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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Griffith, S.' 1 ? primary 'Muir, L.' 2 ? primary 'Suchanek, O.' 3 ? primary 'Hope, J.' 4 ? primary 'Pade, C.' 5 ? primary 'Gibbons, G.' 6 ? primary 'Tuong, K.' 7 ? primary 'Fung, A.' 8 ? primary 'Touizer, E.' 9 ? primary 'Rees-Spear, C.' 10 ? primary 'Nans, A.' 11 ? primary 'Roustan, C.' 12 ? primary 'Alguel, Y.' 13 ? primary 'Fink, D.' 14 ? primary 'Orkin, C.' 15 ? primary 'Deayton, J.' 16 ? primary 'Anderson, J.' 17 ? primary 'Gupta, R.K.' 18 ? primary 'Doores, K.J.' 19 ? primary 'Cherepanov, P.' 20 ? primary 'McKnight, A.' 21 ? primary 'Clatworthy, M.' 22 ? primary 'McCoy, L.E.' 23 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Transmembrane protein gp41' 19103.590 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'Envelope glycoprotein gp160' 57945.977 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'ELC07 heavy 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CZ ? B ARG 507 CZ 11 1 Y 1 C ARG 504 ? NH1 ? B ARG 507 NH1 12 1 Y 1 C ARG 504 ? NH2 ? B ARG 507 NH2 13 1 Y 1 G ASN 33 ? CG ? C ASN 38 CG 14 1 Y 1 G ASN 33 ? OD1 ? C ASN 38 OD1 15 1 Y 1 G ASN 33 ? ND2 ? C ASN 38 ND2 16 1 Y 1 G ARG 504 ? CG ? C ARG 507 CG 17 1 Y 1 G ARG 504 ? CD ? C ARG 507 CD 18 1 Y 1 G ARG 504 ? NE ? C ARG 507 NE 19 1 Y 1 G ARG 504 ? CZ ? C ARG 507 CZ 20 1 Y 1 G ARG 504 ? NH1 ? C ARG 507 NH1 21 1 Y 1 G ARG 504 ? NH2 ? C ARG 507 NH2 22 1 Y 1 F LEU 568 ? CG ? D LEU 57 CG 23 1 Y 1 F LEU 568 ? CD1 ? D LEU 57 CD1 24 1 Y 1 F LEU 568 ? CD2 ? D LEU 57 CD2 25 1 Y 1 E LEU 568 ? CG ? E LEU 57 CG 26 1 Y 1 E LEU 568 ? CD1 ? E LEU 57 CD1 27 1 Y 1 E LEU 568 ? CD2 ? E LEU 57 CD2 28 1 Y 1 N ASN 33 ? CG ? L ASN 38 CG 29 1 Y 1 N ASN 33 ? OD1 ? L ASN 38 OD1 30 1 Y 1 N ASN 33 ? ND2 ? L ASN 38 ND2 31 1 Y 1 N ARG 504 ? CG ? L ARG 507 CG 32 1 Y 1 N ARG 504 ? CD ? L ARG 507 CD 33 1 Y 1 N ARG 504 ? NE ? L ARG 507 NE 34 1 Y 1 N ARG 504 ? CZ ? L ARG 507 CZ 35 1 Y 1 N ARG 504 ? NH1 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.483 ? 33537 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 9.896 ? 10143 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 4008 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4179 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9F02 _struct.title 'HIV-1 envelope glycoprotein (BG505 gp140 SOSIP.664) trimer in complex with three copies of ELC07 broadly neutralizing antibody.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9F02 _struct_keywords.text 'HIV-1, envelope glycoprotein, gp140, neutralizing antibody, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 3 ? K N N 4 ? L N N 2 ? M N N 5 ? 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NAG C 601 ? 1_555 ASN C 234 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 20 NAG LA . ? ASN B 396 ? NAG C 602 ? 1_555 ASN C 392 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 21 NAG M . ? ASN B 267 ? NAG e 1 ? 1_555 ASN C 262 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 22 NAG MA . ? ASN B 306 ? NAG C 603 ? 1_555 ASN C 301 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 23 NAG N . ? ASN B 93 ? NAG q 1 ? 1_555 ASN C 88 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 24 NAG NA . ? ASN B 359 ? NAG C 604 ? 1_555 ASN C 355 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 25 NAG O . ? ASN B 281 ? NAG u 1 ? 1_555 ASN C 276 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 26 NAG OA . ? ASN B 343 ? NAG C 605 ? 1_555 ASN C 339 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 27 NAG P . ? ASN B 390 ? NAG B 1 ? 1_555 ASN C 386 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 28 NAG PA . ? ASN B 202 ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 180 F . ? PHE 146 H PRO 181 F ? PRO 147 H 1 -3.92 2 GLU 182 F . ? GLU 148 H PRO 183 F ? PRO 149 H 1 -4.26 3 SER 28 G . ? SER 7 L PRO 29 G ? PRO 8 L 1 -5.84 4 PHE 115 G . ? PHE 94 L PRO 116 G ? PRO 95 L 1 -2.34 5 TYR 161 G . ? TYR 140 L PRO 162 G ? PRO 141 L 1 0.98 6 PHE 180 H . ? 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