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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.821 ? 470220 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 24.186 ? 129708 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.058 ? 52776 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.011 ? 61656 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9EUJ _struct.title ;Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the post-contraction state - sheath initiator, wedge module, inner tripod, arm segment, and proximal tail sheath proteins ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9EUJ _struct_keywords.text 'bacteriophage, phage, contractile, phi812, baseplate, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0U1WGQ5_9CAUD A0A0U1WGQ5 ? 1 ;MAIATYNSHVELAKYLVSKADSVYLTIGKSTPWSNETNPPQPDENATVLQEVIGYKKATKVTLVRPSKSPEDDNKNLISY GNKSWVEVTPENAKAEGAKWVYLESSIVGDELPLGTYRQVGFVMDLVAKSGISKFNLVPSEVESTGTLLFFDNKQFQNRS EQTTAKERFIVEV ; 1 2 UNP A0A0U1WZ79_9CAUD A0A0U1WZ79 ? 2 ;MAVEPFPRRPITRPHASIEVDTSGIGGSAGSSEKVFCLIGQAEGGEPNTVYELRNYSQAKRLFRSGELLDAIELAWGSNP NYTAGRILAMRIEDAKPASAEIGGLKITSKIYGNVANNIQVGLEKNTLSDSLRLRVIFQDDRFNEVYDNIGNIFTIKYKG EEANATFSVEHDEETQKASRLVLKVGDQEVKSYDLTGGAYDYTNAIITDINQLPDFEAKLSPFGDKNLESSKLDKIENAN IKDKAVYVKAVFGDLEKQTAYNGIVSFEQLNAEGEVPSNVEVEAGEESATVTATSPIKTIEPFELTKLKGGTNGEPPATW ADKLDKFAHEGGYYIVPLSSKQSVHAEVASFVKERSDAGEPMRAIVGGGFNESKEQLFGRQASLSNPRVSLVANSGTFVM DDGRKNHVPAYMVAVALGGLASGLEIGESITFKPLRVSSLDQIYESIDLDELNENGIISIEFVRNRTNTFFRIVDDVTTF NDKSDPVKAEMAVGEANDFLVSELKVQLEDQFIGTRTINTSASIIKDFIQSYLGRKKRDNEIQDFPAEDVQVIVEGNEAR ISMTVYPIRSFKKISVSLVYKQQTLQA ; 1 3 UNP A0A0U1UXD7_9CAUD A0A0U1UXD7 ? 3 ;MRFKKHVVQHEETMQAIAQRYYGDVSYWIDLVEHNNLKYPYLVETDEEKMKDPERLASTGDTLIIPIESDLTDVSAKEIN SRDKDVLVELALGRDLNITADEKYFNEHGTSDNILAFSTNGNGDLDTVKGIDNMKQQLQARLLTPRGSLMLHPNYGSDLH NLFGLNIPEQATLIEMEVLRTLTSDNRVKSANLIDWKIQGNVYSGQFSVEIKSVEESINFVLGQDEEGIFALFE ; 1 4 UNP A0A0U1WF63_9CAUD A0A0U1WF63 ? 4 ;MKTRKLTNILSKLIDKTMAGTSKITDFTPGSASRSLLEAVSLEIEQFYILTKENIDWGIQEGIIEAFDFQKRQSKRAYGD VTIQFYQPLDMRMYIPAGTTFTSTRQEYPQQFETLVDYYAEPDSTEIVVEVYCKETGVAGNVPEGTINTIASGSSLIRSV NNEYSFNTGTKEESQEDFKRRFHSFVESRGRATNKSVRYGALQIPDVEGVYVYEETGHITVFAHDRNGNLSDTLKEDIID ALQDYRPSGIMLDVTGVEKEEVNVSATVTISNKSRIGDTLQKHIESVIRSYLNNLKTSDDLIITDLIQAIMNIDDVLIYD VSFDNLDENIIVPPQGIIRAGEIKVELK ; 1 5 UNP A0A0U1WGD3_9CAUD A0A0U1WGD3 ? 5 ;MANFLKNLHPLLRRDRNKKDNQDPNFALIDALNEEMNQVEKDAIESKLQSSLKTSTSEYLDKFGDWFGVYRKTDEKDDVY RARIIKYLLLKRGTNNAIIDAIKDYLGRDDIDVSVYEPFTNIFYTNKSHLNGEDHLMGYYYRFAVINVSIGDYFPVEIID VINEFKPAGVTLYVTYDGASTIRGGAIIKWLDGLPKIETYQEFDRFTGYDDTFYGHINMNQSKDTDNSSSDIFKTNHSLI NSLDVLTGSSSVGRQYINYGYVTSYVYNPGMTSSVNQISASTEGRGQEVPTDYYMYTSTKNNNTVELSMQTTSGVSYLYN NFNFRDYMSKYRPQVDLQSDEARRIVSDYIKELSIDYYLSAVIPPDESIEIKLQVYDFSINRWLTVSINNLSFYEKNIGS NIGYIKDYLNSELNMFTRLEINAGKRDSVDIKVNYLDLMFYYYERGIYTIKPYKALIENYLDISRETYVEAFKIASLSNG DIITKTGFQPIGYLKLVGNYENTIPSTINIVAKDTDNNPIESNELDVYNTVENRNLLQSYKGVNTIAREITSTKEFTVSG WAKEIYSTNYLSKVLKPGKVYTLSFDMEITGNDPTLKSYSDNHGIYLYSNTKGIVVNGVKSMERTIGNKVSVTQTFTAPT ITDHRLLIYTGRYTSDGKASTPPVFFNTVKITELKLTEGSSKLEYSPAPEDKPNVIEKGIKFNNILTNIQTLSINSDTIL KNVTLYYSYYGDSWVELKTLGNISTGETTETNNLIDLYGLQTVDYSNINPMSKVSLRSIWNVKLGELNNQEGSLSNMPND YFNAVWQDIDKLSDIELGSMRMVKDTEGGVFDGATGEIIKATLFNVGAYTDLDMLAYTLTNYTEPLTLGSSRLISELKEE LLTSESFNVDNRIKVIDSIYEELPNTSIIKNGFVEREVTGSKYLDYGLYEPIEDGTRYKLIVEGEFKDNIEFISLYNSNP NFNETFIYPSEIINGVAEKEFIAKPSTEDKPRLNTDVRIYIRPYDSTISKVRRVELRKV ; 1 6 UNP A0A8E5NSA0_9CAUD A0A8E5NSA0 ? 6 ;MAINFKGSPYLDRFDPSKDRTKVLFNPDRPLQQAELNEMQSIDQYYLKNLGDAIFKDGDKQSGLGFTLSEDNVLTVNPGY VYINGKIRYYDNDDSVKITGVGKETIGIKLTERIVTPDEDASLLDQTSGVPSYFSKGADRLEEKMSLTVNDPTSATIYTF MDGDLYIQSTNAEMDKINKVLAERTYDESGSYKVNGFELFSEGNAEDDDHVSVVVDAGKAYVKGFKVDKPVSTRISVPKS YDLGTAENESTIFNKSNNSISLANSPVKEIRRVTGQVLIEKERVTRGAQGDGQDFLSNNTAFEIVKVWTETSPGVTTKEY KQGEDFRLTDGQTIDWSPQGQEPSGGTSYYVSYKYNKRMEAGKDYEVTTQGEGLSKKWYINFTPSNGAKPIDQTVVLVDY TYYLARKDSVFINKYGDIAILPGEPNIMRLVTPPLNTDPENLQLGTVTVLPDSDEAVCISFAITRLSMEDLQKVKTRVDN LEYNQAVNALDDGAMEGQNPLTLRSVFSEGFISLDKADITHPDFGIVFSFEDAEATLAYTEAVNQPKIIPGDTTAHIWGR LISAPFTEERTIYQGQASETLNVNPYNIPNKQGVLKLTPSEDNWIDTENVTITEQKTKKVTMKRFWRHNESYYGETEHYL YSNLQLDAGQKWKGETYAYDREHGRTGTLLESGGQRTLEEMIEFIRIRDVSFEVKGLNPNDNNLYLLFDGVRCAITPATG YRKGSEDGTIMTDAKGTAKGKFTIPAGIRCGNREVTLKNANSTSATTYTAQGRKKTAQDIIIRTRVTVNLVDPLAQSFQY DENRTISSLGLYFASKGDKQSNVVIQIRGMGDQGYPNKTIYAETVMNADDIKVSNNASAETRVYFDDPMMAEGGKEYAIV IITENSDYTMWVGTRTKPKIDKPNEVISGNPYLQGVLFSSSNASTWTPHQNSDLKFGIYTSKFNETATIEFEPIKDVSAD RIVLMSTYLTPERTGCTWEMKLILDDMASSTTFDQLKWEPIGNYQDLDVLGLARQVKLRATFESNRYISPLMSSSDLTFT TFLTELTGSYVGRAIDMTEAPYNTVRFSYEAFLPKGTKVVPKYSADDGKTWKTFTKSPTTTRANNEFTRYVIDEKVKSSG TNTKLQVRLDLSTENSFLRPRVRRLMVTTRDE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9EUJ H 1 ? 173 ? A0A0U1WGQ5 1 ? 173 ? 1 173 2 2 9EUJ I 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 3 2 9EUJ J 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 4 2 9EUJ K 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 5 2 9EUJ L 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 6 2 9EUJ M 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 7 2 9EUJ N 1 ? 587 ? A0A0U1WZ79 1 ? 587 ? 1 587 8 3 9EUJ A 1 ? 234 ? A0A0U1UXD7 1 ? 234 ? 1 234 9 4 9EUJ B 1 ? 348 ? A0A0U1WF63 1 ? 348 ? 1 348 10 4 9EUJ C 1 ? 348 ? A0A0U1WF63 1 ? 348 ? 1 348 11 5 9EUJ D 1 ? 1019 ? A0A0U1WGD3 1 ? 1019 ? 1 1019 12 6 9EUJ E 1 ? 1152 ? A0A8E5NSA0 1 ? 1152 ? 1 1152 13 6 9EUJ F 1 ? 1152 ? A0A8E5NSA0 1 ? 1152 ? 1 1152 14 6 9EUJ G 1 ? 1152 ? A0A8E5NSA0 1 ? 1152 ? 1 1152 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9EUJ ASP H 174 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 174 1 1 9EUJ PRO H 175 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 175 2 1 9EUJ ASN H 176 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 176 3 1 9EUJ SER H 177 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 177 4 1 9EUJ SER H 178 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 178 5 1 9EUJ SER H 179 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 179 6 1 9EUJ VAL H 180 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 180 7 1 9EUJ ASP H 181 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 181 8 1 9EUJ LYS H 182 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 182 9 1 9EUJ LEU H 183 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 183 10 1 9EUJ ALA H 184 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 184 11 1 9EUJ ALA H 185 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 185 12 1 9EUJ ALA H 186 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 186 13 1 9EUJ LEU H 187 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 187 14 1 9EUJ GLU H 188 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 188 15 1 9EUJ HIS H 189 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 189 16 1 9EUJ HIS H 190 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 190 17 1 9EUJ HIS H 191 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 191 18 1 9EUJ HIS H 192 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 192 19 1 9EUJ HIS H 193 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 193 20 1 9EUJ HIS H 194 ? UNP A0A0U1WGQ5 ? ? 'expression tag' 194 21 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details 'UCSF CHIMERA 1.16_b42360.' _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 14-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 3 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 4 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 5 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 6 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.86602540 0.00000000 519.80000419 0.86602540 0.50000000 0.00000000 -139.28000354 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.86602540 0.00000000 900.32002759 0.86602540 -0.50000000 0.00000000 241.24000321 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 4 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 -0.00000000 0.00000000 761.04004680 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 761.04001350 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 5 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.86602540 0.00000000 241.24004261 -0.86602540 -0.50000000 0.00000000 900.32001704 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 6 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.86602540 0.00000000 -139.27998079 -0.86602540 0.50000000 0.00000000 519.80001029 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 5 ? LYS A 19 ? THR H 5 LYS H 19 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 20 ? SER A 22 ? ALA H 20 SER H 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 89 ? GLU A 91 ? THR H 89 GLU H 91 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 92 ? GLY A 97 ? ASN H 92 GLY H 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 110 ? LEU A 112 ? ASP H 110 LEU H 112 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 AA6 VAL A 138 ? SER A 140 ? VAL H 138 SER H 140 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 22 ? GLY B 26 ? THR I 22 GLY I 26 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN B 55 ? PHE B 63 ? ASN I 55 PHE I 63 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY B 66 ? TRP B 76 ? GLY I 66 TRP I 76 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN B 114 ? ASN B 118 ? ASN I 114 ASN I 118 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 TYR B 202 ? ASN B 211 ? TYR I 202 ASN I 211 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA B 250 ? THR B 259 ? ALA I 250 THR I 259 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 TRP B 320 ? LYS B 326 ? TRP I 320 LYS I 326 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 PHE B 327 ? HIS B 329 ? PHE I 327 HIS I 329 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 LYS B 341 ? ALA B 358 ? 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AN5 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? 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