data_9D93 # _entry.id 9D93 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.396 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 9D93 pdb_00009d93 10.2210/pdb9d93/pdb WWPDB D_1000287582 ? ? EMDB EMD-46661 ? ? # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2024-09-25 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9D93 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-08-20 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? 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_pdbx_contact_author.identifier_ORCID 2 kgf10@pitt.edu Krista Freeman G 'principal investigator/group leader' 0000-0002-2944-5076 3 gfh@pitt.edu Graham Hatfull F 'principal investigator/group leader' 0000-0002-6705-6821 # _audit_author.name 'Freeman, K.G.' _audit_author.pdbx_ordinal 1 _audit_author.identifier_ORCID 0000-0002-2944-5076 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'To Be Published' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure and infection dynamics of mycobacteriophage Bxb1' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Freeman, K.G.' 1 0000-0002-2944-5076 primary 'Mondal, S.' 2 ? primary 'Macale, L.S.' 3 ? primary 'Podgorski, J.' 4 ? primary 'White, S.J.' 5 ? primary 'Silva, B.' 6 ? primary 'Ortiz, V.' 7 ? primary 'Huet, A.' 8 ? primary 'Narsico, J.T.' 9 ? primary 'Ho, M.C.' 10 ? primary 'Jacobs-Sera, D.' 11 ? primary 'Lowary, T.L.' 12 ? primary 'Conway, J.F.' 13 ? primary 'Park, D.' 14 ? primary 'Hatfull, G.F.' 15 0000-0002-6705-6821 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Major tail protein' 30170.271 6 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Minor 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;MTVTITADVRDVTGQPDNQQWVFSTVLRQQDGSILTQKQVRVNPVDGALSVELEPGFAIVVYGEYRWFIEVPETDAGLWG LIATSVAVPPDTSAELLADAVNGYLDANPPSADWDALSNVPSEFPPSAHDHVAADVTDLDSAIAAYLASNPPEAGSVAWD DIDDKPSTFTPSSHTHSIANVTGLQDALDEKLDEAAVDARVSLGTAALVDSAPSTLDTLNELAAALGDDPNFATTVASQI GAKADKATTITAGTGLTGGGDLSANRTLNVSFGTSSTTACVGNDSRLSNTRTPTDGSVTNAKVASGAGIALSKLATGYVA GSDNSGARTLTIWVGTEAQYTAIGTKDSNTIYLRTA ; La,Lb,Lc,Ld,Le,Lf,Lg,Lh,Li ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MASRLLDPDTLVELEGVNGEWFDLTNGTEGIYLATEVTGLLDPPVKATYEEPGNFPGARYLNHRVLRRDLVFGVEILNDE NDETWLRRDSAWRKAWSFKRDAKLHITTGESGHRYLKVRLFESPTTDMVTDPRGREVNITKMVVVAGDPFWYEDDVVYPI EVQEDTTFDPNPLPWPWPQPELPVEDIEITVPNANPTDNIIWPKWTLPGSSEKPAEPYIPGLPWLGAPKSPATLWTVPDY KLDLDEDEDPSLGTRRIRMPGQIGGLRVEEVQQIYIDGRPTGGTFKIGYGDEWTEPIAYNASPNDVRAALIALEGISAND VEVSLGGATNEVQTVRLKGGALGGTFTLSLGSETTVGIPFNASDADLQGALVGLDSIGSADVRVKSTKINEVQVVELVGE PTSGSFTLTLDGQTTAPIAYNATPATVAARIADLPNIDGNYVKVEGLNEWFHSPYRITFGEAQSQGVITDIISGIIDFIG GLFGGNASGKGVGGIDIDEMTGDVGTLSGGAGLDVQVTTEQDGDRLYVVSFQRAAGGLNLPQLVGNASGLEGDDLSIETA 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;MADDQWVPDVPDGAFVIGGGDYRYGQDMTEDIARSLFQVPDFNPANALLVLPQLLLRLPLEALQKFKDFIPNVLEGAFNT VAGAVDAIMGAIRETPRVLEQILSYLPQELRDELEHAAARIGAVIDAIVQALTGTLNIGHTIEDLIFSLTNIRPGAVGGV LGGGSIEETIKRIVDAIVSGIVGVTGIGAGISDLQSLIEQISSAAARGGFAWDILGIQNNKKPKSGLYKSERGNFDLDTL NSTVSVAPGTSIIAFDVIEQSMPIGLITWIGWGTSGITEFYINVYRCVDDRSDPELGELIHQSENIAGLLAGSASPGANM AYELTTPIEAVAGDLLAYEFIAVGGTHTMRGRDFNLPDNDGAPIGNVGATRSLSTPSLPPATLDKADVTWTDNVPRVGIA VDTGTGSDHHDPQVEFFEKPVAIPVPAWCDRIDAIVTGKGGEGADGFLGFYGNPGQPGSVNTVTWTRGEHFSGTTTILEW DGAELSIPGFEVSAANGSNGSGQRPVALGKPVGKGIEEVEYNGLKLAAGGDQHAYGGAGTKPGGGGNGGHWLGIYTQGGP GGPACAAVQFRKGALPGEVVGDGEGDVTPPNVSALHVDVSATSTSITITPSGAVDDA ; ;MADDQWVPDVPDGAFVIGGGDYRYGQDMTEDIARSLFQVPDFNPANALLVLPQLLLRLPLEALQKFKDFIPNVLEGAFNT VAGAVDAIMGAIRETPRVLEQILSYLPQELRDELEHAAARIGAVIDAIVQALTGTLNIGHTIEDLIFSLTNIRPGAVGGV LGGGSIEETIKRIVDAIVSGIVGVTGIGAGISDLQSLIEQISSAAARGGFAWDILGIQNNKKPKSGLYKSERGNFDLDTL NSTVSVAPGTSIIAFDVIEQSMPIGLITWIGWGTSGITEFYINVYRCVDDRSDPELGELIHQSENIAGLLAGSASPGANM AYELTTPIEAVAGDLLAYEFIAVGGTHTMRGRDFNLPDNDGAPIGNVGATRSLSTPSLPPATLDKADVTWTDNVPRVGIA VDTGTGSDHHDPQVEFFEKPVAIPVPAWCDRIDAIVTGKGGEGADGFLGFYGNPGQPGSVNTVTWTRGEHFSGTTTILEW DGAELSIPGFEVSAANGSNGSGQRPVALGKPVGKGIEEVEYNGLKLAAGGDQHAYGGAGTKPGGGGNGGHWLGIYTQGGP GGPACAAVQFRKGALPGEVVGDGEGDVTPPNVSALHVDVSATSTSITITPSGAVDDA ; Pa,Pb,Pc ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSLKVGGLDVVGVFVGDAAATIYVGAMRIWPPVPDFTPFTISSEDPGYEDLIDEQVPEGASGCWVTLGGAGGGGGSGRRA NSGYRYGGGGGGGGGYIDRVWIPRASLGSTFTLIRGLGGAGGARAAGSSNGNNGAPGGSTVFSSGSVSLTASGGAAGVKG TSSSASGSGGAGGTTSISGVSATGYTGGKGGNGGSSPSSGQSRTDGSGAGGGGGGGVRSNDNSFSGGSNGTSSGPAGNGG RGTDGSINTGGSNAGSGGDGYVLIEWE ; ;MSLKVGGLDVVGVFVGDAAATIYVGAMRIWPPVPDFTPFTISSEDPGYEDLIDEQVPEGASGCWVTLGGAGGGGGSGRRA NSGYRYGGGGGGGGGYIDRVWIPRASLGSTFTLIRGLGGAGGARAAGSSNGNNGAPGGSTVFSSGSVSLTASGGAAGVKG TSSSASGSGGAGGTTSISGVSATGYTGGKGGNGGSSPSSGQSRTDGSGAGGGGGGGVRSNDNSFSGGSNGTSSGPAGNGG RGTDGSINTGGSNAGSGGDGYVLIEWE ; Qa,Qb,Qc ? 9 'polypeptide(L)' no no 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Nc . n AA 5 131 ALA 131 131 ? ? ? Nc . n AA 5 132 ALA 132 132 ? ? ? Nc . n AA 5 133 VAL 133 133 ? ? ? Nc . n AA 5 134 ALA 134 134 ? ? ? Nc . n AA 5 135 VAL 135 135 ? ? ? Nc . n AA 5 136 PRO 136 136 ? ? ? Nc . n AA 5 137 ILE 137 137 ? ? ? Nc . n AA 5 138 GLY 138 138 ? ? ? Nc . n AA 5 139 ALA 139 139 ? ? ? Nc . n AA 5 140 LEU 140 140 ? ? ? Nc . n AA 5 141 ALA 141 141 ? ? ? Nc . n AA 5 142 LEU 142 142 ? ? ? Nc . n AA 5 143 GLY 143 143 ? ? ? Nc . n AA 5 144 ILE 144 144 ? ? ? Nc . n AA 5 145 ASP 145 145 ? ? ? Nc . n AA 5 146 GLY 146 146 ? ? ? Nc . n AA 5 147 PHE 147 147 ? ? ? Nc . n AA 5 148 LYS 148 148 ? ? ? Nc . n AA 5 149 ARG 149 149 ? ? ? Nc . n AA 5 150 ALA 150 150 ? ? ? Nc . n AA 5 151 ALA 151 151 ? ? ? Nc . n AA 5 152 GLU 152 152 ? ? ? Nc . n AA 5 153 ARG 153 153 ? ? ? Nc . n AA 5 154 LEU 154 154 ? ? ? Nc . n AA 5 155 LYS 155 155 ? ? ? Nc . n AA 5 156 PRO 156 156 ? ? ? Nc . n AA 5 157 ALA 157 157 ? ? ? Nc . n AA 5 158 PHE 158 158 ? ? ? Nc . n AA 5 159 ASP 159 159 ? ? ? 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