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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.3527 ? 23090 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0390 ? 2720 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0016 ? 2970 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.3829 ? 2390 ? f_dihedral_angle_d ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 7.25827247945e-13 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_1 3.41296270802e-12 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_1 2.94536671407e-12 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_1 3.57856216204e-12 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ens_1 6.59728110829e-13 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' d_7 ens_1 7.93679151406e-13 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' d_8 ens_1 7.01598224636e-13 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 8 'ELECTRON MICROSCOPY' d_9 ens_1 6.04173583348e-13 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? 9 'ELECTRON MICROSCOPY' d_10 ens_1 1.89039082399e-12 ? ? ? 'NCS constraints' H H ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given -0.809096688915 -0.587675435405 0.0003613994542 0.587675278723 -0.809096754306 -0.00045710951125 0.000561039156453 -0.000157460267046 0.999999830221 449.059151023 228.975866653 -0.0976903555649 ? 2 given -0.808892696827 0.587956245537 0.000241565953347 -0.587956266956 -0.808892717013 -2.25925593215e-05 0.000182117503985 -0.000160305172391 0.999999970568 228.757083095 449.158683888 -0.016880622538 ? 3 given -0.3028341417 -0.953042277539 -0.0013783487051 0.953042056517 -0.302835750018 0.00116061222183 -0.00152352577912 -0.000962151278459 0.999998376566 422.975154785 65.4967748148 0.427700482646 ? 4 given -0.308964293688 0.951073576363 0.000342885280702 -0.951073568237 -0.308964389148 0.000272101896071 0.000364728264731 -0.000242039357282 0.999999904195 66.9993292285 423.45448522 -0.0424883948877 ? 5 given 0.309099047134 0.95102981544 0.000263067900526 -0.951029851006 0.309099023569 0.000126979970924 3.94477071272e-05 -0.000289434814259 0.999999957336 -48.7974606575 307.664021681 0.027044116142 ? 6 given 0.809016320248 0.587785441594 -0.00093178419812 -0.587786077963 0.80901609782 -0.000692834862982 0.000346590170084 0.00110820449071 0.999999325879 -74.1682195725 146.06757293 -0.250269088523 ? 7 given -0.999993139476 0.00344938885513 0.00135008062732 -0.00344887627138 -0.999993979717 0.000381813165939 0.00135138952153 0.000377154285461 0.99999901575 373.982681915 375.380162597 -0.336239853301 ? 8 given 0.808915145962 -0.587925300737 -0.000356912722651 0.587925218645 0.808915223505 -0.000313787744751 0.000473195889015 4.39896688442e-05 0.999999887075 146.049710187 -74.3011644184 -0.115280617242 ? 9 given 0.323495430074 -0.946229601877 0.000497245620126 0.946229676122 0.323495547573 0.000175291429073 -0.000326722683305 0.000413802585848 0.99999986101 304.037678956 -50.0432876126 0.0134674698552 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "H" ; ens_1 d_2 ;chain "B" ; ens_1 d_3 ;chain "D" ; ens_1 d_4 ;chain "A" ; ens_1 d_5 ;chain "E" ; ens_1 d_6 ;chain "F" ; ens_1 d_7 ;chain "G" ; ens_1 d_8 ;chain "C" ; ens_1 d_9 ;chain "I" ; ens_1 d_10 ;chain "J" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 H CYS 1 . H ILE 226 . H CYS 22 H ILE 247 ? ? ens_1 d_2 1 B CYS 1 . B ILE 226 . B CYS 22 B ILE 247 ? ? ens_1 d_3 1 D CYS 1 . D ILE 226 . D CYS 22 D ILE 247 ? ? ens_1 d_4 1 A CYS 1 . A ILE 226 . A CYS 22 A ILE 247 ? ? ens_1 d_5 1 E CYS 1 . E ILE 226 . E CYS 22 E ILE 247 ? ? ens_1 d_6 1 F CYS 1 . F ILE 226 . F CYS 22 F ILE 247 ? ? ens_1 d_7 1 G CYS 1 . G ILE 226 . G CYS 22 G ILE 247 ? ? ens_1 d_8 1 C CYS 1 . C ILE 226 . C CYS 22 C ILE 247 ? ? ens_1 d_9 1 I CYS 1 . I ILE 226 . I CYS 22 I ILE 247 ? ? ens_1 d_10 1 J CYS 1 . J ILE 226 . J CYS 22 J ILE 247 ? ? # _struct_ncs_ens.id ens_1 _struct_ncs_ens.details ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_1 d_6 d_1 5 ens_1 d_7 d_1 6 ens_1 d_8 d_1 7 ens_1 d_9 d_1 8 ens_1 d_10 d_1 9 # _struct.entry_id 9E2V _struct.title 'Cryo-EM map of homodecameric TraT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9E2V _struct_keywords.text 'Membrane protein involved in surface exclusion, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code TRAT1_ECOLI _struct_ref.pdbx_db_accession P13979 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;CGAMSTAIKKRNLEVKTQMSETIWLEPASERTVFLQIKNTSDKDMSGLQGKIADAVKAKGYQVVTSPDKAYYWIQANVLK ADKMDLRESQGWLNRGYEGAAVGAALGAGITGYNSNSAGATLGVGLAAGLVGMAADAMVEDVNYTMITDVQIAERTKATV TTDNVAALRQGTSGAKIQTSTETGNQHKYQTRVVSNANKVNLKFEEAKPVLEDQLAKSIANIL ; _struct_ref.pdbx_align_begin 22 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9E2V A 1 ? 223 ? 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The sample eluted with a retention volume indicating a higher order assembly, which was verified by single particle cryo-EM ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 CYS A 1 ? 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