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;KIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLQATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTP TPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNWNHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLL EERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLDMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPD GIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDG DRKFAQYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEF TVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMQFTYEVHLVADGKFGTQERVQNSNKKEWNGMMGE LLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMNPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFS PFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERI TGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKC DLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQQVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMIVAGGI VAGIFLIFIEIAYKSRA ; A,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;SIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQEAIAQILD 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;NFMLTQPHSVSESPGKTVTISCTRSSGSIASNYVQWYQQRPGSAPTTVIYEDNQRPSGVPDRFSGSIDSSSNSASLTISG LKTEDEADYYCQSYDSSTVVFGGGTKLT ; K,L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 LYS n 1 2 ILE n 1 3 VAL n 1 4 ASN n 1 5 ILE n 1 6 GLY n 1 7 ALA n 1 8 VAL n 1 9 LEU n 1 10 SER n 1 11 THR n 1 12 ARG n 1 13 LYS n 1 14 HIS n 1 15 GLU n 1 16 GLN n 1 17 MET n 1 18 PHE n 1 19 ARG n 1 20 GLU n 1 21 ALA n 1 22 VAL n 1 23 ASN n 1 24 GLN n 1 25 ALA n 1 26 ASN n 1 27 LYS n 1 28 ARG n 1 29 HIS n 1 30 GLY n 1 31 SER n 1 32 TRP n 1 33 LYS n 1 34 ILE n 1 35 GLN n 1 36 LEU n 1 37 GLN n 1 38 ALA n 1 39 THR n 1 40 SER n 1 41 VAL n 1 42 THR n 1 43 HIS n 1 44 LYS n 1 45 PRO n 1 46 ASN n 1 47 ALA n 1 48 ILE n 1 49 GLN n 1 50 MET n 1 51 ALA n 1 52 LEU n 1 53 SER n 1 54 VAL n 1 55 CYS n 1 56 GLU n 1 57 ASP n 1 58 LEU n 1 59 ILE n 1 60 SER n 1 61 SER n 1 62 GLN n 1 63 VAL n 1 64 TYR n 1 65 ALA n 1 66 ILE n 1 67 LEU n 1 68 VAL n 1 69 SER n 1 70 HIS n 1 71 PRO n 1 72 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.599 ? 35804 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.889 ? 3819 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 4169 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4607 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8VUY _struct.title 'Rat GluN1-2B with Fab 003-102' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8VUY _struct_keywords.text 'Channel, heterotetramer, receptor, antibody, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NMDZ1_RAT P35439 ? 1 ;KIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTP TPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNWNHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLL EERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPD GIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDG DRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEF TVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGE LLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFS PFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERI TGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKC DLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGI VAGIFLIFIEIAYK ; 25 2 UNP NMDE2_RAT Q00960 ? 2 ;SIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQEAIAQILD FISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNIMEEYDWYIFSIVTTYFPGYQDFVNKIRSTIENS FVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIVPSLVAGDTDTVPSEF PTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSSCYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEGRNLSFSE DGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWKDKSLQMKYYVWPRMCPETEEQEDDHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLSGTCMRNT VPCQKRIISENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMIGEVVMKRAYMAVGSL TINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGR EPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQR PNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLSLKTGKLDAFIYDAAVLNYMAGRDEGCKLVTIGS GKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEMEELEALWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLGAAMALSL ITFICEHLFYWQ ; 34 3 PDB 8VUY 8VUY ? 3 ? 1 4 PDB 8VUY 8VUY ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8VUY A 1 ? 814 ? 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UNP P35439 ASN 771 conflict 771 22 3 8VUY ILE C 795 ? UNP P35439 LEU 819 conflict 819 23 3 8VUY SER C 815 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 839 24 3 8VUY ARG C 816 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 840 25 3 8VUY ALA C 817 ? UNP P35439 ? ? 'expression tag' 841 26 4 8VUY ASP D 315 ? UNP Q00960 ASN 348 conflict 348 27 4 8VUY GLU D 321 ? UNP Q00960 ASP 354 conflict 354 28 4 8VUY GLU D 404 ? UNP Q00960 GLN 437 conflict 437 29 4 8VUY SER D 805 ? UNP Q00960 CYS 838 conflict 838 30 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 11 ? 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PRO 109 J 1 0.46 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 5 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC3 1 2 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF2 1 2 ? parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 38 ? 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