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_citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 16 _citation.language ? _citation.page_first 9565 _citation.page_last 9565 _citation.title 'Molecular mechanism of co-transcriptional H3K36 methylation by SETD2.' _citation.year 2025 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-025-65439-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 41162378 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Walshe, J.L.' 1 0000-0001-7220-3120 primary 'Ochmann, M.' 2 0000-0003-3833-5650 primary 'Neef, U.' 3 ? primary 'Dybkov, O.' 4 0000-0001-6005-7242 primary 'Dienemann, C.' 5 0000-0002-2172-5110 primary 'Oberthur, C.' 6 ? primary 'Zheenbekova, A.' 7 ? primary 'Urlaub, H.' 8 0000-0003-1837-5233 primary 'Cramer, P.' 9 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn 'Non-Template DNA' 56470.930 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone-lysine N-methyltransferase SETD2' 127887.328 1 2.1.1.359,2.1.1.- ? ? ? 3 polymer syn 'Template DNA' 55939.559 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H3.2' 15391.052 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Histone H2A type 1-B/E' 14721.133 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Histone H2B type 1-K' 13921.213 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'FACT complex subunit SPT16' 120290.961 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 2 ;HIF-1,Huntingtin yeast partner B,Huntingtin-interacting protein 1,HIP-1,Huntingtin-interacting protein B,Lysine N-methyltransferase 3A,Protein-lysine N-methyltransferase SETD2,SET domain-containing protein 2,hSET2,p231HBP ; 4 'H3-clustered histone 13,H3-clustered histone 14,H3-clustered histone 15,Histone H3/m,Histone H3/o' 6 'Histone H2A.2,Histone H2A/a,Histone H2A/m' 7 'H2B K,HIRA-interacting protein 1' 8 ;Chromatin-specific transcription elongation factor 140 kDa subunit,FACT 140 kDa subunit,FACTp140,Facilitates chromatin transcription complex subunit SPT16,hSPT16 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG) (DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG) (DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT) (DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG) (DG)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA) (DG)(DC) ; ;ATCGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTAC GTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCATCACTGTCGCGGCCCTTGTGTTCAG GAGCCAGCAGGGAGCTGGGAGC ; N ? 2 'polypeptide(L)' no no ;SNAETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQ 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(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG) (DA)(DT) ; ;GCTCCCAGCTCCCTGCTGGCTCCGAGTGGGTTCTGCCGCGACAGTGATGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAG CTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCA CGTGTCAGATATATACATCGAT ; T ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVMKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVMKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; a,e ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; b,f ? 6 'polypeptide(L)' no no ;SNAPWMSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNK KTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;SNAPWMSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNK KTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; c,g ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; d,h ? 8 'polypeptide(L)' no no ;SNMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMAS KKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEG FDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPST VEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRH GVKICDVYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKEGKKPEEKT YALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQ KELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNIS MSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAE EKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMII VLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFE VPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVAS LDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEE EEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHS SAPPKKKRK ; ;SNMAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMAS KKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEG FDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPST VEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRH 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1 17 DG n 1 18 DA n 1 19 DC n 1 20 DA n 1 21 DC n 1 22 DG n 1 23 DT n 1 24 DG n 1 25 DC n 1 26 DC n 1 27 DT n 1 28 DG n 1 29 DG n 1 30 DA n 1 31 DG n 1 32 DA n 1 33 DC n 1 34 DT n 1 35 DA n 1 36 DG n 1 37 DG n 1 38 DG n 1 39 DA n 1 40 DG n 1 41 DT n 1 42 DA n 1 43 DA n 1 44 DT n 1 45 DC n 1 46 DC n 1 47 DC n 1 48 DC n 1 49 DT n 1 50 DT n 1 51 DG n 1 52 DG n 1 53 DC n 1 54 DG n 1 55 DG n 1 56 DT n 1 57 DT n 1 58 DA n 1 59 DA n 1 60 DA n 1 61 DA n 1 62 DC n 1 63 DG n 1 64 DC n 1 65 DG n 1 66 DG n 1 67 DG n 1 68 DG n 1 69 DG n 1 70 DA n 1 71 DC n 1 72 DA n 1 73 DG n 1 74 DC n 1 75 DG n 1 76 DC n 1 77 DG n 1 78 DT n 1 79 DA n 1 80 DC n 1 81 DG n 1 82 DT n 1 83 DG n 1 84 DC n 1 85 DG n 1 86 DT n 1 87 DT n 1 88 DT n 1 89 DA n 1 90 DA n 1 91 DG n 1 92 DC n 1 93 DG n 1 94 DG n 1 95 DT n 1 96 DG n 1 97 DC n 1 98 DT n 1 99 DA n 1 100 DG n 1 101 DA n 1 102 DG n 1 103 DC n 1 104 DT n 1 105 DG n 1 106 DT n 1 107 DC n 1 108 DT n 1 109 DA n 1 110 DC n 1 111 DG n 1 112 DA n 1 113 DC n 1 114 DC n 1 115 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_refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 13856 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.211 ? 19512 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 23.869 ? 5794 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.067 ? 1963 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.017 ? 1657 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 9GW2 _struct.title 'State 2 MAP 1 SETD2 bound to proximal H3 of upstream nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 9GW2 _struct_keywords.text 'RNA Pol II Activated elongation complex Co-transcriptional H3K36me3 SETD2, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 9GW2 9GW2 ? 1 ? 1 2 UNP SETD2_HUMAN Q9BYW2 ? 2 ;ETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEI ACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVK EYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKE AQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLEQKLTC LELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAV PPLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLEN VPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEIEPKESNGTKLEEPINEETPSQDEEEGVSDVESER SQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQNKEK RKRRSSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPYDS LGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVE VSSSQYVAQSDGVVHQDSSVAVLPVPAPGPVQGQNYSVWDSNQQSVSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPTVYGVTSPYSQ TTPPIVQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPN WKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKASKKPKTAEADTSSELAKKSKEVF RKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAV YKPKEDTELE ; 1435 3 PDB 9GW2 9GW2 ? 3 ? 1 4 UNP H32_HUMAN Q71DI3 ? 4 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 5 UNP H4_HUMAN P62805 ? 5 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 6 UNP H2A1B_HUMAN P04908 ? 6 ;MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 7 UNP H2B1K_HUMAN O60814 ? 7 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 1 8 UNP SP16H_HUMAN Q9Y5B9 ? 8 ;MAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKIIFMASKK KVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFD KIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVE MCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGV KICDVYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKEGKKPEEKTYA LFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKE LAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMS VEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEK EKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVL HFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVP FRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLD PIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEE DSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSA PPKKKRK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 9GW2 N 1 ? 182 ? 9GW2 1 ? 182 ? 1 182 2 2 9GW2 O 4 ? 1133 ? Q9BYW2 1435 ? 2564 ? 1435 2564 3 3 9GW2 T 1 ? 182 ? 9GW2 1 ? 182 ? 1 182 4 4 9GW2 a 1 ? 136 ? Q71DI3 1 ? 136 ? 1 136 5 5 9GW2 b 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 6 6 9GW2 c 6 ? 135 ? P04908 1 ? 130 ? 1 130 7 7 9GW2 d 1 ? 126 ? O60814 1 ? 126 ? 0 125 8 4 9GW2 e 1 ? 136 ? Q71DI3 1 ? 136 ? 1 136 9 5 9GW2 f 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 10 6 9GW2 g 6 ? 135 ? P04908 1 ? 130 ? 1 130 11 7 9GW2 h 1 ? 126 ? O60814 1 ? 126 ? 0 125 12 8 9GW2 j 3 ? 1049 ? Q9Y5B9 1 ? 1047 ? 1 1047 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 9GW2 SER O 1 ? UNP Q9BYW2 ? ? 'expression tag' 1432 1 2 9GW2 ASN O 2 ? UNP Q9BYW2 ? ? 'expression tag' 1433 2 2 9GW2 ALA O 3 ? UNP Q9BYW2 ? ? 'expression tag' 1434 3 2 9GW2 LEU O 531 ? UNP Q9BYW2 PRO 1962 variant 1962 4 4 9GW2 MET a 37 ? UNP Q71DI3 LYS 37 'engineered mutation' 37 5 4 9GW2 ALA a 111 ? UNP Q71DI3 CYS 111 'engineered mutation' 111 6 6 9GW2 SER c 1 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -4 7 6 9GW2 ASN c 2 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -3 8 6 9GW2 ALA c 3 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -2 9 6 9GW2 PRO c 4 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -1 10 6 9GW2 TRP c 5 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' 0 11 8 9GW2 MET e 37 ? UNP Q71DI3 LYS 37 'engineered mutation' 37 12 8 9GW2 ALA e 111 ? UNP Q71DI3 CYS 111 'engineered mutation' 111 13 10 9GW2 SER g 1 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -4 14 10 9GW2 ASN g 2 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -3 15 10 9GW2 ALA g 3 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -2 16 10 9GW2 PRO g 4 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' -1 17 10 9GW2 TRP g 5 ? UNP P04908 ? ? 'expression tag' 0 18 12 9GW2 SER j 1 ? UNP Q9Y5B9 ? ? 'expression tag' -1 19 12 9GW2 ASN j 2 ? UNP Q9Y5B9 ? ? 'expression tag' 0 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP B 21 ? ARG B 24 ? ASP O 1452 ARG O 1455 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP B 25 ? GLN B 35 ? ASP O 1456 GLN O 1466 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN B 57 ? HIS B 60 ? ASN O 1488 HIS O 1491 5 ? 4 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG B 61 ? MET B 66 ? ARG O 1492 MET O 1497 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 SER B 74 ? GLY B 81 ? SER O 1505 GLY O 1512 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN B 91 ? MET B 95 ? ASN O 1522 MET O 1526 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 ASN B 104 ? CYS B 108 ? ASN O 1535 CYS O 1539 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 154 ? ASN B 168 ? ASP O 1585 ASN O 1599 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 ASN B 191 ? MET B 196 ? ASN O 1622 MET O 1627 5 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY D 45 ? SER D 58 ? GLY a 45 SER a 58 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 AB2 ARG D 64 ? GLN D 77 ? ARG a 64 GLN a 77 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 AB3 GLN D 86 ? ALA D 115 ? GLN a 86 ALA a 115 1 ? 30 HELX_P HELX_P13 AB4 MET D 121 ? GLY D 133 ? MET a 121 GLY a 133 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP E 25 ? ILE E 30 ? ASP b 24 ILE b 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 THR E 31 ? GLY E 42 ? THR b 30 GLY b 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 LEU E 50 ? ALA E 77 ? LEU b 49 ALA b 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P17 AB8 THR E 83 ? GLY E 95 ? THR b 82 GLY b 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 THR F 22 ? GLY F 28 ? THR c 17 GLY c 23 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 VAL F 33 ? LYS F 42 ? VAL c 28 LYS c 37 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY F 52 ? ASN F 79 ? GLY c 47 ASN c 74 1 ? 28 HELX_P HELX_P21 AC3 ILE F 85 ? ASP F 96 ? ILE c 80 ASP c 91 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP F 96 ? LEU F 103 ? ASP c 91 LEU c 98 1 ? 8 HELX_P HELX_P23 AC5 TYR G 38 ? HIS G 50 ? TYR d 37 HIS d 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 SER G 56 ? ASN G 85 ? SER d 55 ASN d 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P25 AC7 THR G 91 ? LEU G 103 ? THR d 90 LEU d 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 GLY G 105 ? SER G 124 ? GLY d 104 SER d 123 1 ? 20 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY H 45 ? SER H 58 ? GLY e 45 SER e 58 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG H 64 ? ASP H 78 ? ARG e 64 ASP e 78 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 AD2 GLN H 86 ? ALA H 115 ? 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OP2 N DG 52 ? ? 110.37 119.60 -9.23 1.50 N 63 1 OP1 N DG 54 ? ? P N DG 54 ? ? OP2 N DG 54 ? ? 110.45 119.60 -9.15 1.50 N 64 1 OP1 N DG 55 ? ? P N DG 55 ? ? OP2 N DG 55 ? ? 110.37 119.60 -9.23 1.50 N 65 1 "O4'" N DT 57 ? ? "C1'" N DT 57 ? ? N1 N DT 57 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 66 1 OP1 N DA 58 ? ? P N DA 58 ? ? OP2 N DA 58 ? ? 110.19 119.60 -9.41 1.50 N 67 1 OP1 N DA 59 ? ? P N DA 59 ? ? OP2 N DA 59 ? ? 109.89 119.60 -9.71 1.50 N 68 1 OP1 N DC 62 ? ? P N DC 62 ? ? OP2 N DC 62 ? ? 110.31 119.60 -9.29 1.50 N 69 1 "O4'" N DC 62 ? ? "C1'" N DC 62 ? ? N1 N DC 62 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 70 1 OP1 N DG 67 ? ? P N DG 67 ? ? OP2 N DG 67 ? ? 110.60 119.60 -9.00 1.50 N 71 1 OP1 N DC 71 ? ? P N DC 71 ? ? OP2 N DC 71 ? ? 110.30 119.60 -9.30 1.50 N 72 1 "O4'" N DC 71 ? ? "C1'" N DC 71 ? ? N1 N DC 71 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 73 1 OP1 N DA 72 ? ? P N DA 72 ? ? OP2 N DA 72 ? ? 110.47 119.60 -9.13 1.50 N 74 1 OP1 N DG 73 ? ? P N DG 73 ? ? OP2 N DG 73 ? ? 110.45 119.60 -9.15 1.50 N 75 1 "O3'" N DG 77 ? ? P N DT 78 ? ? OP2 N DT 78 ? ? 118.59 110.50 8.09 1.10 Y 76 1 OP1 N DT 78 ? ? P N DT 78 ? ? OP2 N DT 78 ? ? 108.88 119.60 -10.72 1.50 N 77 1 OP1 N DA 79 ? ? P N DA 79 ? ? OP2 N DA 79 ? ? 110.14 119.60 -9.46 1.50 N 78 1 OP1 N DT 82 ? ? P N DT 82 ? ? OP2 N DT 82 ? ? 110.18 119.60 -9.42 1.50 N 79 1 OP1 N DC 84 ? ? P N DC 84 ? ? OP2 N DC 84 ? ? 109.86 119.60 -9.74 1.50 N 80 1 OP1 N DT 86 ? ? P N DT 86 ? ? OP2 N DT 86 ? ? 110.54 119.60 -9.06 1.50 N 81 1 "O3'" N DA 89 ? ? P N DA 90 ? ? OP1 N DA 90 ? ? 117.62 110.50 7.12 1.10 Y 82 1 OP1 N DA 90 ? ? P N DA 90 ? ? OP2 N DA 90 ? ? 109.90 119.60 -9.70 1.50 N 83 1 OP1 N DG 94 ? ? P N DG 94 ? ? OP2 N DG 94 ? ? 109.58 119.60 -10.02 1.50 N 84 1 "O4'" N DG 94 ? ? "C4'" N DG 94 ? ? "C3'" N DG 94 ? ? 101.76 104.50 -2.74 0.40 N 85 1 "O4'" N DG 94 ? ? "C1'" N DG 94 ? ? N9 N DG 94 ? ? 111.12 108.30 2.82 0.30 N 86 1 OP1 N DT 95 ? ? P N DT 95 ? ? OP2 N DT 95 ? ? 110.44 119.60 -9.16 1.50 N 87 1 "O4'" N DT 95 ? ? "C1'" N DT 95 ? ? N1 N DT 95 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 88 1 "O4'" N DG 96 ? ? "C1'" N DG 96 ? ? N9 N DG 96 ? ? 111.74 108.30 3.44 0.30 N 89 1 OP1 N DC 97 ? ? P N DC 97 ? ? OP2 N DC 97 ? ? 109.75 119.60 -9.85 1.50 N 90 1 "O4'" N DT 98 ? ? "C1'" N DT 98 ? ? N1 N DT 98 ? ? 111.35 108.30 3.05 0.30 N 91 1 "O3'" N DT 98 ? ? P N DA 99 ? ? OP1 N DA 99 ? ? 119.06 110.50 8.56 1.10 Y 92 1 OP1 N DA 99 ? ? P N DA 99 ? ? OP2 N DA 99 ? ? 109.99 119.60 -9.61 1.50 N 93 1 "O4'" N DG 100 ? ? "C1'" N DG 100 ? ? N9 N DG 100 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 94 1 "O3'" N DG 100 ? ? P N DA 101 ? ? OP1 N DA 101 ? ? 117.52 110.50 7.02 1.10 Y 95 1 OP1 N DA 101 ? ? P N DA 101 ? ? OP2 N DA 101 ? ? 109.81 119.60 -9.79 1.50 N 96 1 OP1 N DG 105 ? ? P N DG 105 ? ? OP2 N DG 105 ? ? 110.27 119.60 -9.33 1.50 N 97 1 OP1 N DT 106 ? ? P N DT 106 ? ? OP2 N DT 106 ? ? 110.49 119.60 -9.11 1.50 N 98 1 "O3'" N DC 107 ? ? P N DT 108 ? ? OP2 N DT 108 ? ? 119.39 110.50 8.89 1.10 Y 99 1 OP1 N DT 108 ? ? P N DT 108 ? ? OP2 N DT 108 ? ? 109.05 119.60 -10.55 1.50 N 100 1 OP1 N DA 109 ? ? P N DA 109 ? ? OP2 N DA 109 ? ? 109.99 119.60 -9.61 1.50 N 101 1 "O4'" N DA 109 ? ? "C1'" N DA 109 ? ? N9 N DA 109 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 102 1 OP1 N DC 110 ? ? P N DC 110 ? ? OP2 N DC 110 ? ? 109.45 119.60 -10.15 1.50 N 103 1 "O3'" N DG 111 ? ? P N DA 112 ? ? OP1 N DA 112 ? ? 118.74 110.50 8.24 1.10 Y 104 1 OP1 N DA 112 ? ? P N DA 112 ? ? OP2 N DA 112 ? ? 108.79 119.60 -10.81 1.50 N 105 1 OP1 N DC 113 ? ? P N DC 113 ? ? OP2 N DC 113 ? ? 110.49 119.60 -9.11 1.50 N 106 1 "O4'" N DC 114 ? ? "C1'" N DC 114 ? ? N1 N DC 114 ? ? 113.54 108.30 5.24 0.30 N 107 1 "O3'" N DC 114 ? ? P N DA 115 ? ? OP1 N DA 115 ? ? 118.03 110.50 7.53 1.10 Y 108 1 OP1 N DA 115 ? ? P N DA 115 ? ? OP2 N DA 115 ? ? 110.02 119.60 -9.58 1.50 N 109 1 OP1 N DA 116 ? ? P N DA 116 ? ? OP2 N DA 116 ? ? 110.42 119.60 -9.18 1.50 N 110 1 "O4'" N DA 116 ? ? "C1'" N DA 116 ? ? N9 N DA 116 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 111 1 "O3'" N DA 116 ? ? P N DT 117 ? ? OP2 N DT 117 ? ? 119.20 110.50 8.70 1.10 Y 112 1 OP1 N DT 117 ? ? P N DT 117 ? ? OP2 N DT 117 ? ? 109.52 119.60 -10.08 1.50 N 113 1 "C1'" N DT 117 ? ? "O4'" N DT 117 ? ? "C4'" N DT 117 ? ? 103.81 110.10 -6.29 1.00 N 114 1 "O4'" N DT 117 ? ? "C1'" N DT 117 ? ? N1 N DT 117 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 115 1 OP1 N DT 118 ? ? P N DT 118 ? ? OP2 N DT 118 ? ? 109.74 119.60 -9.86 1.50 N 116 1 "O4'" N DT 118 ? ? "C1'" N DT 118 ? ? N1 N DT 118 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 117 1 OP1 N DG 123 ? ? P N DG 123 ? ? OP2 N DG 123 ? ? 110.34 119.60 -9.26 1.50 N 118 1 "O4'" N DG 123 ? ? "C1'" N DG 123 ? ? N9 N DG 123 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 119 1 OP1 N DG 124 ? ? P N DG 124 ? ? OP2 N DG 124 ? ? 110.45 119.60 -9.15 1.50 N 120 1 OP1 N DC 125 ? ? P N DC 125 ? ? OP2 N DC 125 ? ? 110.36 119.60 -9.24 1.50 N 121 1 OP1 N DC 126 ? ? P N DC 126 ? ? OP2 N DC 126 ? ? 110.53 119.60 -9.07 1.50 N 122 1 "O4'" N DC 126 ? ? "C1'" N DC 126 ? ? N1 N DC 126 ? ? 112.37 108.30 4.07 0.30 N 123 1 OP1 T DG 57 ? ? P T DG 57 ? ? OP2 T DG 57 ? ? 109.46 119.60 -10.14 1.50 N 124 1 OP1 T DG 58 ? ? P T DG 58 ? ? OP2 T DG 58 ? ? 110.17 119.60 -9.43 1.50 N 125 1 OP1 T DC 59 ? ? P T DC 59 ? ? OP2 T DC 59 ? ? 110.51 119.60 -9.09 1.50 N 126 1 OP1 T DG 61 ? ? P T DG 61 ? ? OP2 T DG 61 ? ? 110.02 119.60 -9.58 1.50 N 127 1 "O3'" T DC 62 ? ? P T DT 63 ? ? OP2 T DT 63 ? ? 119.87 110.50 9.37 1.10 Y 128 1 OP1 T DT 63 ? ? P T DT 63 ? ? OP2 T DT 63 ? ? 109.00 119.60 -10.60 1.50 N 129 1 OP1 T DC 64 ? ? P T DC 64 ? ? OP2 T DC 64 ? ? 110.17 119.60 -9.43 1.50 N 130 1 OP1 T DA 65 ? ? P T DA 65 ? ? OP2 T DA 65 ? ? 110.54 119.60 -9.06 1.50 N 131 1 "O4'" T DA 65 ? ? "C1'" T DA 65 ? ? N9 T DA 65 ? ? 112.05 108.30 3.75 0.30 N 132 1 "O3'" T DA 65 ? ? P T DA 66 ? ? OP1 T DA 66 ? ? 118.56 110.50 8.06 1.10 Y 133 1 OP1 T DA 66 ? ? P T DA 66 ? ? OP2 T DA 66 ? ? 109.85 119.60 -9.75 1.50 N 134 1 OP1 T DG 70 ? ? P T DG 70 ? ? OP2 T DG 70 ? ? 109.98 119.60 -9.62 1.50 N 135 1 OP1 T DC 72 ? ? P T DC 72 ? ? OP2 T DC 72 ? ? 110.58 119.60 -9.02 1.50 N 136 1 "O4'" T DG 73 ? ? "C1'" T DG 73 ? ? N9 T DG 73 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 137 1 "O3'" T DG 73 ? ? P T DT 74 ? ? OP2 T DT 74 ? ? 118.52 110.50 8.02 1.10 Y 138 1 OP1 T DT 74 ? ? P T DT 74 ? ? OP2 T DT 74 ? ? 109.13 119.60 -10.47 1.50 N 139 1 "O4'" T DT 74 ? ? "C1'" T DT 74 ? ? N1 T DT 74 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 140 1 "O3'" T DT 74 ? ? P T DA 75 ? ? OP1 T DA 75 ? ? 117.75 110.50 7.25 1.10 Y 141 1 OP1 T DA 77 ? ? P T DA 77 ? ? OP2 T DA 77 ? ? 110.54 119.60 -9.06 1.50 N 142 1 OP1 T DC 78 ? ? P T DC 78 ? ? OP2 T DC 78 ? ? 110.41 119.60 -9.19 1.50 N 143 1 OP1 T DA 79 ? ? P T DA 79 ? ? OP2 T DA 79 ? ? 110.44 119.60 -9.16 1.50 N 144 1 "O4'" T DC 81 ? ? "C1'" T DC 81 ? ? N1 T DC 81 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 145 1 "O3'" T DC 81 ? ? P T DT 82 ? ? 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RELION ? ? # _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 9GW2 'double helix' 9GW2 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DT 2 1_555 C DA 181 1_555 -0.202 -0.026 -0.126 30.926 20.774 -0.821 1 N_DT2:DA181_T N 2 ? 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