D 185 N ILE E 33 SHEET 8 AA4 9 GLY D 101 TYR D 112 -1 N ALA D 109 O THR D 186 SHEET 9 AA4 9 LEU D 154 ILE D 156 -1 O ILE D 156 N GLY D 101 SHEET 1 AA5 6 ASN C 59 VAL C 60 0 SHEET 2 AA5 6 ILE C 64 PRO C 68 -1 O ILE C 64 N VAL C 60 SHEET 3 AA5 6 GLY C 74 ILE C 81 -1 O THR C 76 N GLN C 67 SHEET 4 AA5 6 VAL D 25 ASN D 37 1 O THR D 34 N ALA C 77 SHEET 5 AA5 6 TYR B 86 VAL B 97 -1 N TYR B 86 O TYR D 28 SHEET 6 AA5 6 MET B 42 ALA B 45 -1 N TYR B 43 O ALA B 96 SHEET 1 AA6 9 LEU C 154 ILE C 156 0 SHEET 2 AA6 9 GLY C 101 TYR C 112 -1 N GLY C 101 O ILE C 156 SHEET 3 AA6 9 SER C 179 SER C 192 -1 O THR C 186 N ALA C 109 SHEET 4 AA6 9 VAL D 25 ASN D 37 -1 O TYR D 27 N PHE C 191 SHEET 5 AA6 9 TYR B 86 VAL B 97 -1 N TYR B 86 O TYR D 28 SHEET 6 AA6 9 GLY B 159 PRO B 169 -1 O LEU B 165 N TYR B 89 SHEET 7 AA6 9 ILE B 119 MET B 127 -1 N MET B 127 O ILE B 162 SHEET 8 AA6 9 ILE B 133 VAL B 141 -1 O TYR B 137 N LEU B 124 SHEET 9 AA6 9 VAL B 144 VAL B 145 -1 O VAL B 144 N VAL B 141 SHEET 1 AA7 6 MET E 42 ALA E 45 0 SHEET 2 AA7 6 ASN E 87 VAL E 97 -1 O ALA E 96 N TYR E 43 SHEET 3 AA7 6 GLY E 159 PRO E 169 -1 O LEU E 165 N TYR E 89 SHEET 4 AA7 6 ILE E 119 MET E 127 -1 N MET E 127 O ILE E 162 SHEET 5 AA7 6 ILE E 133 VAL E 141 -1 O TYR E 137 N LEU E 124 SHEET 6 AA7 6 VAL E 144 VAL E 145 -1 O VAL E 144 N VAL E 141 SHEET 1 AA8 3 ASN E 59 VAL E 60 0 SHEET 2 AA8 3 ILE E 64 PRO E 68 -1 O ILE E 64 N VAL E 60 SHEET 3 AA8 3 PHE E 75 VAL E 79 -1 O THR E 76 N GLN E 67 SHEET 1 AA9 3 LEU E 154 ILE E 156 0 SHEET 2 AA9 3 GLY E 101 TYR E 112 -1 N GLY E 101 O ILE E 156 SHEET 3 AA9 3 ALA E 183 SER E 192 -1 O THR E 186 N ALA E 109 SHEET 1 AB1 7 ASN A 59 VAL A 60 0 SHEET 2 AB1 7 ILE A 64 PRO A 68 -1 O ILE A 64 N VAL A 60 SHEET 3 AB1 7 GLY A 74 ILE A 81 -1 O THR A 76 N GLN A 67 SHEET 4 AB1 7 TYR B 27 ASN B 37 1 O THR B 34 N ALA A 77 SHEET 5 AB1 7 SER A 179 SER A 192 -1 N PHE A 191 O TYR B 27 SHEET 6 AB1 7 GLY A 101 TYR A 112 -1 N ALA A 109 O THR A 186 SHEET 7 AB1 7 LEU A 154 ILE A 156 -1 O ILE A 156 N GLY A 101 SHEET 1 AB2 6 MET D 42 ALA D 45 0 SHEET 2 AB2 6 ASN D 87 VAL D 97 -1 O ALA D 96 N TYR D 43 SHEET 3 AB2 6 GLY D 159 PRO D 169 -1 O LEU D 165 N TYR D 89 SHEET 4 AB2 6 ILE D 119 MET D 127 -1 N MET D 127 O ILE D 162 SHEET 5 AB2 6 ILE D 133 VAL D 141 -1 O TYR D 137 N LEU D 124 SHEET 6 AB2 6 VAL D 144 VAL D 145 -1 O VAL D 144 N VAL D 141 LINK ND2 ASN C 56 C1 NAG F 1 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN C 80 C1 NAG G 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN C 83 C1 NAG H 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN C 121 C1 NAG J 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN C 146 C1 NAG I 1 1555 1555 1.43 LINK OG1 THR C 195 C1 MAN C 311 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN E 56 C1 NAG K 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN E 80 C1 NAG L 1 1555 1555 1.42 LINK ND2 ASN E 83 C1 NAG M 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN E 121 C1 NAG O 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN E 146 C1 NAG N 1 1555 1555 1.43 LINK OG1 THR E 195 C1 MAN E 311 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN A 56 C1 NAG P 1 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN A 80 C1 NAG Q 1 1555 1555 1.42 LINK ND2 ASN A 83 C1 NAG R 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN A 121 C1 NAG T 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN A 146 C1 NAG S 1 1555 1555 1.43 LINK OG1 THR A 195 C1 MAN A 311 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN B 56 C1 NAG U 1 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN B 80 C1 NAG V 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN B 83 C1 NAG W 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN B 121 C1 NAG Y 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN B 146 C1 NAG X 1 1555 1555 1.43 LINK OG1 THR B 195 C1 MAN B 311 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN D 56 C1 NAG Z 1 1555 1555 1.45 LINK ND2 ASN D 80 C1 NAG a 1 1555 1555 1.42 LINK ND2 ASN D 83 C1 NAG b 1 1555 1555 1.44 LINK ND2 ASN D 121 C1 NAG d 1 1555 1555 1.43 LINK ND2 ASN D 146 C1 NAG c 1 1555 1555 1.43 LINK OG1 THR D 195 C1 MAN D 311 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG F 1 C1 NAG F 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG F 2 C1 YZT F 3 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG F 2 C1 MAN F 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG F 2 C1 MAN F 6 1555 1555 1.43 LINK O4 YZT F 3 C1 BGC F 4 1555 1555 1.40 LINK O4 NAG G 1 C1 NAG G 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG G 2 C1 YZT G 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG G 2 C1 MAN G 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG G 2 C1 MAN G 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT G 3 C1 BGC G 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG H 1 C1 NAG H 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG H 2 C1 YZT H 3 1555 1555 1.42 LINK O4 NAG H 2 C1 MAN H 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG H 2 C1 MAN H 6 1555 1555 1.47 LINK O4 YZT H 3 C1 BGC H 4 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG I 1 C1 NAG I 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG I 2 C1 YZT I 3 1555 1555 1.46 LINK O4 NAG I 2 C1 MAN I 5 1555 1555 1.45 LINK O6 NAG I 2 C1 MAN I 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT I 3 C1 BGC I 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG J 1 C1 NAG J 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG J 2 C1 YZT J 3 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG J 2 C1 MAN J 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG J 2 C1 MAN J 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT J 3 C1 BGC J 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG K 1 C1 NAG K 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG K 2 C1 YZT K 3 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG K 2 C1 MAN K 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG K 2 C1 MAN K 6 1555 1555 1.43 LINK O4 YZT K 3 C1 BGC K 4 1555 1555 1.40 LINK O4 NAG L 1 C1 NAG L 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG L 2 C1 YZT L 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG L 2 C1 MAN L 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG L 2 C1 MAN L 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT L 3 C1 BGC L 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG M 1 C1 NAG M 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG M 2 C1 YZT M 3 1555 1555 1.42 LINK O4 NAG M 2 C1 MAN M 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG M 2 C1 MAN M 6 1555 1555 1.47 LINK O4 YZT M 3 C1 BGC M 4 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG N 1 C1 NAG N 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG N 2 C1 YZT N 3 1555 1555 1.46 LINK O4 NAG N 2 C1 MAN N 5 1555 1555 1.45 LINK O6 NAG N 2 C1 MAN N 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT N 3 C1 BGC N 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG O 1 C1 NAG O 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG O 2 C1 YZT O 3 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG O 2 C1 MAN O 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG O 2 C1 MAN O 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT O 3 C1 BGC O 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG P 1 C1 NAG P 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG P 2 C1 YZT P 3 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG P 2 C1 MAN P 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG P 2 C1 MAN P 6 1555 1555 1.43 LINK O4 YZT P 3 C1 BGC P 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG Q 1 C1 NAG Q 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG Q 2 C1 YZT Q 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG Q 2 C1 MAN Q 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG Q 2 C1 MAN Q 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT Q 3 C1 BGC Q 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG R 1 C1 NAG R 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG R 2 C1 YZT R 3 1555 1555 1.42 LINK O4 NAG R 2 C1 MAN R 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG R 2 C1 MAN R 6 1555 1555 1.47 LINK O4 YZT R 3 C1 BGC R 4 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG S 1 C1 NAG S 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG S 2 C1 YZT S 3 1555 1555 1.46 LINK O4 NAG S 2 C1 MAN S 5 1555 1555 1.45 LINK O6 NAG S 2 C1 MAN S 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT S 3 C1 BGC S 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG T 1 C1 NAG T 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG T 2 C1 YZT T 3 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG T 2 C1 MAN T 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG T 2 C1 MAN T 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT T 3 C1 BGC T 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG U 1 C1 NAG U 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG U 2 C1 YZT U 3 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG U 2 C1 MAN U 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG U 2 C1 MAN U 6 1555 1555 1.43 LINK O4 YZT U 3 C1 BGC U 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG V 1 C1 NAG V 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG V 2 C1 YZT V 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG V 2 C1 MAN V 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG V 2 C1 MAN V 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT V 3 C1 BGC V 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG W 1 C1 NAG W 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG W 2 C1 YZT W 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG W 2 C1 MAN W 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG W 2 C1 MAN W 6 1555 1555 1.47 LINK O4 YZT W 3 C1 BGC W 4 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG X 1 C1 NAG X 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG X 2 C1 YZT X 3 1555 1555 1.46 LINK O4 NAG X 2 C1 MAN X 5 1555 1555 1.45 LINK O6 NAG X 2 C1 MAN X 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT X 3 C1 BGC X 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG Y 1 C1 NAG Y 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG Y 2 C1 YZT Y 3 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG Y 2 C1 MAN Y 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG Y 2 C1 MAN Y 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT Y 3 C1 BGC Y 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG Z 1 C1 NAG Z 2 1555 1555 1.44 LINK O3 NAG Z 2 C1 YZT Z 3 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG Z 2 C1 MAN Z 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG Z 2 C1 MAN Z 6 1555 1555 1.43 LINK O4 YZT Z 3 C1 BGC Z 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG a 1 C1 NAG a 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG a 2 C1 YZT a 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG a 2 C1 MAN a 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG a 2 C1 MAN a 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT a 3 C1 BGC a 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG b 1 C1 NAG b 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG b 2 C1 YZT b 3 1555 1555 1.43 LINK O4 NAG b 2 C1 MAN b 5 1555 1555 1.44 LINK O6 NAG b 2 C1 MAN b 6 1555 1555 1.47 LINK O4 YZT b 3 C1 BGC b 4 1555 1555 1.45 LINK O4 NAG c 1 C1 NAG c 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG c 2 C1 YZT c 3 1555 1555 1.46 LINK O4 NAG c 2 C1 MAN c 5 1555 1555 1.45 LINK O6 NAG c 2 C1 MAN c 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT c 3 C1 BGC c 4 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG d 1 C1 NAG d 2 1555 1555 1.43 LINK O3 NAG d 2 C1 YZT d 3 1555 1555 1.41 LINK O4 NAG d 2 C1 MAN d 5 1555 1555 1.43 LINK O6 NAG d 2 C1 MAN d 6 1555 1555 1.44 LINK O4 YZT d 3 C1 BGC d 4 1555 1555 1.41 CISPEP 1 LEU C 149 PRO C 150 0 -2.56 CISPEP 2 LEU E 149 PRO E 150 0 -2.54 CISPEP 3 LEU A 149 PRO A 150 0 -2.40 CISPEP 4 LEU B 149 PRO B 150 0 -2.47 CISPEP 5 LEU D 149 PRO D 150 0 -2.59 CRYST1 1.000 1.000 1.000 90.00 90.00 90.00 P 1 ORIGX1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 ORIGX3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 SCALE1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 SCALE2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 SCALE3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000