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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.579 ? 36828 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 5.191 ? 3666 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.045 ? 4196 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4750 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8UH2 _struct.title 'Complex of C3b with the inhibitor albicin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8UH2 _struct_keywords.text 'Complement, Mosquito, C3, convertase, alternative pathway, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? 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GLU B 1116 ALA B 1132 1 ? 17 HELX_P HELX_P30 AD3 SER D 416 ? ASN D 431 ? SER B 1142 ASN B 1157 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG D 437 ? GLY D 452 ? ARG B 1163 GLY B 1178 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY D 456 ? THR D 465 ? GLY B 1182 THR B 1191 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 LYS D 477 ? LYS D 496 ? LYS B 1203 LYS B 1222 1 ? 20 HELX_P HELX_P34 AD7 PHE D 500 ? ARG D 512 ? PHE B 1226 ARG B 1238 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 SER D 520 ? GLN D 535 ? SER B 1246 GLN B 1261 1 ? 16 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU D 566 ? ALA D 568 ? GLU B 1292 ALA B 1294 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP D 666 ? GLY D 676 ? ASP B 1392 GLY B 1402 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 SER D 682 ? ALA D 689 ? SER B 1408 ALA B 1415 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 PHE D 690 ? ARG D 693 ? PHE B 1416 ARG B 1419 5 ? 4 HELX_P HELX_P40 AE4 THR D 780 ? ALA D 788 ? THR B 1506 ALA B 1514 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 AE5 LYS D 841 ? LEU D 846 ? LYS B 1567 LEU B 1572 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 LEU D 859 ? SER D 861 ? 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A CYS 58 SG ? ? ? 1_555 A CYS 113 SG ? ? C CYS 58 C CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 81 SG ? ? ? 1_555 A CYS 91 SG ? ? C CYS 81 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 58 SG ? ? ? 1_555 B CYS 113 SG ? ? D CYS 58 D CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 81 SG ? ? ? 1_555 B CYS 91 SG ? ? D CYS 81 D CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 537 SG ? ? ? 1_555 D CYS 68 SG ? ? A CYS 537 B CYS 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 605 SG ? ? ? 1_555 C CYS 640 SG ? ? A CYS 605 A CYS 640 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 125 SG ? ? ? 1_555 D CYS 765 SG ? ? B CYS 851 B CYS 1491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 353 SG ? ? ? 1_555 D CYS 410 SG ? ? B CYS 1079 B CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 610 SG ? ? ? 1_555 D CYS 741 SG ? ? B CYS 1336 B CYS 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf10 disulf ? ? D CYS 641 SG ? ? ? 1_555 D CYS 710 SG ? ? B CYS 1367 B CYS 1436 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf11 disulf ? ? D CYS 758 SG ? ? ? 1_555 D CYS 763 SG ? ? B CYS 1484 B CYS 1489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 770 SG ? ? ? 1_555 D CYS 842 SG ? ? B CYS 1496 B CYS 1568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 789 SG ? ? ? 1_555 D CYS 913 SG ? ? B CYS 1515 B CYS 1639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 889 SG ? ? ? 1_555 D CYS 898 SG ? ? B CYS 1615 B CYS 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 537 SG ? ? ? 1_555 F CYS 68 SG ? ? G CYS 537 H CYS 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 605 SG ? ? ? 1_555 E CYS 640 SG ? ? G CYS 605 G CYS 640 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf17 disulf ? ? F CYS 125 SG ? ? ? 1_555 F CYS 765 SG ? ? H CYS 851 H CYS 1491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 353 SG ? ? ? 1_555 F CYS 410 SG ? ? H CYS 1079 H CYS 1136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf19 disulf ? ? F CYS 610 SG ? ? ? 1_555 F CYS 741 SG ? ? H CYS 1336 H CYS 1467 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf20 disulf ? ? F CYS 641 SG ? ? ? 1_555 F CYS 710 SG ? ? H CYS 1367 H CYS 1436 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? disulf21 disulf ? ? F CYS 758 SG ? ? ? 1_555 F CYS 763 SG ? ? H CYS 1484 H CYS 1489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf22 disulf ? ? F CYS 770 SG ? ? ? 1_555 F CYS 842 SG ? ? H CYS 1496 H CYS 1568 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf23 disulf ? ? F CYS 789 SG ? ? ? 1_555 F CYS 913 SG ? ? H CYS 1515 H CYS 1639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf24 disulf ? ? F CYS 889 SG ? ? ? 1_555 F CYS 898 SG ? ? H CYS 1615 H CYS 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? C ASN 63 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 63 A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? D ASN 191 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 917 B NAG 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? E ASN 63 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? G ASN 63 G NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? F ASN 191 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? H ASN 917 H NAG 1701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG G . ? 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None 'Disulfide bridge' 11 CYS D 125 ? CYS D 765 ? CYS B 851 ? 1_555 CYS B 1491 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS D 353 ? CYS D 410 ? CYS B 1079 ? 1_555 CYS B 1136 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS D 610 ? CYS D 741 ? CYS B 1336 ? 1_555 CYS B 1467 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS D 641 ? CYS D 710 ? CYS B 1367 ? 1_555 CYS B 1436 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS D 758 ? CYS D 763 ? CYS B 1484 ? 1_555 CYS B 1489 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS D 770 ? CYS D 842 ? CYS B 1496 ? 1_555 CYS B 1568 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS D 789 ? CYS D 913 ? CYS B 1515 ? 1_555 CYS B 1639 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS D 889 ? CYS D 898 ? CYS B 1615 ? 1_555 CYS B 1624 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS E 537 ? CYS F 68 ? CYS G 537 ? 1_555 CYS H 794 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS E 605 ? CYS E 640 ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 40 C . ? PHE 40 A PRO 41 C ? PRO 41 A 1 -2.59 2 ILE 504 C . ? ILE 504 A PRO 505 C ? PRO 505 A 1 -3.67 3 LYS 867 D . ? LYS 1593 B PRO 868 D ? PRO 1594 B 1 0.62 4 PHE 40 E . ? PHE 40 G PRO 41 E ? PRO 41 G 1 -0.10 5 ILE 504 E . ? ILE 504 G PRO 505 E ? PRO 505 G 1 -3.82 6 LYS 867 F . ? LYS 1593 H PRO 868 F ? PRO 1594 H 1 -1.28 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 5 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 5 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 5 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 7 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF2 4 5 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF4 5 6 ? anti-parallel AF4 6 7 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 MET C 61 ? 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PHENIX 1.19.2_4158: # _em_specimen.concentration 1.5 _em_specimen.details 'Complex was formed by incubation of C3b, Factor B, Factor D and albicin in vitro and was monodisperse' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _atom_sites.entry_id 8UH2 _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_