data_8T08 # _entry.id 8T08 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.380 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8T08 pdb_00008t08 10.2210/pdb8t08/pdb WWPDB D_1000274921 ? ? EMDB EMD-40938 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Preholo-Proteasome from Pre1-1 Pre4-1 Double Mutant' _pdbx_database_related.db_id EMD-40938 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8T08 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-05-31 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Walsh Jr., R.M.' 1 0000-0002-8939-8988 'Rawson, S.' 2 0000-0002-2973-2630 'Schnell, H.' 3 0000-0002-7840-4473 'Velez, B.' 4 0000-0002-9090-0699 'Hanna, J.' 5 0000-0003-2964-1058 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 30 _citation.language ? _citation.page_first 1516 _citation.page_last 1524 _citation.title 'Structure of the preholoproteasome reveals late steps in proteasome core particle biogenesis.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-023-01081-w _citation.pdbx_database_id_PubMed 37653242 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Walsh Jr., R.M.' 1 0000-0002-8939-8988 primary 'Rawson, S.' 2 0000-0002-2973-2630 primary 'Schnell, H.M.' 3 0000-0002-7840-4473 primary 'Velez, B.' 4 0000-0002-9090-0699 primary 'Rajakumar, T.' 5 ? primary 'Hanna, J.' 6 0000-0003-2964-1058 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8T08 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8T08 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-1' 28033.830 2 3.4.25.1 ? ? ? 2 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-2' 27191.828 2 3.4.25.1 ? ? ? 3 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-3' 28748.230 2 3.4.25.1 ? ? ? 4 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-4' 28478.111 2 3.4.25.1 ? ? ? 5 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-5' 28649.086 2 3.4.25.1 ? ? ? 6 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-6' 25634.000 2 3.4.25.1 ? ? ? 7 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-7' 31575.068 2 3.4.25.1 ? ? ? 8 polymer nat 'Proteasome maturation factor UMP1' 16777.766 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-2' 28299.889 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-3' 22627.842 2 3.4.25.1 ? ? ? 11 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-4' 22605.771 2 ? ? ? ? 12 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-5' 31670.539 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-6' 26905.076 2 3.4.25.1 ? ? ? 14 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-1' 23573.604 2 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer nat 'Proteasome chaperone 1' 30718.074 2 ? ? ? ? 16 polymer nat 'Proteasome assembly chaperone 2' 30762.895 2 ? ? ? ? 17 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-7' 27716.293 2 ? 'Deletion of 15 C-terminal residues 252-266 (WDFAKDIKGYGTQKI)' ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;Macropain subunit C7-alpha,Multicatalytic endopeptidase complex C7,Proteasome component C7-alpha,Proteasome component Y8,Proteinase YSCE subunit 7,SCL1 suppressor protein ; 2 'Macropain subunit Y7,Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y7,Proteasome component Y7,Proteinase YSCE subunit 7' 3 'Macropain subunit Y13,Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y13,Proteasome component Y13,Proteinase YSCE subunit 13' 4 'Macropain subunit PRE6,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE6,Proteasome component PRE6,Proteinase YSCE subunit PRE6' 5 'Macropain subunit PUP2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP2,Proteasome component PUP2,Proteinase YSCE subunit PUP2' 6 'Macropain subunit PRE5,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE5,Proteasome component PRE5,Proteinase YSCE subunit PRE5' 7 'Macropain subunit C1,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C1,Proteasome component C1,Proteinase YSCE subunit 1' 9 'Macropain subunit PUP1,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP1,Proteasome component PUP1,Proteinase YSCE subunit PUP1' 10 'Macropain subunit PUP3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP3,Proteasome component PUP3' 11 'Macropain subunit C11,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C11,Proteasome component C11,Proteinase YSCE subunit 11' 12 'Macropain subunit PRE2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE2,Proteasome component PRE2,Proteinase YSCE subunit PRE2' 13 'Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5,Proteasome component C5' 14 'Macropain subunit PRE3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE3,Proteasome component PRE3,Proteinase YSCE subunit PRE3' 15 'Proteasome biogenesis-associated protein 1' 16 'Alpha-1-proteinase inhibitor-degradation deficient protein 66,Proteasome biogenesis-associated protein 2' 17 'Macropain subunit PRE4,Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE4,Proteasome component PRE4,Proteinase YSCE subunit PRE4' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; A,R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; B,S ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; C,T ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; D,U ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; E,V ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; F,W ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; G,X ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNIVPQDTFKSQVSTDQDKSVLSSAVPSLPDTLRQQEGGAVPLSTQLNDRHPLESTLKNWETTQRQRQMEQYRQIFGIAE PMKRTMEMEIVNRTDFNPLSTNGSIHRDILLNKECSIDWEDVYPGTGLQASTMVGDDVHSKIEKQLGI ; ;MNIVPQDTFKSQVSTDQDKSVLSSAVPSLPDTLRQQEGGAVPLSTQLNDRHPLESTLKNWETTQRQRQMEQYRQIFGIAE PMKRTMEMEIVNRTDFNPLSTNGSIHRDILLNKECSIDWEDVYPGTGLQASTMVGDDVHSKIEKQLGI ; H,Y ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; I,Z ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; J,a ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFFLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFFLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; K,b ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; L,c ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; M,d ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; N,e ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MLFKQWNDLPEPKHLLDLPEISKNLQSLEVCPVPKVEFPQDLDVPQYSTAVITTKIMNPLFPKNLLQLTSIGEIKTTLTV KSPSLPQSSGKHSWNYDENFPNEVDPDQKNDTADETVYGFSFPIYSFGKTLLFSMEENFISISPIFGNMISRSIISQLAQ FSPDIIVIGTSDKIASMKVMTENECTLQPPEFITGFIGSVLTQLIVGPSKGLKFKCLVAPSEGPNGFEKLSLSDMGSLVD LCGQWLGFEPSRYSEECYRLWRCDSAAIGAQSGLYI ; ;MLFKQWNDLPEPKHLLDLPEISKNLQSLEVCPVPKVEFPQDLDVPQYSTAVITTKIMNPLFPKNLLQLTSIGEIKTTLTV KSPSLPQSSGKHSWNYDENFPNEVDPDQKNDTADETVYGFSFPIYSFGKTLLFSMEENFISISPIFGNMISRSIISQLAQ FSPDIIVIGTSDKIASMKVMTENECTLQPPEFITGFIGSVLTQLIVGPSKGLKFKCLVAPSEGPNGFEKLSLSDMGSLVD LCGQWLGFEPSRYSEECYRLWRCDSAAIGAQSGLYI ; O,f ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MSCLVLPLVSVGNIPQLSIDWLLNSQANEWEYLEALDSKYLVEFVGPLDRPEDGSDSLYKDADMKYSSALEVFYNKKRGL FAIQQRTPLVSVNYLNNFIVEIILPFLSKYNISEICIWDSLYAMEDENGVIVRPQEVYSLGEFYFDDEAELLSNLHLNDQ ESMVNNWLHFTPTSFQDKISVDQPIFKILFQILNASQRPKALRSIKYCSCLANEGDNSLDSQQFLQWIISQKVIKNAPPI VKFVRPISWQGAYGMADARDKFVDLYN ; ;MSCLVLPLVSVGNIPQLSIDWLLNSQANEWEYLEALDSKYLVEFVGPLDRPEDGSDSLYKDADMKYSSALEVFYNKKRGL FAIQQRTPLVSVNYLNNFIVEIILPFLSKYNISEICIWDSLYAMEDENGVIVRPQEVYSLGEFYFDDEAELLSNLHLNDQ ESMVNNWLHFTPTSFQDKISVDQPIFKILFQILNASQRPKALRSIKYCSCLANEGDNSLDSQQFLQWIISQKVIKNAPPI VKFVRPISWQGAYGMADARDKFVDLYN ; P,g ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMK ; ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMK ; Q,h ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 GLY n 1 4 ALA n 1 5 ALA n 1 6 ALA n 1 7 ALA n 1 8 SER n 1 9 ALA n 1 10 ALA n 1 11 GLY n 1 12 TYR n 1 13 ASP n 1 14 ARG n 1 15 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17 ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8T08 A 1 ? 252 ? 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P40302 1 ? 234 ? 1 234 24 7 8T08 X 1 ? 288 ? P21242 1 ? 288 ? 1 288 25 8 8T08 Y 1 ? 148 ? P38293 1 ? 148 ? 1 148 26 9 8T08 Z 1 ? 261 ? P25043 1 ? 261 ? 1 261 27 10 8T08 a 1 ? 205 ? P25451 1 ? 205 ? 1 205 28 11 8T08 b 1 ? 198 ? P22141 1 ? 198 ? 1 198 29 12 8T08 c 1 ? 287 ? P30656 1 ? 287 ? 1 287 30 13 8T08 d 1 ? 241 ? P23724 1 ? 241 ? 1 241 31 14 8T08 e 1 ? 215 ? P38624 1 ? 215 ? 1 215 32 15 8T08 f 1 ? 276 ? Q05778 1 ? 276 ? 1 276 33 16 8T08 g 1 ? 267 ? P36040 1 ? 267 ? 1 267 34 17 8T08 h 1 ? 251 ? P30657 1 ? 251 ? 1 251 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 11 8T08 PHE K 142 ? UNP P22141 SER 142 conflict 142 1 28 8T08 PHE b 142 ? UNP P22141 SER 142 conflict 142 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8T08 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8T08 _struct.title 'Preholo-Proteasome from Pre1-1 Pre4-1 Double Mutant' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8T08 _struct_keywords.text 'Preholo-proteasome, core particle, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 1 ? S N N 2 ? T N N 3 ? U N N 4 ? V N N 5 ? W N N 6 ? X N N 7 ? Y N N 8 ? Z N N 9 ? AA N N 10 ? BA N N 11 ? CA N N 12 ? DA N N 13 ? EA N N 14 ? FA N N 15 ? GA N N 16 ? HA N N 17 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 11 ? ILE A 16 ? GLY A 11 ILE A 16 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 25 ? THR A 35 ? LEU A 25 THR A 35 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 65 ? VAL A 69 ? ASP A 65 VAL A 69 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 86 ? GLY A 109 ? PRO A 86 GLY A 109 1 ? 24 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO A 113 ? ARG A 131 ? PRO A 113 ARG A 131 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS A 174 ? PHE A 186 ? LYS A 174 PHE A 186 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 198 ? GLY A 215 ? SER A 198 GLY A 215 1 ? 18 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 237 ? GLU A 250 ? SER A 237 GLU A 250 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU B 18 ? GLY B 31 ? LEU B 18 GLY B 31 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 MET B 57 ? LEU B 61 ? MET B 57 LEU B 61 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 MET B 78 ? SER B 96 ? MET B 78 SER B 96 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 AB3 TYR B 97 ? GLY B 102 ? TYR B 97 GLY B 102 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO B 106 ? ALA B 121 ? PRO B 106 ALA B 121 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY B 167 ? ARG B 178 ? GLY B 167 ARG B 178 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 GLU B 184 ? VAL B 200 ? GLU B 184 VAL B 200 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN B 218 ? LEU B 222 ? ASN B 218 LEU B 222 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 239 ? ALA B 249 ? THR B 239 ALA B 249 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU C 19 ? SER C 30 ? LEU C 19 SER C 30 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU C 80 ? ASN C 103 ? LEU C 80 ASN C 103 1 ? 24 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO C 107 ? THR C 123 ? PRO C 107 THR C 123 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN C 168 ? TYR C 180 ? ASN C 168 TYR C 180 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS C 185 ? THR C 201 ? LYS C 185 THR C 201 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 AC5 THR C 207 ? ASP C 209 ? THR C 207 ASP C 209 5 ? 3 HELX_P HELX_P24 AC6 LYS C 231 ? GLY C 243 ? LYS C 231 GLY C 243 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 ILE D 17 ? ARG D 29 ? ILE D 17 ARG D 29 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP D 56 ? THR D 60 ? ASP D 56 THR D 60 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU D 78 ? LEU D 100 ? LEU D 78 LEU D 100 1 ? 23 HELX_P HELX_P28 AD1 THR D 105 ? TYR D 120 ? THR D 105 TYR D 120 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 SER D 168 ? TYR D 179 ? SER D 168 TYR D 179 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 AD3 THR D 187 ? GLU D 201 ? THR D 187 GLU D 201 1 ? 15 HELX_P HELX_P31 AD4 GLU D 227 ? GLU D 237 ? 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THR h 202 ASP h 221 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? F CYS 66 SG ? ? ? 1_555 F CYS 92 SG ? ? F CYS 66 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf2 disulf ? ? W CYS 66 SG ? ? ? 1_555 W CYS 92 SG ? ? W CYS 66 W CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 59 A . ? VAL 59 A PRO 60 A ? PRO 60 A 1 -10.35 2 PRO 238 P . ? PRO 238 P PRO 239 P ? PRO 239 P 1 -11.71 3 VAL 59 R . ? VAL 59 R PRO 60 R ? PRO 60 R 1 -10.44 4 PRO 238 GA . ? PRO 238 g PRO 239 GA ? PRO 239 g 1 -11.83 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 8 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 8 ? AD7 ? 5 ? AD8 ? 7 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 5 ? AE3 ? 5 ? AE4 ? 5 ? AE5 ? 6 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 5 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 5 ? AF2 ? 5 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 5 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 5 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 5 ? AF9 ? 6 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 5 ? AG3 ? 6 ? AG4 ? 5 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 5 ? AG7 ? 2 ? AG8 ? 5 ? AG9 ? 3 ? AH1 ? 5 ? AH2 ? 5 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 8 ? AH5 ? 2 ? AH6 ? 8 ? AH7 ? 5 ? AH8 ? 7 ? AH9 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? parallel AD4 5 6 ? parallel AD4 6 7 ? parallel AD4 7 8 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? parallel AD6 4 5 ? parallel AD6 5 6 ? parallel AD6 6 7 ? anti-parallel AD6 7 8 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD8 5 6 ? anti-parallel AD8 6 7 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF2 4 5 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF6 4 5 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AF9 5 6 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG2 4 5 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG3 4 5 ? anti-parallel AG3 5 6 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG4 4 5 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG6 4 5 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG8 4 5 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH1 3 4 ? anti-parallel AH1 4 5 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH2 3 4 ? anti-parallel AH2 4 5 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH4 3 4 ? anti-parallel AH4 4 5 ? parallel AH4 5 6 ? parallel AH4 6 7 ? parallel AH4 7 8 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH6 1 2 ? anti-parallel AH6 2 3 ? anti-parallel AH6 3 4 ? parallel AH6 4 5 ? parallel AH6 5 6 ? parallel AH6 6 7 ? anti-parallel AH6 7 8 ? anti-parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH7 2 3 ? anti-parallel AH7 3 4 ? anti-parallel AH7 4 5 ? anti-parallel AH8 1 2 ? anti-parallel AH8 2 3 ? anti-parallel AH8 3 4 ? anti-parallel AH8 4 5 ? anti-parallel AH8 5 6 ? anti-parallel AH8 6 7 ? anti-parallel AH9 1 2 ? anti-parallel AH9 2 3 ? anti-parallel AH9 3 4 ? anti-parallel AH9 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 168 ? THR A 171 ? ALA A 168 THR A 171 AA1 2 SER A 42 ? ARG A 46 ? SER A 42 ARG A 46 AA1 3 THR A 51 ? GLN A 56 ? THR A 51 GLN A 56 AA1 4 LEU A 223 ? ALA A 228 ? LEU A 223 ALA A 228 AA1 5 PHE A 233 ? THR A 235 ? PHE A 233 THR A 235 AA2 1 ILE A 72 ? PHE A 73 ? ILE A 72 PHE A 73 AA2 2 GLY A 80 ? ASN A 84 ? GLY A 80 ASN A 84 AA2 3 ILE A 140 ? ASP A 147 ? ILE A 140 ASP A 147 AA2 4 GLY A 151 ? THR A 157 ? GLY A 151 THR A 157 AA2 5 TYR A 163 ? TYR A 166 ? TYR A 163 TYR A 166 AA3 1 ALA B 161 ? ILE B 164 ? ALA B 161 ILE B 164 AA3 2 SER B 34 ? ALA B 39 ? SER B 34 ALA B 39 AA3 3 GLY B 42 ? GLU B 48 ? GLY B 42 GLU B 48 AA3 4 ILE B 209 ? ILE B 214 ? ILE B 209 ILE B 214 AA3 5 PHE B 235 ? LEU B 238 ? PHE B 235 LEU B 238 AA4 1 SER B 65 ? THR B 68 ? SER B 65 THR B 68 AA4 2 ILE B 71 ? GLY B 77 ? ILE B 71 GLY B 77 AA4 3 VAL B 132 ? ASP B 140 ? VAL B 132 ASP B 140 AA4 4 GLY B 144 ? VAL B 150 ? GLY B 144 VAL B 150 AA4 5 TYR B 156 ? PRO B 158 ? TYR B 156 PRO B 158 AA5 1 TYR B 224 ? THR B 225 ? TYR B 224 THR B 225 AA5 2 LYS I 211 ? LEU I 220 ? LYS I 211 LEU I 220 AA5 3 VAL I 202 ? GLU I 208 ? VAL I 202 GLU I 208 AA5 4 GLY I 40 ? ASP I 46 ? GLY I 40 ASP I 46 AA5 5 THR I 31 ? PHE I 37 ? THR I 31 PHE I 37 AA5 6 TYR I 153 ? GLY I 157 ? TYR I 153 GLY I 157 AA6 1 ALA C 162 ? VAL C 165 ? ALA C 162 VAL C 165 AA6 2 ALA C 35 ? ALA C 40 ? ALA C 35 ALA C 40 AA6 3 GLY C 43 ? GLU C 49 ? GLY C 43 GLU C 49 AA6 4 LEU C 211 ? ARG C 217 ? LEU C 211 ARG C 217 AA6 5 TYR C 226 ? ILE C 229 ? TYR C 226 ILE C 229 AA7 1 LEU C 66 ? ASN C 70 ? LEU C 66 ASN C 70 AA7 2 ILE C 73 ? GLY C 79 ? ILE C 73 GLY C 79 AA7 3 VAL C 133 ? GLY C 139 ? VAL C 133 GLY C 139 AA7 4 GLN C 147 ? SER C 151 ? GLN C 147 SER C 151 AA7 5 TYR C 157 ? TRP C 160 ? TYR C 157 TRP C 160 AA8 1 ALA D 161 ? ILE D 164 ? ALA D 161 ILE D 164 AA8 2 ALA D 33 ? LYS D 37 ? ALA D 33 LYS D 37 AA8 3 VAL D 42 ? CYS D 46 ? VAL D 42 CYS D 46 AA8 4 GLU D 211 ? LYS D 216 ? GLU D 211 LYS D 216 AA8 5 ASP D 220 ? ALA D 223 ? 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Pre4-1 Mutation is the deletion of the last 15 residues from the C-terminus of Proteasome subunit beta type-7. This double mutation allows for the accumulation of a population of Preholo-Proteasome. This late stage 20S assembley intermediate includes two copies of chaperones UMP1 and PBA1 and 2 in addition to all 28 subunits of the 20S core particle. ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17' # _em_imaging.entry_id 8T08 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 2200 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 81000 _em_imaging.calibrated_magnification 47169 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 50 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details 'PELCO easiGLOW' _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 8T08 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 295.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8T08 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8T08 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG N SER 166 ? ? 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