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full-length alpha1beta3gamma2 GABA(A) receptor in SMALPs without PIP2 and in complex with Mb38' _citation.year ? _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Mihaylov, D.B.' 1 0000-0002-8375-3360 primary 'Malinauskas, T.' 2 0000-0002-4847-5529 primary 'Aricescu, A.R.' 3 0000-0003-3783-1388 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1' 52916.602 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3' 54444.578 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2' 56922.055 1 ? ? ? ? 4 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THR F 513 TYR F 517 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 174 SG ? ? ? 1_555 A CYS 188 SG ? ? A CYS 139 A CYS 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 161 SG ? ? ? 1_555 B CYS 175 SG ? ? B CYS 136 B CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 190 SG ? ? ? 1_555 C CYS 204 SG ? ? C CYS 151 C CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 174 SG ? ? ? 1_555 D CYS 188 SG ? ? D CYS 139 D CYS 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 161 SG ? ? ? 1_555 E CYS 175 SG ? ? E CYS 136 E CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 428 SG ? ? ? 1_555 F CYS 501 SG ? ? F CYS 429 F CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? A ASN 146 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 111 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 80 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 149 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 247 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? C ASN 208 C NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? D ASN 146 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? D ASN 111 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? E ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? E ASN 80 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? E ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? E ASN 149 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale8 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale9 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale10 covale both ? G BMA . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a BMA 3 a MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale11 covale both ? G BMA . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a BMA 3 a MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale12 covale both ? G MAN . O2 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a MAN 4 a MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale13 covale both ? G MAN . O2 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a MAN 5 a MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale14 covale both ? G MAN . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a MAN 7 a MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale15 covale both ? G MAN . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a MAN 7 a MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale16 covale both ? G MAN . O2 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? a MAN 8 a MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale17 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale18 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale19 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale20 covale both ? I BMA . O6 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale21 covale both ? I BMA . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale22 covale both ? I MAN . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G MAN 4 G MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale23 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale24 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale25 covale both ? J BMA . O3 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale26 covale both ? J BMA . O6 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale27 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale28 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale29 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? H NAG 2 H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale30 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? H BMA 3 H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale31 covale both ? L BMA . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? H BMA 3 H MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale32 covale both ? L MAN . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? H MAN 4 H MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG G . ? ASN A 146 ? NAG a 1 ? 1_555 ASN A 111 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG H . ? ASN B 105 ? NAG b 1 ? 1_555 ASN B 80 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG I . ? ASN B 174 ? NAG G 1 ? 1_555 ASN B 149 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG J . ? ASN D 146 ? NAG d 1 ? 1_555 ASN D 111 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG K . ? ASN E 105 ? NAG e 1 ? 1_555 ASN E 80 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 NAG L . ? ASN E 174 ? NAG H 1 ? 1_555 ASN E 149 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 7 NAG M . ? ASN C 247 ? NAG C 501 ? 1_555 ASN C 208 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 8 CYS A 174 ? CYS A 188 ? CYS A 139 ? 1_555 CYS A 153 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS B 161 ? CYS B 175 ? CYS B 136 ? 1_555 CYS B 150 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS C 190 ? CYS C 204 ? CYS C 151 ? 1_555 CYS C 165 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS D 174 ? CYS D 188 ? CYS D 139 ? 1_555 CYS D 153 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS E 161 ? CYS E 175 ? CYS E 136 ? 1_555 CYS E 150 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS F 428 ? CYS F 501 ? CYS F 429 ? 1_555 CYS F 502 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 MET 147 A . ? MET 112 A THR 148 A ? THR 113 A 1 -0.28 2 PHE 181 A . ? PHE 146 A PRO 182 A ? PRO 147 A 1 -1.50 3 VAL 134 B . ? VAL 109 B THR 135 B ? THR 110 B 1 -1.17 4 TYR 168 B . ? TYR 143 B PRO 169 B ? PRO 144 B 1 4.76 5 ILE 163 C . ? ILE 124 C THR 164 C ? THR 125 C 1 -0.47 6 PHE 197 C . ? PHE 158 C PRO 198 C ? PRO 159 C 1 -0.35 7 MET 147 D . ? MET 112 D THR 148 D ? THR 113 D 1 -2.44 8 PHE 181 D . ? PHE 146 D PRO 182 D ? PRO 147 D 1 -1.29 9 VAL 134 E . ? VAL 109 E THR 135 E ? THR 110 E 1 0.87 10 TYR 168 E . ? TYR 143 E PRO 169 E ? PRO 144 E 1 1.92 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 8 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 10 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 8 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 1 7 ? parallel AA1 1 8 ? parallel AA1 2 6 ? anti-parallel AA1 3 5 ? anti-parallel AA1 4 6 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 1 3 ? anti-parallel AA3 1 9 ? parallel AA3 1 10 ? parallel AA3 2 8 ? anti-parallel AA3 3 7 ? anti-parallel AA3 4 6 ? anti-parallel AA3 5 8 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 3 ? anti-parallel AA4 2 5 ? anti-parallel AA4 3 5 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 3 ? anti-parallel AA5 1 7 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 6 ? anti-parallel AA5 4 6 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 3 ? anti-parallel AA6 2 5 ? anti-parallel AA6 3 5 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 3 ? anti-parallel AA7 1 7 ? parallel AA7 1 8 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 6 ? anti-parallel AA7 4 6 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 3 ? anti-parallel AA8 2 5 ? anti-parallel AA8 3 5 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 1 4 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 4 6 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 74 ? SER A 89 ? THR A 39 SER A 54 AA1 2 GLU A 94 ? LYS A 106 ? GLU A 59 LYS A 71 AA1 3 VAL A 118 ? ARG A 120 ? VAL A 83 ARG A 85 AA1 4 VAL A 143 ? ALA A 144 ? VAL A 108 ALA A 109 AA1 5 LYS A 152 ? THR A 157 ? LYS A 117 THR A 122 AA1 6 THR A 161 ? GLU A 173 ? THR A 126 GLU A 138 AA1 7 VAL A 202 ? TRP A 206 ? VAL A 167 TRP A 171 AA1 8 VAL A 214 ? VAL A 216 ? VAL A 179 VAL A 181 AA2 1 PHE A 135 ? PHE A 136 ? PHE A 100 PHE A 101 AA2 2 ALA A 185 ? GLY A 193 ? ALA A 150 GLY A 158 AA2 3 GLU A 244 ? ARG A 256 ? GLU A 209 ARG A 221 AA2 4 TYR A 226 ? GLN A 239 ? TYR A 191 GLN A 204 AA3 1 VAL B 61 ? SER B 76 ? VAL B 36 SER B 51 AA3 2 ASP B 81 ? MET B 86 ? ASP B 56 MET B 61 AA3 3 GLN B 89 ? ARG B 93 ? GLN B 64 ARG B 68 AA3 4 THR B 107 ? LEU B 108 ? THR B 82 LEU B 83 AA3 5 ASP B 126 ? LYS B 128 ? ASP B 101 LYS B 103 AA3 6 ARG B 139 ? LEU B 143 ? ARG B 114 LEU B 118 AA3 7 THR B 148 ? LEU B 153 ? THR B 123 LEU B 128 AA3 8 ILE B 155 ? ALA B 160 ? ILE B 130 ALA B 135 AA3 9 ILE B 189 ? TRP B 193 ? 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