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;EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFHNYAMHWVRQAPGKGLDWVTGITWNSVNVDYADSVKGRFTISRDNAKNSLY LQMNSLRAEDTALYYCVKGQVWSGYYLTHDAFDLWGQGTTVTVSGASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPE PVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKGSSLEVLFQ ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQSPPSLSATVGDRVTITCRASQSISNYLNWYQQKPGKAPKLLISGASSLQLGVPSRFSGSESGTDFTLTISSLQP EDCATYYCQQGYIMPGTFGQGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIVMTQSPPSLSATVGDRVTITCRASQSISNYLNWYQQKPGKAPKLLISGASSLQLGVPSRFSGSESGTDFTLTISSLQP EDCATYYCQQGYIMPGTFGQGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; G,H,I ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 LYS n 1 3 ILE n 1 4 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J MAN . O3 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J MAN 6 J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale28 covale both ? J MAN . O6 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J MAN 6 J MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale29 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale30 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale31 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale32 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? L NAG 2 L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale33 covale both ? L BMA . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? L BMA 3 L MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale34 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? L BMA 3 L MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale35 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale36 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale37 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale38 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale39 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale40 covale both ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale41 covale both ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale42 covale both ? O MAN . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O MAN 4 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale43 covale both ? O MAN . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O MAN 6 O MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale44 covale both ? O MAN . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O MAN 6 O MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale45 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale46 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale47 covale both ? P BMA . O3 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale48 covale both ? P BMA . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale49 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale50 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale51 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale52 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale53 covale both ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale54 covale both ? S BMA . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale55 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale56 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale57 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale58 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale59 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale60 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale61 covale both ? U MAN . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 4 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale62 covale both ? U MAN . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 6 U MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale63 covale both ? U MAN . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 6 U MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale64 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale65 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG AA . ? 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CYS C 52 ? 1_555 CYS C 277 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 30 CYS C 64 ? CYS C 76 ? CYS C 64 ? 1_555 CYS C 76 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 31 CYS C 97 ? CYS C 139 ? CYS C 97 ? 1_555 CYS C 139 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 32 CYS C 281 ? CYS C 305 ? CYS C 281 ? 1_555 CYS C 305 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 33 CYS D 22 ? CYS D 96 ? CYS D 22 ? 1_555 CYS D 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 34 CYS E 22 ? CYS E 96 ? CYS E 22 ? 1_555 CYS E 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 35 CYS F 22 ? CYS F 96 ? CYS F 22 ? 1_555 CYS F 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 36 CYS G 23 ? CYS G 88 ? CYS G 23 ? 1_555 CYS G 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 37 CYS I 23 ? CYS I 88 ? CYS I 23 ? 1_555 CYS I 88 ? 1_555 SG SG . . . 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AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 6 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 6 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 6 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 6 ? AE9 ? 4 ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? cryoSPARC v4.3.1 # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number 75N93019C00051 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 BMA 3 n 4 MAN 4 n 4 MAN 5 n 4 MAN 6 n 4 MAN 7 n 4 MAN 8 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n 6 MAN 5 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 8 MAN 5 n 8 MAN 6 n 8 MAN 7 n 8 MAN 8 n # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _atom_sites.entry_id 9BDG _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.Cartn_transform_axes ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ #