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A G 31 N2 ? ? ? 1_555 B DC 30 O2 ? ? 1 G 31 2 DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A G 31 O6 ? ? ? 1_555 B DC 30 N4 ? ? 1 G 31 2 DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A U 34 N3 ? ? ? 1_555 B DA 27 N1 ? ? 1 U 34 2 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A U 34 O4 ? ? ? 1_555 B DA 27 N6 ? ? 1 U 34 2 DA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A G 35 N1 ? ? ? 1_555 B DC 26 N3 ? ? 1 G 35 2 DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A G 35 N2 ? ? ? 1_555 B DC 26 O2 ? ? 1 G 35 2 DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A G 35 O6 ? ? ? 1_555 B DC 26 N4 ? ? 1 G 35 2 DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A G 36 N1 ? ? ? 1_555 B DC 25 N3 ? ? 1 G 36 2 DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? A G 36 N2 ? ? ? 1_555 B DC 25 O2 ? ? 1 G 36 2 DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? A G 36 O6 ? ? ? 1_555 B DC 25 N4 ? ? 1 G 36 2 DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? A U 37 N3 ? ? ? 1_555 B DA 24 N1 ? ? 1 U 37 2 DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? A U 37 O4 ? ? ? 1_555 B DA 24 N6 ? ? 1 U 37 2 DA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? A A 39 N6 ? ? ? 1_555 B DT 22 O4 ? ? 1 A 39 2 DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-DT PAIR' ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? A C 40 N4 ? ? ? 1_555 B DG 21 O6 ? ? 1 C 40 2 DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-DG PAIR' ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? A C 46 N3 ? ? ? 1_555 A G 60 N1 ? ? 1 C 46 1 G 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? A C 46 N4 ? ? ? 1_555 A G 60 O6 ? ? 1 C 46 1 G 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? A C 46 O2 ? ? ? 1_555 A G 60 N2 ? ? 1 C 46 1 G 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? A U 47 N3 ? ? ? 1_555 A A 59 N1 ? ? 1 U 47 1 A 59 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? 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B DC 55 N3 ? ? ? 1_555 C DG 5 N1 ? ? 2 DC 55 3 DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog83 hydrog ? ? B DC 55 N4 ? ? ? 1_555 C DG 5 O6 ? ? 2 DC 55 3 DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog84 hydrog ? ? B DC 55 O2 ? ? ? 1_555 C DG 5 N2 ? ? 2 DC 55 3 DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog85 hydrog ? ? B DG 57 N1 ? ? ? 1_555 C DC 3 N3 ? ? 2 DG 57 3 DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog86 hydrog ? ? B DG 57 N2 ? ? ? 1_555 C DC 3 O2 ? ? 2 DG 57 3 DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog87 hydrog ? ? B DG 57 O6 ? ? ? 1_555 C DC 3 N4 ? ? 2 DG 57 3 DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog88 hydrog ? ? B DT 58 N3 ? ? ? 1_555 C DA 2 N1 ? ? 2 DT 58 3 DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog89 hydrog ? ? B DT 58 O4 ? ? ? 1_555 C DA 2 N6 ? ? 2 DT 58 3 DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 CYS G 121 ? 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AE4 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 11 ? parallel AA4 3 5 ? anti-parallel AA4 3 7 ? anti-parallel AA4 3 8 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 4 9 ? anti-parallel AA4 4 12 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 9 11 ? anti-parallel AA4 10 11 ? anti-parallel AA4 10 13 ? anti-parallel AA4 12 13 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 4 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 2 4 ? anti-parallel AA8 2 9 ? anti-parallel AA8 4 7 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 5 7 ? anti-parallel AA8 8 9 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 4 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 2 4 ? anti-parallel AB3 4 7 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 5 7 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 4 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 2 4 ? anti-parallel AB8 2 9 ? anti-parallel AB8 4 7 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB8 5 7 ? anti-parallel AB8 8 9 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 4 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 2 4 ? anti-parallel AC4 2 9 ? anti-parallel AC4 4 7 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC4 5 7 ? anti-parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 4 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 2 4 ? anti-parallel AC9 2 9 ? anti-parallel AC9 4 7 ? anti-parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AC9 5 7 ? anti-parallel AC9 8 9 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 4 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 2 4 ? anti-parallel AD4 2 9 ? anti-parallel AD4 4 7 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 5 7 ? anti-parallel AD4 8 9 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 3 ? anti-parallel AD8 1 4 ? anti-parallel AD8 1 5 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE D 82 ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9GS9 'double helix' 9GS9 'a-form double helix' 9GS9 'b-form double helix' 9GS9 'hairpin loop' 9GS9 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 9 1_555 B DT 52 1_555 -0.161 0.132 -0.809 -30.756 20.700 -8.842 1 1_A9:DT52_2 1 9 ? 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