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'principal investigator/group leader' 0000-0003-2606-2835 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Notti, R.Q.' 1 0000-0002-9197-6134 'Walz, T.' 2 0000-0003-2606-2835 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Biorxiv _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2692-8205 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'The resting and ligand-bound states of the membrane-embedded human T-cell receptor-CD3 complex.' _citation.year 2024 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1101/2023.08.22.554360 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37662363 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Notti, R.Q.' 1 0000-0002-9197-6134 primary 'Yi, F.' 2 ? primary 'Heissel, S.' 3 0000-0003-2692-5602 primary 'Bush, M.W.' 4 0000-0002-0472-5725 primary 'Molvi, Z.' 5 0000-0001-6728-4835 primary 'Das, P.' 6 0009-0008-7085-4059 primary 'Molina, H.' 7 0000-0001-8950-4990 primary 'Klebanoff, C.A.' 8 0000-0001-9645-3896 primary 'Walz, T.' 9 0000-0003-2606-2835 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man TCRa 30214.033 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'TCRb (EGFP fusion)' 62121.918 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain' 13836.026 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain' 23174.227 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain' 22041.098 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain' 18723.439 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Cancer/testis antigen 1,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen' 62221.281 1 ? 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;MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVP NGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSYVGNTGELFFGEGSRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKAT LVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDE WTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRGVEDTMGVSK GEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDF FKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKV NFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKVD ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYK DKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCF ; ;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYK DKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCF ; D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MQSGTHWRVLGLCLLSVGVWGQDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDED HLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDVMSVATIVIVDICITGGLLLLVYYWSKNRKAKAK PVTRGAGAGGRQRGQNKERPPPVPNPDYEPIRKGQRDLYSGLNQRRI ; ;MQSGTHWRVLGLCLLSVGVWGQDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDED HLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDVMSVATIVIVDICITGGLLLLVYYWSKNRKAKAK PVTRGAGAGGRQRGQNKERPPPVPNPDYEPIRKGQRDLYSGLNQRRI ; E,F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MEQGKGLAVLILAIILLQGTLAQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKD PRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNCIELNAATISGFLFAEIVSIFVLAVGVYFIAGQDGVRQSRASDKQTLLPNDQLY QPLKDREDDQYSHLQGNQLRRNVEHHHHHHHHVD ; ;MEQGKGLAVLILAIILLQGTLAQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKD PRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNCIELNAATISGFLFAEIVSIFVLAVGVYFIAGQDGVRQSRASDKQTLLPNDQLY QPLKDREDDQYSHLQGNQLRRNVEHHHHHHHHVD ; G ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MKWKALFTAAILQAQLPITEAQSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRR EEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR ; ;MKWKALFTAAILQAQLPITEAQSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRR EEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR ; X,Y ? 7 'polypeptide(L)' no no ;SLLMWITQV(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) IQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYAC RVNHVTLSQPKIVKWDRD(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) SHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDGETRKVKAHSQTHRVDLGTL RGYYNQSEAGSHTVQRMYGCDVGSDWRFLRGYHQYAYDGKDYIALKEDLRSWTAADMAAQTTKHKWEAAHVAEQLRAYLE GTCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTF QKWAAVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKP ; ;SLLMWITQVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLK NGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYACRVNHVTLSQPKIVKWDRDXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDGETRKVKAHSQTHRV DLGTLRGYYNQSEAGSHTVQRMYGCDVGSDWRFLRGYHQYAYDGKDYIALKEDLRSWTAADMAAQTTKHKWEAAHVAEQL RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPA GDGTFQKWAAVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKP ; H ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 9 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 10 CHOLESTEROL CLR # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLU n 1 3 THR n 1 4 LEU n 1 5 LEU n 1 6 GLY n 1 7 LEU n 1 8 LEU n 1 9 ILE n 1 10 LEU n 1 11 TRP n 1 12 LEU n 1 13 GLN n 1 14 LEU n 1 15 GLN n 1 16 TRP n 1 17 VAL n 1 18 SER n 1 19 SER n 1 20 LYS n 1 21 GLN n 1 22 GLU n 1 23 VAL n 1 24 THR n 1 25 GLN n 1 26 ILE n 1 27 PRO n 1 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T N N 10 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9C3E 9C3E ? 1 ? 1 2 PDB 9C3E 9C3E ? 2 ? 1 3 UNP CD3D_HUMAN P04234 ? 3 ;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYK DKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCF ; 1 4 UNP CD3E_HUMAN P07766 ? 4 ;MQSGTHWRVLGLCLLSVGVWGQDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDED HLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDVMSVATIVIVDICITGGLLLLVYYWSKNRKAKAK PVTRGAGAGGRQRGQNKERPPPVPNPDYEPIRKGQRDLYSGLNQRRI ; 1 5 UNP CD3G_HUMAN P09693 ? 5 ;MEQGKGLAVLILAIILLQGTLAQSIKGNHLVKVYDYQEDGSVLLTCDAEAKNITWFKDGKMIGFLTEDKKKWNLGSNAKD PRGMYQCKGSQNKSKPLQVYYRMCQNCIELNAATISGFLFAEIVSIFVLAVGVYFIAGQDGVRQSRASDKQTLLPNDQLY QPLKDREDDQYSHLQGNQLRRN ; 1 6 UNP CD3Z_HUMAN P20963 ? 6 ;MKWKALFTAAILQAQLPITEAQSFGLLDPKLCYLLDGILFIYGVILTALFLRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRR EEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA LPPR ; 1 7 UNP CTG1B_HUMAN P78358 ? 7 SLLMWITQC 157 8 UNP B2MG_HUMAN P61769 ? 7 ;IQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYAC RVNHVTLSQPKIVKWDRD ; 21 9 UNP H9BNV4_HUMAN H9BNV4 ? 7 ;SHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDGETRKVKAHSQTHRVDLGTL RGYYNQSEAGSHTVQRMYGCDVGSDWRFLRGYHQYAYDGKDYIALKEDLRSWTAADMAAQTTKHKWEAAHVAEQLRAYLE GTCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTF QKWAAVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKP ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9C3E A 1 ? 272 ? 9C3E 1 ? 272 ? 1 272 2 2 9C3E B 1 ? 557 ? 9C3E 1 ? 557 ? 1 557 3 3 9C3E D 1 ? 125 ? P04234 1 ? 125 ? 1 125 4 4 9C3E E 1 ? 207 ? P07766 1 ? 207 ? 1 207 5 4 9C3E F 1 ? 207 ? P07766 1 ? 207 ? 1 207 6 5 9C3E G 1 ? 182 ? P09693 1 ? 182 ? 1 182 7 6 9C3E X 1 ? 164 ? P20963 1 ? 164 ? 1 164 8 6 9C3E Y 1 ? 164 ? P20963 1 ? 164 ? 1 164 9 7 9C3E H 1 ? 9 ? P78358 157 ? 165 ? 1 9 10 8 9C3E H 120 ? 217 ? P61769 21 ? 118 ? 121 218 11 9 9C3E H 326 ? 593 ? H9BNV4 1 ? 268 ? 326 593 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 6 9C3E VAL G 183 ? UNP P09693 ? ? 'expression tag' 183 1 6 9C3E GLU G 184 ? UNP P09693 ? ? 'expression tag' 184 2 6 9C3E HIS G 185 ? UNP P09693 ? ? 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GLY H 499 GLN H 504 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 42 SG ? ? ? 1_555 A CYS 109 SG ? ? A CYS 42 A CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 156 SG ? ? ? 1_555 A CYS 206 SG ? ? A CYS 156 A CYS 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 228 SG ? ? ? 1_555 B CYS 263 SG ? ? A CYS 228 B CYS 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 42 SG ? ? ? 1_555 B CYS 110 SG ? ? B CYS 42 B CYS 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 163 SG ? ? ? 1_555 B CYS 228 SG ? ? B CYS 163 B CYS 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 37 SG ? ? ? 1_555 C CYS 73 SG ? ? D CYS 37 D CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 93 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? D CYS 93 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 49 SG ? ? ? 1_555 D CYS 98 SG ? ? E CYS 49 E CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 119 SG ? ? ? 1_555 D CYS 122 SG ? ? E CYS 119 E CYS 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf10 disulf ? ? E CYS 49 SG ? ? ? 1_555 E CYS 98 SG ? ? F CYS 49 F CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 119 SG ? ? ? 1_555 E CYS 122 SG ? ? F CYS 119 F CYS 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 46 SG ? ? ? 1_555 F CYS 87 SG ? ? G CYS 46 G CYS 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf13 disulf ? ? F CYS 104 SG ? ? ? 1_555 F CYS 107 SG ? ? G CYS 104 G CYS 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? G CYS 32 SG ? ? ? 1_555 H CYS 32 SG ? ? X CYS 32 Y CYS 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 144 SG ? ? ? 1_555 I CYS 199 SG ? ? H CYS 145 H CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf16 disulf ? ? I CYS 425 SG ? ? ? 1_555 I CYS 488 SG ? ? H CYS 425 H CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? disulf17 disulf ? ? I CYS 527 SG ? ? ? 1_555 I CYS 583 SG ? ? H CYS 527 H CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? ? covale1 covale one ? A ASN 41 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 41 A NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 82 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 82 A NAG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 166 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 166 A NAG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 200 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 200 A NAG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 211 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 211 A NAG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 84 B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 38 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? D ASN 38 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 74 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 74 D NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? F ASN 52 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? G ASN 52 G NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale10 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale11 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG J . ? ASN C 38 ? NAG N 1 ? 1_555 ASN D 38 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG K . ? ASN A 41 ? NAG A 301 ? 1_555 ASN A 41 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG L . ? ASN A 82 ? NAG A 302 ? 1_555 ASN A 82 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG M . ? ASN A 166 ? NAG A 303 ? 1_555 ASN A 166 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG N . ? ASN A 200 ? NAG A 304 ? 1_555 ASN A 200 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 NAG O . ? ASN A 211 ? NAG A 305 ? 1_555 ASN A 211 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 7 NAG P . ? ASN B 84 ? NAG B 601 ? 1_555 ASN B 84 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 8 NAG Q . ? ASN C 74 ? NAG D 201 ? 1_555 ASN D 74 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 9 NAG R . ? ASN F 52 ? NAG G 201 ? 1_555 ASN G 52 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 10 CYS A 42 ? CYS A 109 ? CYS A 42 ? 1_555 CYS A 109 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS A 156 ? CYS A 206 ? CYS A 156 ? 1_555 CYS A 206 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS A 228 ? CYS B 263 ? CYS A 228 ? 1_555 CYS B 263 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS B 42 ? CYS B 110 ? CYS B 42 ? 1_555 CYS B 110 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS B 163 ? CYS B 228 ? CYS B 163 ? 1_555 CYS B 228 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS C 37 ? CYS C 73 ? CYS D 37 ? 1_555 CYS D 73 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS C 93 ? CYS C 96 ? CYS D 93 ? 1_555 CYS D 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS D 49 ? CYS D 98 ? CYS E 49 ? 1_555 CYS E 98 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS D 119 ? CYS D 122 ? CYS E 119 ? 1_555 CYS E 122 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS E 49 ? CYS E 98 ? CYS F 49 ? 1_555 CYS F 98 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS E 119 ? CYS E 122 ? CYS F 119 ? 1_555 CYS F 122 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 21 CYS F 46 ? CYS F 87 ? CYS G 46 ? 1_555 CYS G 87 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 22 CYS F 104 ? CYS F 107 ? CYS G 104 ? 1_555 CYS G 107 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 23 CYS G 32 ? CYS H 32 ? CYS X 32 ? 1_555 CYS Y 32 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 24 CYS I 144 ? CYS I 199 ? CYS H 145 ? 1_555 CYS H 200 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 25 CYS I 425 ? CYS I 488 ? CYS H 425 ? 1_555 CYS H 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 26 CYS I 527 ? CYS I 583 ? CYS H 527 ? 1_555 CYS H 583 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 26 A . ? ILE 26 A PRO 27 A ? PRO 27 A 1 1.11 2 THR 26 B . ? THR 26 B PRO 27 B ? PRO 27 B 1 -1.26 3 TYR 169 B . ? TYR 169 B PRO 170 B ? PRO 170 B 1 -1.37 4 LYS 80 C . ? LYS 80 D ASP 81 C ? ASP 81 D 1 -1.87 5 TYR 99 D . ? TYR 99 E PRO 100 D ? PRO 100 E 1 -1.10 6 HIS 150 I . ? HIS 151 H PRO 151 I ? PRO 152 H 1 -1.74 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 8 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 6 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB8 6 7 ? anti-parallel AB8 7 8 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 23 ? ILE A 26 ? VAL A 23 ILE A 26 AA1 2 LEU A 38 ? PHE A 44 ? LEU A 38 PHE A 44 AA1 3 ARG A 91 ? ILE A 96 ? ARG A 91 ILE A 96 AA1 4 LEU A 81 ? ASP A 86 ? LEU A 81 ASP A 86 AA1 5 GLU A 75 ? SER A 78 ? GLU A 75 SER A 78 AA2 1 LEU A 30 ? PRO A 33 ? LEU A 30 PRO A 33 AA2 2 THR A 127 ? HIS A 132 ? THR A 127 HIS A 132 AA2 3 ALA A 105 ? VAL A 111 ? ALA A 105 VAL A 111 AA2 4 GLN A 53 ? GLN A 57 ? GLN A 53 GLN A 57 AA2 5 THR A 64 ? LEU A 68 ? THR A 64 LEU A 68 AA3 1 LEU A 30 ? PRO A 33 ? LEU A 30 PRO A 33 AA3 2 THR A 127 ? HIS A 132 ? THR A 127 HIS A 132 AA3 3 ALA A 105 ? VAL A 111 ? ALA A 105 VAL A 111 AA3 4 THR A 122 ? PHE A 123 ? THR A 122 PHE A 123 AA4 1 ALA A 141 ? LEU A 145 ? ALA A 141 LEU A 145 AA4 2 SER A 154 ? THR A 159 ? SER A 154 THR A 159 AA4 3 PHE A 190 ? SER A 199 ? PHE A 190 SER A 199 AA4 4 VAL A 175 ? ILE A 177 ? VAL A 175 ILE A 177 AA5 1 ALA A 141 ? LEU A 145 ? ALA A 141 LEU A 145 AA5 2 SER A 154 ? THR A 159 ? SER A 154 THR A 159 AA5 3 PHE A 190 ? SER A 199 ? PHE A 190 SER A 199 AA5 4 THR A 181 ? MET A 185 ? THR A 181 MET A 185 AA6 1 VAL B 23 ? THR B 26 ? VAL B 23 THR B 26 AA6 2 MET B 38 ? GLN B 44 ? MET B 38 GLN B 44 AA6 3 ASP B 92 ? LEU B 97 ? ASP B 92 LEU B 97 AA6 4 ASN B 84 ? VAL B 85 ? ASN B 84 VAL B 85 AA7 1 PHE B 29 ? LYS B 33 ? PHE B 29 LYS B 33 AA7 2 SER B 127 ? LEU B 132 ? SER B 127 LEU B 132 AA7 3 VAL B 107 ? SER B 113 ? VAL B 107 SER B 113 AA7 4 TYR B 50 ? ASP B 57 ? TYR B 50 ASP B 57 AA7 5 GLY B 61 ? SER B 68 ? GLY B 61 SER B 68 AA8 1 PHE B 29 ? LYS B 33 ? PHE B 29 LYS B 33 AA8 2 SER B 127 ? LEU B 132 ? SER B 127 LEU B 132 AA8 3 VAL B 107 ? SER B 113 ? VAL B 107 SER B 113 AA8 4 LEU B 121 ? PHE B 123 ? LEU B 121 PHE B 123 AA9 1 GLU B 142 ? PHE B 146 ? GLU B 142 PHE B 146 AA9 2 LYS B 158 ? PHE B 168 ? LYS B 158 PHE B 168 AA9 3 TYR B 206 ? SER B 215 ? TYR B 206 SER B 215 AA9 4 VAL B 188 ? THR B 190 ? VAL B 188 THR B 190 AB1 1 GLU B 142 ? PHE B 146 ? GLU B 142 PHE B 146 AB1 2 LYS B 158 ? PHE B 168 ? 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