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AA6 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASP A 206 ? 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ASP D 180 ? ALA A 175 ASP A 180 AA6 4 LYS D 244 ? THR D 247 ? LYS A 244 THR A 247 AA6 5 ILE D 263 ? ASN D 264 ? ILE A 263 ASN A 264 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O LEU A 207 ? O LEU C 207 N LEU A 196 ? N LEU C 196 AA1 2 3 N LEU A 192 ? N LEU C 192 O LYS A 212 ? O LYS C 212 AA2 1 2 O LEU A 207 ? O LEU C 207 N LEU A 196 ? N LEU C 196 AA2 2 3 O PHE A 191 ? O PHE C 191 N TRP A 182 ? N TRP C 182 AA2 3 4 N ALA A 177 ? N ALA C 177 O LYS A 244 ? O LYS C 244 AA2 4 5 N PHE A 245 ? N PHE C 245 O ILE A 263 ? O ILE C 263 AA3 1 2 O LYS B 212 ? O LYS D 212 N LEU B 192 ? N LEU D 192 AA3 2 3 O HIS B 197 ? O HIS D 197 N SER B 176 ? N SER D 176 AA3 3 4 N ALA B 177 ? N ALA D 177 O LYS B 244 ? O LYS D 244 AA4 1 2 N ALA C 177 ? N ALA B 177 O VAL C 246 ? O VAL B 246 AA4 2 3 N THR C 247 ? N THR B 247 O ILE C 263 ? O ILE B 263 AA5 1 2 N TRP C 182 ? N TRP B 182 O PHE C 191 ? O PHE B 191 AA5 2 3 N TYR C 198 ? N TYR B 198 O ARG C 205 ? O ARG B 205 AA6 1 2 O ARG D 205 ? O ARG A 205 N TYR D 198 ? N TYR A 198 AA6 2 3 O HIS D 197 ? O HIS A 197 N SER D 176 ? N SER A 176 AA6 3 4 N ALA D 177 ? N ALA A 177 O LYS D 244 ? O LYS A 244 AA6 4 5 N THR D 247 ? N THR A 247 O ILE D 263 ? O ILE A 263 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O A PHE 435 ? ? OH A TYR 527 ? ? 2.14 2 1 O B VAL 385 ? ? OG B SER 388 ? ? 2.16 3 1 OH A TYR 323 ? ? OD1 A ASP 365 ? ? 2.16 4 1 O A SER 143 ? ? OG1 A THR 146 ? ? 2.18 5 1 ND2 A ASN 272 ? ? OP2 E DA -2 ? ? 2.18 6 1 O C ARG 318 ? ? OG C SER 321 ? ? 2.18 7 1 O B GLY 590 ? ? OG1 B THR 593 ? ? 2.18 8 1 O B MET 541 ? ? 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PDB 'experimental model' 6DX0 1 2 1 4D1Q ? ? ? ? ? PDB 'experimental model' 4D1Q 2 3 1 8EB5 ? ? ? ? ? PDB 'experimental model' 8EB5 3 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8SJD _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ;The 3D reconstruction is not representative of the complex in solution. The Hermes tranposase forms a tetramer of dimers assembled in a ring like shape. Only the Hermes dimers interacting with the DNAs have been partially reconstructed. Their BED domains did not show any density. ; _em_3d_reconstruction.resolution 5.1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 53656 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Two right-end Hermes transpososome' _em_entity_assembly.details ;Hermes transposase tetramer of dimers complex bound to two transposon right-end DNAs. The complex was obtained by mixing the purified protein and the DNA. ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2,3,4 # _em_imaging.entry_id 8SJD _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8SJD _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 298 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8SJD _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 C MET 1 ? 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