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H ARG 837 CG 132 1 Y 1 F ARG 837 ? CD ? H ARG 837 CD 133 1 Y 1 F ARG 837 ? NE ? H ARG 837 NE 134 1 Y 1 F ARG 837 ? CZ ? H ARG 837 CZ 135 1 Y 1 F ARG 837 ? NH1 ? H ARG 837 NH1 136 1 Y 1 F ARG 837 ? NH2 ? H ARG 837 NH2 137 1 Y 1 F VAL 858 ? CG1 ? H VAL 858 CG1 138 1 Y 1 F VAL 858 ? CG2 ? H VAL 858 CG2 139 1 Y 1 F LEU 884 ? CG ? H LEU 884 CG 140 1 Y 1 F LEU 884 ? CD1 ? H LEU 884 CD1 141 1 Y 1 F LEU 884 ? CD2 ? H LEU 884 CD2 142 1 Y 1 F LEU 889 ? CG ? H LEU 889 CG 143 1 Y 1 F LEU 889 ? CD1 ? H LEU 889 CD1 144 1 Y 1 F LEU 889 ? CD2 ? H LEU 889 CD2 145 1 Y 1 F LEU 893 ? CG ? H LEU 893 CG 146 1 Y 1 F LEU 893 ? CD1 ? H LEU 893 CD1 147 1 Y 1 F LEU 893 ? CD2 ? H LEU 893 CD2 148 1 Y 1 F ARG 901 ? CG ? H ARG 901 CG 149 1 Y 1 F ARG 901 ? CD ? H ARG 901 CD 150 1 Y 1 F ARG 901 ? NE ? H ARG 901 NE 151 1 Y 1 F ARG 901 ? CZ ? H ARG 901 CZ 152 1 Y 1 F ARG 901 ? NH1 ? H ARG 901 NH1 153 1 Y 1 F ARG 901 ? NH2 ? H ARG 901 NH2 154 1 Y 1 F LEU 915 ? CG ? H LEU 915 CG 155 1 Y 1 F LEU 915 ? CD1 ? H LEU 915 CD1 156 1 Y 1 F LEU 915 ? CD2 ? H LEU 915 CD2 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8WW6 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8WW6 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 34364 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.596 ? 46718 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.451 ? 4640 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 4914 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5800 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8WW6 _struct.title 'Structure of ATP-rs-Form AsfvPrimPol Hexamer' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8WW6 _struct_keywords.text 'VIRAL PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA COMPLEX' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 4 ? L N N 5 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 4 ? P N N 5 ? Q N N 4 ? R N N 5 ? S N N 4 ? T N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 8WW6 8WW6 ? 1 ? 1 2 PDB 8WW6 8WW6 ? 2 ? 1 3 UNP A0A2X0TKI6_ASF A0A2X0TKI6 ? 3 ;MREESWEDHDTIQLTAQRKYLAEVQALETLLTRELSVFLTEPGSKKTNIINRITGKTYALPSTELLRLYEHLEQCRKQGA LMYFLERQGTYSGLMLDYDLKLNTNAVPPLEPPALSRLCHRIFVHIKNSSVLPEGSHKIHFFFTLKPEVVQGKYGFHVLI PGLKLAASTKKSIIGSLQHDATVQKILHEQGVTNPESCLDPHSASVPSLLYGSSKLNHKPYQLKTGFELVFDSSDPDYIP IHQIKNLESYNLVSELSLTNEQGSLVRPVYCAADIAAEKEEEIPTEDHSLSILMLHDPEARYLHKILNLLPPEYYVEYPL WSNVVFALANTSANYRPLAEWFSQKCPEKWNTGGKEKLEKLWNDASHHTEKKITKRSIMYWAHKHAPQQYKEIVEQGYFS ILAEYVYSYNGMLEHYMIAKVIYAMMGNKFVVDVDSNGKYVWFEFVLPGQPMNQGEIWKWRKEVNPDELHIYISENFSRV MDRITEHIKYHLSQPHESNILNYYKKLLKAFERSKSKIFNDSFKKGVIRQAEFLFRQRSFIQTLDTNPHLLGVGNGVLSI ETIPAKLINHFHEHPIHQYTHICYVPFNPENPWTKLLLNALQDIIPELDARLWIMFYLSTAIFRGLKEALMLLWLGGGCN GKTFLMRLVAMVLGDHYASKLNISLLTSCRETAEKPNSAFMRLKGRGYGYFEETNKSEVLNTSRLKEMVNPGDVTARELN QKQESFQMTATMVAASNYNFIIDTTDHGTWRRLRHYRSKVKFCHNPDPSNPYEKKEDPRFIHEYIMDPDCQNAFFSILVY FWEKLQKEYNGQIKKVFCPTIESETEAYRKSQDTLHRFITERVVESPSAETVYNLSEVVTAYAEWYNTNINVKRHIALEL SQELENSVLEKYLQWSPNKTRILKGCRILHKFETLQPGESYIGVSTAGTLLNTPICEPKNKWWEWSPNPSAPPEKEASAP TP ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8WW6 H 1 ? 25 ? 8WW6 1 ? 25 ? 1 25 2 2 8WW6 I 1 ? 4 ? 8WW6 1 ? 4 ? 1 4 3 3 8WW6 B 1 ? 962 ? 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_chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal AGS PG S1G doub N N 1 AGS PG O2G sing N N 2 AGS PG O3G sing N N 3 AGS PG O3B sing N N 4 AGS PB O1B doub N N 5 AGS PB O2B sing N N 6 AGS PB O3B sing N N 7 AGS PB O3A sing N N 8 AGS PA O1A doub N N 9 AGS PA O2A sing N N 10 AGS PA O3A sing N N 11 AGS PA "O5'" sing N N 12 AGS "O5'" "C5'" sing N N 13 AGS "C5'" "C4'" sing N N 14 AGS "C4'" "O4'" sing N N 15 AGS "C4'" "C3'" sing N N 16 AGS "O4'" "C1'" sing N N 17 AGS "C3'" "O3'" sing N N 18 AGS "C3'" "C2'" sing N N 19 AGS "C2'" "O2'" sing N N 20 AGS "C2'" "C1'" sing N N 21 AGS "C1'" N9 sing N N 22 AGS N9 C8 sing Y N 23 AGS N9 C4 sing Y N 24 AGS C8 N7 doub Y N 25 AGS N7 C5 sing Y N 26 AGS C5 C6 sing Y N 27 AGS C5 C4 doub Y N 28 AGS C6 N6 sing N N 29 AGS C6 N1 doub Y N 30 AGS N1 C2 sing Y N 31 AGS C2 N3 doub Y N 32 AGS N3 C4 sing Y N 33 AGS O2G 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sing N N 120 CYS N H2 sing N N 121 CYS CA C sing N N 122 CYS CA CB sing N N 123 CYS CA HA sing N N 124 CYS C O doub N N 125 CYS C OXT sing N N 126 CYS CB SG sing N N 127 CYS CB HB2 sing N N 128 CYS CB HB3 sing N N 129 CYS SG HG sing N N 130 CYS OXT HXT sing N N 131 DA OP3 P sing N N 132 DA OP3 HOP3 sing N N 133 DA P OP1 doub N N 134 DA P OP2 sing N N 135 DA P "O5'" sing N N 136 DA OP2 HOP2 sing N N 137 DA "O5'" "C5'" sing N N 138 DA "C5'" "C4'" sing N N 139 DA "C5'" "H5'" sing N N 140 DA "C5'" "H5''" sing N N 141 DA "C4'" "O4'" sing N N 142 DA "C4'" "C3'" sing N N 143 DA "C4'" "H4'" sing N N 144 DA "O4'" "C1'" sing N N 145 DA "C3'" "O3'" sing N N 146 DA "C3'" "C2'" sing N N 147 DA "C3'" "H3'" sing N N 148 DA "O3'" "HO3'" sing N N 149 DA "C2'" "C1'" sing N N 150 DA "C2'" "H2'" sing N N 151 DA "C2'" "H2''" sing N N 152 DA "C1'" N9 sing N N 153 DA "C1'" "H1'" sing N N 154 DA N9 C8 sing Y N 155 DA N9 C4 sing Y N 156 DA C8 N7 doub Y N 157 DA C8 H8 sing N N 158 DA N7 C5 sing Y N 159 DA C5 C6 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