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EMDB EMD-40971 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2024-07-03 2 'Structure model' 1 1 2024-10-16 3 'Structure model' 1 2 2025-01-15 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Structure summary' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' em_admin 2 2 'Structure model' pdbx_entry_details 3 2 'Structure model' pdbx_modification_feature 4 3 'Structure model' citation 5 3 'Structure model' citation_author 6 3 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_em_admin.last_update' 2 3 'Structure model' '_citation.country' 3 3 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 4 3 'Structure model' '_citation.journal_id_ASTM' 5 3 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 6 3 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 7 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 8 3 'Structure model' '_citation.page_first' 9 3 'Structure model' '_citation.page_last' 10 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 11 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 12 3 'Structure model' '_citation.title' 13 3 'Structure model' '_citation.year' 14 3 'Structure model' '_em_admin.last_update' # loop_ _database_PDB_caveat.id _database_PDB_caveat.text 1 ;Residues ALA K 286 and THR K 290 are linked together in the model; however, there are residues between them in the deposited polymeric sequence. ; 2 ;The distance between Residue I ASP 1332 and Residue I GLN 1336 is 15.40 Angstrom. But there are only 3 residues (not enough sequence) to cover the gap region. ; 3 ;The distance between Residue L LYS 351 and Residue L ALA 356 is 19.37 Angstrom. But there are only 4 residues (not enough sequence) to cover the gap region. ; # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8T1L _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-06-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Atomic model of the mammalian mouse Mediator complex with CKM module' _pdbx_database_related.db_id EMD-40971 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email francisco.asturias@cuanschutz.edu _pdbx_contact_author.name_first Francisco _pdbx_contact_author.name_last Asturias _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-3518-0756 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhao, H.' 1 ? 'Asturias, F.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 84 _citation.language ? _citation.page_first 2648 _citation.page_last 2664.e10 _citation.title 'An IDR-dependent mechanism for nuclear receptor control of Mediator interaction with RNA polymerase II.' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2024.06.006 _citation.pdbx_database_id_PubMed 38955181 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhao, H.' 1 ? primary 'Li, J.' 2 ? primary 'Xiang, Y.' 3 ? primary 'Malik, S.' 4 ? primary 'Vartak, S.V.' 5 ? primary 'Veronezi, G.M.B.' 6 ? primary 'Young, N.' 7 ? primary 'Riney, M.' 8 ? primary 'Kalchschmidt, J.' 9 ? primary 'Conte, A.' 10 ? primary 'Jung, S.K.' 11 ? primary 'Ramachandran, S.' 12 ? primary 'Roeder, R.G.' 13 ? primary 'Shi, Y.' 14 ? primary 'Casellas, R.' 15 ? primary 'Asturias, F.J.' 16 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8' 29232.008 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1' 167354.859 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4' 29817.475 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Mediator of RNA polymerase 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13' 238831.016 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Activator-recruited cofactor 32 kDa component,ARC32,Mediator complex subunit 8' 2 ;Mediator complex subunit 1,Peroxisome proliferator-activated receptor-binding protein,PBP,PPAR-binding protein,Thyroid hormone receptor-associated protein complex 220 kDa component,Trap220,Thyroid receptor-interacting protein 2,TR-interacting protein 2,TRIP-2 ; 3 'Mediator complex subunit 4' 4 'Mediator complex subunit 6' 5 'Cofactor required for Sp1 transcriptional activation subunit 9,CRSP complex subunit 9,Mediator complex subunit 7' 6 'Mediator complex subunit 9' 7 'Mediator complex subunit 10' 8 'Mediator complex subunit 11' 9 ;Cofactor required for Sp1 transcriptional activation subunit 2,CRSP complex subunit 2,Mediator complex subunit 14,Thyroid hormone receptor-associated protein complex 170 kDa component,Trap170 ; 10 'Mediator complex subunit 15,Positive cofactor 2 glutamine/Q-rich-associated protein,PC2 glutamine/Q-rich-associated protein,mPcqap' 11 ;Mediator complex subunit 16,Thyroid hormone receptor-associated protein 5,Thyroid hormone receptor-associated protein complex 95 kDa component,Trap95,Vitamin D3 receptor-interacting protein complex 92 kDa component,DRIP92 ; 12 ;Cofactor required for Sp1 transcriptional activation subunit 6,CRSP complex subunit 6,Mediator complex subunit 17,Thyroid hormone receptor-associated protein complex 80 kDa component ; 13 'Mediator complex subunit 18' 14 'Mediator complex subunit 20,TRF-proximal protein homolog' 15 'Mediator complex subunit 21,RNA polymerase II holoenzyme component SRB7,RNAPII complex component SRB7' 16 'Mediator complex subunit 22,Surfeit locus protein 5,Surf-5' 17 ;Cofactor required for Sp1 transcriptional activation subunit 3,CRSP complex subunit 3,Mediator complex subunit 23,Protein sur-2 homolog,mSur-2 ; 18 ;Mediator complex subunit 24,Thyroid hormone receptor-associated protein 4,Thyroid hormone receptor-associated protein 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;MADVLSVGVNLEAFSQAISAIQALRSSVSRVFDCLKDGMRNKETLEGREKAFIANFQDNLHSVNRDLNELERLSNLVGKP SENHPLHNSGLLSLDPVQDKTPLYSQLLQAYKWSNKLQYHAGLASGLLNQQSLKRSANQMGVSAKRRPKAQPTTLVLPPQ YVDDVISRIDRMFPEMSIHLSRPNGTSAMLLVTLGKVLKVIVVMRSLFIDRTIVKGYNESVYTEDGKLDIWSKSSYQVFQ KVTDHATTALLHYQLPQMPDVVVRSFMTWLRSYIKLFQAPCQRCGKFLQDGLPPTWRDFRTLEAFHDTCRQ ; V ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MAASLGGMFTGQPPGPPPPPPGLPGQASLLQAAPGAPRPSNSTLVDELESSFEACFASLVSQDYVNGTDQEEIRTGVDQC IQKFLDIARQTECFFLQKRLQLSVQKPDQVIKEDVSELRSELQRKDALVQKHLTKLRHWQQVLEDINVQHKKPADMPQGS LAFLEQASANIPAPLKQT ; ;MAASLGGMFTGQPPGPPPPPPGLPGQASLLQAAPGAPRPSNSTLVDELESSFEACFASLVSQDYVNGTDQEEIRTGVDQC IQKFLDIARQTECFFLQKRLQLSVQKPDQVIKEDVSELRSELQRKDALVQKHLTKLRHWQQVLEDINVQHKKPADMPQGS LAFLEQASANIPAPLKQT ; W ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MAAPQPQAAAVSSASGVSGPGSAGGPGPQQQPQPTQLVGSAQSGLLQQQQQDFDPVQRYKMLIPQLKESLQTLMKVAAQN LIQNTNIDNGQKSSDAPLQRFDKCLEEFYALCDQLELCLRLAHECLSQSCDSAKHSPTLVPTATKPDAVQPDSLPYPQYL AVIKAQITCAKDIHTALLDCANKVTGKTTAPSTGPGGSL ; ;MAAPQPQAAAVSSASGVSGPGSAGGPGPQQQPQPTQLVGSAQSGLLQQQQQDFDPVQRYKMLIPQLKESLQTLMKVAAQN LIQNTNIDNGQKSSDAPLQRFDKCLEEFYALCDQLELCLRLAHECLSQSCDSAKHSPTLVPTATKPDAVQPDSLPYPQYL AVIKAQITCAKDIHTALLDCANKVTGKTTAPSTGPGGSL ; X ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MSTPPLAPTGMASGPFGGPQAQQAAREVNTATLCRIGQETVQDIVYRTMEIFQLLRNMQLPNGVTYHTGTYQDRLTKLQD HLRQLSILFRKLRLVYDKCNENCGGMDPIPVEQLIPYVDEDGSKNDDRAGPPRFASEERREIVEVNKKLKQKNQQLKQIM DQLRNLIWDINAMLAMRN ; ;MSTPPLAPTGMASGPFGGPQAQQAAREVNTATLCRIGQETVQDIVYRTMEIFQLLRNMQLPNGVTYHTGTYQDRLTKLQD HLRQLSILFRKLRLVYDKCNENCGGMDPIPVEQLIPYVDEDGSKNDDRAGPPRFASEERREIVEVNKKLKQKNQQLKQIM DQLRNLIWDINAMLAMRN ; Y ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MAAAVAMETDDAGNRLRFQLELEFVQCLANPNYLNFLAQRGYFKDKAFVNYLKYLLYWKEPEYAKYLKYPQCLHMLELLQ YEHFRKELVNAQCAKFIDEQQILHWQHYSRKRVRLQQALAEQQQQNNTAGK ; ;MAAAVAMETDDAGNRLRFQLELEFVQCLANPNYLNFLAQRGYFKDKAFVNYLKYLLYWKEPEYAKYLKYPQCLHMLELLQ YEHFRKELVNAQCAKFIDEQQILHWQHYSRKRVRLQQALAEQQQQNNTAGK ; Z ? 25 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX a ? 26 'polypeptide(L)' no no ;MSSSFVSNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKRYVWQGPTSAPILFPVTEEDPILSSFSRCLKADVLGVWRRDQRPGRREL WIFWWGKDPNFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRTLLFKAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHL SCSFTFFLHGDSNVCTSVEINQHQPVYLLSEEHVTLAQQSNSPFQVILSPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWKQFY PISCGLKEMSEEKQDDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPAPSSVGASHCSASCLGIHQVPASTRDPAM SSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSAQKWVKFSSVSDGFSTDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRLQNKRKYSATSSG LCEEETADKIGCWDFVEATQRTSCSCLRHKSLKTRNTGQQGQAPSLGQQQQVLPKHKTNEKQDKSEKPQKRPLTPFHHRV SVSDEIGMDTDSASQRLVISAADSQVRFSNIRTNDVAKTPQMHGTELANSPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQSQHF YQMPTPDPLVPTKPMEDRIDSLSQSFPPPFQEAVEPTVYVGTAVSLEEDEANVAWKYYKVPKKKDVEFLPPQLPNDKFKD DPVGPFGQESVTSVTELMVQCKKPLKVSDEIVQQYQIKNQYLSAIASDTEQEPKIDPYAFVEGDEEFIFTDKKDRQNSER EAGKKHKVEDGTSAVTVLSHEEDAMSLFSPSKQDAPRPTNHARPPSTSLIYDSDLAVSYTDLDNLFNSDEDELTPGSKKS 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ISTSVATANSTLTTTSSSSSSSLSSGVSSNKLPSFPPFGSMNTSGTGSMSAQASTVQSGQLGGQQSSSLQAAGISGESAS LPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTDGDSHAITYPPAIVVYIIDPFTYENKDESTNSSNVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKS TVSVQIVPCQYLLQPVKHDDRQIYSQHLKSLAFSVFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALKSPDRPECIRLYTPP FILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLETCIINIDVPNRARRKKGSARRFGLQKL WEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDWSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSF VIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTPQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTENLDLAFNPNNDGADGMGIFDLLDT GDDLDPDIINILPASPTASPVHSPGSHYPHGGDAGKGQGTDRLLSTESHDEVTNILQQPLALGYFVSTAKAGPLPDWFWS ACPQAQYQCPLFLKASLHLHVPSVQSDELLHSKHSHPLDSNQTSDVLRFVLEQYNALSWLTCDPAVQDRRSCLPVHFVVL NQLYNFIMNML ; 9 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLN n 1 3 ARG n 1 4 GLU n 1 5 GLU n 1 6 LYS n 1 7 GLN n 1 8 LEU n 1 9 GLU n 1 10 ALA n 1 11 SER n 1 12 LEU n 1 13 ASP n 1 14 ALA n 1 15 LEU n 1 16 LEU n 1 17 ASN n 1 18 GLN n 1 19 VAL n 1 20 ALA n 1 21 ASP n 1 22 LEU n 1 23 LYS n 1 24 ASN n 1 25 SER n 1 26 LEU n 1 27 GLY n 1 28 SER n 1 29 PHE n 1 30 ILE n 1 31 TYR n 1 32 LYS n 1 33 LEU n 1 34 GLU n 1 35 ASN n 1 36 GLU n 1 37 TYR n 1 38 ASP n 1 39 ARG n 1 40 LEU n 1 41 THR n 1 42 TRP n 1 43 PRO n 1 44 SER n 1 45 VAL n 1 46 LEU n 1 47 ASP n 1 48 SER n 1 49 PHE n 1 50 ALA n 1 51 LEU n 1 52 LEU n 1 53 SER n 1 54 GLY n 1 55 GLN n 1 56 LEU n 1 57 ASN n 1 58 THR n 1 59 LEU n 1 60 ASN n 1 61 LYS n 1 62 VAL n 1 63 LEU n 1 64 LYS n 1 65 HIS n 1 66 GLU n 1 67 LYS n 1 68 THR n 1 69 PRO n 1 70 LEU n 1 71 PHE n 1 72 ARG n 1 73 ASN n 1 74 GLN n 1 75 VAL n 1 76 ILE n 1 77 ILE n 1 78 PRO n 1 79 LEU n 1 80 VAL n 1 81 LEU n 1 82 SER n 1 83 PRO n 1 84 ASP n 1 85 ARG n 1 86 ASP n 1 87 GLU n 1 88 ASP n 1 89 LEU n 1 90 MET n 1 91 ARG n 1 92 GLN n 1 93 THR n 1 94 GLU n 1 95 GLY n 1 96 ARG n 1 97 VAL n 1 98 PRO n 1 99 VAL n 1 100 PHE n 1 101 SER n 1 102 HIS n 1 103 GLU n 1 104 VAL n 1 105 VAL n 1 106 PRO n 1 107 ASP n 1 108 HIS n 1 109 LEU n 1 110 ARG n 1 111 THR n 1 112 LYS n 1 113 PRO n 1 114 ASP n 1 115 PRO n 1 116 GLU n 1 117 VAL n 1 118 GLU n 1 119 GLU n 1 120 GLN n 1 121 GLU n 1 122 LYS n 1 123 GLN n 1 124 LEU n 1 125 THR n 1 126 THR n 1 127 ASP n 1 128 ALA n 1 129 ALA n 1 130 ARG n 1 131 ILE n 1 132 GLY n 1 133 ALA n 1 134 ASP n 1 135 ALA n 1 136 ALA n 1 137 GLN n 1 138 LYS n 1 139 GLN n 1 140 ILE n 1 141 GLN n 1 142 SER n 1 143 LEU n 1 144 ASN n 1 145 LYS n 1 146 MET n 1 147 CYS n 1 148 SER n 1 149 ASN n 1 150 LEU n 1 151 LEU n 1 152 GLU n 1 153 LYS n 1 154 ILE n 1 155 SER n 1 156 LYS n 1 157 GLU n 1 158 GLU n 1 159 ARG n 1 160 GLU n 1 161 SER n 1 162 GLU n 1 163 SER n 1 164 GLY n 1 165 GLY n 1 166 LEU n 1 167 ARG n 1 168 PRO n 1 169 ASN n 1 170 LYS n 1 171 GLN n 1 172 THR n 1 173 PHE n 1 174 ASN n 1 175 PRO n 1 176 GLY n 1 177 ASP n 1 178 THR n 1 179 ASN n 1 180 ALA n 1 181 LEU n 1 182 VAL n 1 183 ALA n 1 184 ALA n 1 185 VAL n 1 186 ALA n 1 187 PHE n 1 188 GLY n 1 189 LYS n 1 190 GLY n 1 191 LEU n 1 192 SER n 1 193 ASN n 1 194 TRP n 1 195 ARG n 1 196 PRO n 1 197 SER n 1 198 GLY n 1 199 SER n 1 200 SER n 1 201 GLY n 1 202 PRO n 1 203 GLY n 1 204 GLN n 1 205 PRO n 1 206 GLY n 1 207 GLN n 1 208 PRO n 1 209 GLY n 1 210 ALA n 1 211 GLY n 1 212 THR n 1 213 ILE n 1 214 LEU n 1 215 ALA n 1 216 GLY n 1 217 ALA n 1 218 SER n 1 219 GLY n 1 220 LEU n 1 221 PRO n 1 222 GLN n 1 223 VAL n 1 224 GLN n 1 225 MET n 1 226 PRO n 1 227 GLY n 1 228 ALA n 1 229 PRO n 1 230 ASN n 1 231 GLN n 1 232 GLN n 1 233 GLN n 1 234 PRO n 1 235 MET n 1 236 LEU n 1 237 SER n 1 238 GLY n 1 239 VAL n 1 240 GLN n 1 241 MET n 1 242 ALA n 1 243 GLN n 1 244 ALA n 1 245 GLY n 1 246 GLN n 1 247 PRO n 1 248 GLY n 1 249 LYS n 1 250 MET n 1 251 PRO n 1 252 SER n 1 253 GLY n 1 254 ILE n 1 255 LYS n 1 256 THR n 1 257 ASN n 1 258 ILE n 1 259 LYS n 1 260 SER n 1 261 ALA n 1 262 SER n 1 263 MET n 1 264 HIS n 1 265 PRO n 1 266 TYR n 1 267 GLN n 1 268 ARG n 2 1 MET n 2 2 LYS n 2 3 ALA n 2 4 GLN n 2 5 GLY n 2 6 GLU n 2 7 THR n 2 8 GLU n 2 9 ASP n 2 10 SER n 2 11 GLU n 2 12 ARG n 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21 ;MAASLGGMFTGQPPGPPPPPPGLPGQASLLQAAPGAPRPSNSTLVDELESSFEACFASLVSQDYVNGTDQEEIRTGVDQC IQKFLDIARQTECFFLQKRLQLSVQKPDQVIKEDVSELRSELQRKDALVQKHLTKLRHWQQVLEDINVQHKKPADMPQGS LAFLEQASANIPAPLKQT ; 1 22 UNP MED29_MOUSE Q9DB91 ? 22 ;MAAPQPQAAAVSSASGVSGPGSAGGPGPQQQPQPTQLVGSAQSGLLQQQQQDFDPVQRYKMLIPQLKESLQTLMKVAAQN LIQNTNIDNGQKSSDAPLQRFDKCLEEFYALCDQLELCLRLAHECLSQSCDSAKHSPTLVPTATKPDAVQPDSLPYPQYL AVIKAQITCAKDIHTALLDCANKVTGKTTAPSTGPGGSL ; 1 23 UNP MED30_MOUSE Q9CQI9 ? 23 ;MSTPPLAPTGMASGPFGGPQAQQAAREVNTATLCRIGQETVQDIVYRTMEIFQLLRNMQLPNGVTYHTGTYQDRLTKLQD HLRQLSILFRKLRLVYDKCNENCGGMDPIPVEQLIPYVDEDGSKNDDRAGPPRFASEERREIVEVNKKLKQKNQQLKQIM DQLRNLIWDINAMLAMRN ; 1 24 UNP MED31_MOUSE Q9CXU1 ? 24 ;MAAAVAMETDDAGNRLRFQLELEFVQCLANPNYLNFLAQRGYFKDKAFVNYLKYLLYWKEPEYAKYLKYPQCLHMLELLQ YEHFRKELVNAQCAKFIDEQQILHWQHYSRKRVRLQQALAEQQQQNNTAGK ; 1 25 PDB 8T1L 8T1L ? 25 ? 1 26 UNP MED13_MOUSE Q5SWW4 ? 26 ;MSSSFVSNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKRYVWQGPTSAPILFPVTEEDPILSSFSRCLKADVLGVWRRDQRPGRREL WIFWWGKDPNFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRTLLFKAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHL SCSFTFFLHGDSNVCTSVEINQHQPVYLLSEEHVTLAQQSNSPFQVILSPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWKQFY PISCGLKEMSEEKQDDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPAPSSVGASHCSASCLGIHQVPASTRDPAM SSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSAQKWVKFSSVSDGFSTDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRLQNKRKYSATSSG LCEEETADKIGCWDFVEATQRTSCSCLRHKSLKTRNTGQQGQAPSLGQQQQVLPKHKTNEKQDKSEKPQKRPLTPFHHRV SVSDEIGMDTDSASQRLVISAADSQVRFSNIRTNDVAKTPQMHGTELANSPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQSQHF YQMPTPDPLVPTKPMEDRIDSLSQSFPPPFQEAVEPTVYVGTAVSLEEDEANVAWKYYKVPKKKDVEFLPPQLPNDKFKD DPVGPFGQESVTSVTELMVQCKKPLKVSDEIVQQYQIKNQYLSAIASDTEQEPKIDPYAFVEGDEEFIFTDKKDRQNSER EAGKKHKVEDGTSAVTVLSHEEDAMSLFSPSKQDAPRPTNHARPPSTSLIYDSDLAVSYTDLDNLFNSDEDELTPGSKKS ASGSDDKASSKESKTGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSLEQHIMGFSPMNMNNKEYGSVDTAPGGTVLEGNSSSVGTQFR IEVEEGFCSPKPSEIKDFSYVYKPENCQVLVGCSMFAPLKTLPSHCLPPIKLPEECVYRQSWTVGKLDLLPSGPSMPFIK EGDGSNLDQDYGPAYTPQTHASFGMPPSSAPPSNGGAGILPSPSTPRFPTPRTPRTPRTPRGAGGPASAQGSVKYENSDL YSPASTPSTCRPLNSVEPATVPSIPEAHSLYVNLILSESVMNLFKDCNFDSCCICVCNMNIKGADVGVYIPDPTQEAQYR CTCGFSAVMNRKFGNNSGLFLEDELDIIGRNTDCGKEAEKRFEALRASSVENVNGGLKESEKVPDELILLLQDQCTNLFS PFGAADQDPFPKVGISSNWVRVEERDCCSDCCLALEHGRQFMDNMSGGKVDEALVRSSCLHPWAKQNDASVQCSQDILRM LLSLQPVLQDAIQKKRTVRPWGVQGPLTWQQFHKMAGRGSYGTDESPEPLPIPTFLLGYDYDFLVLSPFALPYWEKLMLE PYGSQRDIAYVVLCPENEALLNGARSFFRDLTAIYESCRLGQHRPISRLLTDGIMKVGATASKKLSEKFVTEWFSQAADG NNEAFSKLKLYAQVCRYDLGPYLASQPLDSSLLSQPNLVAPPNQSLVTAPQMTNTGNANAPSATLASAASSTMTMTSGVP ISTSVATANSTLTTTSSSSSSSLSSGVSSNKLPSFPPFGSMNTSGTGSMSAQASTVQSGQLGGQQSSSLQAAGISGESAS LPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTDGDSHAITYPPAIVVYIIDPFTYENKDESTNSSNVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKS TVSVQIVPCQYLLQPVKHDDRQIYSQHLKSLAFSVFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGPGLAMETALKSPDRPECIRLYTPP FILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLETCIINIDVPNRARRKKGSARRFGLQKL WEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDWSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSF VIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTPQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTENLDLAFNPNNDGADGMGIFDLLDT GDDLDPDIINILPASPTASPVHSPGSHYPHGGDAGKGQGTDRLLSTESHDEVTNILQQPLALGYFVSTAKAGPLPDWFWS ACPQAQYQCPLFLKASLHLHVPSVQSDELLHSKHSHPLDSNQTSDVLRFVLEQYNALSWLTCDPAVQDRRSCLPVHFVVL NQLYNFIMNML ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8T1L E 1 ? 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Q9DB91 1 ? 199 ? 1 199 23 23 8T1L Y 1 ? 178 ? Q9CQI9 1 ? 178 ? 1 178 24 24 8T1L Z 1 ? 131 ? Q9CXU1 1 ? 131 ? 1 131 25 25 8T1L a 1 ? 20 ? 8T1L 1 ? 20 ? 1 20 26 26 8T1L 9 1 ? 2171 ? Q5SWW4 1 ? 2171 ? 1 2171 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 26-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 26 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 3 ? GLU A 36 ? ARG E 3 GLU E 36 1 ? 34 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 41 ? LEU A 63 ? THR E 41 LEU E 63 1 ? 23 HELX_P HELX_P3 AA3 VAL A 117 ? ASP A 127 ? VAL E 117 ASP E 127 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 134 ? ARG A 159 ? ASP E 134 ARG E 159 1 ? 26 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 174 ? PHE A 187 ? ASN E 174 PHE E 187 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 ARG B 22 ? LYS B 26 ? ARG A 22 LYS A 26 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 60 ? LEU B 65 ? SER A 60 LEU A 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU B 65 ? LYS B 70 ? LEU A 65 LYS A 70 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 SER B 73 ? GLY B 89 ? SER A 73 GLY A 89 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 CYS B 135 ? VAL B 139 ? CYS A 135 VAL A 139 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 LYS B 152 ? TYR B 161 ? LYS A 152 TYR A 161 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 AB3 THR B 171 ? GLU B 181 ? THR A 171 GLU A 181 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 GLN B 182 ? THR B 195 ? GLN A 182 THR A 195 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 SER B 314 ? GLN B 322 ? SER A 314 GLN A 322 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO B 338 ? SER B 349 ? 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