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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.951 ? 9425 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.929 ? 1001 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.054 ? 1020 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 1203 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 9FHB _struct.title 'Cryo-EM structure of human CD163 SRCR2-4 in complex with haptoglobin-hemoglobin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9FHB _struct_keywords.text 'Scavenging receptor, oxygen transport, complex, hemolysis, inflammation, ENDOCYTOSIS' _struct_keywords.pdbx_keywords ENDOCYTOSIS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 7 ? K N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP HBA_HUMAN P69905 ? 1 ;MVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNA LSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR ; 1 2 UNP HBB_HUMAN P68871 ? 2 ;MVHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLD NLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH ; 1 3 UNP HPT_HUMAN P00738 ? 3 ;MSALGAVIALLLWGQLFAVDSGNDVTDIADDGCPKPPEIAHGYVEHSVRYQCKNYYKLRTEGDGVYTLNDKKQWINKAVG DKLPECEADDGCPKPPEIAHGYVEHSVRYQCKNYYKLRTEGDGVYTLNNEKQWINKAVGDKLPECEAVCGKPKNPANPVQ RILGGHLDAKGSFPWQAKMVSHHNLTTGATLINEQWLLTTAKNLFLNHSENATAKDIAPTLTLYVGKKQLVEIEKVVLHP NYSQVDIGLIKLKQKVSVNERVMPICLPSKDYAEVGRVGYVSGWGRNANFKFTDHLKYVMLPVADQDQCIRHYEGSTVPE KKTPKSPVGVQPILNEHTFCAGMSKYQEDTCYGDAGSAFAVHDLEEDTWYATGILSFDKSCAVAEYGVYVKVTSIQDWVQ KTIAEN ; 1 4 UNP C163A_HUMAN Q86VB7 ? 4 ;MSKLRMVLLEDSGSADFRRHFVNLSPFTITVVLLLSACFVTSSLGGTDKELRLVDGENKCSGRVEVKVQEEWGTVCNNGW SMEAVSVICNQLGCPTAIKAPGWANSSAGSGRIWMDHVSCRGNESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMR LTRGGNMCSGRIEIKFQGRWGTVCDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFSGSSNFGEGSGPIWFDDLICNGNESALWNCKH QGWGKHNCDHAEDAGVICSKGADLSLRLVDGVTECSGRLEVRFQGEWGTICDDGWDSYDAAVACKQLGCPTAVTAIGRVN ASKGFGHIWLDSVSCQGHEPAIWQCKHHEWGKHYCNHNEDAGVTCSDGSDLELRLRGGGSRCAGTVEVEIQRLLGKVCDR GWGLKEADVVCRQLGCGSALKTSYQVYSKIQATNTWLFLSSCNGNETSLWDCKNWQWGGLTCDHYEEAKITCSAHREPRL VGGDIPCSGRVEVKHGDTWGSICDSDFSLEAASVLCRELQCGTVVSILGGAHFGEGNGQIWAEEFQCEGHESHLSLCPVA PRPEGTCSHSRDVGVVCSRYTEIRLVNGKTPCEGRVELKTLGAWGSLCNSHWDIEDAHVLCQQLKCGVALSTPGGARFGK GNGQIWRHMFHCTGTEQHMGDCPVTALGASLCPSEQVASVICSGNQSQTLSSCNSSSLGPTRPTIPEESAVACIESGQLR LVNGGGRCAGRVEIYHEGSWGTICDDSWDLSDAHVVCRQLGCGEAINATGSAHFGEGTGPIWLDEMKCNGKESRIWQCHS HGWGQQNCRHKEDAGVICSEFMSLRLTSEASREACAGRLEVFYNGAWGTVGKSSMSETTVGVVCRQLGCADKGKINPASL DKAMSIPMWVDNVQCPKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSCSGRVEIWHGGSWGTVCDDSWDL DDAQVVCQQLGCGPALKAFKEAEFGQGTGPIWLNEVKCKGNESSLWDCPARRWGHSECGHKEDAAVNCTDISVQKTPQKA TTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKRRQRQRLAVSSRGENLVHQIQYREMNSCLNADDLDLMNSSENSHES ADFSAAELISVSKFLPISGMEKEAILSHTEKENGNL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9FHB A 1 ? 142 ? P69905 1 ? 142 ? 0 141 2 2 9FHB B 1 ? 147 ? P68871 1 ? 147 ? 0 146 3 3 9FHB C 1 ? 406 ? P00738 1 ? 406 ? 1 406 4 4 9FHB D 1 ? 1156 ? Q86VB7 1 ? 1156 ? 1 1156 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'surface plasmon resonance' 'not applicable' 2 1 'gel filtration' ? 3 1 'electron microscopy' ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 4 ? GLY A 19 ? SER A 3 GLY A 18 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 HIS A 21 ? PHE A 37 ? HIS A 20 PHE A 36 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 38 ? PHE A 44 ? PRO A 37 PHE A 43 5 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 53 ? HIS A 73 ? SER A 52 HIS A 72 1 ? 21 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 76 ? LEU A 81 ? ASP A 75 LEU A 80 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 81 ? LYS A 91 ? LEU A 80 LYS A 90 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO A 96 ? LEU A 114 ? PRO A 95 LEU A 113 1 ? 19 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 119 ? THR A 138 ? THR A 118 THR A 137 1 ? 20 HELX_P HELX_P9 AA9 THR B 5 ? GLY B 17 ? THR B 4 GLY B 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU B 23 ? TYR B 36 ? GLU B 22 TYR B 35 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO B 37 ? GLY B 47 ? PRO B 36 GLY B 46 5 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 THR B 51 ? ASN B 58 ? THR B 50 ASN B 57 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN B 58 ? ALA B 77 ? ASN B 57 ALA B 76 1 ? 20 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN B 81 ? PHE B 86 ? ASN B 80 PHE B 85 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 PHE B 86 ? LYS B 96 ? PHE B 85 LYS B 95 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO B 101 ? GLY B 120 ? PRO B 100 GLY B 119 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS B 121 ? PHE B 123 ? LYS B 120 PHE B 122 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 THR B 124 ? ALA B 143 ? THR B 123 ALA B 142 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 THR C 200 ? PHE C 205 ? THR C 200 PHE C 205 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 THR C 213 ? ALA C 218 ? THR C 213 ALA C 218 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP C 305 ? GLU C 314 ? ASP C 305 GLU C 314 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL C 318 ? LYS C 322 ? VAL C 318 LYS C 322 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ILE C 395 ? GLU C 405 ? ILE C 395 GLU C 405 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN D 189 ? LEU D 200 ? ASN D 189 LEU D 200 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA D 234 ? CYS D 238 ? ALA D 234 CYS D 238 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP D 249 ? ASP D 253 ? ASP D 249 ASP D 253 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 SER D 259 ? ASP D 263 ? SER D 259 ASP D 263 1 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP D 296 ? GLY D 308 ? ASP D 296 GLY D 308 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA D 341 ? CYS D 345 ? ALA D 341 CYS D 345 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY D 403 ? LEU D 414 ? GLY D 403 LEU D 414 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 SER D 448 ? CYS D 452 ? SER D 448 CYS D 452 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? C CYS 149 SG ? ? ? 1_555 C CYS 266 SG ? ? C CYS 149 C CYS 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? disulf2 disulf ? ? C CYS 309 SG ? ? ? 1_555 C CYS 340 SG ? ? C CYS 309 C CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 351 SG ? ? ? 1_555 C CYS 381 SG ? ? C CYS 351 C CYS 381 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 168 SG ? ? ? 1_555 D CYS 202 SG ? ? D CYS 168 D CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf5 disulf ? ? D CYS 184 SG ? ? ? 1_555 D CYS 248 SG ? ? D CYS 184 D CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 197 SG ? ? ? 1_555 D CYS 258 SG ? ? D CYS 197 D CYS 258 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 228 SG ? ? ? 1_555 D CYS 238 SG ? ? D CYS 228 D CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 275 SG ? ? ? 1_555 D CYS 309 SG ? ? D CYS 275 D CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 291 SG ? ? ? 1_555 D CYS 355 SG ? ? D CYS 291 D CYS 355 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf10 disulf ? ? D CYS 304 SG ? ? ? 1_555 D CYS 365 SG ? ? D CYS 304 D CYS 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? D CYS 335 SG ? ? ? 1_555 D CYS 345 SG ? ? D CYS 335 D CYS 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 382 SG ? ? ? 1_555 D CYS 416 SG ? ? D CYS 382 D CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 398 SG ? ? ? 1_555 D CYS 462 SG ? ? D CYS 398 D CYS 462 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 411 SG ? ? ? 1_555 D CYS 472 SG ? ? D CYS 411 D CYS 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 442 SG ? ? ? 1_555 D CYS 452 SG ? ? D CYS 442 D CYS 452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? C ASN 184 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? C ASN 184 C NAG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 241 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? C ASN 241 C NAG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 320 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? D ASN 320 D NAG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation metalc1 metalc ? ? A HIS 88 NE2 ? ? ? 1_555 E HEM . FE ? ? A HIS 87 A HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? ? metalc2 metalc ? ? B HIS 93 NE2 ? ? ? 1_555 F HEM . FE ? ? B HIS 92 B HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? metalc3 metalc ? ? D ASP 186 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? D ASP 186 D CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? ? metalc4 metalc ? ? D ASP 224 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? D ASP 224 D CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? ? metalc5 metalc ? ? D ASP 224 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? D ASP 224 D CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? ? metalc6 metalc ? ? D ASP 225 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? D ASP 225 D CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? ? metalc7 metalc ? ? D ASN 247 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? D ASN 247 D CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? ? metalc8 metalc ? ? D GLY 294 O ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? D GLY 294 D CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? ? metalc9 metalc ? ? D ASP 296 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? D ASP 296 D CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? ? metalc10 metalc ? ? D ASP 299 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? D ASP 299 D CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.370 ? ? metalc11 metalc ? ? D VAL 333 O ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? 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