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_refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.7609 ? 11637 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0452 ? 1329 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0046 ? 1373 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.3281 ? 1489 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 9GC0 _struct.title ;3'-lobe of the substrate-bound U11 snRNP ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9GC0 _struct_keywords.text 'minor spliceosome, U11 snRNP, RNA-protein complex, SPLICING' _struct_keywords.pdbx_keywords SPLICING # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ZMAT5_HUMAN Q9UDW3 ? 1 ;MGKRYFCDYCDRSFQDNLHNRKKHLNGLQHLKAKKVWYDMFRDAAAILLDEQNKRPCRKFLLTGQCDFGSNCRFSHMSER DLQELSIQVEEERRAREWLLDAPELPEGHLEDWLEKRAKRLSSAPSSRAEPIRTTVFQYPVGWPPVQELPPSLRAPPPGG WPLQPRVQWG ; 1 2 UNP PDCD7_HUMAN Q8N8D1 ? 2 ;MALPPFFGQGRPGPPPPQPPPPAPFGCPPPPLPSPAFPPPLPQRPGPFPGASAPFLQPPLALQPRASAEASRGGGGAGAF YPVPPPPLPPPPPQCRPFPGTDAGERPRPPPPGPGPPWSPRWPEAPPPPADVLGDAALQRLRDRQWLEAVFGTPRRAGCP VPQRTHAGPSLGEVRARLLRALRLVRRLRGLSQALREAEADGAAWVLLYSQTAPLRAELAERLQPLTQAAYVGEARRRLE RVRRRRLRLRERAREREAEREAEAARAVEREQEIDRWRVKCVQEVEEKKREQELKAAADGVLSEVRKKQADTKRMVDILR ALEKLRKLRKEAAARKGVCPPASADETFTHHLQRLRKLIKKRSELYEAEERALRVMLEGEQEEERKRELEKKQRKEKEKI LLQKREIESKLFGDPDEFPLAHLLEPFRQYYLQAEHSLPALIQIRHDWDQYLVPSDHPKGNFVPQGWVLPPLPSNDIWAT AVKLH ; 1 3 UNP SMD1_HUMAN P62314 ? 3 ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; 1 4 UNP SMD3_HUMAN P62318 ? 4 ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; 1 5 UNP RSMB_HUMAN P14678 ? 5 ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP ; 1 6 UNP RUXE_HUMAN P62304 ? 6 ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; 1 7 UNP RUXF_HUMAN P62306 ? 7 ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; 1 8 UNP RUXG_HUMAN P62308 ? 8 MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV 1 9 GB NR_004407.1 161169046 ? 9 ;AAAAAGGGCUUCUGUCGUGAGUGGCACACGUAGGGCAACUCGAUUGCUCUGCGUGCGGAAUCGACAUCAAGAGAUUUCGG AAGCAUAAUUUUUUGGUAUUUGGGCAGCUGGUGAUCGUUGGUCCCGGCGCCCUUU ; 1 10 UNP SNR48_HUMAN Q6IEG0 ? 10 ;MEGEPPPVEERRRLQEELNEFVESGCRTLEEVTASLGWDLDSLDPGEEEAAEDEVVICPYDSNHHMPKSSLAKHMASCRL RKMGYTKEEEDEMYNPEFFYENVKIPSITLNKDSQFQIIKQARTAVGKDSDCYNQRIYSSLPVEVPLNHKRFVCDLTQAD RLALYDFVVEETKKKRSDSQIIENDSDLFVDLAAKINQDNSRKSPKSYLEILAEVRDYKRRRQSYRAKNVHITKKSYTEV IRDVINVHMEELSNHWQEEQEKAEDDAEKNEERRSASVDSRQSGGSYLDAECSRHRRDRSRSPHKRKRNKDKDKNCESRR RKERDGERHHSHKRRKQKI ; 1 11 UNP SMD2_HUMAN P62316 ? 11 ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9GC0 E 1 ? 170 ? Q9UDW3 1 ? 170 ? 1 170 2 2 9GC0 D 1 ? 485 ? Q8N8D1 1 ? 485 ? 1 485 3 3 9GC0 h 1 ? 119 ? P62314 1 ? 119 ? 1 119 4 4 9GC0 j 1 ? 126 ? P62318 1 ? 126 ? 1 126 5 5 9GC0 k 1 ? 240 ? P14678 1 ? 240 ? 1 240 6 6 9GC0 l 1 ? 92 ? P62304 1 ? 92 ? 1 92 7 7 9GC0 m 1 ? 86 ? P62306 1 ? 86 ? 1 86 8 8 9GC0 n 1 ? 76 ? P62308 1 ? 76 ? 1 76 9 9 9GC0 Q 1 ? 135 ? 161169046 1 ? 135 ? 1 135 10 10 9GC0 F 1 ? 339 ? Q6IEG0 1 ? 339 ? 1 339 11 11 9GC0 i 1 ? 118 ? P62316 1 ? 118 ? 1 118 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 11-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 17 ? ASN A 26 ? ASN E 17 ASN E 26 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 27 ? PHE A 41 ? GLY E 27 PHE E 41 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLY B 172 ? ALA B 198 ? GLY D 172 ALA D 198 1 ? 27 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP B 201 ? GLN B 224 ? ASP D 201 GLN D 224 1 ? 24 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO B 225 ? ALA B 229 ? PRO D 225 ALA D 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU B 234 ? GLU B 286 ? GLU D 234 GLU D 286 1 ? 53 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU C 3 ? LYS C 9 ? LEU h 3 LYS h 9 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO C 75 ? LEU C 80 ? PRO h 75 LEU h 80 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY D 4 ? ALA D 13 ? GLY j 4 ALA j 13 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO D 74 ? ALA D 80 ? PRO j 74 ALA j 80 5 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 SER E 7 ? GLN E 11 ? SER k 7 GLN k 11 1 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 GLN F 16 ? ARG F 28 ? GLN l 16 ARG l 28 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 AB4 ASN G 6 ? THR G 15 ? ASN m 6 THR m 15 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN H 22 ? GLY H 24 ? ASN n 22 GLY n 24 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO J 7 ? VAL J 32 ? PRO F 7 VAL F 32 1 ? 26 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS J 68 ? 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LEU i 29 ASN i 39 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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I G 104 O6 ? ? ? 1_555 I C 130 N4 ? ? Q G 104 Q C 130 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? I C 105 N3 ? ? ? 1_555 I G 129 N1 ? ? Q C 105 Q G 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? I C 105 N4 ? ? ? 1_555 I G 129 O6 ? ? Q C 105 Q G 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? I C 105 O2 ? ? ? 1_555 I G 129 N2 ? ? Q C 105 Q G 129 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? I G 107 N1 ? ? ? 1_555 I C 128 N3 ? ? Q G 107 Q C 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? I G 107 N2 ? ? ? 1_555 I C 128 O2 ? ? Q G 107 Q C 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? I G 107 O6 ? ? ? 1_555 I C 128 N4 ? ? Q G 107 Q C 128 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? I C 108 N3 ? ? ? 1_555 I G 127 N1 ? ? Q C 108 Q G 127 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? I C 108 N4 ? ? ? 1_555 I G 127 O6 ? ? Q C 108 Q G 127 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? 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