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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.734 ? 11360 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.676 ? 2997 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.050 ? 1292 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 1442 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8W8Q _struct.title 'Cryo-EM structure of the GPR101-Gs complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8W8Q _struct_keywords.text 'GPCR, orphan receptor, GPR101, constitutive activity, cryo-EM, structural protein, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? 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P0ABE7 23 ? 128 ? -105 0 2 2 8W8Q C 148 ? 655 ? Q96P66 1 ? 508 ? 1 508 3 3 8W8Q A 1 ? 394 ? P63092 1 ? 394 ? 1 394 4 4 8W8Q B 1 ? 339 ? P62873 2 ? 340 ? 2 340 5 5 8W8Q G 1 ? 58 ? P59768 5 ? 62 ? 5 62 6 6 8W8Q N 1 ? 128 ? 8W8Q 1 ? 128 ? 1 128 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8W8Q MET C 1 ? UNP P0ABE7 ? ? 'initiating methionine' -146 1 1 8W8Q LYS C 2 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -145 2 1 8W8Q THR C 3 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -144 3 1 8W8Q ILE C 4 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -143 4 1 8W8Q ILE C 5 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -142 5 1 8W8Q ALA C 6 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -141 6 1 8W8Q LEU C 7 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -140 7 1 8W8Q SER C 8 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -139 8 1 8W8Q TYR C 9 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -138 9 1 8W8Q ILE C 10 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -137 10 1 8W8Q PHE C 11 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -136 11 1 8W8Q CYS C 12 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -135 12 1 8W8Q LEU C 13 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -134 13 1 8W8Q VAL C 14 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -133 14 1 8W8Q PHE C 15 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -132 15 1 8W8Q ALA C 16 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -131 16 1 8W8Q ASP C 17 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -130 17 1 8W8Q TYR C 18 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -129 18 1 8W8Q LYS C 19 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -128 19 1 8W8Q ASP C 20 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -127 20 1 8W8Q ASP C 21 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -126 21 1 8W8Q ASP C 22 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -125 22 1 8W8Q ASP C 23 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -124 23 1 8W8Q LYS C 24 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -123 24 1 8W8Q HIS C 25 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -122 25 1 8W8Q HIS C 26 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -121 26 1 8W8Q HIS C 27 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -120 27 1 8W8Q HIS C 28 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -119 28 1 8W8Q HIS C 29 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -118 29 1 8W8Q HIS C 30 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -117 30 1 8W8Q HIS C 31 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -116 31 1 8W8Q HIS C 32 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -115 32 1 8W8Q HIS C 33 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -114 33 1 8W8Q HIS C 34 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -113 34 1 8W8Q GLU C 35 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -112 35 1 8W8Q ASN C 36 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -111 36 1 8W8Q LEU C 37 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -110 37 1 8W8Q TYR C 38 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -109 38 1 8W8Q PHE C 39 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -108 39 1 8W8Q GLN C 40 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -107 40 1 8W8Q GLY C 41 ? UNP P0ABE7 ? ? 'expression tag' -106 41 1 8W8Q TRP C 48 ? UNP P0ABE7 MET 29 conflict -99 42 1 8W8Q ILE C 143 ? UNP P0ABE7 HIS 124 conflict -4 43 1 8W8Q LEU C 147 ? UNP P0ABE7 ARG 128 conflict 0 44 3 8W8Q ASN A 54 ? UNP P63092 SER 54 'engineered mutation' 54 45 3 8W8Q PHE A 60 ? UNP P63092 MET 60 'engineered mutation' 60 46 3 8W8Q ALA A 226 ? UNP P63092 GLY 226 'engineered mutation' 226 47 3 8W8Q ALA A 268 ? UNP P63092 GLU 268 'engineered mutation' 268 48 3 8W8Q LYS A 271 ? UNP P63092 ASN 271 'engineered mutation' 271 49 3 8W8Q ASP A 274 ? UNP P63092 LYS 274 'engineered mutation' 274 50 3 8W8Q LYS A 280 ? UNP P63092 ARG 280 'engineered mutation' 280 51 3 8W8Q ASP A 284 ? UNP P63092 THR 284 'engineered mutation' 284 52 3 8W8Q THR A 285 ? UNP P63092 ILE 285 'engineered mutation' 285 53 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 174 ? LYS A 206 ? SER C 27 LYS C 59 1 ? 33 HELX_P HELX_P2 AA2 VAL A 212 ? VAL A 240 ? VAL C 65 VAL C 93 1 ? 29 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 247 ? HIS A 282 ? ASN C 100 HIS C 135 1 ? 36 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 285 ? MET A 290 ? SER C 138 MET C 143 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 291 ? TYR A 315 ? THR C 144 TYR C 168 1 ? 25 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 336 ? ILE A 348 ? SER C 189 ILE C 201 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE A 348 ? ASN A 375 ? ILE C 201 ASN C 228 1 ? 28 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN A 541 ? VAL A 572 ? GLN C 394 VAL C 425 1 ? 32 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 573 ? VAL A 578 ? ASP C 426 VAL C 431 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO A 579 ? LEU A 592 ? PRO C 432 LEU C 445 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 592 ? GLY A 602 ? LEU C 445 GLY C 455 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 HIS A 605 ? PHE A 620 ? HIS C 458 PHE C 473 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU B 10 ? THR B 40 ? GLU A 10 THR A 40 1 ? 31 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY B 52 ? GLN B 59 ? GLY A 52 GLN A 59 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 LYS B 233 ? ASP B 240 ? LYS A 233 ASP A 240 5 ? 8 HELX_P HELX_P16 AB7 ARG B 265 ? ASN B 279 ? ARG A 265 ASN A 279 1 ? 15 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS B 293 ? GLY B 304 ? LYS A 293 GLY A 304 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS B 307 ? PHE B 312 ? LYS A 307 PHE A 312 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO B 313 ? ALA B 316 ? PRO A 313 ALA A 316 5 ? 4 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP B 331 ? SER B 352 ? ASP A 331 SER A 352 1 ? 22 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU B 370 ? TYR B 391 ? GLU A 370 TYR A 391 1 ? 22 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU C 2 ? ALA C 25 ? GLU B 3 ALA B 26 1 ? 24 HELX_P HELX_P23 AC5 THR C 28 ? ASN C 34 ? THR B 29 ASN B 35 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 AC6 THR D 2 ? ASN D 20 ? THR G 6 ASN G 24 1 ? 19 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS D 25 ? HIS D 40 ? LYS G 29 HIS G 44 1 ? 16 HELX_P HELX_P26 AC8 THR E 28 ? TYR E 32 ? THR N 28 TYR N 32 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 251 SG ? ? ? 1_555 A CYS 329 SG ? ? C CYS 104 C CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf2 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 96 SG ? ? N CYS 22 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? E CYS 99 SG ? ? ? 1_555 E CYS 107 SG ? ? N CYS 99 N CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 251 ? CYS A 329 ? CYS C 104 ? 1_555 CYS C 182 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS E 22 ? CYS E 96 ? CYS N 22 ? 1_555 CYS N 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS E 99 ? CYS E 107 ? CYS N 99 ? 1_555 CYS N 107 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 321 ? 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