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EMDB EMD-40568 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of human SIgA1 in complex with Streptococcus pyogenes protein M4 (Arp4)' _pdbx_database_related.db_id EMD-40568 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8SKV _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-04-20 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Liu, Q.' 1 0009-0007-5604-8352 'Stadtmueller, B.M.' 2 0000-0003-0637-3206 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 14 _citation.language ? _citation.page_first 6726 _citation.page_last 6726 _citation.title 'SIgA structures bound to Streptococcus pyogenes M4 and human CD89 provide insights into host-pathogen interactions.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-023-42469-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 37872175 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Liu, Q.' 1 0009-0007-5604-8352 primary 'Stadtmueller, B.M.' 2 0000-0003-0637-3206 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8SKV _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8SKV _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Immunoglobulin heavy constant alpha 1' 37687.488 4 ? ? ? 'The sequence of the Fab region is not included due to legal reasons.' 2 polymer man 'Secretory component' 61095.578 1 ? ? ? 'secretory component' 3 polymer man 'Immunoglobulin J chain' 15611.458 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'IgA receptor' 37352.664 2 ? ? ? 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1 23 VAL n 1 24 ILE n 1 25 ALA n 1 26 CYS n 1 27 LEU n 1 28 VAL n 1 29 GLN n 1 30 GLY n 1 31 PHE n 1 32 PHE n 1 33 PRO n 1 34 GLN n 1 35 GLU n 1 36 PRO n 1 37 LEU n 1 38 SER n 1 39 VAL n 1 40 THR n 1 41 TRP n 1 42 SER n 1 43 GLU n 1 44 SER n 1 45 GLY n 1 46 GLN n 1 47 GLY n 1 48 VAL n 1 49 THR n 1 50 ALA n 1 51 ARG n 1 52 ASN n 1 53 PHE n 1 54 PRO n 1 55 PRO n 1 56 SER n 1 57 GLN n 1 58 ASP n 1 59 ALA n 1 60 SER n 1 61 GLY n 1 62 ASP n 1 63 LEU n 1 64 TYR n 1 65 THR n 1 66 THR n 1 67 SER n 1 68 SER n 1 69 GLN n 1 70 LEU n 1 71 THR n 1 72 LEU n 1 73 PRO n 1 74 ALA n 1 75 THR n 1 76 GLN n 1 77 CYS n 1 78 LEU n 1 79 ALA n 1 80 GLY n 1 81 LYS n 1 82 SER n 1 83 VAL n 1 84 THR n 1 85 CYS n 1 86 HIS n 1 87 VAL n 1 88 LYS n 1 89 HIS n 1 90 TYR n 1 91 THR n 1 92 ASN n 1 93 PRO n 1 94 SER n 1 95 GLN n 1 96 ASP n 1 97 VAL n 1 98 THR n 1 99 VAL n 1 100 PRO n 1 101 CYS n 1 102 PRO n 1 103 VAL n 1 104 PRO n 1 105 SER n 1 106 THR n 1 107 PRO n 1 108 PRO n 1 109 THR n 1 110 PRO n 1 111 SER n 1 112 PRO 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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C CYS 180 SG ? ? ? 1_555 D CYS 123 SG ? ? C CYS 299 D CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 192 SG ? ? ? 1_555 E CYS 468 SG ? ? C CYS 311 E CYS 468 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 250 SG ? ? ? 1_555 C CYS 313 SG ? ? C CYS 369 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 352 SG ? ? ? 1_555 F CYS 15 SG ? ? C CYS 471 J CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 147 SG ? ? ? 1_555 D CYS 204 SG ? ? D CYS 266 D CYS 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 250 SG ? ? ? 1_555 D CYS 313 SG ? ? D CYS 369 D CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 92 SG ? ? E CYS 22 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 38 SG ? ? ? 1_555 E CYS 46 SG ? ? E CYS 38 E CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 134 SG ? ? ? 1_555 E CYS 202 SG ? ? E CYS 134 E CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf19 disulf ? ? 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