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M PHE 45 CE1 284 1 Y 1 M PHE 45 ? CE2 ? M PHE 45 CE2 285 1 Y 1 M PHE 45 ? CZ ? M PHE 45 CZ 286 1 Y 1 M LYS 48 ? CG ? M LYS 48 CG 287 1 Y 1 M LYS 48 ? CD ? M LYS 48 CD 288 1 Y 1 M LYS 48 ? CE ? M LYS 48 CE 289 1 Y 1 M LYS 48 ? NZ ? M LYS 48 NZ 290 1 Y 1 M GLU 51 ? CG ? M GLU 51 CG 291 1 Y 1 M GLU 51 ? CD ? M GLU 51 CD 292 1 Y 1 M GLU 51 ? OE1 ? M GLU 51 OE1 293 1 Y 1 M GLU 51 ? OE2 ? M GLU 51 OE2 294 1 Y 1 M ARG 54 ? CG ? M ARG 54 CG 295 1 Y 1 M ARG 54 ? CD ? M ARG 54 CD 296 1 Y 1 M ARG 54 ? NE ? M ARG 54 NE 297 1 Y 1 M ARG 54 ? CZ ? M ARG 54 CZ 298 1 Y 1 M ARG 54 ? NH1 ? M ARG 54 NH1 299 1 Y 1 M ARG 54 ? NH2 ? M ARG 54 NH2 300 1 Y 1 M SER 57 ? OG ? M SER 57 OG 301 1 Y 1 M ASP 58 ? CG ? M ASP 58 CG 302 1 Y 1 M ASP 58 ? OD1 ? M ASP 58 OD1 303 1 Y 1 M ASP 58 ? OD2 ? M ASP 58 OD2 304 1 Y 1 M TYR 59 ? CG ? M TYR 59 CG 305 1 Y 1 M TYR 59 ? CD1 ? M TYR 59 CD1 306 1 Y 1 M TYR 59 ? CD2 ? M TYR 59 CD2 307 1 Y 1 M TYR 59 ? CE1 ? M TYR 59 CE1 308 1 Y 1 M TYR 59 ? CE2 ? M TYR 59 CE2 309 1 Y 1 M TYR 59 ? CZ ? M TYR 59 CZ 310 1 Y 1 M TYR 59 ? OH ? M TYR 59 OH 311 1 Y 1 M SER 65 ? OG ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.635 ? 23947 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 25.677 ? 6765 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 2707 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1994 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8SVF _struct.title 'BAP1/ASXL1 bound to the H2AK119Ub Nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8SVF _struct_keywords.text 'DNA complex protein, hydrolase, structural protein, NUCLEAR PROTEIN-DNA-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN/DNA/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H32_XENLA P84233 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1_XENLA P06897 ? 3 ;MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAVRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESAKSAKSK ; 1 4 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 5 PDB 8SVF 8SVF ? 5 ? 1 6 PDB 8SVF 8SVF ? 6 ? 1 7 UNP BAP1_HUMAN Q92560 ? 7 ;MNKGWLELESDPGLFTLLVEDFGVKGVQVEEIYDLQSKCQGPVYGFIFLFKWIEERRSRRKVSTLVDDTSVIDDDIVNNM FFAHQLIPNSCATHALLSVLLNCSSVDLGPTLSRMKDFTKGFSPESKGYAIGNAPELAKAHNSHARPEPRHLPEKQNGLS AVRTMEAFHFVSYVPITGRLFELDGLKVYPIDHGPWGEDEEWTDKARRVIMERIGLATAGEPYHDIRFNLMAVVPDRRIK YEARLHVLKVNRQTVLEALQQLIRVTQPELIQTHKSQESQLPEESKSASNKSPLVLEANRAPAASEGNHTDGAEEAAGSC AQAPSHSPPNKPKLVVKPPGSSLNGVHPNPTPIVQRLPAFLDNHNYAKSPMQEEEDLAAGVGRSRVPVRPPQQYSDDEDD YEDDEEDDVQNTNSALRYKGKGTGKPGALSGSADGQLSVLQPNTINVLAEKLKESQKDLSIPLSIKTSSGAGSPAVAVPT HSQPSPTPSNESTDTASEIGSAFNSPLRSPIRSANPTRPSSPVTSHISKVLFGEDDSLLRVDCIRYNRAVRDLGPVISTG LLHLAEDGVLSPLALTEGGKGSSPSIRPIQGSQGSSSPVEKEVVEATDSREKTGMVRPGEPLSGEKYSPKELLALLKCVE AEIANYEACLKEEVEKRKKFKIDDQRRTHNYDEFICTFISMLAQEGMLANLVEQNISVRRRQGVSIGRLHKQRKPDRRKR SRPYKAKRQ ; 1 8 UNP ASXL1_HUMAN Q8IXJ9 ? 8 ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGLFYKLPGRISL FTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSNPRDSYRASSQANK QKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSLALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATG QMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHFQQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSW RERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQWKEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQEEAEIKSGLCVPGESVRIQRGPA TRQRDGHFKKRSRPDLRTRARRNLYKKQESEQAGVAKDAKSVASDVPLYKDGEAKTDPAGLSSPHLPGTSSAAPDLEGPE FPVESVASRIQAEPDNLARASASPDRIPSLPQETVDQEPKDQKRKSFEQAASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKP QPTKEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVVKGQPTYQICPRIIPTTESSCRGWTGARTLADIKARALQVRGARGHHCHREAATTA IGGGGGPGGGGGGATDEGGGRGSSSGDGGEACGHPEPRGGPSTPGKCTSDLQRTQLLPPYPLNGEHTQAGTAMSRARRED LPSLRKEESCLLQRATVGLTDGLGDASQLPVAPTGDQPCQALPLLSSQTSVAERLVEQPQLHPDVRTECESGTTSWESDD EEQGPTVPADNGPIPSLVGDDTLEKGTGQALDSHPTMKDPVNVTPSSTPESSPTDCLQNRAFDDELGLGGSCPPMRESDT RQENLKTKALVSNSSLHWIPIPSNDEVVKQPKPESREHIPSVEPQVGEEWEKAAPTPPALPGDLTAEEGLDPLDSLTSLW TVPSRGGSDSNGSYCQQVDIEKLKINGDSEALSPHGESTDTASDFEGHLTEDSSEADTREAAVTKGSSVDKDEKPNWNQS APLSKVNGDMRLVTRTDGMVAPQSWVSRVCAVRQKIPDSLLLASTEYQPRAVCLSMPGSSVEATNPLVMQLLQGSLPLEK VLPPAHDDSMSESPQVPLTKDQSHGSLRMGSLHGLGKNSGMVDGSSPSSLRALKEPLLPDSCETGTGLARIEATQAPGAP QKNCKAVPSFDSLHPVTNPITSSRKLEEMDSKEQFSSFSCEDQKEVRAMSQDSNSNAAPGKSPGDLTTSRTPRFSSPNVI SFGPEQTGRALGDQSNVTGQGKKLFGSGNVAATLQRPRPADPMPLPAEIPPVFPSGKLGPSTNSMSGGVQTPREDWAPKP HAFVGSVKNEKTFVGGPLKANAENRKATGHSPLELVGHLEGMPFVMDLPFWKLPREPGKGLSEPLEPSSLPSQLSIKQAF YGKLSKLQLSSTSFNYSSSSPTFPKGLAGSVVQLSHKANFGASHSASLSLQMFTDSSTVESISLQCACSLKAMIMCQGCG AFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR ; 1 9 UNP UBC_HUMAN P0CG48 ? 9 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8SVF A 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 2 2 8SVF B 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 3 3 8SVF C 1 ? 130 ? P06897 1 ? 130 ? 0 129 4 4 8SVF D 1 ? 126 ? P02281 1 ? 126 ? -3 122 5 1 8SVF E 1 ? 136 ? P84233 1 ? 136 ? 0 135 6 2 8SVF F 1 ? 103 ? P62799 1 ? 103 ? 0 102 7 3 8SVF G 1 ? 130 ? P06897 1 ? 130 ? 0 129 8 4 8SVF H 1 ? 126 ? P02281 1 ? 126 ? -3 122 9 5 8SVF I 1 ? 187 ? 8SVF -1 ? 185 ? -1 185 10 6 8SVF J 1 ? 327 ? 8SVF 13 ? 339 ? 13 339 11 7 8SVF K 1 ? 729 ? Q92560 1 ? 729 ? 1 729 12 8 8SVF L 1 ? 1541 ? Q8IXJ9 1 ? 1541 ? 1 1541 13 9 8SVF M 1 ? 76 ? P0CG48 1 ? 76 ? 1 76 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8SVF ALA A 103 ? UNP P84233 GLY 103 'engineered mutation' 102 1 3 8SVF ARG C 100 ? UNP P06897 GLY 100 'engineered mutation' 99 2 4 8SVF THR D 33 ? UNP P02281 SER 33 'engineered mutation' 29 3 5 8SVF ALA E 103 ? UNP P84233 GLY 103 'engineered mutation' 102 4 7 8SVF ARG G 100 ? UNP P06897 GLY 100 'engineered mutation' 99 5 8 8SVF THR H 33 ? UNP P02281 SER 33 'engineered mutation' 29 6 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 13-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? 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ASN K 229 PRO K 235 AB2 3 PHE K 46 ? LEU K 49 ? PHE K 46 LEU K 49 AB2 4 PHE K 170 ? ILE K 176 ? PHE K 170 ILE K 176 AB2 5 ARG K 179 ? LEU K 183 ? ARG K 179 LEU K 183 AB2 6 ILE K 191 ? PRO K 195 ? ILE K 191 PRO K 195 AB3 1 ARG L 293 ? VAL L 295 ? ARG L 293 VAL L 295 AB3 2 LEU L 301 ? LEU L 303 ? LEU L 301 LEU L 303 AB4 1 THR M 12 ? LEU M 15 ? THR M 12 LEU M 15 AB4 2 ILE M 3 ? LYS M 6 ? ILE M 3 LYS M 6 AB4 3 THR M 66 ? LEU M 71 ? THR M 66 LEU M 71 AB4 4 GLN M 41 ? PHE M 45 ? GLN M 41 PHE M 45 AB4 5 LYS M 48 ? LEU M 50 ? LYS M 48 LEU M 50 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ARG A 84 ? N ARG A 83 O VAL B 82 ? O VAL B 81 AA2 1 2 N ILE A 120 ? N ILE A 119 O ARG B 46 ? O ARG B 45 AA3 1 2 N THR B 97 ? N THR B 96 O THR G 102 ? O THR G 101 AA4 1 2 N ARG C 43 ? N ARG C 42 O ILE D 90 ? O ILE D 86 AA5 1 2 N ILE C 79 ? N ILE C 78 O GLY D 54 ? O GLY D 50 AA6 1 2 N THR C 102 ? N THR C 101 O TYR F 99 ? O TYR F 98 AA7 1 2 N ARG E 84 ? N ARG E 83 O VAL F 82 ? O VAL F 81 AA8 1 2 N ILE E 120 ? N ILE E 119 O ARG F 46 ? O ARG F 45 AA9 1 2 N ARG G 43 ? N ARG G 42 O ILE H 90 ? O ILE H 86 AB1 1 2 N ILE G 79 ? N ILE G 78 O GLY H 54 ? O GLY H 50 AB2 1 2 N GLN K 28 ? N GLN K 28 O VAL K 234 ? O VAL K 234 AB2 2 3 O MET K 231 ? O MET K 231 N ILE K 47 ? N ILE K 47 AB2 3 4 N PHE K 48 ? N PHE K 48 O VAL K 171 ? O VAL K 171 AB2 4 5 N ILE K 176 ? N ILE K 176 O ARG K 179 ? O ARG K 179 AB2 5 6 N LEU K 180 ? N LEU K 180 O GLY K 194 ? O GLY K 194 AB3 1 2 N GLN L 294 ? N GLN L 294 O ARG L 302 ? O ARG L 302 AB4 1 2 O LEU M 15 ? O LEU M 15 N ILE M 3 ? N ILE M 3 AB4 2 3 N PHE M 4 ? N PHE M 4 O LEU M 67 ? O LEU M 67 AB4 3 4 O HIS M 68 ? O HIS M 68 N ILE M 44 ? N ILE M 44 AB4 4 5 N LEU M 43 ? N LEU M 43 O LEU M 50 ? O LEU M 50 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 TYR H 34 ? ? -99.22 32.36 2 1 LYS K 51 ? ? 178.18 168.40 3 1 TRP K 52 ? ? -142.28 32.66 4 1 ARG K 59 ? ? 68.79 -4.68 5 1 ALA K 219 ? ? 51.03 72.22 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8SVF _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol ? # loop_ _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 1 . . . 'Multimer prediction' ? ? AlphaFold 'in silico model' ? ? 2 1 3tu4 ? ? ? ? ? PDB 'experimental model' 3tu4 2 3 1 . . . 'SwissModel template' ? ? Other 'integrative model' 4uel 3 4 1 . . . 'SwissModel template' ? ? Other 'integrative model' 6hgc 4 5 1 7k5y ? ? ? ? ? PDB 'experimental model' 7k5y 5 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8SVF _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.2 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 39056 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'BAP1/ASXL1 bound to the H2AK119Ub Nucleosome' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9' # _em_imaging.entry_id 8SVF _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode OTHER _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 900 _em_imaging.nominal_defocus_max 1900 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type Quantifoil _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8SVF _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 298 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8SVF _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 0 ? A MET 1 2 1 Y 1 A ALA 1 ? A ALA 2 3 1 Y 1 A ARG 2 ? A ARG 3 4 1 Y 1 A THR 3 ? A THR 4 5 1 Y 1 A LYS 4 ? A LYS 5 6 1 Y 1 A GLN 5 ? A GLN 6 7 1 Y 1 A THR 6 ? A THR 7 8 1 Y 1 A ALA 7 ? A ALA 8 9 1 Y 1 A ARG 8 ? A ARG 9 10 1 Y 1 A LYS 9 ? A LYS 10 11 1 Y 1 A SER 10 ? A SER 11 12 1 Y 1 A THR 11 ? A THR 12 13 1 Y 1 A GLY 12 ? A GLY 13 14 1 Y 1 A GLY 13 ? A GLY 14 15 1 Y 1 A LYS 14 ? A LYS 15 16 1 Y 1 A ALA 15 ? A ALA 16 17 1 Y 1 A PRO 16 ? A PRO 17 18 1 Y 1 A ARG 17 ? A ARG 18 19 1 Y 1 A LYS 18 ? A LYS 19 20 1 Y 1 A GLN 19 ? A GLN 20 21 1 Y 1 A LEU 20 ? A LEU 21 22 1 Y 1 A ALA 21 ? A ALA 22 23 1 Y 1 A THR 22 ? A THR 23 24 1 Y 1 A LYS 23 ? A LYS 24 25 1 Y 1 A ALA 24 ? A ALA 25 26 1 Y 1 A ALA 25 ? A ALA 26 27 1 Y 1 A ARG 26 ? A ARG 27 28 1 Y 1 A LYS 27 ? A LYS 28 29 1 Y 1 A SER 28 ? A SER 29 30 1 Y 1 A ALA 29 ? A ALA 30 31 1 Y 1 A PRO 30 ? A PRO 31 32 1 Y 1 A ALA 31 ? A ALA 32 33 1 Y 1 A THR 32 ? A THR 33 34 1 Y 1 A GLY 33 ? A GLY 34 35 1 Y 1 A GLY 34 ? A GLY 35 36 1 Y 1 A VAL 35 ? A VAL 36 37 1 Y 1 A LYS 36 ? A LYS 37 38 1 Y 1 A ALA 135 ? A ALA 136 39 1 Y 1 B MET 0 ? B MET 1 40 1 Y 1 B SER 1 ? B SER 2 41 1 Y 1 B GLY 2 ? B GLY 3 42 1 Y 1 B ARG 3 ? B ARG 4 43 1 Y 1 B GLY 4 ? B GLY 5 44 1 Y 1 B LYS 5 ? B LYS 6 45 1 Y 1 B GLY 6 ? B GLY 7 46 1 Y 1 B GLY 7 ? B GLY 8 47 1 Y 1 B LYS 8 ? B LYS 9 48 1 Y 1 B GLY 9 ? B GLY 10 49 1 Y 1 B LEU 10 ? B LEU 11 50 1 Y 1 B GLY 11 ? B GLY 12 51 1 Y 1 B LYS 12 ? B LYS 13 52 1 Y 1 B GLY 13 ? B GLY 14 53 1 Y 1 B GLY 14 ? B GLY 15 54 1 Y 1 B ALA 15 ? B ALA 16 55 1 Y 1 B LYS 16 ? B LYS 17 56 1 Y 1 B ARG 17 ? B ARG 18 57 1 Y 1 B HIS 18 ? B HIS 19 58 1 Y 1 B ARG 19 ? B ARG 20 59 1 Y 1 B LYS 20 ? B LYS 21 60 1 Y 1 B GLY 102 ? B GLY 103 61 1 Y 1 C MET 0 ? C MET 1 62 1 Y 1 C SER 1 ? C SER 2 63 1 Y 1 C GLY 2 ? C GLY 3 64 1 Y 1 C ARG 3 ? C ARG 4 65 1 Y 1 C GLY 4 ? C GLY 5 66 1 Y 1 C LYS 5 ? C LYS 6 67 1 Y 1 C GLN 6 ? C GLN 7 68 1 Y 1 C GLY 7 ? C GLY 8 69 1 Y 1 C GLY 8 ? C GLY 9 70 1 Y 1 C LYS 9 ? C LYS 10 71 1 Y 1 C THR 10 ? C THR 11 72 1 Y 1 C ARG 11 ? C ARG 12 73 1 Y 1 C ILE 111 ? C ILE 112 74 1 Y 1 C GLN 112 ? C GLN 113 75 1 Y 1 C SER 113 ? C SER 114 76 1 Y 1 C VAL 114 ? C VAL 115 77 1 Y 1 C LEU 115 ? C LEU 116 78 1 Y 1 C LEU 116 ? C LEU 117 79 1 Y 1 C PRO 117 ? C PRO 118 80 1 Y 1 C LYS 118 ? C LYS 119 81 1 Y 1 C LYS 119 ? C LYS 120 82 1 Y 1 C THR 120 ? C THR 121 83 1 Y 1 C GLU 121 ? C GLU 122 84 1 Y 1 C SER 122 ? C SER 123 85 1 Y 1 C ALA 123 ? C ALA 124 86 1 Y 1 C LYS 124 ? C LYS 125 87 1 Y 1 C SER 125 ? C SER 126 88 1 Y 1 C ALA 126 ? C ALA 127 89 1 Y 1 C LYS 127 ? C LYS 128 90 1 Y 1 C SER 128 ? C SER 129 91 1 Y 1 C LYS 129 ? C LYS 130 92 1 Y 1 D MET -3 ? D MET 1 93 1 Y 1 D PRO -2 ? D PRO 2 94 1 Y 1 D GLU -1 ? D GLU 3 95 1 Y 1 D PRO 0 ? D PRO 4 96 1 Y 1 D ALA 1 ? D ALA 5 97 1 Y 1 D LYS 2 ? D LYS 6 98 1 Y 1 D SER 3 ? D SER 7 99 1 Y 1 D ALA 4 ? D ALA 8 100 1 Y 1 D PRO 5 ? D PRO 9 101 1 Y 1 D ALA 6 ? D ALA 10 102 1 Y 1 D PRO 7 ? D PRO 11 103 1 Y 1 D LYS 8 ? D LYS 12 104 1 Y 1 D LYS 9 ? 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N N 132 C N1 C2 sing N N 133 C N1 C6 sing N N 134 C C2 O2 doub N N 135 C C2 N3 sing N N 136 C N3 C4 doub N N 137 C C4 N4 sing N N 138 C C4 C5 sing N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 CYS N CA sing N N 145 CYS N H sing N N 146 CYS N H2 sing N N 147 CYS CA C sing N N 148 CYS CA CB sing N N 149 CYS CA HA sing N N 150 CYS C O doub N N 151 CYS C OXT sing N N 152 CYS CB SG sing N N 153 CYS CB HB2 sing N N 154 CYS CB HB3 sing N N 155 CYS SG HG sing N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 DA OP3 P sing N N 158 DA OP3 HOP3 sing N N 159 DA P OP1 doub N N 160 DA P OP2 sing N N 161 DA P "O5'" sing N N 162 DA OP2 HOP2 sing N N 163 DA "O5'" "C5'" sing N N 164 DA "C5'" "C4'" sing N N 165 DA "C5'" "H5'" sing N N 166 DA "C5'" "H5''" sing N N 167 DA "C4'" "O4'" sing N N 168 DA "C4'" "C3'" sing N N 169 DA "C4'" "H4'" sing N N 170 DA "O4'" "C1'" sing N N 171 DA "C3'" "O3'" sing N N 172 DA "C3'" "C2'" sing N N 173 DA "C3'" "H3'" sing N N 174 DA "O3'" "HO3'" sing N N 175 DA "C2'" "C1'" sing N N 176 DA "C2'" "H2'" sing N N 177 DA "C2'" "H2''" sing N N 178 DA "C1'" N9 sing N N 179 DA "C1'" "H1'" sing N N 180 DA N9 C8 sing Y N 181 DA N9 C4 sing Y N 182 DA C8 N7 doub Y N 183 DA C8 H8 sing N N 184 DA N7 C5 sing Y N 185 DA C5 C6 sing Y N 186 DA C5 C4 doub Y N 187 DA C6 N6 sing N N 188 DA C6 N1 doub Y N 189 DA N6 H61 sing N N 190 DA N6 H62 sing N N 191 DA N1 C2 sing Y N 192 DA C2 N3 doub Y N 193 DA C2 H2 sing N N 194 DA N3 C4 sing Y N 195 DC OP3 P sing N N 196 DC OP3 HOP3 sing N N 197 DC P OP1 doub N N 198 DC P OP2 sing N N 199 DC P "O5'" sing N N 200 DC OP2 HOP2 sing N N 201 DC "O5'" "C5'" sing N N 202 DC "C5'" "C4'" sing N N 203 DC "C5'" "H5'" sing N N 204 DC "C5'" "H5''" sing N N 205 DC "C4'" "O4'" sing N N 206 DC "C4'" "C3'" sing N N 207 DC "C4'" "H4'" sing N N 208 DC "O4'" "C1'" sing N N 209 DC "C3'" "O3'" sing N N 210 DC "C3'" "C2'" sing N N 211 DC "C3'" "H3'" sing N N 212 DC "O3'" "HO3'" sing N N 213 DC "C2'" "C1'" 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N N 379 GLU CD OE1 doub N N 380 GLU CD OE2 sing N N 381 GLU OE2 HE2 sing N N 382 GLU OXT HXT sing N N 383 GLY N CA sing N N 384 GLY N H sing N N 385 GLY N H2 sing N N 386 GLY CA C sing N N 387 GLY CA HA2 sing N N 388 GLY CA HA3 sing N N 389 GLY C O doub N N 390 GLY C OXT sing N N 391 GLY OXT HXT sing N N 392 HIS N CA sing N N 393 HIS N H sing N N 394 HIS N H2 sing N N 395 HIS CA C sing N N 396 HIS CA CB sing N N 397 HIS CA HA sing N N 398 HIS C O doub N N 399 HIS C OXT sing N N 400 HIS CB CG sing N N 401 HIS CB HB2 sing N N 402 HIS CB HB3 sing N N 403 HIS CG ND1 sing Y N 404 HIS CG CD2 doub Y N 405 HIS ND1 CE1 doub Y N 406 HIS ND1 HD1 sing N N 407 HIS CD2 NE2 sing Y N 408 HIS CD2 HD2 sing N N 409 HIS CE1 NE2 sing Y N 410 HIS CE1 HE1 sing N N 411 HIS NE2 HE2 sing N N 412 HIS OXT HXT sing N N 413 ILE N CA sing N N 414 ILE N H sing N N 415 ILE N H2 sing N N 416 ILE CA C sing N N 417 ILE CA CB sing N N 418 ILE CA HA sing N N 419 ILE C O doub N N 420 ILE C OXT sing N N 421 ILE CB CG1 sing N 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