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DA 6 MG 1 602 701 MG MG E . EA 5 ADP 1 601 601 ADP ADP F . FA 6 MG 1 602 701 MG MG F . # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 Q ARG 225 ? CG ? Q ARG 225 CG 2 1 Y 1 Q ARG 225 ? CD ? Q ARG 225 CD 3 1 Y 1 Q ARG 225 ? NE ? Q ARG 225 NE 4 1 Y 1 Q ARG 225 ? CZ ? Q ARG 225 CZ 5 1 Y 1 Q ARG 225 ? NH1 ? Q ARG 225 NH1 6 1 Y 1 Q ARG 225 ? NH2 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.804 ? 67696 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.080 ? 6645 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.050 ? 7385 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 8639 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8XAW _struct.title 'Cryo-EM structure of an anti-phage defense complex bound to AMPPNP and DNA at state 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8XAW _struct_keywords.text 'HerA, Helicase DUF4297, Endonuclease, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 4 ? U N N 5 ? V N N 6 ? W N N 7 ? X N N 6 ? Y N N 7 ? Z N N 6 ? AA N N 7 ? BA N N 6 ? CA N N 5 ? DA N N 6 ? EA N N 5 ? 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S DC 4 T DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? S DC 4 O2 ? ? ? 1_555 T DG 56 N2 ? ? S DC 4 T DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? S DC 5 N3 ? ? ? 1_555 T DG 55 N2 ? ? S DC 5 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? S DC 5 O2 ? ? ? 1_555 T DG 55 N1 ? ? S DC 5 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? S DA 6 N1 ? ? ? 1_555 T DT 54 N3 ? ? S DA 6 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? S DA 6 N6 ? ? ? 1_555 T DT 54 O4 ? ? S DA 6 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? S DT 7 N3 ? ? ? 1_555 T DA 53 N1 ? ? S DT 7 T DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? S DG 8 N1 ? ? ? 1_555 T DC 52 N3 ? ? S DG 8 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? S DG 8 N2 ? ? ? 1_555 T DC 52 O2 ? ? S DG 8 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? S DG 8 O6 ? ? ? 1_555 T DC 52 N4 ? ? S DG 8 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? S DC 9 N3 ? ? ? 1_555 T DG 51 N2 ? ? S DC 9 T DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? S DG 10 N1 ? ? ? 1_555 T DC 50 N3 ? ? S DG 10 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? S DG 10 N2 ? ? ? 1_555 T DC 50 O2 ? ? S DG 10 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? S DG 10 O6 ? ? ? 1_555 T DC 50 N4 ? ? S DG 10 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? S DC 11 N3 ? ? ? 1_555 T DG 49 N1 ? ? S DC 11 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? S DC 11 N4 ? ? ? 1_555 T DG 49 O6 ? ? S DC 11 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? S DC 11 O2 ? ? ? 1_555 T DG 49 N2 ? ? S DC 11 T DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? S DG 12 N1 ? ? ? 1_555 T DA 47 N1 ? ? S DG 12 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? S DG 12 O6 ? ? ? 1_555 T DA 47 N6 ? ? S DG 12 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? S DT 13 N3 ? ? ? 1_555 T DA 47 N1 ? ? S DT 13 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? S DT 13 O4 ? ? ? 1_555 T DA 47 N6 ? ? S DT 13 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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F ADP 601 ? 1_555 75.8 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 96 A . ? PRO 96 A PRO 97 A ? PRO 97 A 1 -0.66 2 PRO 96 B . ? PRO 96 B PRO 97 B ? PRO 97 B 1 -4.96 3 PRO 96 C . ? PRO 96 C PRO 97 C ? PRO 97 C 1 0.06 4 PRO 96 D . ? PRO 96 D PRO 97 D ? PRO 97 D 1 -1.50 5 PRO 96 E . ? PRO 96 E PRO 97 E ? PRO 97 E 1 -2.86 6 PRO 96 F . ? PRO 96 F PRO 97 F ? 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