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C . n C 3 678 LEU 678 701 ? ? ? C . n C 3 679 GLN 679 702 ? ? ? C . n C 3 680 PRO 680 703 ? ? ? C . n C 3 681 GLU 681 704 ? ? ? C . n C 3 682 SER 682 705 ? ? ? C . n C 3 683 LEU 683 706 ? ? ? C . n C 3 684 TYR 684 707 ? ? ? C . n C 3 685 GLU 685 708 ? ? ? C . n C 3 686 PHE 686 709 ? ? ? C . n C 3 687 PHE 687 710 ? ? ? C . n C 3 688 VAL 688 711 ? ? ? C . n C 3 689 THR 689 712 ? ? ? C . n C 3 690 PRO 690 713 ? ? ? C . n C 3 691 TYR 691 714 ? ? ? C . n C 3 692 THR 692 715 ? ? ? C . n C 3 693 SER 693 716 ? ? ? C . n C 3 694 ALA 694 717 ? ? ? C . n C 3 695 GLY 695 718 ? ? ? C . n C 3 696 PRO 696 719 ? ? ? C . n C 3 697 GLY 697 720 ? ? ? C . n C 3 698 PRO 698 721 ? ? ? C . n C 3 699 ASN 699 722 ? ? ? C . n C 3 700 GLU 700 723 ? ? ? C . n C 3 701 THR 701 724 ? ? ? C . n C 3 702 PHE 702 725 ? ? ? C . n C 3 703 THR 703 726 ? ? ? C . n C 3 704 LYS 704 727 ? ? ? C . n C 3 705 VAL 705 728 ? ? ? C . n C 3 706 THR 706 729 ? ? ? C . n C 3 707 THR 707 730 ? ? ? C . n C 3 708 PRO 708 731 ? ? ? C . n C 3 709 ASP 709 732 ? ? ? C . n C 3 710 ALA 710 733 ? ? ? C . n C 3 711 ARG 711 734 ? ? ? C . n C 3 712 SER 712 735 ? ? ? C . n C 3 713 HIS 713 736 ? ? ? C . n C 3 714 MET 714 737 ? ? ? C . n C 3 715 LEU 715 738 ? ? ? C . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 4 NAG 1 D NAG 1 B NAG 1022 n D 4 NAG 2 D NAG 2 B NAG 1023 n E 4 NAG 1 E NAG 1 C NAG 1013 n E 4 NAG 2 E NAG 2 C NAG 1014 n F 4 NAG 1 F NAG 1 C NAG 1016 n F 4 NAG 2 F NAG 2 C NAG 1017 n G 4 NAG 1 G NAG 1 C NAG 1018 n G 4 NAG 2 G NAG 2 C NAG 1019 n H 4 NAG 1 H NAG 1 C NAG 1020 n H 4 NAG 2 H NAG 2 C NAG 1021 n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 5 NAG 1 701 1003 NAG NAG B . 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.401 ? 6379 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 25.237 ? 672 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.040 ? 746 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 802 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8V2C _struct.title 'Cryo-EM structure of mouse type II OSM receptor complex: model for assembly core region' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8V2C _struct_keywords.text 'cytokine signaling, OSM, gp130, OSMR, CYTOKINE, CYTOKINE-RECEPTOR complex' _struct_keywords.pdbx_keywords CYTOKINE/RECEPTOR # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? 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'expression tag' 645 28 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 9 ? 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PRO B 271 MET B 276 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 5 SG ? ? ? 1_555 A CYS 116 SG ? ? A CYS 28 A CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 48 SG ? ? ? 1_555 A CYS 154 SG ? ? A CYS 71 A CYS 177 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 112 SG ? ? ? 1_555 B CYS 122 SG ? ? B CYS 134 B CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 150 SG ? ? ? 1_555 B CYS 158 SG ? ? B CYS 172 B CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 155 SG ? ? ? 1_555 C CYS 191 SG ? ? C CYS 178 C CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 219 SG ? ? ? 1_555 C CYS 229 SG ? ? C CYS 242 C CYS 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 252 SG ? ? ? 1_555 C CYS 259 SG ? ? C CYS 275 C CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? B ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? B ASN 131 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 157 B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 203 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 225 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 139 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? C ASN 162 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 216 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? C ASN 239 C NAG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? C ASN 248 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? C ASN 271 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 281 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? C ASN 304 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 300 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? C ASN 323 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale10 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale11 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale12 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale13 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG D . ? 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None 'Disulfide bridge' 11 CYS B 112 ? CYS B 122 ? CYS B 134 ? 1_555 CYS B 144 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS B 150 ? CYS B 158 ? CYS B 172 ? 1_555 CYS B 180 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS C 155 ? CYS C 191 ? CYS C 178 ? 1_555 CYS C 214 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS C 219 ? CYS C 229 ? CYS C 242 ? 1_555 CYS C 252 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS C 252 ? CYS C 259 ? CYS C 275 ? 1_555 CYS C 282 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 128 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id C _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 151 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id C _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 129 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 C _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 152 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 C _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -1.63 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 CYS B 158 ? 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LYS C 315 PHE C 322 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O CYS B 158 ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Other private' _pdbx_audit_support.country ? _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _atom_sites.entry_id 8V2C _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_