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LLGIWGCSGKLICCTAVPWNSSWSNKSQTEIWNNMTWMQWDREINNYTDIIYRLLEESQNQQENNEEDLLALD ; B,D,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYDITWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGDTNYAQRLQGRVTMTTDTSTSTAY MELRSLRSDDTAVYYCARAKHTVLVTAMRWFDPWGQGTLVTVSS ; ;QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYDITWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGDTNYAQRLQGRVTMTTDTSTSTAY MELRSLRSDDTAVYYCARAKHTVLVTAMRWFDPWGQGTLVTVSS ; H,I,J ? 4 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISNYLNWYQQKPGKAPKLLISATSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP DDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKLEIKRT ; ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISNYLNWYQQKPGKAPKLLISATSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP DDFATYYCQQSYSTPWTFGQGTKLEIKRT ; L,M,N ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 6 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLY n 1 2 ASN n 1 3 LEU n 1 4 TRP n 1 5 VAL n 1 6 THR n 1 7 VAL n 1 8 TYR n 1 9 TYR n 1 10 GLY n 1 11 VAL n 1 12 PRO n 1 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SA N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP D7S2E5_9HIV1 D7S2E5 ? 1 ;GNLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPADPNPQEMLLKNVTENFNMWKNEMVNQMHEDVISL WDQSLKPCVKLTPLCVTLNCTNVKINSTSNETCIDSGNNSTCNETYKEMRNCSFNATTVVRDKQQKMYALFYKLDIVPLN SGYKNSSDETYRLINCNTSAITQACPKVSFDPIPIHYCTPAGYALLKCNNKTFNGTGPCNNVSTVQCTHGIKPVVSTQLL LNGSLAEEEIIIRSENLTNNAKTIIVHLKEPVNITCERPNNNTRKSIRIGPGQTFYATGDIIGNIREAHCNISRSQWNKT LQGVGEKLAELFPNKTIVFKNSSGGDLEITTHSFNCRGEFFYCNTTDLFNSTYWSNGTYITQSNSSSINITLPCRIKQII NMWQEVGRAIYAPPIAGQITCISNITGLLLLRDGGKEANGTEIFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVEIKPLGVAPTKAKRR VVEREKR ; 31 2 UNP D7S2E5_9HIV1 D7S2E5 ? 2 ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASITLTVQARQLLSGIVQQQSNLLKAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQQ LLGIWGCSGKLICTTAVPWNSSWSNKSQTEIWNNMTWMQWDREINNYTDIIYRLLEESQNQQENNEEDLLALD ; 518 3 PDB 8TR3 8TR3 ? 3 ? 1 4 PDB 8TR3 8TR3 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8TR3 A 1 ? 487 ? D7S2E5 31 ? 517 ? 32 511 2 2 8TR3 B 1 ? 153 ? D7S2E5 518 ? 670 ? 512 664 3 3 8TR3 H 1 ? 124 ? 8TR3 1 ? 113 ? 1 113 4 4 8TR3 L 1 ? 109 ? 8TR3 1 ? 109 ? 1 109 5 1 8TR3 C 1 ? 487 ? D7S2E5 31 ? 517 ? 32 511 6 2 8TR3 D 1 ? 153 ? D7S2E5 518 ? 670 ? 512 664 7 3 8TR3 I 1 ? 124 ? 8TR3 1 ? 113 ? 1 113 8 4 8TR3 M 1 ? 109 ? 8TR3 1 ? 109 ? 1 109 9 1 8TR3 E 1 ? 487 ? D7S2E5 31 ? 517 ? 32 511 10 2 8TR3 F 1 ? 153 ? D7S2E5 518 ? 670 ? 512 664 11 3 8TR3 J 1 ? 124 ? 8TR3 1 ? 113 ? 1 113 12 4 8TR3 N 1 ? 109 ? 8TR3 1 ? 109 ? 1 109 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8TR3 CYS A 477 ? UNP D7S2E5 ALA 507 'engineered mutation' 501 1 1 8TR3 ARG A 478 ? UNP D7S2E5 LYS 508 'engineered mutation' 502 2 1 8TR3 ARG A 485 ? UNP D7S2E5 GLU 515 'engineered mutation' 509 3 1 8TR3 ARG A 486 ? UNP D7S2E5 LYS 516 'engineered mutation' 510 4 1 8TR3 ARG A 488 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 512 5 1 8TR3 ARG A 489 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 513 6 2 8TR3 PRO B 48 ? UNP D7S2E5 ILE 565 'engineered mutation' 559 7 2 8TR3 CYS B 94 ? UNP D7S2E5 THR 611 'engineered mutation' 605 8 5 8TR3 CYS C 477 ? UNP D7S2E5 ALA 507 'engineered mutation' 501 9 5 8TR3 ARG C 478 ? UNP D7S2E5 LYS 508 'engineered mutation' 502 10 5 8TR3 ARG C 485 ? UNP D7S2E5 GLU 515 'engineered mutation' 509 11 5 8TR3 ARG C 486 ? UNP D7S2E5 LYS 516 'engineered mutation' 510 12 5 8TR3 ARG C 488 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 512 13 5 8TR3 ARG C 489 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 513 14 6 8TR3 PRO D 48 ? UNP D7S2E5 ILE 565 'engineered mutation' 559 15 6 8TR3 CYS D 94 ? UNP D7S2E5 THR 611 'engineered mutation' 605 16 9 8TR3 CYS E 477 ? UNP D7S2E5 ALA 507 'engineered mutation' 501 17 9 8TR3 ARG E 478 ? UNP D7S2E5 LYS 508 'engineered mutation' 502 18 9 8TR3 ARG E 485 ? UNP D7S2E5 GLU 515 'engineered mutation' 509 19 9 8TR3 ARG E 486 ? UNP D7S2E5 LYS 516 'engineered mutation' 510 20 9 8TR3 ARG E 488 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 512 21 9 8TR3 ARG E 489 ? UNP D7S2E5 ? ? insertion 513 22 10 8TR3 PRO F 48 ? UNP D7S2E5 ILE 565 'engineered mutation' 559 23 10 8TR3 CYS F 94 ? UNP D7S2E5 THR 611 'engineered mutation' 605 24 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 68 ? 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GLU C 99 LEU C 116 1 ? 18 HELX_P HELX_P16 AB7 ARG E 314 ? PHE E 332 ? ARG C 335 PHE C 353 1 ? 19 HELX_P HELX_P17 AB8 THR E 365 ? PHE E 369 ? THR C 387 PHE C 391 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 452 ? SER E 457 ? ARG C 476 SER C 481 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 ILE F 4 ? PHE F 11 ? ILE D 515 PHE D 522 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 AC2 THR F 18 ? THR F 25 ? THR D 529 THR D 536 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 THR F 25 ? SER F 35 ? THR D 536 SER D 546 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 GLN F 51 ? TRP F 85 ? GLN D 562 TRP D 596 1 ? 35 HELX_P HELX_P23 AC5 SER F 107 ? MET F 115 ? SER D 618 MET D 626 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 116 ? ASN F 125 ? THR D 627 ASN D 636 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 TYR F 127 ? ASN F 144 ? TYR D 638 ASN D 655 1 ? 18 HELX_P HELX_P26 AC8 THR G 28 ? SER G 31 ? THR I 28 SER I 31 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG G 87 ? THR G 91 ? ARG I 83 THR I 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 GLN H 79 ? PHE H 83 ? GLN M 79 PHE M 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 GLU I 68 ? LEU I 85 ? 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D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 43 SG ? ? C CYS 54 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? E CYS 198 SG ? ? ? 1_555 E CYS 227 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 208 SG ? ? ? 1_555 E CYS 219 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 276 SG ? ? ? 1_555 E CYS 310 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 356 SG ? ? ? 1_555 E CYS 421 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 363 SG ? ? ? 1_555 E CYS 394 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 477 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? C CYS 501 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 87 SG ? ? ? 1_555 F CYS 93 SG ? ? D CYS 598 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf19 disulf ? ? 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