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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.860 ? 67728 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.889 ? 6649 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.053 ? 7389 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 8640 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 8XAY _struct.title 'Cryo-EM structure of an anti-phage defense complex bound to ATPrS and DNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8XAY _struct_keywords.text 'HerA, Helicase DUF4297, Endonuclease, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 3 ? 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MG ? ? E ADP 601 E MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? ? metalc17 metalc ? ? F SER 158 OG ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? F SER 158 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? ? metalc18 metalc ? ? EA ADP . O2B ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? F ADP 601 F MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? hydrog1 hydrog ? ? S DG 1 N2 ? ? ? 1_555 T DC 59 O2 ? ? S DG 1 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? S DC 2 N3 ? ? ? 1_555 T DG 58 N1 ? ? S DC 2 T DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? S DC 2 N4 ? ? ? 1_555 T DG 58 O6 ? ? S DC 2 T DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? S DC 2 O2 ? ? ? 1_555 T DG 58 N2 ? ? S DC 2 T DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? S DT 3 N3 ? ? ? 1_555 T DA 57 N1 ? ? S DT 3 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? S DT 3 O4 ? ? ? 1_555 T DA 57 N6 ? ? S DT 3 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? S DT 4 N3 ? ? ? 1_555 T DA 56 N1 ? ? S DT 4 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? S DT 4 O4 ? ? ? 1_555 T DA 56 N6 ? ? S DT 4 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? S DT 5 N3 ? ? ? 1_555 T DA 55 N1 ? ? S DT 5 T DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? S DT 5 O4 ? ? ? 1_555 T DA 55 N6 ? ? S DT 5 T DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? S DA 6 N1 ? ? ? 1_555 T DT 54 N3 ? ? S DA 6 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? S DA 6 N6 ? ? ? 1_555 T DT 54 O4 ? ? S DA 6 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? S DT 7 N3 ? ? ? 1_555 T DA 53 N1 ? ? S DT 7 T DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? S DT 7 O4 ? ? ? 1_555 T DA 53 N6 ? ? S DT 7 T DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? S DC 8 N3 ? ? ? 1_555 T DG 52 N2 ? ? S DC 8 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? S DC 8 O2 ? ? ? 1_555 T DG 52 N1 ? ? S DC 8 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? S DA 9 N1 ? ? ? 1_555 T DC 50 N4 ? ? S DA 9 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? S DG 10 N1 ? ? ? 1_555 T DC 50 O2 ? ? S DG 10 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? S DG 10 N2 ? ? ? 1_555 T DC 50 N3 ? ? S DG 10 T DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? S DA 11 N1 ? ? ? 1_555 T DT 49 N3 ? ? S DA 11 T DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? S DA 11 N6 ? ? ? 1_555 T DT 49 O4 ? ? S DA 11 T DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? S DA 12 N1 ? ? ? 1_555 T DT 48 N3 ? ? S DA 12 T DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? S DA 12 N6 ? ? ? 1_555 T DT 48 O4 ? ? S DA 12 T DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? S DG 13 N1 ? ? ? 1_555 T DC 47 O2 ? ? S DG 13 T DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? S DG 13 N2 ? ? ? 1_555 T DC 47 N3 ? ? S DG 13 T DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? A SER 158 ? A SER 158 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 OE2 ? A GLU 192 ? A GLU 192 ? 1_555 77.2 ? 2 OG ? A SER 158 ? A SER 158 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2G ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 121.1 ? 3 OE2 ? A GLU 192 ? A GLU 192 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2G ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 156.9 ? 4 OG ? A SER 158 ? A SER 158 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2B ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 70.5 ? 5 OE2 ? A GLU 192 ? A GLU 192 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2B ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 143.9 ? 6 O2G ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 MG ? V MG . ? A MG 602 ? 1_555 O2B ? U AGS . ? A AGS 601 ? 1_555 59.1 ? 7 OG ? B SER 158 ? B SER 158 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 602 ? 1_555 O2G ? W AGS . ? B AGS 601 ? 1_555 150.0 ? 8 OG ? B SER 158 ? B SER 158 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 602 ? 1_555 O2B ? W AGS . ? B AGS 601 ? 1_555 86.5 ? 9 O2G ? W AGS . ? B AGS 601 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 602 ? 1_555 O2B ? W AGS . ? B AGS 601 ? 1_555 63.6 ? 10 OG ? C SER 158 ? C SER 158 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 602 ? 1_555 O2G ? Y AGS . ? C AGS 601 ? 1_555 125.1 ? 11 OG ? C SER 158 ? C SER 158 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 602 ? 1_555 O2B ? Y AGS . ? C AGS 601 ? 1_555 92.7 ? 12 O2G ? Y AGS . ? C AGS 601 ? 1_555 MG ? Z MG . ? C MG 602 ? 1_555 O2B ? Y AGS . ? C AGS 601 ? 1_555 62.9 ? 13 OG ? D SER 158 ? D SER 158 ? 1_555 MG ? BA MG . ? D MG 602 ? 1_555 O2G ? AA AGS . ? D AGS 601 ? 1_555 138.2 ? 14 OG ? D SER 158 ? D SER 158 ? 1_555 MG ? BA MG . ? D MG 602 ? 1_555 O2B ? AA AGS . ? D AGS 601 ? 1_555 91.1 ? 15 O2G ? AA AGS . ? D AGS 601 ? 1_555 MG ? BA MG . ? D MG 602 ? 1_555 O2B ? AA AGS . ? D AGS 601 ? 1_555 59.3 ? 16 OG ? E SER 158 ? E SER 158 ? 1_555 MG ? DA MG . ? E MG 602 ? 1_555 OE2 ? E GLU 192 ? E GLU 192 ? 1_555 100.1 ? 17 OG ? E SER 158 ? E SER 158 ? 1_555 MG ? DA MG . ? E MG 602 ? 1_555 O2B ? CA ADP . ? E ADP 601 ? 1_555 64.9 ? 18 OE2 ? E GLU 192 ? E GLU 192 ? 1_555 MG ? DA MG . ? E MG 602 ? 1_555 O2B ? CA ADP . ? E ADP 601 ? 1_555 156.8 ? 19 OG ? F SER 158 ? F SER 158 ? 1_555 MG ? FA MG . ? F MG 602 ? 1_555 O2B ? EA ADP . ? F ADP 601 ? 1_555 96.2 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 96 A . ? PRO 96 A PRO 97 A ? PRO 97 A 1 1.14 2 PRO 96 B . ? PRO 96 B PRO 97 B ? PRO 97 B 1 -3.65 3 PRO 96 C . ? PRO 96 C PRO 97 C ? PRO 97 C 1 0.43 4 PRO 96 D . ? PRO 96 D PRO 97 D ? PRO 97 D 1 -2.56 5 PRO 96 E . ? PRO 96 E PRO 97 E ? PRO 97 E 1 -4.34 6 PRO 96 F . ? PRO 96 F PRO 97 F ? PRO 97 F 1 -1.74 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 42 ? AA2 ? 11 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 11 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 11 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 11 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 11 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 11 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 7 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 6 ? AC9 ? 6 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 6 ? AD3 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 1 7 ? anti-parallel AA1 1 39 ? anti-parallel AA1 2 5 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 3 7 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 4 8 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 8 14 ? anti-parallel AA1 9 12 ? anti-parallel AA1 10 11 ? anti-parallel AA1 10 14 ? anti-parallel AA1 11 12 ? anti-parallel AA1 11 15 ? anti-parallel AA1 12 13 ? anti-parallel AA1 15 16 ? anti-parallel AA1 15 21 ? anti-parallel AA1 16 19 ? anti-parallel AA1 17 18 ? anti-parallel AA1 17 21 ? anti-parallel AA1 18 19 ? anti-parallel AA1 18 22 ? anti-parallel AA1 19 20 ? anti-parallel AA1 22 23 ? anti-parallel AA1 22 28 ? anti-parallel AA1 23 26 ? anti-parallel AA1 24 25 ? anti-parallel AA1 24 28 ? anti-parallel AA1 25 26 ? anti-parallel AA1 25 29 ? anti-parallel AA1 26 27 ? anti-parallel AA1 29 30 ? anti-parallel AA1 29 35 ? anti-parallel AA1 30 33 ? anti-parallel AA1 31 32 ? anti-parallel AA1 31 35 ? anti-parallel AA1 32 33 ? anti-parallel AA1 32 36 ? anti-parallel AA1 33 34 ? anti-parallel AA1 36 37 ? anti-parallel AA1 36 42 ? anti-parallel AA1 37 40 ? anti-parallel AA1 38 39 ? anti-parallel AA1 38 42 ? anti-parallel AA1 39 40 ? anti-parallel AA1 40 41 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? parallel AA2 8 9 ? parallel AA2 9 10 ? parallel AA2 10 11 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? parallel AA5 6 7 ? parallel AA5 7 8 ? parallel AA5 8 9 ? parallel AA5 9 10 ? parallel AA5 10 11 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? parallel AA7 7 8 ? parallel AA7 8 9 ? parallel AA7 9 10 ? parallel AA7 10 11 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? parallel AB1 6 7 ? parallel AB1 7 8 ? parallel AB1 8 9 ? parallel AB1 9 10 ? parallel AB1 10 11 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? parallel AB4 6 7 ? parallel AB4 7 8 ? parallel AB4 8 9 ? parallel AB4 9 10 ? parallel AB4 10 11 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? parallel AB7 7 8 ? parallel AB7 8 9 ? parallel AB7 9 10 ? parallel AB7 10 11 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? parallel AC2 6 7 ? parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC8 3 4 ? parallel AC8 4 5 ? parallel AC8 5 6 ? parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AC9 4 5 ? parallel AC9 5 6 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD1 5 6 ? parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD2 5 6 ? parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 7 ? 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