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P 4 MG 1 602 804 MG MG D . # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8X5N _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8X5N _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8X5N _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 8X5N _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.028 ? 23998 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.124 ? 32267 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.334 ? 3118 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.063 ? 3511 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 4080 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8X5N _struct.title 'Tetramer Gabija with ATP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8X5N _struct_keywords.text 'Anti-Phage System, IMMUNE SYSTEM, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 3 ? 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'expression tag' 5 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS A 35 ? 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ILE G 86 PHE G 95 1 ? 10 HELX_P HELX_P44 AE8 SER D 114 ? TYR D 124 ? SER G 114 TYR G 124 1 ? 11 HELX_P HELX_P45 AE9 ASN D 137 ? SER D 150 ? ASN G 137 SER G 150 1 ? 14 HELX_P HELX_P46 AF1 SER D 150 ? LYS D 160 ? SER G 150 LYS G 160 1 ? 11 HELX_P HELX_P47 AF2 GLU D 168 ? SER D 172 ? GLU G 168 SER G 172 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 ASP D 173 ? GLN D 186 ? ASP G 173 GLN G 186 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 AF4 ILE E 2 ? LYS E 13 ? ILE H 2 LYS H 13 1 ? 12 HELX_P HELX_P50 AF5 GLY E 27 ? ASN E 43 ? GLY H 27 ASN H 43 1 ? 17 HELX_P HELX_P51 AF6 THR E 55 ? GLY E 67 ? THR H 55 GLY H 67 1 ? 13 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN E 78 ? ILE E 86 ? ASN H 78 ILE H 86 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 AF8 ILE E 86 ? PHE E 95 ? ILE H 86 PHE H 95 1 ? 10 HELX_P HELX_P54 AF9 SER E 114 ? GLN E 125 ? SER H 114 GLN H 125 1 ? 12 HELX_P HELX_P55 AG1 ASN E 137 ? SER E 150 ? ASN H 137 SER H 150 1 ? 14 HELX_P HELX_P56 AG2 LEU E 151 ? LYS E 160 ? LEU H 151 LYS H 160 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP E 173 ? GLN E 186 ? 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I ATP . ? A ATP 601 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2B ? I ATP . ? A ATP 601 ? 1_555 87.1 ? 2 O1G ? M ATP . ? C ATP 601 ? 1_555 MG ? N MG . ? C MG 602 ? 1_555 O2B ? M ATP . ? C ATP 601 ? 1_555 95.9 ? 3 O1G ? O ATP . ? D ATP 601 ? 1_555 MG ? P MG . ? D MG 602 ? 1_555 O2B ? O ATP . ? D ATP 601 ? 1_555 91.5 ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 4 ? 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