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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8379 ? 20564 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0462 ? 2322 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0065 ? 2616 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.7199 ? 5482 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 9G8R _struct.title 'human SKI7-SKI238 complex in the open state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9G8R _struct_keywords.text 'Helicase, RNA-binding, RNA-degradation, cytoplasm, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SKI3_HUMAN Q6PGP7 ? 1 ;MSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKTVLKQEKNNYNAWVFIGVAAAELEQPDQAQSAYKKAAELEPDQLLAWQGL ANLYEKYNHINAKDDLPGVYQKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHLEVARTWHKLIKTRQEQGAENEELHQLW RKLTQFLAESTEDQNNETQQLLFTAFENALGLSDKIPSEDHQVLYRHFIQSLSKFPHESARLKKACEGMINIYPTVQYPL EVLCLHLIESGNLTDEGQQYCCRLVEMDSKSGPGLIGLGIKALQDKKYEDAVRNLTEGLKESPVCTSGWYHLAEAQVKMH RPKEAVLSCSQALKIVDNLGASGNSLYQRNLCLHLKAEALIKLSDYDSSEEAIRTLDQISDADNIPGLLVLKSLAYRNKG SFDEAAKIMEDLLSSYPDLAEVHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQRALEKDTEVAEYHYQLGLTYWFMGEETRKDKTKALT HFLKAARLDTYMGKVFCYLGHYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEDMEMALAILTTVTQKASA GTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNCWESLGEAYLSRGGYTTALKSFTKASELNPESIYSVFKVAA IQQILGKYKEAVAQYQMIIKKKEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYIEKALEYFTCALQHRADVSCLWKLA GDACTCLYAVAPSKVNVHVLGVLLGQKEGKQVLKKNELLHLGGRCYGRALKLMSTSNTWCDLGINYYRQAQHLAETGSNM NDLKELLEKSLHCLKKAVRLDSNNHLYWNALGVVACYSGIGNYALAQHCFIKSIQSEQINAVAWTNLGVLYLTNENIEQA HEAFKMAQSLDPSYLMCWIGQALIAEAVGSYDTMDLFRHTTELNMHTEGALGYAYWVCTTLQDKSNRETELYQYNILQMN AIPAAQVILNKYVERIQNYAPAFTMLGYLNEHLQLKKEAANAYQRAILLLQTAEDQDTYNVAIRNYGRLLCSTGEYDKAI QAFKSTPLEVLEDIIGFALALFMKGLYKESSKAYERALSIVESEQDKAHILTALAITEYKQGKTDVAKTLLFKCSILKEP TTESLQALCALGLAMQDATLSKAALNELLKHIKHKDSNYQRCLLTSAIYALQGRSVAVQKQISKAVHSNPGDPALWSLLS RVVAQYAQRNAKGGVVAGNVAHILDSNHGKKALLYTAVNQLAMGSSSAEDEKNTALKTIQKAALLSPGDPAIWAGLMAAC HADDKLALVNNTQPKRIDLYLALLSAVSASIKDEKFFENYNQSLEKWSLSQAVTGLIDTGRISEAETLCTKNLKSNPDQP AVILLLRQVQCKPLLESQKPLPDAVLEELQKTVMSNSTSVPAWQWLAHVYQSQGMMRAAEMCYRKSLQLASQRGSWSGKL SSLLRLALLALKVCMANISNDHWPSLVQEATTEALKLCFCPLAVLLQALLQFKRKMGARETRRLLERVVYQPGYPKSIAS TARWYLLRHLYAKDDYELIDVLVNNAKTHGDTRALELNQRLSSQ ; 1 2 UNP WDR61_HUMAN Q9GZS3 ? 2 ;MTNQYGILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAA SSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDG KYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGHAMPIRSLTFSPDSQLLVTASDDGYIKIYDVQHANLAGTLSGHASWVLNVAF CPDDTHFVSSSSDKSVKVWDVGTRTCVHTFFDHQDQVWGVKYNGNGSKIVSVGDDQEIHIYDCPI ; 1 3 UNP HBS1L_HUMAN Q9Y450 Q9Y450-2 3 ;ESPSLTELFQEHKENNISQCFTLSDLCNQSSASFTDLSLGSFPLSQLANRCQSSPGISELTGSLSSLAFHKASPTRDLEN LSLSELIAETIDVDNSQIKKESFEVSLSEVRSPGIDSNIDLSVLIKNPDFVPKPVVDPSIAPSSRTKVLSSKLGKNSNFA KDNKKNNKGSLTRKP ; 372 4 UNP SKI2_HUMAN Q15477 ? 4 ;MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARK WQRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTQYPFWPGGMD EPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCMLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGD TVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAIL HLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVIST VTRPVPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLAS LRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLNRGLGVHHSGIL PILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCK GRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFP ; 1 5 UNP SKI2_HUMAN Q15477 ? 4 ;LLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLP NTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCR SLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ ; 1049 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9G8R B 5 ? 1568 ? 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'expression tag' 368 5 4 9G8R PRO E 2 ? UNP Q9Y450 ? ? 'expression tag' 369 6 4 9G8R ASP E 3 ? UNP Q9Y450 ? ? 'expression tag' 370 7 4 9G8R SER E 4 ? UNP Q9Y450 ? ? 'expression tag' 371 8 5 9G8R GLY A 775 ? UNP Q15477 ? ? linker 775 9 5 9G8R SER A 776 ? UNP Q15477 ? ? linker 776 10 5 9G8R ARG A 777 ? UNP Q15477 ? ? linker 777 11 5 9G8R GLY A 778 ? UNP Q15477 ? ? linker 778 12 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 457 ? GLY A 472 ? VAL B 453 GLY B 468 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 472 ? ASP A 478 ? GLY B 468 ASP B 474 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 481 ? ASP A 493 ? LYS B 477 ASP B 489 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 496 ? VAL A 510 ? MET B 492 VAL B 506 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 513 ? ASP A 528 ? ASP B 509 ASP B 524 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 531 ? LEU A 545 ? ASP B 527 LEU B 541 1 ? 15 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 547 ? ALA A 562 ? ASP B 543 ALA B 558 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 AA8 ALA A 567 ? ALA A 581 ? ALA B 563 ALA B 577 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 GLN A 583 ? ARG A 596 ? GLN B 579 ARG B 592 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 601 ? GLY A 616 ? ASP B 597 GLY B 612 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 THR A 619 ? ASN A 632 ? THR B 615 ASN B 628 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE A 636 ? LEU A 649 ? ILE B 632 LEU B 645 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS A 651 ? LYS A 666 ? LYS B 647 LYS B 662 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR A 669 ? ASP A 690 ? TYR B 665 ASP B 686 1 ? 22 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU A 692 ? ARG A 714 ? LEU B 688 ARG B 710 1 ? 23 HELX_P HELX_P16 AB7 VAL A 717 ? LEU A 731 ? VAL B 713 LEU B 727 1 ? 15 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL A 746 ? LEU A 748 ? VAL B 742 LEU B 744 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS A 758 ? MET A 777 ? LYS B 754 MET B 773 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 THR A 779 ? THR A 800 ? THR B 775 THR B 796 1 ? 22 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU A 807 ? ASP A 825 ? LEU B 803 ASP B 821 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN A 828 ? CYS A 840 ? ASN B 824 CYS B 836 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN A 846 ? GLU A 861 ? ASN B 842 GLU B 857 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 ASN A 864 ? ASN A 878 ? ASN B 860 ASN B 874 1 ? 15 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN A 880 ? ASP A 895 ? ASN B 876 ASP B 891 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 AC7 TYR A 898 ? GLY A 913 ? TYR B 894 GLY B 909 1 ? 16 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP A 916 ? MET A 929 ? ASP B 912 MET B 925 1 ? 14 HELX_P HELX_P27 AC9 HIS A 930 ? ASP A 947 ? HIS B 926 ASP B 943 1 ? 18 HELX_P HELX_P28 AD1 GLU A 954 ? GLN A 962 ? GLU B 950 GLN B 958 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN A 964 ? ILE A 980 ? ASN B 960 ILE B 976 1 ? 17 HELX_P HELX_P30 AD3 TYR A 983 ? LEU A 997 ? TYR B 979 LEU B 993 1 ? 15 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU A 999 ? GLN A 1015 ? LEU B 995 GLN B 1011 1 ? 17 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP A 1021 ? THR A 1037 ? ASP B 1017 THR B 1033 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU A 1039 ? SER A 1049 ? GLU B 1035 SER B 1045 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 AD7 VAL A 1054 ? GLY A 1069 ? VAL B 1050 GLY B 1065 1 ? 16 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU A 1070 ? VAL A 1085 ? LEU B 1066 VAL B 1081 1 ? 16 HELX_P HELX_P36 AD9 SER A 1087 ? GLN A 1105 ? SER B 1083 GLN B 1101 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 AE1 LYS A 1107 ? LEU A 1121 ? LYS B 1103 LEU B 1117 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 AE2 THR A 1125 ? MET A 1139 ? THR B 1121 MET B 1135 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 AE3 THR A 1143 ? ILE A 1156 ? THR B 1139 ILE B 1152 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 AE4 SER A 1161 ? GLN A 1176 ? SER B 1157 GLN B 1172 1 ? 16 HELX_P HELX_P41 AE5 VAL A 1180 ? ASN A 1193 ? VAL B 1176 ASN B 1189 1 ? 14 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP A 1196 ? TYR A 1210 ? ASP B 1192 TYR B 1206 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 AE7 ASN A 1214 ? ASP A 1229 ? ASN B 1210 ASP B 1225 1 ? 16 HELX_P HELX_P44 AE8 HIS A 1232 ? GLY A 1248 ? HIS B 1228 GLY B 1244 1 ? 17 HELX_P HELX_P45 AE9 THR A 1258 ? SER A 1270 ? THR B 1254 SER B 1266 1 ? 13 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP A 1273 ? ASN A 1295 ? ASP B 1269 ASN B 1291 1 ? 23 HELX_P HELX_P47 AF2 LEU A 1303 ? LYS A 1316 ? LEU B 1299 LYS B 1312 1 ? 14 HELX_P HELX_P48 AF3 PHE A 1321 ? GLY A 1344 ? PHE B 1317 GLY B 1340 1 ? 24 HELX_P HELX_P49 AF4 ARG A 1345 ? ASN A 1360 ? ARG B 1341 ASN B 1356 1 ? 16 HELX_P HELX_P50 AF5 GLN A 1363 ? CYS A 1375 ? GLN B 1359 CYS B 1371 1 ? 13 HELX_P HELX_P51 AF6 PRO A 1386 ? ASN A 1400 ? PRO B 1382 ASN B 1396 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 AF7 SER A 1403 ? GLY A 1418 ? SER B 1399 GLY B 1414 1 ? 16 HELX_P HELX_P53 AF8 MET A 1419 ? ARG A 1437 ? MET B 1415 ARG B 1433 1 ? 19 HELX_P HELX_P54 AF9 TRP A 1440 ? ALA A 1460 ? TRP B 1436 ALA B 1456 1 ? 21 HELX_P HELX_P55 AG1 HIS A 1466 ? CYS A 1482 ? 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