data_8WLQ # _entry.id 8WLQ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.395 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8WLQ pdb_00008wlq 10.2210/pdb8wlq/pdb WWPDB D_1300041508 ? ? EMDB EMD-37628 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-09-04 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8WLQ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-09-30 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Cryo-EM structure of the whole rod-export apparatus with hook within the flagellar motor-hook complex in the CCW state.' EMD-37628 'associated EM volume' PDB 'Cryo-EM structure of the proximal rod-export apparatus and FlgF within the motor-hook complex in the CCW state' 8WLH unspecified EMDB 'Cryo-EM structure of the proximal rod-export apparatus and FlgF within the motor-hook complex in the CCW state' EMD-37619 'other EM volume' PDB 'Cryo-EM structure of the distal rod-hook within the flagellar motor-hook complex in the CCW state' 8WLP unspecified EMDB 'Cryo-EM structure of the distal rod-hook within the flagellar motor-hook complex in the CCW state' EMD-37627 'other EM volume' # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 3 zhuyongqun@zju.edu.cn Yongqun Zhu ? 'principal investigator/group leader' 0000-0002-4158-5223 4 zhouyanlsi@zju.edu.cn Yan Zhou ? 'principal investigator/group leader' 0000-0001-9352-7108 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Tan, J.X.' 1 ? 'Zhang, L.' 2 ? 'Zhou, Y.' 3 ? 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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Tan, J.X.' 1 ? primary 'Zhang, L.' 2 ? primary 'Zhou, Y.' 3 ? primary 'Zhu, Y.Q.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Flagellar basal-body rod protein FlgG' 27784.807 24 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Flagellar hook protein FlgE' 42233.152 29 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Flagellar biosynthetic protein FliQ' 9606.758 4 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Flagellar biosynthetic protein FliR' 28938.865 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Flagellar biosynthetic protein FliP' 26801.086 5 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Flagellar hook-basal body complex protein FliE' 11087.662 6 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Flagellar basal body rod protein FlgB' 15145.061 5 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Flagellar basal-body rod protein FlgC' 13991.889 6 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Flagellar M-ring protein' 61295.645 11 ? ? ? ? 10 polymer nat 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QQGQAAPVQVGQLNLTTFMNDTGLESIGENLYIETQSSGAPNESTPGLNGAGLLYQGYVETSNVNVAEELVNMIQVQRAY EINSKAVSTTDQMLQKLTQL ; 0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,ZA,ZB,ZC,ZD,ZE,r,s,t,u,v,w,x,y,z ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSFSQAVSGLNAAATNLDVIGNNIANSATYGFKSGTASFADMFAGSKVGLGVKVAGITQDFTDGTTTNTGRGLDVAISQN GFFRLVDSNGSVFYSRNGQFKLDENRNLVNMQGMQLTGYPATGTPPTIQQGANPAPITIPNTLMAAKSTTTASMQINLNS TDPVPSKTPFSVSDADSYNKKGTVTVYDSQGNAHDMNVYFVKTKDNEWAVYTHDSSDPAATAPTTASTTLKFNENGILES GGTVNITTGTINGATAATFSLSFLNSMQQNTGANNIVATNQNGYKPGDLVSYQINNDGTVVGNYSNEQEQVLGQIVLANF ANNEGLASQGDNVWAATQASGVALLGTAGSGNFGKLTNGALEASNVDLSKELVNMIVAQRNYQSNAQTIKTQDQILNTLV NLR ; ;MSFSQAVSGLNAAATNLDVIGNNIANSATYGFKSGTASFADMFAGSKVGLGVKVAGITQDFTDGTTTNTGRGLDVAISQN GFFRLVDSNGSVFYSRNGQFKLDENRNLVNMQGMQLTGYPATGTPPTIQQGANPAPITIPNTLMAAKSTTTASMQINLNS TDPVPSKTPFSVSDADSYNKKGTVTVYDSQGNAHDMNVYFVKTKDNEWAVYTHDSSDPAATAPTTASTTLKFNENGILES GGTVNITTGTINGATAATFSLSFLNSMQQNTGANNIVATNQNGYKPGDLVSYQINNDGTVVGNYSNEQEQVLGQIVLANF ANNEGLASQGDNVWAATQASGVALLGTAGSGNFGKLTNGALEASNVDLSKELVNMIVAQRNYQSNAQTIKTQDQILNTLV NLR ; ZF,ZG,ZH,ZI,ZJ,ZK,ZL,ZM,ZN,ZO,ZP,ZQ,ZR,ZS,ZT,ZU,ZV,ZW,ZX,ZY,ZZ,Za,Zb,Zc,Zd,Ze,Zf,Zg,Zh ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MTPESVMMMGTEAMKVALALAAPLLLVALITGLIISILQAATQINEMTLSFIPKIVAVFIAIIVAGPWMLNLLLDYVRTL FSNLPYIIG ; ;MTPESVMMMGTEAMKVALALAAPLLLVALITGLIISILQAATQINEMTLSFIPKIVAVFIAIIVAGPWMLNLLLDYVRTL FSNLPYIIG ; A,B,C,D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MIQVTSEQWLYWLHLYFWPLLRVLALISTAPILSERAIPKRVKLGLGIMITLVIAPSLPANDTPLFSIAALWLAMQQILI GIALGFTMQFAFAAVRTAGEFIGLQMGLSFATFVDPGSHLNMPVLARIMDMLAMLLFLTFNGHLWLISLLVDTFHTLPIG SNPVNSNAFMALARAGGLIFLNGLMLALPVITLLLTLNLALGLLNRMAPQLSIFVIGFPLTLTVGIMLMAALMPLIAPFC EHLFSEIFNLLADIVSEMPINNNP ; ;MIQVTSEQWLYWLHLYFWPLLRVLALISTAPILSERAIPKRVKLGLGIMITLVIAPSLPANDTPLFSIAALWLAMQQILI GIALGFTMQFAFAAVRTAGEFIGLQMGLSFATFVDPGSHLNMPVLARIMDMLAMLLFLTFNGHLWLISLLVDTFHTLPIG SNPVNSNAFMALARAGGLIFLNGLMLALPVITLLLTLNLALGLLNRMAPQLSIFVIGFPLTLTVGIMLMAALMPLIAPFC EHLFSEIFNLLADIVSEMPINNNP ; E ? 5 'polypeptide(L)' no no 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;MLDRLDAALRFQQEALNLRAQRQEILAANIANADTPGYQARDIDFASELKKVMVRGREETGGVALTLTSSHHIPAQAVSS PAVDLLYRVPDQPSLDGNTVDMDRERTQFADNSLKYQMGLTVLGSQLKGMMNVLQGGN ; Q,R,S,T,U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MALLNIFDIAGSALAAQSKRLNVAASNLANADSVTGPDGQPYRAKQVVFQVDAAPGQATGGVKVASVIESQAPEKLVYEP GNPLADANGYVKMPNVDVVGEMVNTMSASRSYQANIEVLNTVKSMMLKTLTLGQ ; ;MALLNIFDIAGSALAAQSKRLNVAASNLANADSVTGPDGQPYRAKQVVFQVDAAPGQATGGVKVASVIESQAPEKLVYEP GNPLADANGYVKMPNVDVVGEMVNTMSASRSYQANIEVLNTVKSMMLKTLTLGQ ; V,W,X,Y,Z,a ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSATASTATQPKPLEWLNRLRANPRIPLIVAGSAAVAIVVAMVLWAKTPDYRTLFSNLSDQDGGAIVAQLTQMNIPYRFA NGSGAIEVPADKVHELRLRLAQQGLPKGGAVGFELLDQEKFGISQFSEQVNYQRALEGELARTIETLGPVKSARVHLAMP KPSLFVREQKSPSASVTVTLEPGRALDEGQISAVVHLVSSAVAGLPPGNVTLVDQSGHLLTQSNTSGRDLNDAQLKFAND VESRIQRRIEAILSPIVGNGNVHAQVTAQLDFANKEQTEEHYSPNGDASKATLRSRQLNISEQVGAGYPGGVPGALSNQP APPNEAPIATPPTNQQNAQNTPQTSTSTNSNSAGPRSTQRNETSNYEVDRTIRHTKMNVGDIERLSVAVVVNYKTLADGK PLPLTADQMKQIEDLTREAMGFSDKRGDTLNVVNSPFSAVDNTGGELPFWQQQSFIDQLLAAGRWLLVLVVAWILWRKAV 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;MDHAIYTAMGAASQTLNQQAVTASNLANASTPGFRAQLNALRAVPVDGLSLATRTLVTASTPGADMTPGQLDYTSRPLDV ALQQDGWLVVQAADGAEGYTRNGNIQVGPTGQLTIQGHPVIGEGGPITVPEGSEITIAADGTISALNPGDPPNTVAPVGR LKLVKAEGNEVQRSDDGLFRLTAEAQAERGAVLAADPSIRIMSGVLEGSNVKPVEAMTDMIANARRFEMQMKVITSVDEN EGRANQLLSMS ; m,n,o,p,q ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ILE n 1 3 SER n 1 4 SER n 1 5 LEU n 1 6 TRP n 1 7 ILE n 1 8 ALA n 1 9 LYS n 1 10 THR n 1 11 GLY n 1 12 LEU n 1 13 ASP n 1 14 ALA n 1 15 GLN n 1 16 GLN n 1 17 THR n 1 18 ASN n 1 19 MET n 1 20 ASP n 1 21 VAL n 1 22 ILE n 1 23 ALA n 1 24 ASN n 1 25 ASN n 1 26 LEU n 1 27 ALA n 1 28 ASN n 1 29 VAL n 1 30 SER n 1 31 THR n 1 32 ASN n 1 33 GLY n 1 34 PHE n 1 35 LYS n 1 36 ARG n 1 37 GLN n 1 38 ARG n 1 39 ALA n 1 40 VAL n 1 41 PHE n 1 42 GLU n 1 43 ASP n 1 44 LEU n 1 45 LEU n 1 46 TYR n 1 47 GLN n 1 48 THR n 1 49 ILE n 1 50 ARG n 1 51 GLN n 1 52 PRO n 1 53 GLY n 1 54 ALA n 1 55 GLN n 1 56 SER n 1 57 SER n 1 58 GLU 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O THR ZI 117 AR4 1 8 N PHE S 82 ? N PHE ZI 82 O ALA S 318 ? O ALA ZI 318 AR4 3 4 N THR S 122 ? N THR ZI 122 O THR S 127 ? O THR ZI 127 AR4 3 5 N GLY S 118 ? N GLY ZI 118 O ALA S 135 ? O ALA ZI 135 AR4 3 8 N TYR S 119 ? N TYR ZI 119 O GLN S 314 ? O GLN ZI 314 AR4 6 7 N SER S 291 ? N SER ZI 291 O ASN S 303 ? O ASN ZI 303 AR4 7 8 N VAL S 300 ? N VAL ZI 300 O GLY S 313 ? O GLY ZI 313 AR4 8 9 N ASN S 319 ? N ASN ZI 319 O LEU S 344 ? O LEU ZI 344 AR5 1 2 N LYS S 101 ? N LYS ZI 101 O VAL S 109 ? O VAL ZI 109 AR6 1 3 N ALA S 152 ? N ALA ZI 152 O SER S 260 ? O SER ZI 260 AR6 1 4 N LEU S 158 ? N LEU ZI 158 O MET S 267 ? O MET ZI 267 AR6 1 5 N ASN S 157 ? N ASN ZI 157 O ASN S 275 ? O ASN ZI 275 AR6 2 3 N ILE S 246 ? N ILE ZI 246 O PHE S 259 ? O PHE ZI 259 AR7 1 2 N VAL S 186 ? N VAL ZI 186 O HIS S 194 ? O HIS ZI 194 AR7 2 3 N TYR S 199 ? N TYR ZI 199 O TYR S 211 ? O TYR ZI 211 AR7 3 4 N TRP S 208 ? N TRP ZI 208 O LEU S 230 ? O LEU ZI 230 AR7 4 5 N LYS S 231 ? N LYS ZI 231 O GLU S 239 ? 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