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'expression tag' 890 44 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 38 ? 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GLN E 703 GLY E 712 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 AD3 SER B 38 ? THR B 40 ? SER F 38 THR F 40 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG B 41 ? ALA B 62 ? ARG F 41 ALA F 62 1 ? 22 HELX_P HELX_P32 AD5 THR B 66 ? PHE B 80 ? THR F 66 PHE F 80 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 PHE B 80 ? LEU B 93 ? PHE F 80 LEU F 93 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 AD7 ASN B 94 ? VAL B 98 ? ASN F 94 VAL F 98 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP B 99 ? ALA B 125 ? ASP F 99 ALA F 125 1 ? 27 HELX_P HELX_P36 AD9 SER B 129 ? GLN B 143 ? SER F 129 GLN F 143 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU B 149 ? GLN B 159 ? LEU F 149 GLN F 159 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 TYR B 162 ? TYR B 165 ? TYR F 162 TYR F 165 5 ? 4 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU B 166 ? THR B 196 ? LEU F 166 THR F 196 1 ? 31 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN B 202 ? GLN B 216 ? ASN F 202 GLN F 216 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN B 217 ? ASP B 234 ? ASN F 217 ASP F 234 1 ? 18 HELX_P HELX_P42 AE6 PRO B 238 ? VAL B 265 ? PRO F 238 VAL F 265 1 ? 28 HELX_P HELX_P43 AE7 LYS B 272 ? LEU B 288 ? LYS F 272 LEU F 288 1 ? 17 HELX_P HELX_P44 AE8 LEU B 288 ? ASP B 302 ? LEU F 288 ASP F 302 1 ? 15 HELX_P HELX_P45 AE9 SER B 306 ? VAL B 322 ? SER F 306 VAL F 322 1 ? 17 HELX_P HELX_P46 AF1 ALA B 326 ? ASN B 337 ? ALA F 326 ASN F 337 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 AF2 GLU B 339 ? PHE B 367 ? GLU F 339 PHE F 367 1 ? 29 HELX_P HELX_P48 AF3 PRO B 368 ? MET B 370 ? PRO F 368 MET F 370 5 ? 3 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP B 371 ? SER B 404 ? ASP F 371 SER F 404 1 ? 34 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS B 405 ? GLN B 409 ? LYS F 405 GLN F 409 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 PRO B 411 ? LYS B 436 ? PRO F 411 LYS F 436 1 ? 26 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN B 439 ? LYS B 473 ? ASN F 439 LYS F 473 1 ? 35 HELX_P HELX_P53 AF8 PRO B 480 ? GLY B 503 ? PRO F 480 GLY F 503 1 ? 24 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP B 511 ? PHE B 515 ? ASP F 511 PHE F 515 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 TYR B 516 ? GLN B 544 ? TYR F 516 GLN F 544 1 ? 29 HELX_P HELX_P56 AG2 LEU B 655 ? ASN B 682 ? LEU F 655 ASN F 682 1 ? 28 HELX_P HELX_P57 AG3 ARG B 687 ? GLN B 703 ? ARG F 687 GLN F 703 1 ? 17 HELX_P HELX_P58 AG4 GLN B 703 ? GLY B 712 ? GLN F 703 GLY F 712 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 410 A . ? LEU 410 E PRO 411 A ? PRO 411 E 1 9.28 2 LEU 410 B . ? LEU 410 F PRO 411 B ? PRO 411 F 1 8.76 # _pdbx_entry_details.entry_id 8U5C _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 SER E 36 ? ? 64.39 -49.30 2 1 PHE E 80 ? ? -127.57 -57.35 3 1 THR E 142 ? ? -131.33 -33.26 4 1 ARG E 235 ? ? 72.75 -6.67 5 1 LEU E 288 ? ? -130.47 -51.94 6 1 ASP E 302 ? ? -100.82 77.74 7 1 LYS E 405 ? ? 58.71 12.50 8 1 ALA E 513 ? ? -69.68 11.71 9 1 SER F 36 ? ? 65.16 -47.62 10 1 PHE F 80 ? ? -127.96 -55.11 11 1 SER F 129 ? ? -143.49 -0.32 12 1 ARG F 235 ? ? 72.72 -6.70 13 1 LEU F 288 ? ? -130.48 -52.32 14 1 LYS F 405 ? ? 58.67 11.31 15 1 ALA F 513 ? ? -69.74 11.14 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 8U5C _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id . _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range . _em_3d_fitting_list.details ;A dimeric assembly was predicted with AlphaFold and then rigid body fit into the map. Subsequent refinements were performed in ISOLDE. ; _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name AlphaFold _em_3d_fitting_list.type 'in silico model' _em_3d_fitting_list.accession_code Q7Z3F1 _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 # _em_3d_reconstruction.entry_id 8U5C _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.68 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 144608 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'Homodimeric complex of LYCHOS (GPR155)' _em_entity_assembly.details 'In complex with cholesterol' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list 1 # _em_imaging.entry_id 8U5C _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'ZEMLIN TABLEAU' _em_imaging.c2_aperture_diameter 50.0 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_vitrification.entry_id 8U5C _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 8U5C _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 8U5C _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 E MET 1 ? 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