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O . n O 3 421 PRO 421 440 440 PRO PRO O . n O 3 422 LEU 422 441 441 LEU LEU O . n O 3 423 LYS 423 442 442 LYS LYS O . n O 3 424 LYS 424 443 443 LYS LYS O . n O 3 425 TYR 425 444 444 TYR TYR O . n O 3 426 THR 426 445 445 THR THR O . n O 3 427 PHE 427 446 446 PHE PHE O . n O 3 428 TRP 428 447 447 TRP TRP O . n O 3 429 GLU 429 448 448 GLU GLU O . n O 3 430 VAL 430 449 449 VAL VAL O . n O 3 431 ASN 431 450 450 ASN ASN O . n O 3 432 LEU 432 451 451 LEU LEU O . n O 3 433 LYS 433 452 452 LYS LYS O . n O 3 434 GLU 434 453 453 GLU GLU O . n O 3 435 LYS 435 454 454 LYS LYS O . n O 3 436 PHE 436 455 455 PHE PHE O . n O 3 437 SER 437 456 456 SER SER O . n O 3 438 ALA 438 457 457 ALA ALA O . n O 3 439 ASP 439 458 458 ASP ASP O . n O 3 440 LEU 440 459 459 LEU LEU O . n O 3 441 ASP 441 460 460 ASP ASP O . n O 3 442 GLN 442 461 461 GLN GLN O . n O 3 443 PHE 443 462 462 PHE PHE O . n O 3 444 PRO 444 463 463 PRO PRO O . n O 3 445 LEU 445 464 464 LEU LEU O . n O 3 446 GLY 446 465 465 GLY GLY O . n O 3 447 ARG 447 466 466 ARG ARG O . n O 3 448 LYS 448 467 467 LYS LYS O . n O 3 449 PHE 449 468 468 PHE PHE O . n O 3 450 LEU 450 469 469 LEU LEU O . n O 3 451 LEU 451 470 470 LEU LEU O . n O 3 452 GLN 452 471 471 GLN GLN O . n O 3 453 ALA 453 472 472 ALA ALA O . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8YEH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8YEH _struct.title 'HPV16 L1 pentamer in complex with Fab F5-196' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8YEH _struct_keywords.text 'HPV16, L1, antibody, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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PHE O 462 ALA O 472 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? A CYS 22 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 88 SG ? ? B CYS 23 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf3 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? C CYS 22 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf4 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? H CYS 23 H CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf5 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 96 SG ? ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf6 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 88 SG ? ? I CYS 23 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf7 disulf ? ? J CYS 22 SG ? ? ? 1_555 J CYS 96 SG ? ? E CYS 22 E CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf8 disulf ? ? K CYS 23 SG ? ? ? 1_555 K CYS 88 SG ? ? J CYS 23 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf9 disulf ? ? M CYS 22 SG ? ? ? 1_555 M CYS 96 SG ? ? G CYS 22 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf10 disulf ? ? N CYS 23 SG ? ? ? 1_555 N CYS 88 SG ? ? K CYS 23 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 22 ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 B . ? SER 7 B PRO 8 B ? PRO 8 B 1 -7.61 2 SER 7 E . ? SER 7 H PRO 8 E ? PRO 8 H 1 -7.59 3 SER 7 H . ? SER 7 I PRO 8 H ? PRO 8 I 1 -7.62 4 SER 7 K . ? SER 7 J PRO 8 K ? PRO 8 J 1 -7.55 5 SER 7 N . ? SER 7 K PRO 8 N ? PRO 8 K 1 -7.58 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 7 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 7 ? AB7 ? 7 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 7 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 7 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 7 ? AC7 ? 7 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 7 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 7 ? AD7 ? 7 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 7 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 7 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 7 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 7 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 2 5 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 5 7 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 7 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 2 5 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 5 7 ? anti-parallel AA5 1 6 ? anti-parallel AA5 2 6 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 3 6 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 5 ? anti-parallel AA7 1 6 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 2 5 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 3 7 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? parallel AB1 1 7 ? parallel AB1 2 7 ? anti-parallel AB1 3 7 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 4 7 ? anti-parallel AB1 6 7 ? anti-parallel AB2 1 4 ? anti-parallel AB2 2 6 ? anti-parallel AB2 2 7 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 3 6 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 7 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 2 5 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 5 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 7 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 2 5 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB6 5 7 ? anti-parallel AB7 1 6 ? anti-parallel AB7 2 6 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 3 6 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB7 6 7 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? parallel AC2 1 4 ? anti-parallel AC2 2 6 ? anti-parallel AC2 2 7 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 3 6 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 7 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 2 5 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC4 5 7 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 7 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 2 5 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC6 5 7 ? anti-parallel AC7 1 6 ? anti-parallel AC7 2 6 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 3 6 ? anti-parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC7 6 7 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? parallel AD2 1 4 ? anti-parallel AD2 2 6 ? anti-parallel AD2 2 7 ? parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 3 6 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 7 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 2 5 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 5 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 7 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 2 5 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD6 5 7 ? anti-parallel AD7 1 6 ? anti-parallel AD7 2 6 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 3 6 ? anti-parallel AD7 5 6 ? anti-parallel AD7 6 7 ? parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? parallel AE2 1 4 ? anti-parallel AE2 2 6 ? anti-parallel AE2 2 7 ? parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 3 6 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 7 ? parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 2 5 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 5 6 ? anti-parallel AE4 5 7 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 7 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 2 5 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE6 5 6 ? anti-parallel AE6 5 7 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 4 ? 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