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EMDB EMD-50285 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-07-02 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-07-02 ? 3 'Additional map' 1 0 2025-07-02 1 4 FSC 1 0 2025-07-02 ? 5 'Half map' 1 0 2025-07-02 1 6 'Half map' 1 0 2025-07-02 2 7 Image 1 0 2025-07-02 ? 8 Mask 1 0 2025-07-02 1 9 'Primary map' 1 0 2025-07-02 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 'Additional map' repository 'Initial release' ? ? 4 4 FSC repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 7 7 Image repository 'Initial release' ? ? 8 8 Mask repository 'Initial release' ? ? 9 9 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9FAX _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-05-10 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;CryoEM structure of human full-length beta3gamma2 GABA(A) receptor in complex with Megabody25, doubly occupied GARLH4 and Neuroligin2 TMD, in a closed state ; _pdbx_database_related.db_id EMD-50285 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email radu@mrc-lmb.cam.ac.uk _pdbx_contact_author.name_first 'A. 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receptor in complex with Megabody25, doubly occupied GARLH4 and Neuroligin2 TMD, in a closed state ; _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kasaragod, V.B.' 1 0000-0002-1241-4038 primary 'Aricescu, A.R.' 2 0000-0003-3783-1388 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Isoform 2 of Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2' 47870.398 2 ? ? ? ? 2 polymer man Neuroligin-2 3614.107 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein' 20634.434 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3' 50733.375 3 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_refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? 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_refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.697 ? 26690 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.719 ? 3332 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.055 ? 3009 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 3179 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9FAX _struct.title ;CryoEM structure of human full-length beta3gamma2 GABA(A) receptor in complex with Megabody25, doubly occupied GARLH4 and Neuroligin2 TMD, in a closed state ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9FAX _struct_keywords.text 'GABA, Neurotransmission, Ternary complex, Inhibitory synapse, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 7 ? M N N 8 ? N N N 7 ? O N N 9 ? P N N 10 ? Q N N 11 ? R N N 12 ? S N N 12 ? T N N 13 ? U N N 14 ? V N N 12 ? W N N 15 ? X N N 15 ? Y N N 13 ? Z N N 16 ? AA N N 16 ? BA N N 17 ? CA N N 16 ? DA N N 17 ? EA N N 18 ? FA N N 16 ? GA N N 16 ? HA N N 16 ? IA N N 16 ? JA N N 16 ? KA N N 17 ? LA N N 18 ? MA N N 17 ? NA N N 17 ? OA N N 16 ? PA N N 16 ? QA N N 18 ? RA N N 16 ? SA N N 16 ? TA N N 11 ? UA N N 12 ? VA N N 12 ? WA N N 18 ? XA N N 18 ? YA N N 16 ? ZA N N 14 ? AB N N 15 ? BB N N 15 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GBRG2_HUMAN P18507 P18507-1 1 ;GDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHTDMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVG KIWIPDTFFRNSKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYPREEIVYQWK RSSVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRRMGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPA RTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSYVTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVSNRKPSKDKDKKKKNPAPTIDIR PRSATIQMNNATHLQERDEEYGYECLDGKDCASFFCCFEDCRTGAWRHGRIHIRIAKMDSYARIFFPTAFCLFNLVYWVS YLYL ; 64 2 UNP NLGN2_HUMAN Q8NFZ4 ? 2 DSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNILAFAALYYK 668 3 UNP LHPL4_HUMAN Q7Z7J7 ? 3 ;MRNSRAIGVLWAIFTICFAIINVVVFIQPYWVGDSVSTPKPGYFGLFHYCVGSGLAGRELTCRGSFTDFSTIPSSAFKAA AFFVLLSMVLILGCITCFSLFFFCNTATVYKICAWMQLLAALCLVLGCMIFPDGWDAETIRDMCGAKTGKYSLGDCSVRW AYILAIIGILNALILSFLAFVLGNRQTD ; 16 4 UNP GBRB3_HUMAN P28472 ? 4 ;MSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVA DQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYW RGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASA ARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDR SKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSS QLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYV ; 34 5 PDB 9FAX 9FAX ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9FAX E 1 ? 404 ? P18507 64 ? 467 ? 25 428 2 2 9FAX G 1 ? 33 ? Q8NFZ4 668 ? 700 ? 668 700 3 3 9FAX I 1 ? 188 ? Q7Z7J7 16 ? 203 ? 16 203 4 4 9FAX B 1 ? 439 ? P28472 34 ? 472 ? 9 447 5 4 9FAX A 1 ? 439 ? P28472 34 ? 472 ? 9 447 6 4 9FAX D 1 ? 439 ? P28472 34 ? 472 ? 9 447 7 1 9FAX C 1 ? 404 ? P18507 64 ? 467 ? 25 428 8 2 9FAX H 1 ? 33 ? Q8NFZ4 668 ? 700 ? 668 700 9 3 9FAX L 1 ? 188 ? Q7Z7J7 16 ? 203 ? 16 203 10 5 9FAX F 1 ? 522 ? 9FAX 1 ? 522 ? 1 522 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 9FAX GLY E 405 ? UNP P18507 ? ? 'expression tag' 429 1 7 9FAX GLY C 405 ? UNP P18507 ? ? 'expression tag' 429 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 1 ? GLU A 12 ? GLY E 25 GLU E 36 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 77 ? LYS A 81 ? ASN E 101 LYS E 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 130 ? PHE A 134 ? GLN E 154 PHE E 158 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 168 ? TRP A 172 ? ASP E 192 TRP E 196 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 MET A 209 ? THR A 216 ? MET E 233 THR E 240 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 216 ? VAL A 229 ? THR E 240 VAL E 253 1 ? 14 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 230 ? ILE A 233 ? SER E 254 ILE E 257 5 ? 4 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA A 237 ? ARG A 260 ? ALA E 261 ARG E 284 1 ? 24 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 270 ? SER A 298 ? THR E 294 SER E 322 1 ? 29 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 350 ? PHE A 355 ? ASP E 374 PHE E 379 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 HIS A 372 ? ALA A 376 ? HIS E 396 ALA E 400 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS A 377 ? TYR A 403 ? LYS E 401 TYR E 427 1 ? 27 HELX_P HELX_P13 AB4 TYR B 5 ? TYR B 32 ? TYR G 672 TYR G 699 1 ? 28 HELX_P HELX_P14 AB5 ARG C 2 ? GLN C 28 ? ARG I 17 GLN I 43 1 ? 27 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP C 68 ? ILE C 72 ? 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LYS B 279 GLY B 308 1 ? 30 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN D 413 ? TYR D 438 ? ASN B 421 TYR B 446 1 ? 26 HELX_P HELX_P31 AD4 SER E 2 ? LYS E 13 ? SER A 10 LYS A 21 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 LYS E 62 ? ALA E 65 ? LYS A 70 ALA A 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP E 76 ? LEU E 83 ? ASP A 84 LEU A 91 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP E 131 ? TYR E 135 ? ASP A 139 TYR A 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY E 162 ? LYS E 165 ? GLY A 170 LYS A 173 5 ? 4 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY E 211 ? THR E 217 ? GLY A 219 THR A 225 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 THR E 217 ? VAL E 230 ? THR A 225 VAL A 238 1 ? 14 HELX_P HELX_P38 AE2 SER E 231 ? TRP E 233 ? SER A 239 TRP A 241 5 ? 3 HELX_P HELX_P39 AE3 ALA E 238 ? GLU E 262 ? ALA A 246 GLU A 270 1 ? 25 HELX_P HELX_P40 AE4 LYS E 271 ? PHE E 298 ? LYS A 279 PHE A 306 1 ? 28 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN E 413 ? VAL E 439 ? ASN A 421 VAL A 447 1 ? 27 HELX_P HELX_P42 AE6 SER F 2 ? LYS F 13 ? SER D 10 LYS D 21 1 ? 12 HELX_P HELX_P43 AE7 LYS F 62 ? ALA F 65 ? 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MET C 233 ILE C 257 1 ? 25 HELX_P HELX_P58 AG4 ALA G 237 ? ILE G 258 ? ALA C 261 ILE C 282 1 ? 22 HELX_P HELX_P59 AG5 ALA G 259 ? SER G 262 ? ALA C 283 SER C 286 5 ? 4 HELX_P HELX_P60 AG6 THR G 270 ? ARG G 300 ? THR C 294 ARG C 324 1 ? 31 HELX_P HELX_P61 AG7 ASP G 350 ? P1L G 356 ? ASP C 374 P1L C 380 1 ? 7 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG G 374 ? ALA G 376 ? ARG C 398 ALA C 400 5 ? 3 HELX_P HELX_P63 AG9 LYS G 377 ? TYR G 403 ? LYS C 401 TYR C 427 1 ? 27 HELX_P HELX_P64 AH1 TYR H 5 ? TYR H 32 ? TYR H 672 TYR H 699 1 ? 28 HELX_P HELX_P65 AH2 ARG I 2 ? GLN I 28 ? ARG L 17 GLN L 43 1 ? 27 HELX_P HELX_P66 AH3 SER I 74 ? PHE I 101 ? SER L 89 PHE L 116 1 ? 28 HELX_P HELX_P67 AH4 ASN I 105 ? PHE I 131 ? ASN L 120 PHE L 146 1 ? 27 HELX_P HELX_P68 AH5 PRO I 132 ? ASP I 136 ? PRO L 147 ASP L 151 5 ? 5 HELX_P HELX_P69 AH6 ALA I 137 ? GLY I 145 ? ALA L 152 GLY L 160 1 ? 9 HELX_P HELX_P70 AH7 ARG I 159 ? ARG I 185 ? ARG L 174 ARG L 200 1 ? 27 HELX_P HELX_P71 AH8 LYS J 474 ? THR J 478 ? LYS F 474 THR F 478 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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I CYS 94 SG ? ? ? 1_555 I CYS 113 SG ? ? L CYS 109 L CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf11 disulf ? ? I CYS 144 SG ? ? ? 1_555 I CYS 156 SG ? ? L CYS 159 L CYS 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? J CYS 409 SG ? ? ? 1_555 J CYS 483 SG ? ? F CYS 409 F CYS 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? A ASN 184 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? E ASN 208 E NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? N-Glycosylation covale2 covale both ? A PHE 355 C ? ? ? 1_555 A P1L 356 N ? ? E PHE 379 E P1L 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale3 covale both ? A P1L 356 C ? ? ? 1_555 A P1L 357 N ? ? E P1L 380 E P1L 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale4 covale both ? A P1L 357 C ? ? ? 1_555 A PHE 358 N ? ? E P1L 381 E PHE 382 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale5 covale both ? A ASP 360 C ? ? ? 1_555 A P1L 361 N ? ? E ASP 384 E P1L 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale6 covale one ? D ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 80 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? D ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 149 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? E ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 80 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? E ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 149 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? F ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? D ASN 80 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? G ASN 184 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 208 C NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale12 covale both ? G PHE 355 C ? ? ? 1_555 G P1L 356 N ? ? C PHE 379 C P1L 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale13 covale both ? G P1L 356 C ? ? ? 1_555 G P1L 357 N ? ? C P1L 380 C P1L 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale14 covale both ? G P1L 357 C ? ? ? 1_555 G PHE 358 N ? ? C P1L 381 C PHE 382 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale15 covale both ? G ASP 360 C ? ? ? 1_555 G P1L 361 N ? ? C ASP 384 C P1L 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale16 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? ? covale17 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale18 covale both ? K BMA . O6 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale19 covale both ? K BMA . O3 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale20 covale both ? K MAN . O3 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale21 covale both ? K MAN . O6 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale22 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? ? covale23 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale24 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale25 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale26 covale both ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale27 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale28 covale both ? M MAN . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M MAN 4 M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale29 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? ? covale30 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale31 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale32 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale33 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale34 covale both ? P BMA . O3 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale35 covale both ? P BMA . O6 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 100 A . ? ILE 124 E THR 101 A ? THR 125 E 1 -7.38 2 PHE 134 A . ? PHE 158 E PRO 135 A ? PRO 159 E 1 0.90 3 VAL 101 D . ? VAL 109 B THR 102 D ? 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P1L C7 C8 sing N N 452 P1L C8 C9 sing N N 453 P1L C8 H8C1 sing N N 454 P1L C8 H8C2 sing N N 455 P1L C9 C10 sing N N 456 P1L C9 H9C1 sing N N 457 P1L C9 H9C2 sing N N 458 P1L C10 C11 sing N N 459 P1L C10 H101 sing N N 460 P1L C10 H102 sing N N 461 P1L C11 C12 sing N N 462 P1L C11 H111 sing N N 463 P1L C11 H112 sing N N 464 P1L C12 C13 sing N N 465 P1L C12 H121 sing N N 466 P1L C12 H122 sing N N 467 P1L C13 C14 sing N N 468 P1L C13 H131 sing N N 469 P1L C13 H132 sing N N 470 P1L C14 C15 sing N N 471 P1L C14 H141 sing N N 472 P1L C14 H142 sing N N 473 P1L C15 C16 sing N N 474 P1L C15 H151 sing N N 475 P1L C15 H152 sing N N 476 P1L C16 C17 sing N N 477 P1L C16 H161 sing N N 478 P1L C16 H162 sing N N 479 P1L C17 C18 sing N N 480 P1L C17 H171 sing N N 481 P1L C17 H172 sing N N 482 P1L C18 C19 sing N N 483 P1L C18 H181 sing N N 484 P1L C18 H182 sing N N 485 P1L C19 C20 sing N N 486 P1L C19 H191 sing N N 487 P1L C19 H192 sing N N 488 P1L C20 C21 sing N N 489 P1L C20 H201 sing N N 490 P1L C20 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N 531 PGW C4 H4 sing N N 532 PGW C4 H4A sing N N 533 PGW O04 C19 doub N N 534 PGW C05 H05 sing N N 535 PGW C5 C6 sing N N 536 PGW C5 H5 sing N N 537 PGW C5 H5A sing N N 538 PGW C06 C07 sing N N 539 PGW C06 H06 sing N N 540 PGW C06 H06A sing N N 541 PGW C6 C7 sing N N 542 PGW C6 H6 sing N N 543 PGW C6 H6A sing N N 544 PGW C07 H07 sing N N 545 PGW C07 H07A sing N N 546 PGW C7 C8 sing N N 547 PGW C7 H7 sing N N 548 PGW C7 H7A sing N N 549 PGW C08 C07 sing N N 550 PGW C08 H08 sing N N 551 PGW C08 H08A sing N N 552 PGW C8 C9 sing N N 553 PGW C8 H8 sing N N 554 PGW C8 H8A sing N N 555 PGW C09 C08 sing N N 556 PGW C09 C11 sing N N 557 PGW C09 H09 sing N N 558 PGW C09 H09A sing N N 559 PGW C9 C10 doub N Z 560 PGW C10 C06 sing N N 561 PGW C11 H11 sing N N 562 PGW C11 H11A sing N N 563 PGW O11 C03 sing N N 564 PGW C12 C11 sing N N 565 PGW C12 H12 sing N N 566 PGW C12 H12A sing N N 567 PGW O12 P sing N N 568 PGW C13 C12 sing N N 569 PGW C13 C14 sing N N 570 PGW C13 H13 sing N N 571 PGW C13 H13A 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sing N N 653 PLM C2 C3 sing N N 654 PLM C2 H21 sing N N 655 PLM C2 H22 sing N N 656 PLM C3 C4 sing N N 657 PLM C3 H31 sing N N 658 PLM C3 H32 sing N N 659 PLM C4 C5 sing N N 660 PLM C4 H41 sing N N 661 PLM C4 H42 sing N N 662 PLM C5 C6 sing N N 663 PLM C5 H51 sing N N 664 PLM C5 H52 sing N N 665 PLM C6 C7 sing N N 666 PLM C6 H61 sing N N 667 PLM C6 H62 sing N N 668 PLM C7 C8 sing N N 669 PLM C7 H71 sing N N 670 PLM C7 H72 sing N N 671 PLM C8 C9 sing N N 672 PLM C8 H81 sing N N 673 PLM C8 H82 sing N N 674 PLM C9 CA sing N N 675 PLM C9 H91 sing N N 676 PLM C9 H92 sing N N 677 PLM CA CB sing N N 678 PLM CA HA1 sing N N 679 PLM CA HA2 sing N N 680 PLM CB CC sing N N 681 PLM CB HB1 sing N N 682 PLM CB HB2 sing N N 683 PLM CC CD sing N N 684 PLM CC HC1 sing N N 685 PLM CC HC2 sing N N 686 PLM CD CE sing N N 687 PLM CD HD1 sing N N 688 PLM CD HD2 sing N N 689 PLM CE CF sing N N 690 PLM CE HE1 sing N N 691 PLM CE HE2 sing N N 692 PLM CF CG sing N N 693 PLM CF HF1 sing N N 694 PLM CF HF2 sing N 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PX2 C6 H10 sing N N 739 PX2 C7 C8 sing N N 740 PX2 C7 H11 sing N N 741 PX2 C7 H12 sing N N 742 PX2 C8 C9 sing N N 743 PX2 C8 H13 sing N N 744 PX2 C8 H14 sing N N 745 PX2 C9 C10 sing N N 746 PX2 C9 H15 sing N N 747 PX2 C9 H16 sing N N 748 PX2 C10 C11 sing N N 749 PX2 C10 H17 sing N N 750 PX2 C10 H18 sing N N 751 PX2 C11 C12 sing N N 752 PX2 C11 H19 sing N N 753 PX2 C11 H20 sing N N 754 PX2 C12 C13 sing N N 755 PX2 C12 H21 sing N N 756 PX2 C12 H22 sing N N 757 PX2 C13 C14 sing N N 758 PX2 C13 H23 sing N N 759 PX2 C13 H24 sing N N 760 PX2 C14 C15 sing N N 761 PX2 C14 H25 sing N N 762 PX2 C14 H26 sing N N 763 PX2 C15 H27 sing N N 764 PX2 C15 H28 sing N N 765 PX2 C15 H29 sing N N 766 PX2 O7 C16 sing N N 767 PX2 C16 O8 doub N N 768 PX2 C16 C17 sing N N 769 PX2 C17 C18 sing N N 770 PX2 C17 H30 sing N N 771 PX2 C17 H31 sing N N 772 PX2 C18 C19 sing N N 773 PX2 C18 H32 sing N N 774 PX2 C18 H33 sing N N 775 PX2 C19 C20 sing N N 776 PX2 C19 H34 sing N N 777 PX2 C19 H35 sing N N 778 PX2 C20 C21 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