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EMDB EMD-44846 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-06-19 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9BRZ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-05-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'V0-only V-ATPase and synaptophysin complex in mouse brain isolated synaptic vesicles' _pdbx_database_related.db_id EMD-44846 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email brunger@stanford.edu _pdbx_contact_author.name_first Axel _pdbx_contact_author.name_last Brunger _pdbx_contact_author.name_mi T _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-5121-2036 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, C.' 1 ? 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GFSFCQVRLNKRKEYMVR ; ;MASLLCCGPKLAACGIVLSAWGVIMLIMLGIFFNVHSAVLIEDVPFTEKDFENGPQNIYNLYEQVSYNCFIAAGLYLLLG GFSFCQVRLNKRKEYMVR ; f ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MADIKNNPEYSSFFGVMGASSAMVFSAMGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSL TDGITLYRSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK ; ;MADIKNNPEYSSFFGVMGASSAMVFSAMGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSL TDGITLYRSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK ; g,h,i,j,k,l,m,n,o ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAVLVVLLFFLVAGALGNEFSILRSPGSVVFRNGNWPIPGDRIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFHRPRATIMVM VKGVDKLALPAGSVISYPLENAVPFSLDSVANSIHSLFSEETPVVLQLAPSEERVYMVGKANSVFEDLSVTLRQLRNRLF QENSLLNSLPLNSLSRNNEVDLLFLSELQVLHDISSLLSRHKHLAKDHSPDLYSLELAGLDELGKRYGEDSEQFRDASKI LVDALQKFADDMYSLYGGNAVVELVTVKSFDTSLVRKSRTILEAKQENTQSPYNLAYKYNLEYSVVFNLVLWIMIGLALA VIITSYNIWNMDPGYDSIIYRMTNQKIRID ; ;MAVLVVLLFFLVAGALGNEFSILRSPGSVVFRNGNWPIPGDRIPDVAALSMGFSVKEDLSWPGLAVGNLFHRPRATIMVM 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;MTAHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVATAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLW E ; ;MTAHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVATAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFLW E ; e ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIM DTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSS LLEPNEMGRGAPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNID VTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTHGFQNIVDAYGIGTYREINPAP YTVITFPFLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKHENEMFSMVFSGRYIILLMGLFSIYTGLIYNDCFSKSLN IFGSSWSVRPMFTQGNWTEETLLGSSVLQLNPAIPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGV SLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMSSLFGYLVILIFYKWTAYDAHSSRNAPSLLIHFINMFLFSYPESGNAMLYSGQ KGIQCFLIVVAMLCVPWMLLFKPLILRHQYLRKKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAEEFDFGDTMV 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_pdbx_entity_nonpoly.entity_id 12 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 MET n 1 3 ALA n 1 4 ALA n 1 5 THR n 1 6 VAL n 1 7 VAL n 1 8 SER n 1 9 ARG n 1 10 ILE n 1 11 ARG n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 THR n 1 15 GLY n 1 16 ARG n 1 17 ALA n 1 18 PRO n 1 19 VAL n 1 20 MET n 1 21 TRP n 1 22 LEU n 1 23 SER n 1 24 LEU n 1 25 SER n 1 26 LEU n 1 27 VAL n 1 28 ALA n 1 29 VAL n 1 30 ALA n 1 31 ALA n 1 32 ALA n 1 33 VAL n 1 34 ALA n 1 35 THR n 1 36 GLU n 1 37 GLN n 1 38 GLN n 1 39 VAL n 1 40 PRO n 1 41 LEU n 1 42 VAL n 1 43 LEU n 1 44 TRP n 1 45 SER n 1 46 SER n 1 47 ASP n 1 48 ARG n 1 49 ASN n 1 50 LEU n 1 51 TRP n 1 52 ALA n 1 53 PRO n 1 54 VAL n 1 55 ALA n 1 56 ASP n 1 57 THR n 1 58 HIS n 1 59 GLU n 1 60 GLY n 1 61 HIS n 1 62 ILE n 1 63 THR n 1 64 SER n 1 65 ASP n 1 66 MET n 1 67 GLN n 1 68 LEU n 1 69 SER n 1 70 THR n 1 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n J 5 138 ALA 138 138 138 ALA ALA l . n J 5 139 GLU 139 139 139 GLU GLU l . n J 5 140 VAL 140 140 140 VAL VAL l . n J 5 141 LEU 141 141 141 LEU LEU l . n J 5 142 GLY 142 142 142 GLY GLY l . n J 5 143 LEU 143 143 143 LEU LEU l . n J 5 144 TYR 144 144 144 TYR TYR l . n J 5 145 GLY 145 145 145 GLY GLY l . n J 5 146 LEU 146 146 146 LEU LEU l . n J 5 147 ILE 147 147 147 ILE ILE l . n J 5 148 VAL 148 148 148 VAL VAL l . n J 5 149 ALA 149 149 149 ALA ALA l . n J 5 150 LEU 150 150 150 LEU LEU l . n J 5 151 ILE 151 151 151 ILE ILE l . n J 5 152 LEU 152 152 152 LEU LEU l . n J 5 153 SER 153 153 153 SER SER l . n J 5 154 THR 154 154 154 THR THR l . n J 5 155 LYS 155 155 155 LYS LYS l . n K 5 1 MET 1 1 ? ? ? m . n K 5 2 ALA 2 2 ? ? ? m . n K 5 3 ASP 3 3 ? ? ? m . n K 5 4 ILE 4 4 ? ? ? m . n K 5 5 LYS 5 5 ? ? ? m . n K 5 6 ASN 6 6 6 ASN ASN m . n K 5 7 ASN 7 7 7 ASN ASN m . n K 5 8 PRO 8 8 8 PRO PRO m . n K 5 9 GLU 9 9 9 GLU GLU m . n K 5 10 TYR 10 10 10 TYR TYR m . n K 5 11 SER 11 11 11 SER SER m 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AA9 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 252 ? 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GLU O 72 ? ALA s 64 GLU s 72 AA5 2 THR O 48 ? VAL O 55 ? THR s 48 VAL s 55 AA5 3 LYS O 192 ? ARG O 195 ? LYS s 192 ARG s 195 AA6 1 TYR O 81 ? PRO O 85 ? TYR s 81 PRO s 85 AA6 2 THR O 92 ? PHE O 96 ? THR s 92 PHE s 96 AA7 1 LEU Q 12 ? ALA Q 13 ? LEU a 12 ALA a 13 AA7 2 GLU Q 329 ? TRP Q 331 ? GLU a 322 TRP a 324 AA7 3 GLN Q 36 ? ARG Q 38 ? GLN a 36 ARG a 38 AA8 1 VAL Q 178 ? ILE Q 182 ? VAL a 171 ILE a 175 AA8 2 SER Q 225 ? PHE Q 230 ? SER a 218 PHE a 223 AA8 3 PHE Q 203 ? GLU Q 208 ? PHE a 196 GLU a 201 AA9 1 LEU Q 213 ? GLU Q 214 ? LEU a 206 GLU a 207 AA9 2 TYR Q 221 ? VAL Q 222 ? TYR a 214 VAL a 215 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 252 ? N VAL c 252 O PHE A 263 ? O PHE c 263 AA1 2 3 N LEU A 262 ? N LEU c 262 O GLN A 396 ? O GLN c 396 AA1 3 4 O THR A 389 ? O THR c 389 N SER A 269 ? N SER c 269 AA1 4 5 N VAL A 270 ? N VAL c 270 O LYS A 277 ? O LYS c 277 AA2 1 2 N VAL A 252 ? N VAL c 252 O PHE A 263 ? O PHE c 263 AA2 2 3 N LEU A 262 ? N LEU c 262 O GLN A 396 ? O GLN c 396 AA2 3 4 O PHE A 393 ? O PHE c 393 N CYS A 365 ? N CYS c 365 AA2 4 5 N SER A 362 ? N SER c 362 O SER A 409 ? O SER c 409 AA3 1 2 N PHE A 295 ? N PHE c 295 O MET A 302 ? O MET c 302 AA3 2 3 N TYR A 307 ? N TYR c 307 O VAL A 315 ? O VAL c 315 AA3 3 4 N THR A 316 ? N THR c 316 O HIS A 342 ? O HIS c 342 AA3 4 5 N SER A 343 ? N SER c 343 O SER A 346 ? O SER c 346 AA4 1 2 N PHE A 295 ? N PHE c 295 O MET A 302 ? O MET c 302 AA4 2 3 N TYR A 307 ? N TYR c 307 O VAL A 315 ? O VAL c 315 AA4 3 4 N THR A 316 ? N THR c 316 O HIS A 342 ? O HIS c 342 AA4 4 5 N PHE A 334 ? N PHE c 334 O GLY A 357 ? O GLY c 357 AA5 1 2 O ILE O 67 ? O ILE s 67 N LEU O 53 ? N LEU s 53 AA5 2 3 N ARG O 52 ? N ARG s 52 O ARG O 195 ? O ARG s 195 AA6 1 2 N PHE O 82 ? N PHE s 82 O ILE O 95 ? O ILE s 95 AA7 1 2 N ALA Q 13 ? N ALA a 13 O VAL Q 330 ? O VAL a 323 AA7 2 3 O GLU Q 329 ? O GLU a 322 N ARG Q 38 ? N ARG a 38 AA8 1 2 N GLY Q 180 ? N GLY a 173 O PHE Q 227 ? O PHE a 220 AA8 2 3 O VAL Q 226 ? O VAL a 219 N ALA Q 207 ? N ALA a 200 AA9 1 2 N LEU Q 213 ? N LEU a 206 O VAL Q 222 ? O VAL a 215 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 THR c 257 ? ? 48.93 -118.51 2 1 TYR c 272 ? ? -92.86 -62.41 3 1 LEU c 291 ? ? -92.26 56.61 4 1 SER c 299 ? ? 72.38 35.35 5 1 PHE c 300 ? ? -170.97 136.38 6 1 SER c 343 ? ? -147.65 -158.20 7 1 ASN c 344 ? ? -66.85 75.51 8 1 ASN c 351 ? ? -55.78 170.57 9 1 LYS c 373 ? ? 76.87 -8.44 10 1 ASN c 381 ? ? 36.56 -128.21 11 1 VAL c 382 ? ? 37.64 72.84 12 1 SER c 384 ? ? 59.80 -174.20 13 1 TRP c 386 ? ? -161.91 116.50 14 1 ALA c 397 ? ? -130.23 -40.04 15 1 GLU c 403 ? ? -95.39 58.76 16 1 ASN d 58 ? ? 60.63 67.47 17 1 ALA d 64 ? ? -92.69 56.33 18 1 ASN d 89 ? ? -69.73 2.85 19 1 GLN d 139 ? ? -109.21 41.63 20 1 PHE d 166 ? ? -141.71 18.13 21 1 SER d 229 ? ? -97.41 37.68 22 1 LEU d 249 ? ? -99.76 39.75 23 1 GLN d 256 ? ? -131.79 -37.43 24 1 ARG d 259 ? ? -95.01 31.63 25 1 ASN f 34 ? ? -93.96 -61.48 26 1 SER f 37 ? ? 58.56 19.75 27 1 ASN f 53 ? ? -92.74 -62.81 28 1 ASN f 68 ? ? -66.72 2.33 29 1 PHE f 70 ? ? -84.81 -87.42 30 1 VAL g 24 ? ? -106.66 -70.11 31 1 ARG g 48 ? ? -114.53 66.50 32 1 SER g 55 ? ? -94.06 33.03 33 1 TYR h 10 ? ? -59.76 -8.64 34 1 PHE h 13 ? ? -38.77 -71.63 35 1 SER h 79 ? ? -98.49 32.73 36 1 MET k 23 ? ? -91.46 -64.58 37 1 VAL n 24 ? ? -91.29 -64.38 38 1 TYR o 10 ? ? -98.21 34.34 39 1 GLU o 50 ? ? -69.81 6.39 40 1 TYR p 633 ? ? 37.08 41.47 41 1 SER p 635 ? ? -122.47 -63.67 42 1 SER s 46 ? ? -142.25 31.31 43 1 PRO s 74 ? ? -88.04 35.67 44 1 LEU s 194 ? ? -93.23 -61.14 45 1 ASN e 61 ? ? 62.20 67.23 46 1 GLU a 9 ? ? -93.20 -60.54 47 1 ASP a 39 ? ? -171.54 -174.39 48 1 LEU a 40 ? ? 75.20 37.87 49 1 PRO a 251 ? ? -58.86 177.85 50 1 ASN a 311 ? ? -47.35 154.37 51 1 GLN a 316 ? ? 48.47 25.06 52 1 ARG a 387 ? ? 64.20 60.61 53 1 ARG a 426 ? ? -99.43 33.82 54 1 SER a 432 ? ? -93.57 52.47 55 1 SER a 469 ? ? 73.08 -5.30 56 1 LEU a 472 ? ? -69.94 99.45 57 1 GLN a 502 ? ? 61.14 69.09 58 1 PRO a 514 ? ? -69.62 -176.48 59 1 LYS a 564 ? ? 62.50 61.68 60 1 SER a 602 ? ? -98.81 35.74 61 1 ASN a 605 ? ? 71.27 -4.53 62 1 LEU a 653 ? ? -132.71 -30.86 63 1 VAL a 760 ? ? -91.71 -64.17 64 1 ILE a 793 ? ? -105.70 -62.33 65 1 TRP a 808 ? ? -90.59 -63.58 66 1 PHE a 811 ? ? -93.78 -60.54 67 1 LEU a 824 ? ? -118.51 65.32 68 1 PRO a 825 ? ? -48.44 157.10 # _pdbx_entry_details.entry_id 9BRZ _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.has_protein_modification ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 9BRZ _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ;Initial model: 6VQH, 6WLW, mouse synaptophysin from AlphaFold2 . For fitting and refinement details, see https://doi.org/10.1038/s41586-024-07610-x. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' # _em_3d_reconstruction.entry_id 9BRZ _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 3.8 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 42137 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type 'ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT' _em_entity_assembly.name 'Mouse brain isolated glutamatergic synaptic vesicles' _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9' # _em_imaging.entry_id 9BRZ _em_imaging.id 1 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.microscope_model 'TFS KRIOS' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.details ? _em_imaging.date ? _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 2000 _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.cryogen ? # _em_vitrification.entry_id 9BRZ _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.details ? # _em_experiment.entry_id 9BRZ _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.aggregation_state CELL _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 c MET 1 ? 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