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_citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2025.01.004 _citation.pdbx_database_id_PubMed 39855198 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhang, M.' 1 ? primary 'Feng, J.' 2 ? primary 'Xie, C.' 3 ? primary 'Song, N.' 4 ? primary 'Jin, C.' 5 ? primary 'Wang, J.' 6 ? primary 'Zhao, Q.' 7 ? primary 'Zhang, L.' 8 ? primary 'Wang, B.' 9 ? primary 'Sun, Y.' 10 ? primary 'Guo, F.' 11 ? primary 'Li, Y.' 12 ? primary 'Zhu, S.' 13 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1' 105645.875 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A' 165666.953 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B' 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;MGRLGYWTLLVLPALLVWRDPAQNAAAEKGPPALNIAVLLGHSHDVTERELRNLWGPEQATGLPLDVNVVALLMNRTDPK SLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSQTFIPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLK IMQDYDWHVFSLVTTIFPGYRDFISFIKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGLGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASC YGQAEKPETPLHTLHQFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENQTLSLRHAVWPRYKSFSDCE PDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVM MFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVI FLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSL KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFASTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC HNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKK KSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISNMSNMNSSRMDSPKRATDFIQRGSLIVDMVSDKGNLIYSDNRSFQGKDSIFGDNM 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CHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMGVCSGKPGMVFSISRGIYSCIHGVAIEER QSVMNSPTATMNNTHSNILRLLRTAKNMANLSGVNGSPQSALDFIRRESSVYDISEHRRSFTHSDCKSYNNPPCEENLFS DYISEVERTFGNLQLKDSNVYQDHYHHHHRPHSIGSTSSIDGLYDCDNPPFTTQPRSISKKPLDIGLPSSKHSQLSDLYG KFSFKSDRYSGHDDLIRSDVSDISTHTVTYGNIEGNAAKRRKQQYKDSLKKRPASAKSRREFDEIELAYRRRPPRSPDHK RYFRDKEGLRDFYLDQFRTKENSPHWEHVDLTDIYKERSDDFKRDSVSGGGPCTNRSHLKHGTGEKHGVVGGVPAPWEKN LTNVDWEDRSGGNFCRSCPSKLHNYSSTVAGQNSGRQACIRCEACKKAGNLYDISEDNSLQELDQPAAPVAVTSNASSTK YPQSPTNSKAQKKNRNKLRRQHSYDTFVDLQKEEAALAPRSVSLKDKGRFMDGSPYAHMFEMPAGESSFANKSSVPTAGH HHNNPGSGYMLSKSLYPDRVTQNPFIPTFGDDQCLLHGSKSYFFRQPTVAGASKTRPDFRALVTNKPVVVTLHGAVPGRF QKDICIGNQSNPCVPNNKNPRAFNGSSNGHVYEKLSSIESDV ; D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;PMVSAIVLYVLLAAAAHSAFAMDVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSDYAWNWIRQFPGNKLEWMGYISYSGST GYNPSLKSRISITRDTSKNQFFLQLNSVTTEDTATYYCARLYYGFYGMDYWGQGTSVTVS ; ;PMVSAIVLYVLLAAAAHSAFAMDVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSDYAWNWIRQFPGNKLEWMGYISYSGST GYNPSLKSRISITRDTSKNQFFLQLNSVTTEDTATYYCARLYYGFYGMDYWGQGTSVTVS ; E,I ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFAMIVLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGNSYMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNLES GIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQQGNEDPPTFGGGTKLEIK ; ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFAMIVLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGNSYMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNLES GIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQQGNEDPPTFGGGTKLEIK ; F,J ? 6 'polypeptide(L)' no no ;QVTLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGAAAAAAGVGVGWIRQPSGKGLEWLAHIAAAAAKRYNPALKSRLTISKDTSSSQV FLKIASVATADTATYYCTRAAAAAAPYWGQGTLVTVSAKRADARTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREA KVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNR ; ;QVTLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGAAAAAAGVGVGWIRQPSGKGLEWLAHIAAAAAKRYNPALKSRLTISKDTSSSQV FLKIASVATADTATYYCTRAAAAAAPYWGQGTLVTVSAKRADARTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREA KVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNR ; G ? 7 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPASLSVSVGETVTITCRAAAAAAAALAWYQQKQGKSPQLLVAAAAAAADGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQS EDFGSYYCQAAAAAPWTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG ; ;DIQMTQSPASLSVSVGETVTITCRAAAAAAAALAWYQQKQGKSPQLLVAAAAAAADGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQS EDFGSYYCQAAAAAPWTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG ; H ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFADVKLQESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSSYTMSWVRQTPEKRLEWVAYISNGGGGTYY PDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKEDTAMYYCARPSRGGSSYWYFDVWGAGTTVTVSSAKTKGPSVFPLAPSSKSTS GGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRHH HHHHHHHH ; ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFADVKLQESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSSYTMSWVRQTPEKRLEWVAYISNGGGGTYY PDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKEDTAMYYCARPSRGGSSYWYFDVWGAGTTVTVSSAKTKGPSVFPLAPSSKSTS GGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRHH HHHHHHHH ; K ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFADIQMTQSPSSLSASLGGKVTITCKASQDINKYIAWYQHKPGKGPRLLIHYTSSLQPGIPS RFSGSGSGRDYSFSISNLEPEDIATYYCLQYDNLYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYP REAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECGSGSWSH PQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEK ; ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFADIQMTQSPSSLSASLGGKVTITCKASQDINKYIAWYQHKPGKGPRLLIHYTSSLQPGIPS RFSGSGSGRDYSFSISNLEPEDIATYYCLQYDNLYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYP REAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGECGSGSWSH PQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEK ; L ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 12 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 13 '(2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid' 7RC # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 THR n 1 4 MET n 1 5 HIS n 1 6 LEU n 1 7 LEU n 1 8 THR n 1 9 PHE n 1 10 ALA n 1 11 LEU n 1 12 LEU n 1 13 PHE n 1 14 SER 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GLU n 1 189 SER n 1 190 LYS n 1 191 ALA n 1 192 GLU n 1 193 LYS n 1 194 VAL n 1 195 LEU n 1 196 GLN n 1 197 PHE n 1 198 ASP n 1 199 PRO n 1 200 GLY n 1 201 THR n 1 202 LYS n 1 203 ASN n 1 204 VAL n 1 205 THR n 1 206 ALA n 1 207 LEU n 1 208 LEU n 1 209 MET n 1 210 GLU n 1 211 ALA n 1 212 ARG n 1 213 GLU n 1 214 LEU n 1 215 GLU n 1 216 ALA n 1 217 ARG n 1 218 VAL n 1 219 ILE n 1 220 ILE n 1 221 LEU n 1 222 SER n 1 223 ALA n 1 224 SER n 1 225 GLU n 1 226 ASP n 1 227 ASP n 1 228 ALA n 1 229 ALA n 1 230 THR n 1 231 VAL n 1 232 TYR n 1 233 ARG n 1 234 ALA n 1 235 ALA n 1 236 ALA n 1 237 MET n 1 238 LEU n 1 239 ASN n 1 240 MET n 1 241 THR n 1 242 GLY n 1 243 SER n 1 244 GLY n 1 245 TYR n 1 246 VAL n 1 247 TRP n 1 248 LEU n 1 249 VAL n 1 250 GLY n 1 251 GLU n 1 252 ARG n 1 253 GLU n 1 254 ILE n 1 255 SER n 1 256 GLY n 1 257 ASN n 1 258 ALA n 1 259 LEU n 1 260 ARG n 1 261 TYR n 1 262 ALA n 1 263 PRO n 1 264 ASP n 1 265 GLY n 1 266 ILE n 1 267 ILE n 1 268 GLY n 1 269 LEU n 1 270 GLN n 1 271 LEU 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KA N N 13 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NMDZ1_RAT P35439 ? 1 ;MSTMHLLTFALLFSCSFARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCE DLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNW NHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPL FKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKI VTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQS TLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFA MIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDS RSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQDRKSGRAEPDPKKKATF RAITSTLASSFKRRRSSKDTSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHRES ; 1 2 UNP NMDE1_RAT Q00959 ? 2 ;MGRLGYWTLLVLPALLVWRDPAQNAAAEKGPPALNIAVLLGHSHDVTERELRNLWGPEQATGLPLDVNVVALLMNRTDPK SLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSQTFIPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLK IMQDYDWHVFSLVTTIFPGYRDFISFIKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGLGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASC YGQAEKPETPLHTLHQFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENQTLSLRHAVWPRYKSFSDCE PDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVM MFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVI FLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSL KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFASTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC HNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKK KSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISNMSNMNSSRMDSPKRATDFIQRGSLIVDMVSDKGNLIYSDNRSFQGKDSIFGDNM NELQTFVANRHKDNLSNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKGNSRPRQLWKKSMESLRQDSLNQNPVSQRDEKTAE NRTHSLKSPRYLPEEVAHSDISETSSRATCHREPDNNKNHKTKDNFKRSMASKYPKDCSDVDRTYMKTKASSPRDKIYTI DGEKEPSFHLDPPQFVENITLPENVGFPDTYQDHNENFRKGDSTLPMNRNPLHNEDGLPNNDQYKLYAKHFTLKDKGSPH SEGSDRYRQNSTHCRSCLSNLPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNPATREEVYQQDWSQNNALQFQ KNKLRINRQHSYDNILDKPREIDLSRPSRSISLKDRERLLEGNLYGSLFSVPSSKLLGNKSSLFPQGLEDSKRSKSLLPD HASDNPFLHTYGDDQRLVIGRCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTASYCSRDSRGHSDVYISEHVMPYAANKNTMYS TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV ; 1 3 UNP NMDE2_RAT Q00960 ? 3 ;MKPSAECCSPKFWLVLAVLAVSGSKARSQKSPPSIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKS IITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQEAIAQILDFISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNI MEEYDWYIFSIVTTYFPGYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTKEEATYI FEVANSVGLTGYGYTWIVPSLVAGDTDTVPSEFPTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSS CYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEGRNLSFSEDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWKDKSLQMKYYVWPRMCPETEE QEDDHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLSGTCMRNTVPCQKRIISENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYL VTNGKHGKKINGTWNGMIGEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWV MMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAV IFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQRPNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLS LKTGKLDAFIYDAAVLNYMAGRDEGCKLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEMEELEALWLTGI CHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMGVCSGKPGMVFSISRGIYSCIHGVAIEER QSVMNSPTATMNNTHSNILRLLRTAKNMANLSGVNGSPQSALDFIRRESSVYDISEHRRSFTHSDCKSYNNPPCEENLFS DYISEVERTFGNLQLKDSNVYQDHYHHHHRPHSIGSTSSIDGLYDCDNPPFTTQPRSISKKPLDIGLPSSKHSQLSDLYG KFSFKSDRYSGHDDLIRSDVSDISTHTVTYGNIEGNAAKRRKQQYKDSLKKRPASAKSRREFDEIELAYRRRPPRSPDHK RYFRDKEGLRDFYLDQFRTKENSPHWEHVDLTDIYKERSDDFKRDSVSGGGPCTNRSHLKHGTGEKHGVVGGVPAPWEKN LTNVDWEDRSGGNFCRSCPSKLHNYSSTVAGQNSGRQACIRCEACKKAGNLYDISEDNSLQELDQPAAPVAVTSNASSTK YPQSPTNSKAQKKNRNKLRRQHSYDTFVDLQKEEAALAPRSVSLKDKGRFMDGSPYAHMFEMPAGESSFANKSSVPTAGH HHNNPGSGYMLSKSLYPDRVTQNPFIPTFGDDQCLLHGSKSYFFRQPTVAGASKTRPDFRALVTNKPVVVTLHGAVPGRF QKDICIGNQSNPCVPNNKNPRAFNGSSNGHVYEKLSSIESDV ; 1 4 PDB 8XLK 8XLK ? 4 ? 1 5 PDB 8XLK 8XLK ? 5 ? 1 6 PDB 8XLK 8XLK ? 6 ? 1 7 PDB 8XLK 8XLK ? 7 ? 1 8 PDB 8XLK 8XLK ? 8 ? 1 9 PDB 8XLK 8XLK ? 9 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8XLK A 1 ? 938 ? 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Q00960 1 ? 1482 ? 1 1482 5 4 8XLK E 1 ? 140 ? 8XLK -1 ? 138 ? -1 138 6 5 8XLK F 1 ? 131 ? 8XLK 0 ? 130 ? 0 130 7 6 8XLK G 1 ? 227 ? 8XLK 1 ? 227 ? 1 227 8 7 8XLK H 1 ? 212 ? 8XLK 1 ? 212 ? 1 212 9 4 8XLK I 1 ? 140 ? 8XLK -1 ? 138 ? -1 138 10 5 8XLK J 1 ? 131 ? 8XLK 0 ? 130 ? 0 130 11 8 8XLK K 1 ? 248 ? 8XLK 1 ? 249 ? 1 249 12 9 8XLK L 1 ? 265 ? 8XLK 1 ? 265 ? 1 265 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 35 ? 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MET B 817 PHE B 841 1 ? 25 HELX_P HELX_P58 AG4 THR C 35 ? GLY C 54 ? THR C 35 GLY C 54 1 ? 20 HELX_P HELX_P59 AG5 ALA C 71 ? ASP C 81 ? ALA C 71 ASP C 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 AG6 THR C 103 ? TYR C 114 ? THR C 103 TYR C 114 1 ? 12 HELX_P HELX_P61 AG7 MET C 125 ? SER C 129 ? MET C 125 SER C 129 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 SER C 145 ? ASN C 159 ? SER C 145 ASN C 159 1 ? 15 HELX_P HELX_P63 AG9 ASP C 170 ? GLU C 186 ? ASP C 170 GLU C 186 1 ? 17 HELX_P HELX_P64 AH1 VAL C 204 ? GLU C 213 ? VAL C 204 GLU C 213 1 ? 10 HELX_P HELX_P65 AH2 SER C 224 ? LEU C 238 ? SER C 224 LEU C 238 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 AH3 GLU C 251 ? SER C 255 ? GLU C 251 SER C 255 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 AH4 GLU C 277 ? GLU C 297 ? GLU C 277 GLU C 297 1 ? 21 HELX_P HELX_P68 AH5 THR C 317 ? SER C 328 ? THR C 317 SER C 328 1 ? 12 HELX_P HELX_P69 AH6 TRP C 381 ? GLU C 385 ? TRP C 381 GLU C 385 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 AH7 GLY C 457 ? MET C 470 ? GLY C 457 MET C 470 1 ? 14 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY C 500 ? SER C 507 ? 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GLU D 47 ASP D 52 1 ? 6 HELX_P HELX_P86 AJ5 ASP D 77 ? ARG D 92 ? ASP D 77 ARG D 92 1 ? 16 HELX_P HELX_P87 AJ6 GLU D 106 ? GLN D 118 ? GLU D 106 GLN D 118 1 ? 13 HELX_P HELX_P88 AJ7 SER D 149 ? TYR D 164 ? SER D 149 TYR D 164 1 ? 16 HELX_P HELX_P89 AJ8 TYR D 179 ? ASN D 192 ? TYR D 179 ASN D 192 1 ? 14 HELX_P HELX_P90 AJ9 ASP D 211 ? LYS D 221 ? ASP D 211 LYS D 221 1 ? 11 HELX_P HELX_P91 AK1 THR D 233 ? GLY D 248 ? THR D 233 GLY D 248 1 ? 16 HELX_P HELX_P92 AK2 PRO D 259 ? GLY D 264 ? PRO D 259 GLY D 264 1 ? 6 HELX_P HELX_P93 AK3 GLY D 288 ? HIS D 311 ? GLY D 288 HIS D 311 1 ? 24 HELX_P HELX_P94 AK4 ARG D 328 ? ASN D 341 ? ARG D 328 ASN D 341 1 ? 14 HELX_P HELX_P95 AK5 GLY D 459 ? LYS D 473 ? GLY D 459 LYS D 473 1 ? 15 HELX_P HELX_P96 AK6 ASN D 495 ? MET D 503 ? ASN D 495 MET D 503 1 ? 9 HELX_P HELX_P97 AK7 ASN D 516 ? GLU D 521 ? ASN D 516 GLU D 521 1 ? 6 HELX_P HELX_P98 AK8 SER D 555 ? GLU D 578 ? SER D 555 GLU D 578 1 ? 24 HELX_P HELX_P99 AK9 LYS D 604 ? ASN D 615 ? 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LYS H 183 HIS H 189 1 ? 7 HELX_P HELX_P114 AM6 ASN I 83 ? LYS I 87 ? ASN I 81 LYS I 85 5 ? 5 HELX_P HELX_P115 AM7 TYR I 122 ? TYR I 126 ? 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C CYS 420 SG ? ? ? 1_555 C CYS 454 SG ? ? C CYS 420 C CYS 454 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 436 SG ? ? ? 1_555 C CYS 455 SG ? ? C CYS 436 C CYS 455 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 744 SG ? ? ? 1_555 C CYS 798 SG ? ? C CYS 744 C CYS 798 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 86 SG ? ? ? 1_555 D CYS 321 SG ? ? D CYS 86 D CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 429 SG ? ? ? 1_555 D CYS 456 SG ? ? D CYS 429 D CYS 456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 436 SG ? ? ? 1_555 D CYS 457 SG ? ? D CYS 436 D CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 44 SG ? ? ? 1_555 E CYS 118 SG ? ? E CYS 42 E CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? F CYS 43 SG ? ? ? 1_555 F CYS 112 SG ? ? F CYS 42 F CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 97 SG ? ? G CYS 22 G CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf19 disulf ? ? G CYS 150 SG ? ? ? 1_555 G CYS 210 SG ? ? G CYS 150 G CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf20 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 88 SG ? ? H CYS 23 H CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf21 disulf ? ? H CYS 134 SG ? ? ? 1_555 H CYS 194 SG ? ? H CYS 134 H CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf22 disulf ? ? I CYS 44 SG ? ? ? 1_555 I CYS 118 SG ? ? I CYS 42 I CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf23 disulf ? ? J CYS 43 SG ? ? ? 1_555 J CYS 112 SG ? ? J CYS 42 J CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf24 disulf ? ? K CYS 42 SG ? ? ? 1_555 K CYS 115 SG ? ? K CYS 42 K CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf25 disulf ? ? L CYS 43 SG ? ? ? 1_555 L CYS 108 SG ? ? L CYS 43 L CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 203 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 203 A NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.569 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 239 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 239 A NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 276 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 276 A NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 300 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 300 A NAG 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 350 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 350 A NAG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 471 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 471 A NAG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.557 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 771 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 771 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 340 B NAG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 380 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 380 B NAG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 541 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 541 B NAG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 687 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 687 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 61 C NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 203 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 203 C NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 239 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 239 C NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 276 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 276 C NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? C ASN 300 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 300 C NAG 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 350 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 350 C NAG 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? C ASN 471 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 471 C NAG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 771 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? C ASN 771 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? D ASN 341 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? D ASN 341 D NAG 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? D ASN 542 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? D ASN 542 D NAG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? D ASN 688 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? D ASN 688 D NAG 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? N-Glycosylation covale24 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale25 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M NAG 2 M MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale26 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale27 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale28 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O NAG 2 O MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG AA . ? 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None 'Disulfide bridge' 29 CYS B 429 ? CYS B 455 ? CYS B 429 ? 1_555 CYS B 455 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 30 CYS B 436 ? CYS B 456 ? CYS B 436 ? 1_555 CYS B 456 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 31 CYS B 745 ? CYS B 800 ? CYS B 745 ? 1_555 CYS B 800 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 32 CYS C 79 ? CYS C 308 ? CYS C 79 ? 1_555 CYS C 308 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 33 CYS C 420 ? CYS C 454 ? CYS C 420 ? 1_555 CYS C 454 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 34 CYS C 436 ? CYS C 455 ? CYS C 436 ? 1_555 CYS C 455 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 35 CYS C 744 ? CYS C 798 ? CYS C 744 ? 1_555 CYS C 798 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 36 CYS D 86 ? CYS D 321 ? CYS D 86 ? 1_555 CYS D 321 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 37 CYS D 429 ? CYS D 456 ? CYS D 429 ? 1_555 CYS D 456 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 38 CYS D 436 ? CYS D 457 ? CYS D 436 ? 1_555 CYS D 457 ? 1_555 SG SG . . . 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