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'X-RAY DIFFRACTION' ? 19.9 ? ? ? t_other_torsion ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.d_res_high 2.77 _refine_ls_shell.d_res_low 2.98 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs 836 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 34 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work ? _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 6.57 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs 0.336 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.3355 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used ? _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.347 # _struct.entry_id 8W85 _struct.title 'HLA-DQ2.5-gamma2 gliadin peptide in complex with DQN0385AE01' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8W85 _struct_keywords.text 'CELIAC DISEASE, ANTIBODY, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? 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PDB ? ? ? linker 994 44 9 8W85 GLY H 21 ? PDB ? ? ? linker 995 45 9 8W85 SER H 22 ? PDB ? ? ? linker 996 46 9 8W85 GLY H 23 ? PDB ? ? ? linker 997 47 9 8W85 GLY H 24 ? PDB ? ? ? linker 998 48 9 8W85 GLY H 25 ? PDB ? ? ? linker 999 49 9 8W85 SER H 26 ? PDB ? ? ? linker 1000 50 10 8W85 LEU H 217 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1191 51 10 8W85 GLU H 218 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1192 52 10 8W85 VAL H 219 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1193 53 10 8W85 LEU H 220 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1194 54 10 8W85 PHE H 221 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1195 55 10 8W85 GLN H 222 ? UNP O19712 ? ? 'expression tag' 1196 56 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? tetrameric 4 2 author_defined_assembly ? tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,I 2 1 E,F,G,H,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 28 ? 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A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 97 SG ? ? A CYS 22 A CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 36 SG ? ? ? 1_555 A CYS 51 SG ? ? A CYS 36 A CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 145 SG ? ? ? 1_555 A CYS 201 SG ? ? A CYS 145 A CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 88 SG ? ? B CYS 23 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 133 SG ? ? ? 1_555 B CYS 193 SG ? ? B CYS 133 B CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 109 SG ? ? ? 1_555 C CYS 165 SG ? ? C CYS 109 C CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 41 SG ? ? ? 1_555 D CYS 105 SG ? ? D CYS 1015 D CYS 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 143 SG ? ? ? 1_555 D CYS 199 SG ? ? D CYS 1117 D CYS 1173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf9 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 97 SG ? ? E CYS 22 E CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf10 disulf ? ? E CYS 36 SG ? ? ? 1_555 E CYS 51 SG ? ? E CYS 36 E CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 23 SG ? ? ? 1_555 F CYS 88 SG ? ? F CYS 23 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.050 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 109 SG ? ? ? 1_555 G CYS 165 SG ? ? G CYS 109 G CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 41 SG ? ? ? 1_555 H CYS 105 SG ? ? H CYS 1015 H CYS 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? H CYS 143 SG ? ? ? 1_555 H CYS 199 SG ? ? H CYS 1117 H CYS 1173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 22 ? 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CYS F 23 ? 1_555 CYS F 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS G 109 ? CYS G 165 ? CYS G 109 ? 1_555 CYS G 165 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS H 41 ? CYS H 105 ? CYS H 1015 ? 1_555 CYS H 1079 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS H 143 ? CYS H 199 ? CYS H 1117 ? 1_555 CYS H 1173 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 151 A . ? PHE 151 A PRO 152 A ? PRO 152 A 1 -9.78 2 GLU 153 A . ? GLU 153 A PRO 154 A ? PRO 154 A 1 12.56 3 TYR 139 B . ? TYR 139 B PRO 140 B ? PRO 140 B 1 -1.84 4 GLY 20 C . ? GLY 20 C PRO 21 C ? PRO 21 C 1 -3.12 5 PHE 115 C . ? PHE 115 C PRO 116 C ? PRO 116 C 1 -3.99 6 TYR 149 D . ? 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AD2 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN A 3 ? 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VAL A 212 VAL A 216 AA6 1 MET B 4 ? GLN B 6 ? MET B 4 GLN B 6 AA6 2 VAL B 19 ? ALA B 25 ? VAL B 19 ALA B 25 AA6 3 ASP B 70 ? ILE B 75 ? ASP B 70 ILE B 75 AA6 4 PHE B 62 ? SER B 67 ? PHE B 62 SER B 67 AA7 1 SER B 10 ? ALA B 13 ? SER B 10 ALA B 13 AA7 2 THR B 101 ? ILE B 105 ? THR B 101 ILE B 105 AA7 3 VAL B 85 ? TYR B 90 ? VAL B 85 TYR B 90 AA7 4 ASN B 34 ? GLN B 38 ? ASN B 34 GLN B 38 AA7 5 LYS B 45 ? ILE B 48 ? LYS B 45 ILE B 48 AA8 1 SER B 10 ? ALA B 13 ? SER B 10 ALA B 13 AA8 2 THR B 101 ? ILE B 105 ? THR B 101 ILE B 105 AA8 3 VAL B 85 ? TYR B 90 ? VAL B 85 TYR B 90 AA8 4 SER B 96 ? PHE B 97 ? SER B 96 PHE B 97 AA9 1 SER B 113 ? PHE B 117 ? SER B 113 PHE B 117 AA9 2 THR B 128 ? PHE B 138 ? THR B 128 PHE B 138 AA9 3 TYR B 172 ? SER B 181 ? TYR B 172 SER B 181 AB1 1 ALA B 152 ? GLN B 154 ? ALA B 152 GLN B 154 AB1 2 LYS B 144 ? VAL B 149 ? LYS B 144 VAL B 149 AB1 3 VAL B 190 ? THR B 196 ? VAL B 190 THR B 196 AB1 4 VAL B 204 ? ASN B 209 ? VAL B 204 ASN B 209 AB2 1 GLU C 43 ? TRP C 46 ? 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