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O88602 1 ? 323 ? 1 323 2 1 9B63 F 1 ? 323 ? O88602 1 ? 323 ? 1 323 3 2 9B63 C 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 4 2 9B63 B 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 5 2 9B63 A 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 6 2 9B63 D 1 ? 889 ? P19491 1 ? 883 ? -20 868 7 1 9B63 E 1 ? 323 ? O88602 1 ? 323 ? 1 323 8 1 9B63 G 1 ? 323 ? O88602 1 ? 323 ? 1 323 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 9B63 ASP C 754 ? UNP P19491 GLY 754 conflict 733 1 3 9B63 ASP C 869 ? UNP P19491 ? ? insertion 848 2 3 9B63 LYS C 871 ? UNP P19491 ? ? insertion 850 3 3 9B63 ASP C 872 ? 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THR A 30 ? ASP H 5 THR H 30 1 ? 26 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 92 ? SER A 105 ? ASP H 92 SER H 105 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 105 ? ALA A 124 ? SER H 105 ALA H 124 1 ? 20 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 125 ? PHE A 127 ? SER H 125 PHE H 127 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 HIS A 132 ? GLY A 162 ? HIS H 132 GLY H 162 1 ? 31 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 177 ? ALA A 214 ? GLY H 177 ALA H 214 1 ? 38 HELX_P HELX_P7 AA7 ARG B 6 ? THR B 30 ? ARG F 6 THR F 30 1 ? 25 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 92 ? SER B 105 ? ASP F 92 SER F 105 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 AA9 SER B 105 ? GLU B 126 ? SER F 105 GLU F 126 1 ? 22 HELX_P HELX_P10 AB1 HIS B 132 ? GLY B 162 ? HIS F 132 GLY F 162 1 ? 31 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY B 177 ? ALA B 214 ? GLY F 177 ALA F 214 1 ? 38 HELX_P HELX_P12 AB3 PHE C 536 ? ASP C 540 ? PHE C 515 ASP C 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA C 543 ? PHE C 567 ? ALA C 522 PHE C 546 1 ? 25 HELX_P HELX_P14 AB5 SER C 568 ? TRP C 572 ? SER C 547 TRP C 551 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY C 593 ? MET C 606 ? GLY C 572 MET C 585 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 SER C 616 ? MET C 650 ? SER C 595 MET C 629 1 ? 35 HELX_P HELX_P17 AB8 SER C 809 ? ASN C 812 ? SER C 788 ASN C 791 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL C 813 ? MET C 846 ? VAL C 792 MET C 825 1 ? 34 HELX_P HELX_P19 AC1 PHE D 536 ? ASP D 540 ? PHE B 515 ASP B 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 ALA D 543 ? PHE D 567 ? ALA B 522 PHE B 546 1 ? 25 HELX_P HELX_P21 AC3 SER D 568 ? TRP D 572 ? SER B 547 TRP B 551 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY D 593 ? MET D 606 ? GLY B 572 MET B 585 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 SER D 616 ? VAL D 647 ? SER B 595 VAL B 626 1 ? 32 HELX_P HELX_P24 AC6 SER D 809 ? ASN D 812 ? SER B 788 ASN B 791 5 ? 4 HELX_P HELX_P25 AC7 VAL D 813 ? MET D 846 ? VAL B 792 MET B 825 1 ? 34 HELX_P HELX_P26 AC8 PHE E 536 ? ASP E 540 ? PHE A 515 ASP A 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA E 543 ? PHE E 567 ? ALA A 522 PHE A 546 1 ? 25 HELX_P HELX_P28 AD1 SER E 568 ? TRP E 572 ? SER A 547 TRP A 551 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY E 593 ? MET E 606 ? GLY A 572 MET A 585 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 AD3 SER E 616 ? MET E 650 ? SER A 595 MET A 629 1 ? 35 HELX_P HELX_P31 AD4 SER E 809 ? MET E 846 ? SER A 788 MET A 825 1 ? 38 HELX_P HELX_P32 AD5 PHE F 536 ? ASP F 540 ? PHE D 515 ASP D 519 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA F 543 ? PHE F 567 ? ALA D 522 PHE D 546 1 ? 25 HELX_P HELX_P34 AD7 SER F 568 ? TRP F 572 ? SER D 547 TRP D 551 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY F 593 ? MET F 606 ? GLY D 572 MET D 585 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 AD9 SER F 616 ? VAL F 647 ? SER D 595 VAL D 626 1 ? 32 HELX_P HELX_P37 AE1 SER F 809 ? MET F 846 ? SER D 788 MET D 825 1 ? 38 HELX_P HELX_P38 AE2 ARG G 6 ? THR G 30 ? ARG E 6 THR E 30 1 ? 25 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP G 92 ? SER G 105 ? ASP E 92 SER E 105 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 AE4 SER G 105 ? SER G 125 ? SER E 105 SER E 125 1 ? 21 HELX_P HELX_P41 AE5 HIS G 132 ? ALA G 161 ? HIS E 132 ALA E 161 1 ? 30 HELX_P HELX_P42 AE6 GLY G 177 ? ALA G 214 ? GLY E 177 ALA E 214 1 ? 38 HELX_P HELX_P43 AE7 ARG H 6 ? THR H 30 ? ARG G 6 THR G 30 1 ? 25 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP H 92 ? SER H 105 ? ASP G 92 SER G 105 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 AE9 SER H 105 ? SER H 125 ? SER G 105 SER G 125 1 ? 21 HELX_P HELX_P46 AF1 HIS H 132 ? ALA H 161 ? HIS G 132 ALA G 161 1 ? 30 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY H 177 ? ALA H 214 ? GLY G 177 ALA G 214 1 ? 38 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 40 SG ? ? ? 1_555 A CYS 68 SG ? ? H CYS 40 H CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 67 SG ? ? ? 1_555 A CYS 77 SG ? ? H CYS 67 H CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 40 SG ? ? ? 1_555 B CYS 68 SG ? ? F CYS 40 F CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 67 SG ? ? ? 1_555 B CYS 77 SG ? ? F CYS 67 F CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf5 disulf ? ? G CYS 40 SG ? ? ? 1_555 G CYS 68 SG ? ? E CYS 40 E CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf6 disulf ? ? G CYS 67 SG ? ? ? 1_555 G CYS 77 SG ? ? E CYS 67 E CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf7 disulf ? ? H CYS 40 SG ? ? ? 1_555 H CYS 68 SG ? ? G CYS 40 G CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf8 disulf ? ? H CYS 67 SG ? ? ? 1_555 H CYS 77 SG ? ? G CYS 67 G CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS A 40 ? CYS A 68 ? CYS H 40 ? 1_555 CYS H 68 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 2 CYS A 67 ? CYS A 77 ? CYS H 67 ? 1_555 CYS H 77 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 3 CYS B 40 ? CYS B 68 ? CYS F 40 ? 1_555 CYS F 68 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 4 CYS B 67 ? CYS B 77 ? CYS F 67 ? 1_555 CYS F 77 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 5 CYS G 40 ? CYS G 68 ? CYS E 40 ? 1_555 CYS E 68 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS G 67 ? CYS G 77 ? CYS E 67 ? 1_555 CYS E 77 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS H 40 ? CYS H 68 ? CYS G 40 ? 1_555 CYS G 68 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS H 67 ? CYS H 77 ? CYS G 67 ? 1_555 CYS G 77 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? 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O LYS H 78 N THR A 66 ? N THR H 66 AA1 2 3 O CYS A 67 ? O CYS H 67 N HIS A 60 ? N HIS H 60 AA1 3 4 O THR A 59 ? O THR H 59 N SER A 36 ? N SER H 36 AA1 4 5 N TYR A 35 ? N TYR H 35 O SER A 175 ? O SER H 175 AA2 1 2 O LYS B 78 ? O LYS F 78 N THR B 66 ? N THR F 66 AA2 2 3 O CYS B 67 ? O CYS F 67 N HIS B 60 ? N HIS F 60 AA2 3 4 O VAL B 57 ? O VAL F 57 N GLY B 38 ? N GLY F 38 AA2 4 5 N TYR B 35 ? N TYR F 35 O SER B 175 ? O SER F 175 AA3 1 2 O LYS G 78 ? O LYS E 78 N THR G 66 ? N THR E 66 AA3 2 3 O CYS G 67 ? O CYS E 67 N HIS G 60 ? N HIS E 60 AA3 3 4 O SER G 61 ? O SER E 61 N LEU G 34 ? N LEU E 34 AA3 4 5 N TYR G 35 ? N TYR E 35 O SER G 175 ? O SER E 175 AA4 1 2 O LYS H 78 ? O LYS G 78 N THR H 66 ? N THR G 66 AA4 2 3 O CYS H 67 ? O CYS G 67 N HIS H 60 ? N HIS G 60 AA4 3 4 O SER H 61 ? O SER G 61 N LEU H 34 ? N LEU G 34 AA4 4 5 N TYR H 35 ? N TYR G 35 O SER H 175 ? 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PDB 'experimental model' 8FQG 2 # _em_3d_reconstruction.entry_id 9B63 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 2.76 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 813615 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ;Tris adjusted to pH 8 using HCl. 4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid. ; _em_buffer.pH 8 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.name 'GluA2 (flip-Q isoform) in complex with TARPgamma2 at 4:4 stoichiometry' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2' # _em_imaging.entry_id 9B63 _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2400 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen NITROGEN # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.method ? _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'UltrAuFoil R1.2/1.3' _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 9B63 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9B63 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 9B63 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 H MET 1 ? 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