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A ARG 210 CZ 11 1 Y 1 A ARG 210 ? NH1 ? A ARG 210 NH1 12 1 Y 1 A ARG 210 ? NH2 ? A ARG 210 NH2 13 1 Y 1 A GLU 326 ? CG ? A GLU 326 CG 14 1 Y 1 A GLU 326 ? CD ? A GLU 326 CD 15 1 Y 1 A GLU 326 ? OE1 ? A GLU 326 OE1 16 1 Y 1 A GLU 326 ? OE2 ? A GLU 326 OE2 17 1 Y 1 D ARG 10 ? CG ? B ARG 10 CG 18 1 Y 1 D ARG 10 ? CD ? B ARG 10 CD 19 1 Y 1 D ARG 10 ? NE ? B ARG 10 NE 20 1 Y 1 D ARG 10 ? CZ ? B ARG 10 CZ 21 1 Y 1 D ARG 10 ? NH1 ? B ARG 10 NH1 22 1 Y 1 D ARG 10 ? NH2 ? B ARG 10 NH2 23 1 Y 1 D ASP 56 ? CG ? B ASP 56 CG 24 1 Y 1 D ASP 56 ? OD1 ? B ASP 56 OD1 25 1 Y 1 D ASP 56 ? OD2 ? B ASP 56 OD2 26 1 Y 1 D ARG 78 ? CG ? B ARG 78 CG 27 1 Y 1 D ARG 78 ? CD ? B ARG 78 CD 28 1 Y 1 D ARG 78 ? NE ? B ARG 78 NE 29 1 Y 1 D ARG 78 ? CZ ? B ARG 78 CZ 30 1 Y 1 D ARG 78 ? NH1 ? B ARG 78 NH1 31 1 Y 1 D ARG 78 ? NH2 ? B ARG 78 NH2 32 1 Y 1 D GLU 212 ? CG ? B GLU 212 CG 33 1 Y 1 D GLU 212 ? CD ? B GLU 212 CD 34 1 Y 1 D GLU 212 ? OE1 ? B GLU 212 OE1 35 1 Y 1 D GLU 212 ? OE2 ? B GLU 212 OE2 36 1 Y 1 D GLU 326 ? CG ? B GLU 326 CG 37 1 Y 1 D GLU 326 ? CD ? B GLU 326 CD 38 1 Y 1 D GLU 326 ? OE1 ? B GLU 326 OE1 39 1 Y 1 D GLU 326 ? OE2 ? B GLU 326 OE2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9B7Y _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9B7Y _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9B7Y _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9B7Y _struct.title 'Cryo-EM structure of TetR regulator Mce3R from Mycobacterium tuberculosis bound to a DNA oligonucleotide' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9B7Y _struct_keywords.text 'TetR-like repressor stress resistance, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP MCE3R_MYCTU P95251 ? 1 ;MASVAQPVRRRPKDRKKQILDQAVGLFIERGFHSVKLEDIAEAAGVTARALYRHYDNKQALLAEAIRTGQDQYQSARRLT EGETEPTPRPLNADLEDLIAAAVASRALTVLWQREARYLNEDDRTAVRRRINAIVAGMRDSVLLEVPDLSPQHSELRAWA VSSTLTSLGRHSLSLPGEELKKLLYQACMAAARTPPVCELPPLPAGDAARDEADVLFSRYETLLAAGARLFRAQGYPAVN TSEIGKGAGIAGPGLYRSFSSKQAILDALIRRLDEWRCLECIRALRANQQAAQRLRGLVQGHVRISLDAPDLVAVSVTEL SHASVEVRDGYLRNQGDREAVWIDLIGKLVPATSVAQGRLLVAAAISFIEDVARTWHLTRYAGVADEISGLALAILTSGA GNLLRA ; 1 2 GB AL123456.3 444893469 ? 2 ;GCCCCGCGCTATAGGATACTAGCAAGATACATCATAGCCAATATATGCCAGTTTGCATTGCTATTTACCGATCAGTTGTC CAAGCAATCGCGTATTGGCTATGGACATCAGCGGTTCTGCCGC ; 2207477 3 GB AL123456.3 444893469 ? 3 ;GCGGCAGAACCGCTGATGTCCATAGCCAATACGCGATTGCTTGGACAACTGATCGGTAAATAGCAATGCAAACTGGCATA TATTGGCTATGATGTATCTTGCTAGTATCCTATAGCGCGGGGC ; 2207599 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9B7Y A 1 ? 406 ? 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P95251 1 ? 406 ? 1 406 3 2 9B7Y E 1 ? 123 ? 444893469 2207477 ? 2207599 ? 1 123 4 3 9B7Y F 1 ? 123 ? 444893469 2207599 ? 2207477 ? 1 123 5 2 9B7Y B 1 ? 123 ? 444893469 2207477 ? 2207599 ? 1 123 6 3 9B7Y C 1 ? 123 ? 444893469 2207599 ? 2207477 ? 1 123 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 14 ? 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ASN A 240 GLY A 249 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 ALA A 251 ? PHE A 259 ? ALA A 251 PHE A 259 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 SER A 261 ? ASN A 288 ? SER A 261 ASN A 288 1 ? 28 HELX_P HELX_P18 AB9 GLN A 290 ? ALA A 309 ? GLN A 290 ALA A 309 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA A 309 ? GLU A 319 ? ALA A 309 GLU A 319 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU A 320 ? ALA A 323 ? LEU A 320 ALA A 323 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 AC3 SER A 324 ? VAL A 350 ? SER A 324 VAL A 350 1 ? 27 HELX_P HELX_P22 AC4 SER A 354 ? THR A 375 ? SER A 354 THR A 375 1 ? 22 HELX_P HELX_P23 AC5 TRP A 376 ? ARG A 380 ? TRP A 376 ARG A 380 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY A 383 ? SER A 398 ? GLY A 383 SER A 398 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY A 399 ? GLY A 401 ? GLY A 399 GLY A 401 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP B 14 ? ARG B 30 ? ASP D 14 ARG D 30 1 ? 17 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS B 36 ? ALA B 44 ? LYS D 36 ALA D 44 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 47 ? TYR B 55 ? THR D 47 TYR D 55 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN B 57 ? ARG B 78 ? 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GLY D 383 SER D 398 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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