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L ARG 168 NH2 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 9CZ9 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 9CZ9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 9CZ9 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 9CZ9 _struct.title 'Structure of thioferritin with averaged iron mineral core, from Pyrococcus furiosis' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9CZ9 _struct_keywords.text ;Ferritin, thioferritin, oxidative stress, iron homeostasis, iron mineral, ferric oxyhydroxide, mineral core, protein cage, METAL BINDING PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'METAL BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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Q8U1L3 1 ? 185 ? 1 185 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'electron microscopy' ? 2 1 'mass spectrometry' '264,866.1 Da' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 15 ? 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ASP C 84 ASP C 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 THR C 104 ? ASN C 128 ? THR C 104 ASN C 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP C 134 ? GLY C 161 ? ASP C 134 GLY C 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL C 178 ? LEU C 182 ? VAL C 178 LEU C 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP D 15 ? ALA D 44 ? ASP D 15 ALA D 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P20 AC2 THR D 45 ? LEU D 77 ? THR D 45 LEU D 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP D 84 ? ASP D 90 ? ASP D 84 ASP D 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 THR D 104 ? ASN D 128 ? THR D 104 ASN D 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP D 134 ? GLY D 161 ? ASP D 134 GLY D 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 VAL D 178 ? LEU D 182 ? VAL D 178 LEU D 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP E 15 ? ALA E 44 ? ASP E 15 ALA E 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P26 AC8 THR E 45 ? LEU E 77 ? THR E 45 LEU E 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP E 84 ? ASP E 90 ? ASP E 84 ASP E 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 THR E 104 ? ASN E 128 ? THR E 104 ASN E 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP E 134 ? GLY E 161 ? ASP E 134 GLY E 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P30 AD3 VAL E 178 ? LEU E 182 ? VAL E 178 LEU E 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP F 15 ? ALA F 44 ? ASP F 15 ALA F 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P32 AD5 THR F 45 ? LEU F 77 ? THR F 45 LEU F 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP F 84 ? ASP F 90 ? ASP F 84 ASP F 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 AD7 THR F 104 ? ASN F 128 ? THR F 104 ASN F 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP F 134 ? GLY F 161 ? ASP F 134 GLY F 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P36 AD9 VAL F 178 ? LEU F 182 ? VAL F 178 LEU F 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP G 15 ? ALA G 44 ? ASP G 15 ALA G 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P38 AE2 THR G 45 ? LEU G 77 ? THR G 45 LEU G 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP G 84 ? ASP G 90 ? ASP G 84 ASP G 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 THR G 104 ? ASN G 128 ? THR G 104 ASN G 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP G 134 ? GLY G 161 ? ASP G 134 GLY G 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P42 AE6 VAL G 178 ? LEU G 182 ? VAL G 178 LEU G 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP H 15 ? ALA H 44 ? ASP H 15 ALA H 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P44 AE8 THR H 45 ? LEU H 77 ? THR H 45 LEU H 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P45 AE9 ASP H 84 ? ASP H 90 ? ASP H 84 ASP H 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P46 AF1 THR H 104 ? ASN H 128 ? THR H 104 ASN H 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP H 134 ? GLY H 161 ? ASP H 134 GLY H 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P48 AF3 VAL H 178 ? LEU H 182 ? VAL H 178 LEU H 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP I 15 ? ALA I 44 ? ASP I 15 ALA I 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P50 AF5 THR I 45 ? LEU I 77 ? THR I 45 LEU I 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP I 84 ? ASP I 90 ? ASP I 84 ASP I 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P52 AF7 THR I 104 ? ASN I 128 ? THR I 104 ASN I 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P53 AF8 ASP I 134 ? GLY I 161 ? ASP I 134 GLY I 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P54 AF9 VAL I 178 ? LEU I 182 ? VAL I 178 LEU I 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP J 15 ? ALA J 44 ? ASP J 15 ALA J 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P56 AG2 THR J 45 ? LEU J 77 ? THR J 45 LEU J 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP J 84 ? ASP J 90 ? ASP J 84 ASP J 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P58 AG4 THR J 104 ? ASN J 128 ? THR J 104 ASN J 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP J 134 ? GLY J 161 ? ASP J 134 GLY J 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P60 AG6 VAL J 178 ? LEU J 182 ? VAL J 178 LEU J 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 ASP K 15 ? ALA K 44 ? ASP K 15 ALA K 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P62 AG8 THR K 45 ? LEU K 77 ? THR K 45 LEU K 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P63 AG9 ASP K 84 ? ASP K 90 ? ASP K 84 ASP K 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P64 AH1 THR K 104 ? ASN K 128 ? THR K 104 ASN K 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P65 AH2 ASP K 134 ? GLY K 161 ? ASP K 134 GLY K 161 1 ? 28 HELX_P HELX_P66 AH3 VAL K 178 ? LEU K 182 ? VAL K 178 LEU K 182 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 AH4 ASP L 15 ? ALA L 44 ? ASP L 15 ALA L 44 1 ? 30 HELX_P HELX_P68 AH5 THR L 45 ? LEU L 77 ? THR L 45 LEU L 77 1 ? 33 HELX_P HELX_P69 AH6 ASP L 84 ? ASP L 90 ? ASP L 84 ASP L 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P70 AH7 THR L 104 ? ASN L 128 ? THR L 104 ASN L 128 1 ? 25 HELX_P HELX_P71 AH8 ASP L 134 ? GLY L 161 ? 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VAL L 178 LEU L 182 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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C GLU 148 C FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? ? metalc35 metalc ? ? C HIS 151 ND1 ? ? ? 1_555 R FE . FE ? ? C HIS 151 C FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? ? metalc36 metalc ? ? Q FE . FE ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C FE 201 C HOH 330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? ? metalc37 metalc ? ? D GLU 30 OE1 ? ? ? 1_555 S FE . FE ? ? D GLU 30 D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? ? metalc38 metalc ? ? D GLU 30 OE2 ? ? ? 1_555 S FE . FE ? ? D GLU 30 D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? metalc39 metalc ? ? D ASP 63 OD1 ? ? ? 1_555 S FE . FE ? ? D ASP 63 D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? ? metalc40 metalc ? ? D ASP 63 OD1 ? ? ? 1_555 T FE . FE ? ? D ASP 63 D FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.220 ? ? metalc41 metalc ? ? D ASP 63 OD2 ? ? ? 1_555 T FE . FE ? ? D ASP 63 D FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? ? metalc42 metalc ? ? D HIS 66 ND1 ? ? ? 1_555 S FE . FE ? ? D HIS 66 D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.670 ? ? metalc43 metalc ? ? D GLU 116 OE1 ? ? ? 1_555 T FE . FE ? ? 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MA HOH . ? C HOH 330 ? 1_555 86.3 ? 73 OD1 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? Q FE . ? C FE 201 ? 1_555 O ? MA HOH . ? C HOH 330 ? 1_555 98.8 ? 74 ND1 ? C HIS 66 ? C HIS 66 ? 1_555 FE ? Q FE . ? C FE 201 ? 1_555 O ? MA HOH . ? C HOH 330 ? 1_555 171.0 ? 75 OE2 ? C GLU 148 ? C GLU 148 ? 1_555 FE ? Q FE . ? C FE 201 ? 1_555 O ? MA HOH . ? C HOH 330 ? 1_555 111.2 ? 76 OD1 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OD2 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 55.5 ? 77 OD1 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OE1 ? C GLU 116 ? C GLU 116 ? 1_555 161.2 ? 78 OD2 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OE1 ? C GLU 116 ? C GLU 116 ? 1_555 133.2 ? 79 OD1 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OE2 ? C GLU 116 ? C GLU 116 ? 1_555 137.7 ? 80 OD2 ? C ASP 63 ? C ASP 63 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OE2 ? C GLU 116 ? C GLU 116 ? 1_555 84.7 ? 81 OE1 ? C GLU 116 ? C GLU 116 ? 1_555 FE ? R FE . ? C FE 202 ? 1_555 OE2 ? 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D FE 201 ? 1_555 OE2 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 71.2 ? 100 ND1 ? D HIS 66 ? D HIS 66 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 OE2 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 66.5 ? 101 OE1 ? D GLU 30 ? D GLU 30 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 O ? NA HOH . ? D HOH 330 ? 1_555 98.4 ? 102 OE2 ? D GLU 30 ? D GLU 30 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 O ? NA HOH . ? D HOH 330 ? 1_555 86.3 ? 103 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 O ? NA HOH . ? D HOH 330 ? 1_555 98.8 ? 104 ND1 ? D HIS 66 ? D HIS 66 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 O ? NA HOH . ? D HOH 330 ? 1_555 171.1 ? 105 OE2 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 FE ? S FE . ? D FE 201 ? 1_555 O ? NA HOH . ? D HOH 330 ? 1_555 111.2 ? 106 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OD2 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 55.5 ? 107 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 161.1 ? 108 OD2 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 133.2 ? 109 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE2 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 137.7 ? 110 OD2 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE2 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 84.7 ? 111 OE1 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE2 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 58.9 ? 112 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 105.5 ? 113 OD2 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 141.9 ? 114 OE1 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 56.8 ? 115 OE2 ? D GLU 116 ? D GLU 116 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 OE1 ? D GLU 148 ? D GLU 148 ? 1_555 115.6 ? 116 OD1 ? D ASP 63 ? D ASP 63 ? 1_555 FE ? T FE . ? D FE 202 ? 1_555 ND1 ? D HIS 151 ? D HIS 151 ? 1_555 90.2 ? 117 OD2 ? D ASP 63 ? 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