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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5558 ? 36256 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0435 ? 4254 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0035 ? 4643 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.8727 ? 4386 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 9DSL _struct.title 'Structure of the SARS-CoV-2 S 6P trimer in complex with the cow antibody 99 Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9DSL _struct_keywords.text 'immune system, neutralizing antibody, IMMUNE SYSTEM-VIRAL PROTEIN complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM/VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 5 ? 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'expression tag' 1259 165 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 294 ? 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NAG B 1305 ? 1_555 ASN B 603 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 38 NAG Y . ? ASN B 616 ? NAG B 1306 ? 1_555 ASN B 616 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 39 NAG Z . ? ASN B 657 ? NAG B 1307 ? 1_555 ASN B 657 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 40 CYS A 131 ? CYS A 166 ? CYS A 131 ? 1_555 CYS A 166 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 41 CYS A 291 ? CYS A 301 ? CYS A 291 ? 1_555 CYS A 301 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 42 CYS A 336 ? CYS A 361 ? CYS A 336 ? 1_555 CYS A 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 43 CYS A 379 ? CYS A 432 ? CYS A 379 ? 1_555 CYS A 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 44 CYS A 391 ? CYS A 525 ? CYS A 391 ? 1_555 CYS A 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 45 CYS A 480 ? CYS A 488 ? CYS A 480 ? 1_555 CYS A 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 46 CYS A 617 ? CYS A 649 ? CYS A 617 ? 1_555 CYS A 649 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 47 CYS A 662 ? CYS A 671 ? CYS A 662 ? 1_555 CYS A 671 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 48 CYS A 735 ? CYS A 757 ? CYS A 738 ? 1_555 CYS A 760 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 49 CYS A 740 ? CYS A 746 ? CYS A 743 ? 1_555 CYS A 749 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 50 CYS A 1029 ? CYS A 1040 ? CYS A 1032 ? 1_555 CYS A 1043 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 51 CYS A 1079 ? CYS A 1123 ? CYS A 1082 ? 1_555 CYS A 1126 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 52 CYS B 131 ? CYS B 166 ? CYS B 131 ? 1_555 CYS B 166 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 53 CYS B 291 ? CYS B 301 ? CYS B 291 ? 1_555 CYS B 301 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 54 CYS B 336 ? CYS B 361 ? CYS B 336 ? 1_555 CYS B 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 55 CYS B 379 ? CYS B 432 ? CYS B 379 ? 1_555 CYS B 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 56 CYS B 391 ? CYS B 525 ? CYS B 391 ? 1_555 CYS B 525 ? 1_555 SG SG . . . 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None 'Disulfide bridge' 67 CYS C 379 ? CYS C 432 ? CYS C 379 ? 1_555 CYS C 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 68 CYS C 391 ? CYS C 525 ? CYS C 391 ? 1_555 CYS C 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 69 CYS C 480 ? CYS C 488 ? CYS C 480 ? 1_555 CYS C 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 70 CYS C 617 ? CYS C 649 ? CYS C 617 ? 1_555 CYS C 649 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 71 CYS C 662 ? CYS C 671 ? CYS C 662 ? 1_555 CYS C 671 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 72 CYS C 735 ? CYS C 757 ? CYS C 738 ? 1_555 CYS C 760 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 73 CYS C 740 ? CYS C 746 ? CYS C 743 ? 1_555 CYS C 749 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 74 CYS C 1029 ? CYS C 1040 ? CYS C 1032 ? 1_555 CYS C 1043 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 75 CYS C 1079 ? CYS C 1123 ? CYS C 1082 ? 1_555 CYS C 1126 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 76 CYS D 22 ? CYS D 95 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 77 CYS E 22 ? CYS E 89 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 3 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 6 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 28 ? 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