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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.597 ? 29498 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.173 ? 3014 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 3389 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 3775 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8TM4 _struct.title 'Human pre 13S proteasome assembly intermediate' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8TM4 _struct_keywords.text 'proteasome, proteasome assembly, POMP, beta ring assembly, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? 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Q9Y244 1 ? 141 ? 1 141 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tridecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 19 ? 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GLU e 129 GLY e 139 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id disulf1 _struct_conn.conn_type_id disulf _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id G _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 115 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id G _struct_conn.ptnr2_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 154 _struct_conn.ptnr2_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id G _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 115 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id G _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 154 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.033 _struct_conn.pdbx_value_order ? _struct_conn.pdbx_role ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _pdbx_modification_feature.ordinal 1 _pdbx_modification_feature.label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.label_asym_id G _pdbx_modification_feature.label_seq_id 115 _pdbx_modification_feature.label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id G _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id 154 _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.auth_asym_id G _pdbx_modification_feature.auth_seq_id 115 _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id G _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id 154 _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id . _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id . _pdbx_modification_feature.ref_comp_id . _pdbx_modification_feature.type None _pdbx_modification_feature.category 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? 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ILE E 161 ? ALA E 158 ILE E 161 AB3 2 THR E 35 ? LYS E 39 ? THR E 35 LYS E 39 AB3 3 HIS E 43 ? ALA E 48 ? HIS E 43 ALA E 48 AB3 4 SER E 211 ? GLY E 216 ? SER E 211 GLY E 216 AB3 5 THR E 222 ? TYR E 224 ? THR E 222 TYR E 224 AB4 1 ILE E 63 ? ASP E 67 ? ILE E 63 ASP E 67 AB4 2 ILE E 70 ? GLY E 76 ? ILE E 70 GLY E 76 AB4 3 VAL E 130 ? LEU E 132 ? VAL E 130 LEU E 132 AB5 1 ILE E 63 ? ASP E 67 ? ILE E 63 ASP E 67 AB5 2 ILE E 70 ? GLY E 76 ? ILE E 70 GLY E 76 AB5 3 ALA E 135 ? ASP E 138 ? ALA E 135 ASP E 138 AB5 4 GLY E 141 ? PRO E 142 ? GLY E 141 PRO E 142 AB6 1 ALA F 37 ? ILE F 38 ? ALA F 37 ILE F 38 AB6 2 VAL F 46 ? VAL F 50 ? VAL F 46 VAL F 50 AB6 3 GLU F 213 ? VAL F 217 ? GLU F 213 VAL F 217 AB6 4 GLU F 226 ? ILE F 227 ? GLU F 226 ILE F 227 AB7 1 VAL F 74 ? GLY F 75 ? VAL F 74 GLY F 75 AB7 2 PHE F 136 ? SER F 140 ? PHE F 136 SER F 140 AB7 3 GLN F 148 ? ILE F 152 ? GLN F 148 ILE F 152 AB7 4 SER F 158 ? TYR F 161 ? SER F 158 TYR F 161 AB8 1 ALA G 165 ? GLY G 169 ? ALA G 165 GLY G 169 AB8 2 THR G 38 ? ARG G 43 ? THR G 38 ARG G 43 AB8 3 CYS G 47 ? GLN G 53 ? CYS G 47 GLN G 53 AB8 4 ILE G 215 ? THR G 221 ? ILE G 215 THR G 221 AB9 1 LEU G 69 ? THR G 73 ? LEU G 69 THR G 73 AB9 2 ILE G 76 ? VAL G 79 ? ILE G 76 VAL G 79 AB9 3 MET G 138 ? ASP G 144 ? MET G 138 ASP G 144 AB9 4 GLY G 148 ? PRO G 149 ? GLY G 148 PRO G 149 AC1 1 LEU G 69 ? THR G 73 ? LEU G 69 THR G 73 AC1 2 ILE G 76 ? VAL G 79 ? ILE G 76 VAL G 79 AC1 3 MET G 138 ? ASP G 144 ? MET G 138 ASP G 144 AC1 4 VAL G 151 ? CYS G 154 ? VAL G 151 CYS G 154 AC1 5 TYR G 160 ? PHE G 163 ? TYR G 160 PHE G 163 AC2 1 VAL H 49 ? TYR H 51 ? VAL H 5 TYR H 7 AC2 2 GLY H 54 ? LEU H 57 ? GLY H 10 LEU H 13 AC2 3 CYS H 219 ? SER H 222 ? CYS H 175 SER H 178 AC3 1 HIS H 78 ? PHE H 79 ? HIS H 34 PHE H 35 AC3 2 TYR H 85 ? CYS H 86 ? TYR H 41 CYS H 42 AC3 3 LEU H 143 ? ASP H 147 ? LEU H 99 ASP H 103 AC3 4 GLY H 150 ? TYR H 154 ? GLY H 106 TYR H 110 AC4 1 ALA H 89 ? GLY H 90 ? ALA H 45 GLY H 46 AC4 2 ALA H 139 ? 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