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_refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5193 ? 8037 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0389 ? 909 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0043 ? 986 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.1826 ? 818 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 8TH3 _struct.title 'Structure of AT118-H Nanobody Antagonist in Complex with the Angiotensin II Type I Receptor' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8TH3 _struct_keywords.text 'G protein-coupled receptor, nanobody, SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8TH3 8TH3 ? 1 ? 1 2 UNP AGTR1_HUMAN P30556 ? 1 ;ILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTL PLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASL PAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAY ; 2 3 UNP C562_ECOLX P0ABE7 ? 1 ;DLEDNMETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANE GKVKEAQAAAEQLKTTRNAYHQKY ; 24 4 UNP AGTR1_HUMAN P30556 ? 1 ;NDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFL QLLKY ; 235 5 PDB 8TH3 8TH3 ? 2 ? 1 6 PDB 8TH3 8TH3 ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8TH3 A 1 ? 136 ? 8TH3 -134 ? 1 ? -134 1 2 2 8TH3 A 137 ? 361 ? 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UNP P0ABE7 HIS 124 'engineered mutation' 327 2 3 8TH3 LEU A 466 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 331 3 3 8TH3 GLU A 467 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 332 4 3 8TH3 ARG A 468 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 333 5 3 8TH3 ALA A 469 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 334 6 3 8TH3 ARG A 470 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 335 7 3 8TH3 SER A 471 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 336 8 3 8TH3 THR A 472 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 337 9 3 8TH3 LEU A 473 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 338 10 3 8TH3 ASP A 474 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 339 11 3 8TH3 LYS A 475 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 340 12 3 8TH3 LEU A 476 ? UNP P0ABE7 ? ? linker 341 13 4 8TH3 GLY A 562 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1320 14 4 8TH3 GLY A 563 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1321 15 4 8TH3 SER A 564 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1322 16 4 8TH3 SER A 565 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1323 17 4 8TH3 LEU A 566 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1324 18 4 8TH3 GLU A 567 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1325 19 4 8TH3 VAL A 568 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 1326 20 4 8TH3 LEU A 569 ? 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UNP P30556 ? ? 'expression tag' 570 56 8 8TH3 GLN B 571 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 571 57 8 8TH3 GLY B 572 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 572 58 8 8TH3 PRO B 573 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 573 59 8 8TH3 THR B 574 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 574 60 8 8TH3 GLU B 575 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 575 61 8 8TH3 THR B 576 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 576 62 8 8TH3 SER B 577 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 577 63 8 8TH3 GLN B 578 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 578 64 8 8TH3 VAL B 579 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 579 65 8 8TH3 ALA B 580 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 580 66 8 8TH3 PRO B 581 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 581 67 8 8TH3 ALA B 582 ? UNP P30556 ? ? 'expression tag' 582 68 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 158 ? 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TYR D 94 VAL D 98 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 153 SG ? ? ? 1_555 A CYS 516 SG ? ? A CYS 18 A CYS 1274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 236 SG ? ? ? 1_555 A CYS 315 SG ? ? A CYS 101 A CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 95 SG ? ? B CYS 22 B CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 25 SG ? ? ? 1_555 C CYS 99 SG ? ? C CYS 25 C CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? D CYS 24 D CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 153 ? CYS A 516 ? CYS A 18 ? 1_555 CYS A 1274 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS A 236 ? CYS A 315 ? CYS A 101 ? 1_555 CYS A 180 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS B 22 ? CYS B 95 ? CYS B 22 ? 1_555 CYS B 95 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS C 25 ? CYS C 99 ? CYS C 25 ? 1_555 CYS C 99 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS D 23 ? CYS D 88 ? CYS D 24 ? 1_555 CYS D 89 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 302 ? 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GLY C 103 ? ALA C 95 GLY C 103 AA5 4 PHE C 35 ? GLN C 42 ? PHE C 35 GLN C 42 AA5 5 LEU C 48 ? ILE C 54 ? LEU C 48 ILE C 54 AA5 6 SER C 62 ? TYR C 63 ? SER C 62 TYR C 63 AA6 1 MET D 4 ? GLN D 6 ? MET D 5 GLN D 7 AA6 2 VAL D 19 ? ALA D 25 ? VAL D 20 ALA D 26 AA6 3 ASP D 70 ? ILE D 75 ? ASP D 71 ILE D 76 AA6 4 PHE D 62 ? SER D 67 ? PHE D 63 SER D 68 AA7 1 SER D 10 ? LEU D 11 ? SER D 11 LEU D 12 AA7 2 LYS D 104 ? VAL D 105 ? LYS D 105 VAL D 106 AA8 1 SER D 53 ? LEU D 54 ? SER D 54 LEU D 55 AA8 2 LYS D 45 ? TYR D 49 ? LYS D 46 TYR D 50 AA8 3 VAL D 33 ? GLN D 38 ? VAL D 34 GLN D 39 AA8 4 THR D 85 ? GLN D 90 ? THR D 86 GLN D 91 AA8 5 THR D 98 ? PHE D 99 ? THR D 99 PHE D 100 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 305 ? 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O TRP C 102 N SER C 36 ? N SER C 36 AA5 4 5 N ARG C 41 ? N ARG C 41 O GLU C 49 ? O GLU C 49 AA5 5 6 N TYR C 53 ? N TYR C 53 O SER C 62 ? O SER C 62 AA6 1 2 N THR D 5 ? N THR D 6 O ARG D 24 ? O ARG D 25 AA6 2 3 N CYS D 23 ? N CYS D 24 O PHE D 71 ? O PHE D 72 AA6 3 4 O ASP D 70 ? O ASP D 71 N SER D 67 ? N SER D 68 AA7 1 2 N LEU D 11 ? N LEU D 12 O LYS D 104 ? O LYS D 105 AA8 1 2 O SER D 53 ? O SER D 54 N TYR D 49 ? N TYR D 50 AA8 2 3 O LEU D 47 ? O LEU D 48 N TRP D 35 ? N TRP D 36 AA8 3 4 N GLN D 38 ? N GLN D 39 O THR D 85 ? O THR D 86 AA8 4 5 N GLN D 90 ? N GLN D 91 O THR D 98 ? 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