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ILE C 689 PHE C 712 1 ? 24 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A GLY 620 O ? ? ? 1_555 G NA . NA ? ? B GLY 643 A NA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc2 metalc ? ? B GLY 620 O ? ? ? 1_555 G NA . NA ? ? A GLY 643 A NA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? ? metalc3 metalc ? ? G NA . NA ? ? ? 1_555 C GLY 620 O ? ? A NA 902 D GLY 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? ? metalc4 metalc ? ? G NA . NA ? ? ? 1_555 D GLY 620 O ? ? A NA 902 C GLY 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O ? A GLY 620 ? B GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? B GLY 620 ? A GLY 643 ? 1_555 82.5 ? 2 O ? A GLY 620 ? B GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? C GLY 620 ? D GLY 643 ? 1_555 149.8 ? 3 O ? B GLY 620 ? A GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? C GLY 620 ? D GLY 643 ? 1_555 88.4 ? 4 O ? A GLY 620 ? B GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? D GLY 620 ? C GLY 643 ? 1_555 88.4 ? 5 O ? B GLY 620 ? A GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? D GLY 620 ? C GLY 643 ? 1_555 165.8 ? 6 O ? C GLY 620 ? D GLY 643 ? 1_555 NA ? G NA . ? A NA 902 ? 1_555 O ? D GLY 620 ? C GLY 643 ? 1_555 94.1 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 461 A . ? PRO 461 B PRO 462 A ? PRO 462 B 1 -0.88 2 PRO 461 B . ? PRO 461 A PRO 462 B ? PRO 462 A 1 -1.62 3 PRO 461 C . ? PRO 461 D PRO 462 C ? PRO 462 D 1 -1.57 4 PRO 461 D . ? PRO 461 C PRO 462 D ? PRO 462 C 1 1.61 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLU B 391 ? ? 72.90 -6.75 2 1 PHE B 429 ? ? -156.58 25.84 3 1 PRO B 461 ? ? -59.96 171.86 4 1 ARG B 500 ? ? 43.60 70.13 5 1 ARG B 575 ? ? -96.32 -63.92 6 1 LEU B 647 ? ? 74.49 -5.21 7 1 GLU B 648 ? ? -142.36 25.70 8 1 ASN B 652 ? ? -108.72 78.23 9 1 PHE B 655 ? ? 62.49 64.27 10 1 GLU A 391 ? ? 71.80 -8.20 11 1 ASN A 393 ? ? -172.62 136.55 12 1 TYR A 454 ? ? -94.78 31.01 13 1 PRO A 461 ? ? -57.47 172.94 14 1 LEU A 503 ? ? 69.97 -2.45 15 1 GLN A 533 ? ? 62.17 61.54 16 1 ARG A 575 ? ? -96.45 -64.57 17 1 LEU A 647 ? ? 69.60 -5.15 18 1 GLU A 648 ? ? -141.85 22.76 19 1 THR A 670 ? ? -94.51 -64.20 20 1 CYS D 386 ? ? 72.78 30.14 21 1 GLU D 391 ? ? 74.02 -8.44 22 1 PRO D 462 ? ? -73.35 -164.11 23 1 PHE D 507 ? ? -127.60 -56.76 24 1 ARG D 575 ? ? -108.41 -64.19 25 1 LEU D 647 ? ? 69.37 -5.32 26 1 GLU D 648 ? ? -142.30 28.86 27 1 PHE D 655 ? ? 61.49 65.90 28 1 THR D 670 ? ? -95.35 -65.31 29 1 GLU C 391 ? ? 72.21 -7.07 30 1 LEU C 460 ? ? 56.72 71.87 31 1 ARG C 575 ? ? -94.54 -64.58 32 1 LEU C 647 ? ? 73.52 -5.69 33 1 GLU C 648 ? ? -144.04 31.31 34 1 TYR C 653 ? ? -166.93 -168.68 35 1 PHE C 655 ? ? 60.11 66.22 36 1 THR C 670 ? ? -94.82 -64.05 # loop_ _pdbx_validate_chiral.id _pdbx_validate_chiral.PDB_model_num _pdbx_validate_chiral.auth_atom_id _pdbx_validate_chiral.label_alt_id _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id _pdbx_validate_chiral.PDB_ins_code _pdbx_validate_chiral.details _pdbx_validate_chiral.omega 1 1 C8 ? B 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 2 1 C12 ? B 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 3 1 C18 ? B 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 4 1 C18 ? A 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 5 1 C8 ? C 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 6 1 C12 ? C 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . 7 1 C18 ? C 8IJ 901 ? 'WRONG HAND' . # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 ARG B 428 ? ? 0.139 'SIDE CHAIN' 2 1 ARG B 432 ? ? 0.268 'SIDE CHAIN' 3 1 ARG B 499 ? ? 0.202 'SIDE CHAIN' 4 1 ARG B 500 ? ? 0.286 'SIDE CHAIN' 5 1 ARG B 557 ? ? 0.267 'SIDE CHAIN' 6 1 ARG B 701 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 7 1 ARG A 409 ? ? 0.258 'SIDE CHAIN' 8 1 ARG A 420 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 9 1 ARG A 428 ? ? 0.173 'SIDE CHAIN' 10 1 ARG A 701 ? ? 0.164 'SIDE CHAIN' 11 1 ARG D 409 ? ? 0.283 'SIDE CHAIN' 12 1 ARG C 420 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' # _pdbx_entry_details.entry_id 8T0Y _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8T0Y _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 8T0Y _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 7921 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'TRPV1 in nanodisc bound with one LPA in one monomer' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 8T0Y _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_vitrification.entry_id 8T0Y _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8T0Y _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8T0Y _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 B MET 1 ? 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