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EMDB EMD-51195 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2025-03-26 ? 2 'EM metadata' 1 0 2025-03-26 ? 3 'Additional map' 1 0 2025-03-26 1 4 'Half map' 1 0 2025-03-26 1 5 'Half map' 1 0 2025-03-26 2 6 Image 1 0 2025-03-26 ? 7 'Primary map' 1 0 2025-03-26 ? 8 'Structure model' 1 1 2025-04-09 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 'Additional map' repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 5 5 'Half map' repository 'Initial release' ? ? 6 6 Image repository 'Initial release' ? ? 7 7 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 8 'Structure model' 'Data collection' 2 8 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 8 'Structure model' citation 2 8 'Structure model' citation_author 3 8 'Structure model' em_admin # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 8 'Structure model' '_citation.country' 2 8 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 8 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 8 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 8 'Structure model' '_citation.journal_volume' 6 8 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 7 8 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 8 8 'Structure model' '_citation.title' 9 8 'Structure model' '_citation.year' 10 8 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 11 8 'Structure model' '_em_admin.last_update' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 9GB2 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2024-07-29 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Extended phiCD508 baseplate' _pdbx_database_related.db_id EMD-51195 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _pdbx_contact_author.id _pdbx_contact_author.email _pdbx_contact_author.name_first _pdbx_contact_author.name_last _pdbx_contact_author.name_mi _pdbx_contact_author.role _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 2 p.bullough@sheffield.ac.uk Per Bullough A 'principal investigator/group leader' 0000-0001-8147-1127 3 r.fagan@sheffield.ac.uk Rob Fagan P 'principal investigator/group leader' 0000-0002-8704-4828 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wilson, J.S.' 1 ? 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_entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MERELPIPVFLTEDEDSVHERMLSNFQDVSTLEGDFIYDATRPTAEQIAELKQLGLQNNLKIAFPQTSYGTYLEWLGECK GVFKNQPTKATGVITFTGVQGTIITKGTIVTTIATDEKQSIEFELLETKTIGENETVDIKAESRIVGTIGNVSKGSISVL LGSISGVKSITNKEDFRGGTDIEDEEHFRERVLVAEQEDKLSGASSDYIRWAKEVDGVGYAYVVSEWAGAGTVKVLILDK NRKAATQELIDKVQEYIYPLNISEGENRDGKAPIGALVTVVTPDTLLINVKASFIFSNGFSEETVLNNLKTKIDKYLDKI DLGGTVSYNAIQAIVGSMMLTDEGIEDFSNLTINDVKENIKLQDQVVGIGEIVNEVVG ; ;MERELPIPVFLTEDEDSVHERMLSNFQDVSTLEGDFIYDATRPTAEQIAELKQLGLQNNLKIAFPQTSYGTYLEWLGECK GVFKNQPTKATGVITFTGVQGTIITKGTIVTTIATDEKQSIEFELLETKTIGENETVDIKAESRIVGTIGNVSKGSISVL LGSISGVKSITNKEDFRGGTDIEDEEHFRERVLVAEQEDKLSGASSDYIRWAKEVDGVGYAYVVSEWAGAGTVKVLILDK NRKAATQELIDKVQEYIYPLNISEGENRDGKAPIGALVTVVTPDTLLINVKASFIFSNGFSEETVLNNLKTKIDKYLDKI DLGGTVSYNAIQAIVGSMMLTDEGIEDFSNLTINDVKENIKLQDQVVGIGEIVNEVVG ; A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MIASKKGKEMLLTLSPIYEQSIIMQSLYEAIGSEFDNLELLDEEIELQLFPQSATWGLGFWENRVGLITNLDEDMETRRR 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GLU n 1 118 LYS n 1 119 GLN n 1 120 SER n 1 121 ILE n 1 122 GLU n 1 123 PHE n 1 124 GLU n 1 125 LEU n 1 126 LEU n 1 127 GLU n 1 128 THR n 1 129 LYS n 1 130 THR n 1 131 ILE n 1 132 GLY n 1 133 GLU n 1 134 ASN n 1 135 GLU n 1 136 THR n 1 137 VAL n 1 138 ASP n 1 139 ILE n 1 140 LYS n 1 141 ALA n 1 142 GLU n 1 143 SER n 1 144 ARG n 1 145 ILE n 1 146 VAL n 1 147 GLY n 1 148 THR n 1 149 ILE n 1 150 GLY n 1 151 ASN n 1 152 VAL n 1 153 SER n 1 154 LYS n 1 155 GLY n 1 156 SER n 1 157 ILE n 1 158 SER n 1 159 VAL n 1 160 LEU n 1 161 LEU n 1 162 GLY n 1 163 SER n 1 164 ILE n 1 165 SER n 1 166 GLY n 1 167 VAL n 1 168 LYS n 1 169 SER n 1 170 ILE n 1 171 THR n 1 172 ASN n 1 173 LYS n 1 174 GLU n 1 175 ASP n 1 176 PHE n 1 177 ARG n 1 178 GLY n 1 179 GLY n 1 180 THR n 1 181 ASP n 1 182 ILE n 1 183 GLU n 1 184 ASP n 1 185 GLU n 1 186 GLU n 1 187 HIS n 1 188 PHE n 1 189 ARG n 1 190 GLU n 1 191 ARG n 1 192 VAL n 1 193 LEU n 1 194 VAL n 1 195 ALA n 1 196 GLU n 1 197 GLN n 1 198 GLU n 1 199 ASP n 1 200 LYS 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J9QEB8 1 ? 152 ? 1 152 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 42-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 42 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 9 ? 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ALA B 204 VAL B 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 THR B 246 ? TYR B 258 ? THR B 246 TYR B 258 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 SER B 301 ? ILE B 320 ? SER B 301 ILE B 320 1 ? 20 HELX_P HELX_P18 AB9 SER B 327 ? ASP B 342 ? SER B 327 ASP B 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P19 AC1 VAL C 9 ? GLU C 13 ? VAL C 9 GLU C 13 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP C 14 ? LEU C 23 ? ASP C 14 LEU C 23 1 ? 10 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP C 35 ? PHE C 64 ? ASP C 35 PHE C 64 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 TYR C 69 ? LYS C 80 ? TYR C 69 LYS C 80 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP C 184 ? ALA C 195 ? ASP C 184 ALA C 195 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA C 204 ? VAL C 215 ? ALA C 204 VAL C 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 THR C 246 ? TYR C 258 ? THR C 246 TYR C 258 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 SER C 301 ? ILE C 320 ? SER C 301 ILE C 320 1 ? 20 HELX_P HELX_P27 AC9 SER C 327 ? ASP C 342 ? SER C 327 ASP C 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL D 9 ? GLU D 13 ? VAL D 9 GLU D 13 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP D 14 ? LEU D 23 ? ASP D 14 LEU D 23 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP D 35 ? PHE D 64 ? ASP D 35 PHE D 64 1 ? 30 HELX_P HELX_P31 AD4 TYR D 69 ? LYS D 80 ? TYR D 69 LYS D 80 1 ? 12 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP D 184 ? ALA D 195 ? ASP D 184 ALA D 195 1 ? 12 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA D 204 ? VAL D 215 ? ALA D 204 VAL D 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 AD7 THR D 246 ? TYR D 258 ? THR D 246 TYR D 258 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 SER D 301 ? ILE D 320 ? SER D 301 ILE D 320 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 AD9 SER D 327 ? ASP D 342 ? SER D 327 ASP D 342 1 ? 16 HELX_P HELX_P37 AE1 VAL E 9 ? GLU E 13 ? VAL E 9 GLU E 13 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP E 14 ? LEU E 23 ? ASP E 14 LEU E 23 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP E 35 ? PHE E 64 ? ASP E 35 PHE E 64 1 ? 30 HELX_P HELX_P40 AE4 TYR E 69 ? LYS E 80 ? TYR E 69 LYS E 80 1 ? 12 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP E 184 ? ALA E 195 ? ASP E 184 ALA E 195 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 ALA E 204 ? VAL E 215 ? ALA E 204 VAL E 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P43 AE7 THR E 246 ? TYR E 258 ? 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ASP G 35 GLY G 55 1 ? 21 HELX_P HELX_P58 AG4 GLY G 55 ? PHE G 64 ? GLY G 55 PHE G 64 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 AG5 PRO G 65 ? SER G 68 ? PRO G 65 SER G 68 5 ? 4 HELX_P HELX_P60 AG6 GLY G 70 ? LYS G 80 ? GLY G 70 LYS G 80 1 ? 11 HELX_P HELX_P61 AG7 GLY G 147 ? ASN G 151 ? GLY G 147 ASN G 151 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 ASP G 184 ? GLU G 198 ? ASP G 184 GLU G 198 1 ? 15 HELX_P HELX_P63 AG9 ALA G 204 ? VAL G 215 ? ALA G 204 VAL G 215 1 ? 12 HELX_P HELX_P64 AH1 THR G 246 ? TYR G 258 ? THR G 246 TYR G 258 1 ? 13 HELX_P HELX_P65 AH2 SER G 301 ? ILE G 320 ? SER G 301 ILE G 320 1 ? 20 HELX_P HELX_P66 AH3 SER G 327 ? THR G 341 ? SER G 327 THR G 341 1 ? 15 HELX_P HELX_P67 AH4 VAL H 9 ? GLU H 13 ? VAL H 9 GLU H 13 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 AH5 ASP H 14 ? SER H 24 ? ASP H 14 SER H 24 1 ? 11 HELX_P HELX_P69 AH6 ASP H 35 ? GLY H 55 ? ASP H 35 GLY H 55 1 ? 21 HELX_P HELX_P70 AH7 GLY H 55 ? PHE H 64 ? GLY H 55 PHE H 64 1 ? 10 HELX_P HELX_P71 AH8 PRO H 65 ? SER H 68 ? 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